EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020010431 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3441 bases
Position: chr20:3621573-3625013
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020027461	RVT_1	PF00078.27	2.4e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020015939	-	3441	-	ENSORLP00020027461	974 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020010431	-	62	46.154	ENSORLG00020012063	-	81	46.154
ENSORLG00020010431	-	85	39.256	ENSORLG00020012549	-	91	39.256
ENSORLG00020010431	-	73	40.922	ENSORLG00020016659	-	89	40.922
ENSORLG00020010431	-	67	41.452	ENSORLG00020006422	-	87	41.239
ENSORLG00020010431	-	71	42.919	ENSORLG00020004554	-	89	42.981
ENSORLG00020010431	-	62	46.154	ENSORLG00020016342	-	81	46.154
ENSORLG00020010431	-	68	41.829	ENSORLG00020005659	-	89	41.679
ENSORLG00020010431	-	62	45.827	ENSORLG00020012251	-	81	45.827
ENSORLG00020010431	-	59	44.425	ENSORLG00020014334	-	86	44.425
ENSORLG00020010431	-	63	42.414	ENSORLG00020019488	-	88	42.182
ENSORLG00020010431	-	62	46.318	ENSORLG00020008999	-	81	46.318
ENSORLG00020010431	-	91	38.764	ENSORLG00020008961	-	89	39.282
ENSORLG00020010431	-	62	46.318	ENSORLG00020021860	-	81	46.318
ENSORLG00020010431	-	77	40.843	ENSORLG00020001972	-	90	40.975
ENSORLG00020010431	-	89	41.796	ENSORLG00020004158	-	86	41.808
ENSORLG00020010431	-	59	45.690	ENSORLG00020021237	-	91	45.690
ENSORLG00020010431	-	71	41.571	ENSORLG00020003828	-	89	41.571
ENSORLG00020010431	-	75	37.973	ENSORLG00020007799	-	92	38.701
ENSORLG00020010431	-	78	55.772	ENSORLG00020010019	-	95	55.253
ENSORLG00020010431	-	62	46.318	ENSORLG00020003775	-	89	46.318
ENSORLG00020010431	-	62	46.481	ENSORLG00020003779	-	90	46.481
ENSORLG00020010431	-	88	39.931	ENSORLG00020021850	-	78	40.046
ENSORLG00020010431	-	59	46.062	ENSORLG00020006111	-	90	46.062
ENSORLG00020010431	-	61	40.770	ENSORLG00020002120	-	95	40.705
ENSORLG00020010431	-	55	99.435	ENSORLG00020012070	-	87	99.435
ENSORLG00020010431	-	91	39.150	ENSORLG00020002718	-	88	40.047
ENSORLG00020010431	-	62	45.990	ENSORLG00020000803	-	81	45.990
ENSORLG00020010431	-	62	46.318	ENSORLG00020015125	-	88	46.318
ENSORLG00020010431	-	62	44.224	ENSORLG00020004729	-	88	44.224
ENSORLG00020010431	-	62	46.318	ENSORLG00020011031	-	88	46.318
ENSORLG00020010431	-	91	38.695	ENSORLG00020015822	-	88	39.323
ENSORLG00020010431	-	89	41.907	ENSORLG00020018578	-	89	41.921
ENSORLG00020010431	-	53	62.644	ENSORLG00020003864	-	99	62.101
ENSORLG00020010431	-	60	44.351	ENSORLG00020000622	-	88	44.351
ENSORLG00020010431	-	50	47.023	ENSORLG00020011898	-	86	47.023
ENSORLG00020010431	-	83	41.746	ENSORLG00020019417	-	91	41.746
ENSORLG00020010431	-	99	60.597	ENSORLG00020013041	-	91	60.391
ENSORLG00020010431	-	84	39.277	ENSORLG00020014097	-	91	39.110
ENSORLG00020010431	-	91	38.920	ENSORLG00020010964	-	89	39.327
ENSORLG00020010431	-	93	38.370	ENSORLG00020021297	-	76	38.940
ENSORLG00020010431	-	55	38.961	ENSORLG00020015429	-	86	38.704
ENSORLG00020010431	-	80	41.286	ENSORLG00020007092	-	99	41.460
ENSORLG00020010431	-	91	38.583	ENSORLG00020015506	-	89	39.024
ENSORLG00020010431	-	59	73.230	ENSORLG00020021613	-	88	73.230
ENSORLG00020010431	-	69	36.618	ENSORLG00020007840	-	98	36.857
ENSORLG00020010431	-	62	43.212	ENSORLG00020018691	-	87	42.975
ENSORLG00020010431	-	55	40.706	ENSORLG00020006907	-	99	40.706
ENSORLG00020010431	-	71	41.810	ENSORLG00020004099	-	89	41.810
ENSORLG00020010431	-	61	46.333	ENSORLG00020008289	-	91	46.333
ENSORLG00020010431	-	93	38.370	ENSORLG00020008178	-	76	38.940
ENSORLG00020010431	-	91	37.416	ENSORLG00020000004	-	77	38.035
ENSORLG00020010431	-	61	46.281	ENSORLG00020001010	-	91	46.281
ENSORLG00020010431	-	91	38.695	ENSORLG00020019255	-	88	39.323
ENSORLG00020010431	-	91	38.695	ENSORLG00020002198	-	89	39.095
ENSORLG00020010431	-	83	41.746	ENSORLG00020005060	-	93	41.746
ENSORLG00020010431	-	89	42.018	ENSORLG00020008688	-	89	42.034
ENSORLG00020010431	-	74	64.167	ENSORLG00020016049	-	89	64.167
ENSORLG00020010431	-	71	41.810	ENSORLG00020018405	-	90	41.810
ENSORLG00020010431	-	62	45.172	ENSORLG00020014062	-	81	45.172
ENSORLG00020010431	-	62	46.154	ENSORLG00020009908	-	90	46.154
ENSORLG00020010431	-	62	43.046	ENSORLG00020007946	-	84	42.810
ENSORLG00020010431	-	84	39.398	ENSORLG00020017660	-	91	39.230

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020010431	-	73	51.046	ENSAOCG00000011105	-	90	51.037	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010431	-	62	46.829	ENSAPEG00000006041	-	87	46.743	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010431	-	72	44.847	ENSATEG00000013493	-	86	44.568	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010431	-	54	41.758	ENSATEG00000007647	-	100	41.209	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010431	-	72	45.125	ENSATEG00000015818	-	90	44.708	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010431	-	63	43.561	ENSATEG00000016515	-	98	43.084	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010431	-	72	44.290	ENSATEG00000007199	-	91	43.872	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010431	-	72	45.265	ENSATEG00000010400	-	90	44.847	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010431	-	68	47.934	ENSATEG00000022147	-	80	47.934	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010431	-	55	48.540	ENSATEG00000019303	-	87	47.993	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010431	-	72	44.290	ENSATEG00000019513	-	90	44.011	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010431	-	51	44.814	ENSATEG00000007276	-	94	44.227	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010431	-	63	42.925	ENSATEG00000009980	-	98	42.448	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010431	-	56	43.608	ENSACLG00000005642	-	97	43.608	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	77	43.902	ENSACLG00000023885	-	89	43.902	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	60	47.483	ENSACLG00000008859	-	87	47.483	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	71	44.306	ENSACLG00000027996	-	89	44.306	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	77	43.902	ENSACLG00000002468	-	89	43.902	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	71	43.889	ENSACLG00000020864	-	89	43.889	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	55	47.874	ENSACLG00000017297	-	99	47.874	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	57	48.313	ENSACLG00000014746	-	87	48.313	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	57	48.313	ENSACLG00000003670	-	87	48.313	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	56	46.942	ENSACLG00000015704	-	91	46.942	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	57	48.135	ENSACLG00000005547	-	87	48.135	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	77	43.902	ENSACLG00000008391	-	89	43.902	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	77	44.031	ENSACLG00000004826	-	89	44.031	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	69	40.429	ENSACLG00000004144	-	87	41.379	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	71	43.697	ENSACLG00000002614	-	99	43.697	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	62	47.222	ENSACLG00000000736	-	86	47.222	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	77	43.902	ENSACLG00000021287	-	89	43.902	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010431	-	62	45.351	ENSAMXG00000030235	-	97	45.082	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010431	-	54	47.584	ENSAMXG00000033549	-	87	47.477	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010431	-	99	67.042	ENSAMXG00000037852	-	92	67.042	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010431	-	86	41.472	ENSAMXG00000040782	-	91	40.563	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010431	-	75	41.545	ENSAMXG00000034383	-	97	41.310	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010431	-	52	48.940	ENSAMXG00000035603	-	86	49.038	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010431	-	86	41.404	ENSAMXG00000040632	-	91	41.197	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010431	-	62	44.571	ENSAMXG00000033627	-	87	44.171	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010431	-	85	41.784	ENSAMXG00000036981	-	100	41.578	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010431	-	86	41.841	ENSAMXG00000029285	-	91	41.637	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010431	-	63	44.637	ENSCSEG00000013023	-	81	44.374	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020010431	-	77	41.899	ENSCSEG00000014137	-	90	41.677	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020010431	-	59	45.286	ENSCSEG00000013241	-	88	44.915	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020010431	-	58	46.341	ENSIPUG00000013666	-	88	46.354	Ictalurus_punctatus
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ENSORLG00020010431	-	65	49.137	ENSKMAG00000010396	-	87	49.137	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020010431	-	67	65.802	ENSKMAG00000014228	-	93	65.798	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020010431	-	65	49.137	ENSKMAG00000001967	-	87	49.137	Kryptolebias_marmoratus
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