EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020010916 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1683 bases
Position: chr2:4491791-4493473
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020027803	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-54	1	10
ENSORLP00020027803	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-54	2	10
ENSORLP00020027803	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-54	3	10
ENSORLP00020027803	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-54	4	10
ENSORLP00020027803	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-54	5	10
ENSORLP00020027803	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-54	6	10
ENSORLP00020027803	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-54	7	10
ENSORLP00020027803	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-54	8	10
ENSORLP00020027803	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-54	9	10
ENSORLP00020027803	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-54	10	10
ENSORLP00020027803	zf-met	PF12874.7	4e-17	1	2
ENSORLP00020027803	zf-met	PF12874.7	4e-17	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020016579	-	1683	-	ENSORLP00020027803	560 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020010916	-	56	42.857	ENSORLG00020003719	GFI1B	54	42.857
ENSORLG00020010916	-	59	39.667	ENSORLG00020008744	-	66	39.667
ENSORLG00020010916	-	91	73.913	ENSORLG00020009419	-	98	93.103
ENSORLG00020010916	-	62	41.071	ENSORLG00020006820	-	67	43.066
ENSORLG00020010916	-	89	40.339	ENSORLG00020007599	-	88	45.228
ENSORLG00020010916	-	88	65.763	ENSORLG00020009857	-	98	65.763
ENSORLG00020010916	-	96	63.452	ENSORLG00020004313	-	77	63.452
ENSORLG00020010916	-	58	52.466	ENSORLG00020001707	-	75	52.466
ENSORLG00020010916	-	68	69.710	ENSORLG00020009180	-	93	69.710
ENSORLG00020010916	-	88	55.378	ENSORLG00020009184	-	98	55.378
ENSORLG00020010916	-	93	73.585	ENSORLG00020010880	-	97	73.585
ENSORLG00020010916	-	69	61.240	ENSORLG00020000246	-	87	67.372
ENSORLG00020010916	-	92	59.794	ENSORLG00020021857	-	81	62.500
ENSORLG00020010916	-	54	35.333	ENSORLG00020001758	-	56	35.333
ENSORLG00020010916	-	79	46.667	ENSORLG00020000219	-	84	46.667
ENSORLG00020010916	-	56	38.554	ENSORLG00020009554	-	76	38.554
ENSORLG00020010916	-	54	44.776	ENSORLG00020008787	snai2	53	44.776
ENSORLG00020010916	-	94	48.318	ENSORLG00020017483	-	96	52.282
ENSORLG00020010916	-	71	66.537	ENSORLG00020010647	-	94	66.537
ENSORLG00020010916	-	62	35.955	ENSORLG00020010285	znf646	90	35.955
ENSORLG00020010916	-	59	30.870	ENSORLG00020005815	-	73	31.169
ENSORLG00020010916	-	54	38.462	ENSORLG00020012967	scrt1b	53	38.462
ENSORLG00020010916	-	94	59.686	ENSORLG00020008240	-	75	59.686
ENSORLG00020010916	-	59	50.450	ENSORLG00020019341	-	75	70.588
ENSORLG00020010916	-	63	55.769	ENSORLG00020017164	-	99	53.282
ENSORLG00020010916	-	79	61.883	ENSORLG00020008933	-	99	59.494
ENSORLG00020010916	-	72	62.564	ENSORLG00020011149	-	98	65.495
ENSORLG00020010916	-	64	37.838	ENSORLG00020007790	zbtb48	54	37.838
ENSORLG00020010916	-	91	53.182	ENSORLG00020015703	-	77	53.182
ENSORLG00020010916	-	76	36.585	ENSORLG00020012229	zbtb41	65	36.585
ENSORLG00020010916	-	55	47.143	ENSORLG00020000264	-	52	47.143
ENSORLG00020010916	-	73	33.978	ENSORLG00020006144	-	69	40.102
ENSORLG00020010916	-	96	53.962	ENSORLG00020006148	-	97	53.962
ENSORLG00020010916	-	61	30.263	ENSORLG00020010937	patz1	58	30.859
ENSORLG00020010916	-	64	75.439	ENSORLG00020010636	-	89	75.439
ENSORLG00020010916	-	57	66.341	ENSORLG00020004353	-	96	66.341
ENSORLG00020010916	-	90	46.500	ENSORLG00020018921	-	94	43.882
ENSORLG00020010916	-	93	39.442	ENSORLG00020013114	zbtb47b	57	39.442
ENSORLG00020010916	-	64	72.917	ENSORLG00020004370	-	98	71.111
ENSORLG00020010916	-	69	42.331	ENSORLG00020002817	GFI1	61	42.331
ENSORLG00020010916	-	55	37.267	ENSORLG00020018503	-	68	37.267
ENSORLG00020010916	-	58	51.210	ENSORLG00020009139	-	98	45.726
ENSORLG00020010916	-	86	56.633	ENSORLG00020007074	-	97	56.633
ENSORLG00020010916	-	55	44.304	ENSORLG00020010932	-	71	44.304
ENSORLG00020010916	-	92	57.196	ENSORLG00020008018	-	93	57.196
ENSORLG00020010916	-	94	68.667	ENSORLG00020009943	-	99	68.667
ENSORLG00020010916	-	59	53.398	ENSORLG00020010950	-	95	53.398
ENSORLG00020010916	-	84	68.493	ENSORLG00020010171	-	93	71.154
ENSORLG00020010916	-	81	73.187	ENSORLG00020009089	-	86	69.512
ENSORLG00020010916	-	55	42.574	ENSORLG00020006433	-	79	42.574
ENSORLG00020010916	-	92	62.946	ENSORLG00020007967	-	97	59.901
ENSORLG00020010916	-	59	40.364	ENSORLG00020018791	-	83	40.364
ENSORLG00020010916	-	91	71.311	ENSORLG00020010953	-	97	71.311
ENSORLG00020010916	-	74	48.214	ENSORLG00020004162	znf341	52	48.214
ENSORLG00020010916	-	86	50.000	ENSORLG00020010250	-	87	60.797
ENSORLG00020010916	-	96	56.535	ENSORLG00020008891	-	99	66.667
ENSORLG00020010916	-	84	65.098	ENSORLG00020011234	-	97	65.098
ENSORLG00020010916	-	91	30.000	ENSORLG00020010923	-	65	30.000
ENSORLG00020010916	-	59	46.512	ENSORLG00020005132	-	74	46.512
ENSORLG00020010916	-	56	55.049	ENSORLG00020018069	-	90	49.038
ENSORLG00020010916	-	58	66.245	ENSORLG00020008424	-	87	66.245
ENSORLG00020010916	-	56	59.797	ENSORLG00020007018	-	77	59.797
ENSORLG00020010916	-	86	69.192	ENSORLG00020000161	-	95	69.192
ENSORLG00020010916	-	58	52.846	ENSORLG00020016037	-	93	52.846
ENSORLG00020010916	-	96	50.000	ENSORLG00020000639	-	84	50.000
ENSORLG00020010916	-	54	37.500	ENSORLG00020001791	-	51	37.500
ENSORLG00020010916	-	61	50.336	ENSORLG00020009965	-	72	50.336
ENSORLG00020010916	-	55	32.911	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	98	32.911
ENSORLG00020010916	-	85	48.372	ENSORLG00020010038	-	96	48.372
ENSORLG00020010916	-	54	41.748	ENSORLG00020019789	snai1a	55	41.748
ENSORLG00020010916	-	80	36.041	ENSORLG00020000009	znf710b	51	36.041
ENSORLG00020010916	-	89	77.350	ENSORLG00020010560	-	95	74.468
ENSORLG00020010916	-	58	38.636	ENSORLG00020004889	ZNF319	87	38.636
ENSORLG00020010916	-	55	53.234	ENSORLG00020017528	-	73	53.234
ENSORLG00020010916	-	60	62.162	ENSORLG00020020419	-	78	48.846
ENSORLG00020010916	-	56	58.228	ENSORLG00020016754	-	89	57.848
ENSORLG00020010916	-	58	41.017	ENSORLG00020018495	-	57	40.217
ENSORLG00020010916	-	68	87.879	ENSORLG00020008346	-	89	87.879
ENSORLG00020010916	-	79	55.584	ENSORLG00020008484	-	98	56.710
ENSORLG00020010916	-	81	68.388	ENSORLG00020011075	-	93	70.925
ENSORLG00020010916	-	90	57.647	ENSORLG00020000481	-	96	57.647
ENSORLG00020010916	-	84	68.627	ENSORLG00020010020	-	98	68.627
ENSORLG00020010916	-	56	57.273	ENSORLG00020017514	-	74	57.273
ENSORLG00020010916	-	67	39.423	ENSORLG00020018051	prdm5	73	39.423
ENSORLG00020010916	-	56	35.484	ENSORLG00020018685	znf319b	89	35.256
ENSORLG00020010916	-	90	54.982	ENSORLG00020017850	-	95	52.632
ENSORLG00020010916	-	68	39.615	ENSORLG00020002128	-	94	39.615
ENSORLG00020010916	-	91	52.294	ENSORLG00020021196	-	81	52.294
ENSORLG00020010916	-	99	70.572	ENSORLG00020010804	-	96	78.788
ENSORLG00020010916	-	56	45.378	ENSORLG00020001922	-	60	43.939
ENSORLG00020010916	-	69	45.833	ENSORLG00020001912	znf236	71	50.476
ENSORLG00020010916	-	90	46.429	ENSORLG00020016666	-	93	46.429

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020010916	-	55	57.025	ENSAPOG00000010330	-	72	57.025	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010916	-	52	57.143	ENSAPOG00000003414	-	97	57.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010916	-	86	48.673	ENSAPOG00000010645	-	87	48.673	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010916	-	64	54.167	ENSAPOG00000000601	-	75	54.167	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010916	-	57	60.811	ENSAPOG00000016615	-	87	60.811	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010916	-	56	52.381	ENSAPOG00000014372	-	65	52.381	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010916	-	56	45.570	ENSAOCG00000007347	-	76	45.570	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010916	-	58	48.837	ENSAPEG00000004256	-	65	48.837	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010916	-	90	58.955	ENSATEG00000007658	-	70	50.256	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010916	-	61	46.729	ENSAMXG00000013492	-	97	46.729	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010916	-	55	47.183	ENSCING00000024717	-	75	47.183	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020010916	-	55	41.060	ENSCVAG00000011712	-	51	41.060	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020010916	-	62	42.486	ENSCVAG00000018383	-	81	42.486	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020010916	-	56	45.277	ENSEBUG00000003418	-	95	45.277	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010916	-	56	45.872	ENSEBUG00000000422	-	63	45.872	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010916	-	57	50.379	ENSEBUG00000014768	-	70	50.379	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010916	-	54	46.947	ENSEBUG00000015472	-	60	46.947	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010916	-	54	50.000	ENSEBUG00000000436	-	67	50.000	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010916	-	56	49.826	ENSEBUG00000006666	-	77	49.826	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010916	-	57	52.510	ENSEBUG00000001569	-	79	52.510	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010916	-	56	49.375	ENSEBUG00000013126	-	53	49.375	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010916	-	56	42.955	ENSEBUG00000003232	-	57	42.955	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010916	-	56	51.759	ENSEBUG00000013874	-	50	51.759	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010916	-	54	47.368	ENSEBUG00000001308	-	64	47.368	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010916	-	96	49.270	ENSELUG00000022942	-	83	45.662	Esox_lucius
ENSORLG00020010916	-	95	53.020	ENSELUG00000000281	-	76	53.020	Esox_lucius
ENSORLG00020010916	-	61	53.667	ENSELUG00000007694	-	75	53.667	Esox_lucius
ENSORLG00020010916	-	59	43.902	ENSGMOG00000016007	-	85	43.902	Gadus_morhua
ENSORLG00020010916	-	55	49.630	ENSGMOG00000005588	-	100	49.630	Gadus_morhua
ENSORLG00020010916	-	54	52.336	ENSGAFG00000021143	-	92	52.336	Gambusia_affinis
ENSORLG00020010916	-	56	52.400	ENSGAFG00000021139	-	86	52.400	Gambusia_affinis
ENSORLG00020010916	-	56	52.071	ENSGAGG00000010492	-	73	52.695	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020010916	-	56	41.985	ENSHBUG00000007316	-	67	41.985	Haplochromis_burtoni
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