EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020010495 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3313 bases
Position: chr11:13564827-13568139
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020027504	RVT_1	PF00078.27	9.5e-43	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020016029	-	3313	-	ENSORLP00020027504	926 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020010495	-	100	98.596	ENSORLG00020010522	-	93	98.596
ENSORLG00020010495	-	100	98.380	ENSORLG00020014816	-	93	98.380
ENSORLG00020010495	-	84	97.826	ENSORLG00020004369	-	100	97.826
ENSORLG00020010495	-	100	98.380	ENSORLG00020011016	-	93	98.380
ENSORLG00020010495	-	100	98.488	ENSORLG00020000686	-	93	98.488
ENSORLG00020010495	-	84	98.593	ENSORLG00020015867	-	100	98.593
ENSORLG00020010495	-	92	98.592	ENSORLG00020002609	-	100	98.592
ENSORLG00020010495	-	78	30.829	ENSORLG00020005057	-	100	30.662
ENSORLG00020010495	-	100	98.704	ENSORLG00020003054	-	93	98.704
ENSORLG00020010495	-	54	35.701	ENSORLG00020018851	-	88	35.010
ENSORLG00020010495	-	95	32.792	ENSORLG00020009508	-	84	32.283
ENSORLG00020010495	-	100	98.704	ENSORLG00020003643	-	93	98.704
ENSORLG00020010495	-	98	32.062	ENSORLG00020009614	-	95	32.255
ENSORLG00020010495	-	100	97.840	ENSORLG00020017275	-	93	97.840
ENSORLG00020010495	-	95	31.906	ENSORLG00020020316	-	95	31.857
ENSORLG00020010495	-	94	32.747	ENSORLG00020007707	-	84	32.131
ENSORLG00020010495	-	75	32.377	ENSORLG00020001879	-	80	33.333
ENSORLG00020010495	-	100	98.272	ENSORLG00020015225	-	93	98.272
ENSORLG00020010495	-	100	98.704	ENSORLG00020012851	-	93	98.704
ENSORLG00020010495	-	100	98.272	ENSORLG00020020339	-	93	98.272
ENSORLG00020010495	-	100	98.596	ENSORLG00020005358	-	92	98.596
ENSORLG00020010495	-	82	97.493	ENSORLG00020020442	-	100	97.493
ENSORLG00020010495	-	100	98.596	ENSORLG00020018358	-	93	98.596
ENSORLG00020010495	-	100	97.948	ENSORLG00020009902	-	93	97.948
ENSORLG00020010495	-	100	98.164	ENSORLG00020001429	-	93	98.164
ENSORLG00020010495	-	100	98.704	ENSORLG00020007996	-	93	98.704
ENSORLG00020010495	-	100	97.840	ENSORLG00020017598	-	93	97.840
ENSORLG00020010495	-	100	98.380	ENSORLG00020014382	-	93	98.380
ENSORLG00020010495	-	100	98.488	ENSORLG00020020415	-	93	98.488
ENSORLG00020010495	-	57	33.925	ENSORLG00020011847	-	81	34.690
ENSORLG00020010495	-	67	97.573	ENSORLG00020002162	-	89	97.573
ENSORLG00020010495	-	90	32.276	ENSORLG00020002875	-	97	32.503
ENSORLG00020010495	-	100	98.164	ENSORLG00020010084	-	93	98.164
ENSORLG00020010495	-	100	98.272	ENSORLG00020022082	-	92	98.272
ENSORLG00020010495	-	100	98.704	ENSORLG00020002402	-	92	98.704
ENSORLG00020010495	-	100	97.840	ENSORLG00020004913	-	93	97.840
ENSORLG00020010495	-	84	98.210	ENSORLG00020005006	-	100	98.210
ENSORLG00020010495	-	100	98.704	ENSORLG00020009527	-	93	98.704

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020010495	-	94	97.018	ENSATEG00000009051	-	92	97.018	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010495	-	93	96.292	ENSATEG00000017712	-	100	96.292	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010495	-	67	95.185	ENSATEG00000004689	-	90	95.185	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010495	-	100	96.436	ENSATEG00000005213	-	93	96.436	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010495	-	100	95.572	ENSATEG00000020668	-	92	95.572	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010495	-	100	95.896	ENSATEG00000022633	-	93	95.896	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010495	-	99	95.987	ENSATEG00000009591	-	93	95.987	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010495	-	91	95.514	ENSATEG00000007887	-	99	95.514	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010495	-	100	77.862	ENSCSEG00000015459	-	100	77.862	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020010495	-	99	77.935	ENSCSEG00000014508	-	90	77.935	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020010495	-	100	77.862	ENSCSEG00000010768	-	91	77.862	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020010495	-	100	77.862	ENSCSEG00000004965	-	91	77.862	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020010495	-	72	34.230	ENSLOCG00000001168	-	87	40.889	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020010495	-	100	98.380	ENSORLG00000027645	-	93	98.380	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	68	97.933	ENSORLG00000025112	-	90	97.933	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.272	ENSORLG00000024556	-	93	98.272	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	95	97.506	ENSORLG00000030541	-	91	97.506	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.272	ENSORLG00000028518	-	93	98.272	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.488	ENSORLG00000030049	-	100	98.488	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.056	ENSORLG00000027862	-	93	98.056	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	97	98.322	ENSORLG00000030514	-	95	98.322	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.272	ENSORLG00000024622	-	93	98.272	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	97.948	ENSORLG00000022907	-	93	97.948	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.596	ENSORLG00000026112	-	93	98.596	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.272	ENSORLG00000024473	-	93	98.272	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.272	ENSORLG00000024801	-	93	98.272	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.164	ENSORLG00000023626	-	93	98.164	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.164	ENSORLG00000024537	-	93	98.164	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.056	ENSORLG00000024533	-	93	98.056	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.164	ENSORLG00000026850	-	93	98.164	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.272	ENSORLG00000023624	-	93	98.272	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	97.840	ENSORLG00000028249	-	93	97.840	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.272	ENSORLG00000023217	-	93	98.272	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.380	ENSORLG00000022044	-	93	98.380	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020010495	-	100	98.380	ENSORLG00000029283	-	93	98.380	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020010495	-	100	97.948	ENSORLG00000024101	-	93	97.948	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.488	ENSORLG00000023036	-	93	98.488	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.164	ENSORLG00000025556	-	93	98.164	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.164	ENSORLG00000024333	-	93	98.164	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.488	ENSORLG00000021860	-	93	98.488	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020010495	-	100	98.272	ENSORLG00000026767	-	93	98.272	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.272	ENSORLG00000026392	-	100	98.272	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020010495	-	100	98.164	ENSORLG00000022102	-	93	98.164	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	87	97.260	ENSORLG00000022101	-	91	97.260	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020010495	-	100	97.948	ENSORLG00000022049	-	100	97.948	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.380	ENSORLG00000025138	-	93	98.380	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020010495	-	90	98.441	ENSORLG00000026815	-	88	98.441	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.704	ENSORLG00000023676	-	93	98.704	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.056	ENSORLG00000021789	-	93	98.056	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	65	97.333	ENSORLG00000029231	-	89	97.333	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.380	ENSORLG00000029970	-	93	98.380	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	97.840	ENSORLG00000025543	-	93	97.840	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.812	ENSORLG00000026507	-	93	98.812	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.380	ENSORLG00000029692	-	93	98.380	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010495	-	100	98.164	ENSORLG00000026123	-	93	98.164	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020010495	-	100	98.596	ENSORLG00000029331	-	93	98.596	Oryzias_latipes
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