EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020010647 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5738 bases
Position: chr2:4692561-4698298
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020027605	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-46	1	8
ENSORLP00020027605	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-46	2	8
ENSORLP00020027605	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-46	3	8
ENSORLP00020027605	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-46	4	8
ENSORLP00020027605	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-46	5	8
ENSORLP00020027605	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-46	6	8
ENSORLP00020027605	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-46	7	8
ENSORLP00020027605	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-46	8	8
ENSORLP00020027605	zf-met	PF12874.7	6.7e-22	1	6
ENSORLP00020027605	zf-met	PF12874.7	6.7e-22	2	6
ENSORLP00020027605	zf-met	PF12874.7	6.7e-22	3	6
ENSORLP00020027605	zf-met	PF12874.7	6.7e-22	4	6
ENSORLP00020027605	zf-met	PF12874.7	6.7e-22	5	6
ENSORLP00020027605	zf-met	PF12874.7	6.7e-22	6	6

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020016226	-	906	-	ENSORLP00020027605	301 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020010647	-	86	54.783	ENSORLG00020018069	-	92	55.300
ENSORLG00020010647	-	93	67.197	ENSORLG00020011075	-	85	67.197
ENSORLG00020010647	-	93	68.511	ENSORLG00020009419	-	80	79.612
ENSORLG00020010647	-	85	48.193	ENSORLG00020000219	-	72	48.193
ENSORLG00020010647	-	93	63.898	ENSORLG00020010171	-	95	71.233
ENSORLG00020010647	-	78	48.214	ENSORLG00020004162	znf341	55	48.214
ENSORLG00020010647	-	93	50.355	ENSORLG00020009184	-	89	50.896
ENSORLG00020010647	-	91	59.873	ENSORLG00020016754	-	89	56.279
ENSORLG00020010647	-	81	49.057	ENSORLG00020018791	-	81	49.057
ENSORLG00020010647	-	93	67.708	ENSORLG00020010020	-	89	71.495
ENSORLG00020010647	-	91	55.082	ENSORLG00020006148	-	65	56.425
ENSORLG00020010647	-	82	44.776	ENSORLG00020004889	ZNF319	91	44.776
ENSORLG00020010647	-	83	40.244	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	59	35.354
ENSORLG00020010647	-	85	44.318	ENSORLG00020018503	-	76	38.776
ENSORLG00020010647	-	96	56.436	ENSORLG00020017850	-	98	52.655
ENSORLG00020010647	-	95	57.277	ENSORLG00020017514	-	90	57.277
ENSORLG00020010647	-	91	55.116	ENSORLG00020010636	-	76	57.491
ENSORLG00020010647	-	93	60.076	ENSORLG00020000246	-	95	64.681
ENSORLG00020010647	-	87	59.091	ENSORLG00020007074	-	92	59.477
ENSORLG00020010647	-	85	56.463	ENSORLG00020009965	-	87	48.515
ENSORLG00020010647	-	89	70.000	ENSORLG00020011149	-	98	70.000
ENSORLG00020010647	-	97	59.302	ENSORLG00020008891	-	93	64.851
ENSORLG00020010647	-	89	54.585	ENSORLG00020017483	-	93	54.585
ENSORLG00020010647	-	95	58.042	ENSORLG00020007967	-	94	63.235
ENSORLG00020010647	-	91	65.482	ENSORLG00020004353	-	96	65.482
ENSORLG00020010647	-	74	52.577	ENSORLG00020017528	-	71	52.577
ENSORLG00020010647	-	70	44.538	ENSORLG00020001922	-	63	43.182
ENSORLG00020010647	-	95	69.869	ENSORLG00020009857	-	95	69.869
ENSORLG00020010647	-	86	52.736	ENSORLG00020015703	-	51	52.736
ENSORLG00020010647	-	77	39.604	ENSORLG00020001758	-	68	34.959
ENSORLG00020010647	-	95	65.000	ENSORLG00020011234	-	90	64.407
ENSORLG00020010647	-	74	39.316	ENSORLG00020001791	-	51	39.316
ENSORLG00020010647	-	95	64.561	ENSORLG00020010880	-	80	64.286
ENSORLG00020010647	-	86	49.367	ENSORLG00020001912	znf236	73	49.367
ENSORLG00020010647	-	84	43.182	ENSORLG00020018685	znf319b	91	40.741
ENSORLG00020010647	-	88	51.142	ENSORLG00020009139	-	98	46.961
ENSORLG00020010647	-	85	39.583	ENSORLG00020012967	scrt1b	55	38.889
ENSORLG00020010647	-	93	61.207	ENSORLG00020009089	-	70	72.414
ENSORLG00020010647	-	84	52.511	ENSORLG00020001707	-	77	52.511
ENSORLG00020010647	-	79	41.270	ENSORLG00020009554	-	78	41.270
ENSORLG00020010647	-	84	60.731	ENSORLG00020007018	-	77	60.731
ENSORLG00020010647	-	96	59.143	ENSORLG00020008933	-	89	61.472
ENSORLG00020010647	-	90	34.211	ENSORLG00020014595	PRDM15	52	34.211
ENSORLG00020010647	-	92	51.376	ENSORLG00020000639	-	53	51.376
ENSORLG00020010647	-	78	69.853	ENSORLG00020004370	-	82	69.853
ENSORLG00020010647	-	77	42.339	ENSORLG00020018495	-	64	42.339
ENSORLG00020010647	-	90	63.187	ENSORLG00020008424	-	92	63.187
ENSORLG00020010647	-	81	48.673	ENSORLG00020019341	-	75	66.667
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ENSORLG00020010647	-	80	35.577	ENSORLG00020005815	-	75	35.577
ENSORLG00020010647	-	97	63.481	ENSORLG00020010953	-	89	63.481
ENSORLG00020010647	-	88	47.727	ENSORLG00020010950	-	95	51.887
ENSORLG00020010647	-	89	50.617	ENSORLG00020019227	-	71	50.617
ENSORLG00020010647	-	93	39.583	ENSORLG00020002128	-	93	40.394
ENSORLG00020010647	-	81	42.708	ENSORLG00020000009	znf710b	51	37.931
ENSORLG00020010647	-	94	60.494	ENSORLG00020008240	-	59	56.129
ENSORLG00020010647	-	94	47.737	ENSORLG00020021196	-	61	47.737
ENSORLG00020010647	-	94	66.537	ENSORLG00020010916	-	71	66.537
ENSORLG00020010647	-	73	41.176	ENSORLG00020019789	snai1a	53	41.176
ENSORLG00020010647	-	87	51.429	ENSORLG00020016037	-	94	51.598
ENSORLG00020010647	-	95	66.337	ENSORLG00020000161	-	93	66.337
ENSORLG00020010647	-	93	55.556	ENSORLG00020008484	-	96	59.298
ENSORLG00020010647	-	81	33.891	ENSORLG00020010285	znf646	72	33.891
ENSORLG00020010647	-	84	43.243	ENSORLG00020008744	-	67	43.243
ENSORLG00020010647	-	85	62.212	ENSORLG00020017164	-	96	58.921
ENSORLG00020010647	-	87	46.185	ENSORLG00020007599	-	73	44.322
ENSORLG00020010647	-	85	42.945	ENSORLG00020002817	GFI1	50	42.945
ENSORLG00020010647	-	78	36.607	ENSORLG00020007790	zbtb48	56	36.607
ENSORLG00020010647	-	82	43.885	ENSORLG00020003719	GFI1B	54	43.885
ENSORLG00020010647	-	86	57.511	ENSORLG00020000481	-	82	57.511
ENSORLG00020010647	-	94	65.254	ENSORLG00020010250	-	89	62.054
ENSORLG00020010647	-	66	42.857	ENSORLG00020010932	-	71	42.857
ENSORLG00020010647	-	95	58.824	ENSORLG00020020419	-	97	58.824
ENSORLG00020010647	-	75	44.030	ENSORLG00020008787	snai2	55	44.030
ENSORLG00020010647	-	93	81.106	ENSORLG00020010560	-	93	74.330
ENSORLG00020010647	-	83	47.273	ENSORLG00020016666	-	74	47.273
ENSORLG00020010647	-	76	50.000	ENSORLG00020005132	-	71	50.000
ENSORLG00020010647	-	77	42.358	ENSORLG00020018051	prdm5	73	42.358
ENSORLG00020010647	-	89	42.132	ENSORLG00020018921	-	84	40.000
ENSORLG00020010647	-	88	69.072	ENSORLG00020009180	-	96	64.103
ENSORLG00020010647	-	80	39.906	ENSORLG00020006144	-	77	41.520
ENSORLG00020010647	-	93	63.429	ENSORLG00020008018	-	78	63.429
ENSORLG00020010647	-	95	71.491	ENSORLG00020009943	-	94	71.491
ENSORLG00020010647	-	82	44.068	ENSORLG00020006820	-	77	44.068
ENSORLG00020010647	-	75	31.447	ENSORLG00020010937	patz1	61	33.103
ENSORLG00020010647	-	77	50.926	ENSORLG00020010038	-	55	50.926
ENSORLG00020010647	-	95	68.996	ENSORLG00020008346	-	88	68.996
ENSORLG00020010647	-	93	61.481	ENSORLG00020021857	-	61	64.557

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020010647	-	85	51.145	ENSAPOG00000010330	-	77	51.145	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010647	-	88	45.968	ENSAPOG00000010645	-	61	45.968	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010647	-	75	55.556	ENSAPOG00000003414	-	99	55.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010647	-	86	49.405	ENSAPOG00000000601	-	77	49.405	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010647	-	92	48.810	ENSAPOG00000014372	-	77	48.810	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010647	-	86	58.904	ENSAPOG00000016615	-	87	58.904	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010647	-	80	43.038	ENSAOCG00000007347	-	78	43.038	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010647	-	73	49.425	ENSAPEG00000004256	-	65	49.425	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010647	-	93	47.982	ENSATEG00000007658	-	72	47.982	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010647	-	99	48.780	ENSAMXG00000013492	-	98	49.215	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010647	-	81	47.183	ENSCING00000024717	-	77	47.183	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020010647	-	86	54.545	ENSCVAG00000018383	-	87	54.545	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020010647	-	80	42.157	ENSCVAG00000011712	-	52	42.157	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020010647	-	77	51.528	ENSEBUG00000006666	-	84	51.528	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010647	-	76	43.617	ENSEBUG00000001308	-	64	43.617	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010647	-	76	51.408	ENSEBUG00000015472	-	60	48.927	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010647	-	78	46.569	ENSEBUG00000000422	-	65	46.569	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010647	-	78	50.439	ENSEBUG00000014768	-	73	50.439	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010647	-	78	45.089	ENSEBUG00000003418	-	95	45.089	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010647	-	95	47.598	ENSEBUG00000001569	-	83	47.598	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010647	-	80	46.250	ENSEBUG00000003232	-	59	46.250	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010647	-	87	48.235	ENSEBUG00000000436	-	83	48.235	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010647	-	84	47.090	ENSEBUG00000013874	-	56	44.351	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010647	-	86	54.483	ENSELUG00000000281	-	59	54.483	Esox_lucius
ENSORLG00020010647	-	84	50.314	ENSELUG00000022965	-	64	50.314	Esox_lucius
ENSORLG00020010647	-	95	55.947	ENSELUG00000007694	-	93	55.947	Esox_lucius
ENSORLG00020010647	-	87	46.535	ENSELUG00000022942	-	62	50.000	Esox_lucius
ENSORLG00020010647	-	76	42.063	ENSGMOG00000016007	-	82	42.063	Gadus_morhua
ENSORLG00020010647	-	80	51.111	ENSGMOG00000005588	-	100	51.111	Gadus_morhua
ENSORLG00020010647	-	96	52.475	ENSGAFG00000021139	-	98	52.475	Gambusia_affinis
ENSORLG00020010647	-	74	54.762	ENSGAFG00000021143	-	56	54.762	Gambusia_affinis
ENSORLG00020010647	-	74	50.943	ENSGAGG00000010492	-	72	50.943	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020010647	-	97	37.037	ENSHBUG00000007316	-	91	39.106	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020010647	-	82	46.753	ENSHBUG00000003529	-	97	46.753	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020010647	-	82	50.299	ENSHCOG00000014781	-	53	50.299	Hippocampus_comes
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