EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020010950 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14303 bases
Position: chr11:3174239-3188541
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020010062	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-53	1	10
ENSORLP00020010062	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-53	2	10
ENSORLP00020010062	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-53	3	10
ENSORLP00020010062	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-53	4	10
ENSORLP00020010062	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-53	5	10
ENSORLP00020010062	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-53	6	10
ENSORLP00020010062	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-53	7	10
ENSORLP00020010062	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-53	8	10
ENSORLP00020010062	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-53	9	10
ENSORLP00020010062	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-53	10	10
ENSORLP00020010054	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-22	1	4
ENSORLP00020010054	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-22	2	4
ENSORLP00020010054	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-22	3	4
ENSORLP00020010054	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-22	4	4
ENSORLP00020010062	zf-met	PF12874.7	5.6e-17	1	1
ENSORLP00020010054	zf-met	PF12874.7	1.5e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020016604	-	6491	-	ENSORLP00020010062	633 (aa)	-	-
ENSORLT00020031162	-	342	-	ENSORLP00020010054	113 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020010950	-	98	44.860	ENSORLG00020018051	prdm5	74	34.298
ENSORLG00020010950	-	97	46.067	ENSORLG00020001922	-	86	42.647
ENSORLG00020010950	-	97	49.541	ENSORLG00020010038	-	72	42.683
ENSORLG00020010950	-	97	53.659	ENSORLG00020010636	-	73	53.659
ENSORLG00020010950	-	94	49.462	ENSORLG00020016754	-	88	49.057
ENSORLG00020010950	-	96	38.182	ENSORLG00020010937	patz1	60	33.080
ENSORLG00020010950	-	94	57.447	ENSORLG00020010880	-	80	50.943
ENSORLG00020010950	-	97	60.526	ENSORLG00020006433	-	91	49.541
ENSORLG00020010950	-	100	44.144	ENSORLG00020002128	-	99	31.830
ENSORLG00020010950	-	97	52.326	ENSORLG00020010250	-	86	54.762
ENSORLG00020010950	-	97	50.000	ENSORLG00020020419	-	84	50.000
ENSORLG00020010950	-	97	41.758	ENSORLG00020018921	-	70	41.758
ENSORLG00020010950	-	94	50.943	ENSORLG00020009089	-	57	50.943
ENSORLG00020010950	-	94	42.500	ENSORLG00020004889	ZNF319	93	31.762
ENSORLG00020010950	-	99	48.837	ENSORLG00020008346	-	87	47.778
ENSORLG00020010950	-	94	45.679	ENSORLG00020019227	-	92	49.558
ENSORLG00020010950	-	97	50.943	ENSORLG00020011075	-	76	50.943
ENSORLG00020010950	-	96	42.157	ENSORLG00020000639	-	54	41.667
ENSORLG00020010950	-	94	43.529	ENSORLG00020006144	-	72	43.396
ENSORLG00020010950	-	97	38.462	ENSORLG00020010285	znf646	88	33.000
ENSORLG00020010950	-	96	49.074	ENSORLG00020021196	-	51	44.898
ENSORLG00020010950	-	97	46.914	ENSORLG00020019341	-	91	61.765
ENSORLG00020010950	-	96	34.653	ENSORLG00020001758	-	56	32.955
ENSORLG00020010950	-	94	49.074	ENSORLG00020011234	-	76	47.179
ENSORLG00020010950	-	97	50.943	ENSORLG00020018069	-	89	50.943
ENSORLG00020010950	-	94	40.187	ENSORLG00020005212	wt1b	55	39.024
ENSORLG00020010950	-	97	50.943	ENSORLG00020010171	-	92	49.524
ENSORLG00020010950	-	97	52.381	ENSORLG00020007074	-	98	49.682
ENSORLG00020010950	-	94	47.222	ENSORLG00020006148	-	58	42.982
ENSORLG00020010950	-	97	47.312	ENSORLG00020018495	-	64	47.312
ENSORLG00020010950	-	94	46.316	ENSORLG00020004370	-	86	45.055
ENSORLG00020010950	-	97	37.143	ENSORLG00020014595	PRDM15	50	34.091
ENSORLG00020010950	-	94	49.057	ENSORLG00020015703	-	62	46.970
ENSORLG00020010950	-	97	49.057	ENSORLG00020008424	-	85	49.057
ENSORLG00020010950	-	99	45.833	ENSORLG00020000219	-	65	45.833
ENSORLG00020010950	-	95	51.887	ENSORLG00020009180	-	88	51.887
ENSORLG00020010950	-	93	41.121	ENSORLG00020001791	-	69	41.379
ENSORLG00020010950	-	94	54.839	ENSORLG00020009184	-	89	46.907
ENSORLG00020010950	-	95	51.887	ENSORLG00020010647	-	88	47.727
ENSORLG00020010950	-	94	48.352	ENSORLG00020010020	-	72	44.490
ENSORLG00020010950	-	96	42.202	ENSORLG00020003719	GFI1B	55	41.765
ENSORLG00020010950	-	97	50.943	ENSORLG00020008240	-	97	49.239
ENSORLG00020010950	-	94	47.170	ENSORLG00020021857	-	51	39.116
ENSORLG00020010950	-	97	45.122	ENSORLG00020016116	-	53	38.914
ENSORLG00020010950	-	79	62.857	ENSORLG00020002700	znf367	57	51.471
ENSORLG00020010950	-	97	52.830	ENSORLG00020008484	-	81	52.830
ENSORLG00020010950	-	97	48.113	ENSORLG00020008018	-	76	48.113
ENSORLG00020010950	-	98	49.057	ENSORLG00020017483	-	98	45.105
ENSORLG00020010950	-	96	43.902	ENSORLG00020018685	znf319b	84	43.902
ENSORLG00020010950	-	97	52.941	ENSORLG00020009857	-	92	52.941
ENSORLG00020010950	-	96	49.074	ENSORLG00020000246	-	96	45.198
ENSORLG00020010950	-	100	42.169	ENSORLG00020012967	scrt1b	63	35.417
ENSORLG00020010950	-	94	51.887	ENSORLG00020000481	-	87	50.000
ENSORLG00020010950	-	99	46.667	ENSORLG00020001912	znf236	73	39.286
ENSORLG00020010950	-	97	42.718	ENSORLG00020007790	zbtb48	82	37.755
ENSORLG00020010950	-	100	50.943	ENSORLG00020017164	-	98	50.943
ENSORLG00020010950	-	99	36.607	ENSORLG00020004162	znf341	51	43.860
ENSORLG00020010950	-	100	36.792	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	98	38.889
ENSORLG00020010950	-	97	55.046	ENSORLG00020009965	-	84	47.000
ENSORLG00020010950	-	95	51.948	ENSORLG00020010953	-	78	51.948
ENSORLG00020010950	-	95	51.351	ENSORLG00020008891	-	96	41.810
ENSORLG00020010950	-	97	50.000	ENSORLG00020017850	-	98	40.923
ENSORLG00020010950	-	97	43.137	ENSORLG00020018503	-	69	45.652
ENSORLG00020010950	-	94	50.909	ENSORLG00020016037	-	93	50.909
ENSORLG00020010950	-	94	49.057	ENSORLG00020009139	-	98	49.057
ENSORLG00020010950	-	97	50.602	ENSORLG00020008933	-	69	50.602
ENSORLG00020010950	-	94	53.012	ENSORLG00020009419	-	87	53.012
ENSORLG00020010950	-	97	42.727	ENSORLG00020009554	-	86	40.909
ENSORLG00020010950	-	94	49.020	ENSORLG00020004353	-	95	46.193
ENSORLG00020010950	-	96	45.455	ENSORLG00020005815	-	72	42.308
ENSORLG00020010950	-	94	53.763	ENSORLG00020011149	-	95	43.966
ENSORLG00020010950	-	95	53.398	ENSORLG00020010916	-	59	53.398
ENSORLG00020010950	-	97	50.943	ENSORLG00020007967	-	81	50.943
ENSORLG00020010950	-	96	50.943	ENSORLG00020017514	-	93	43.617
ENSORLG00020010950	-	94	54.762	ENSORLG00020010560	-	99	48.571
ENSORLG00020010950	-	94	55.952	ENSORLG00020000161	-	92	47.264
ENSORLG00020010950	-	96	40.594	ENSORLG00020006820	-	76	42.958
ENSORLG00020010950	-	100	54.717	ENSORLG00020009943	-	93	54.717
ENSORLG00020010950	-	94	51.429	ENSORLG00020007018	-	78	51.429
ENSORLG00020010950	-	94	50.476	ENSORLG00020007599	-	70	46.341
ENSORLG00020010950	-	94	48.780	ENSORLG00020005132	-	66	48.780
ENSORLG00020010950	-	97	51.429	ENSORLG00020001707	-	83	47.101
ENSORLG00020010950	-	97	43.750	ENSORLG00020018791	-	81	43.750
ENSORLG00020010950	-	96	50.877	ENSORLG00020016666	-	82	45.050
ENSORLG00020010950	-	97	40.385	ENSORLG00020000009	znf710b	54	40.385
ENSORLG00020010950	-	97	53.774	ENSORLG00020010804	-	94	53.774
ENSORLG00020010950	-	94	60.976	ENSORLG00020010932	-	82	59.551
ENSORLG00020010950	-	96	46.667	ENSORLG00020008744	-	50	46.667
ENSORLG00020010950	-	97	35.294	ENSORLG00020008787	snai2	73	36.471
ENSORLG00020010950	-	97	48.571	ENSORLG00020017528	-	70	48.571
ENSORLG00020010950	-	97	43.636	ENSORLG00020002817	GFI1	67	40.580

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020010950	-	97	45.652	ENSAPOG00000013493	-	79	45.652	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010950	-	94	51.887	ENSAPOG00000020116	-	92	42.353	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010950	-	100	42.202	ENSAPOG00000013499	-	67	47.619	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010950	-	96	65.714	ENSAPOG00000018586	-	98	46.893	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010950	-	97	53.191	ENSAPOG00000018492	-	62	53.191	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010950	-	97	50.000	ENSAPOG00000001054	-	94	49.524	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010950	-	94	53.571	ENSAPOG00000005187	-	60	43.850	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010950	-	97	50.000	ENSACIG00000004041	-	90	50.000	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020010950	-	95	53.704	ENSACIG00000007034	-	90	53.704	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020010950	-	96	49.524	ENSACIG00000022293	-	94	49.524	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020010950	-	95	51.887	ENSACIG00000023794	-	83	38.796	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020010950	-	97	52.830	ENSACIG00000010647	-	99	50.420	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020010950	-	98	87.736	ENSAOCG00000012903	-	99	68.562	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010950	-	97	52.439	ENSAOCG00000022459	-	97	45.902	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010950	-	94	51.429	ENSAOCG00000013951	-	51	43.850	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010950	-	100	42.574	ENSAOCG00000019475	-	85	33.179	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010950	-	96	54.206	ENSAOCG00000013934	-	71	43.195	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010950	-	100	51.429	ENSAOCG00000015369	-	99	50.000	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010950	-	100	46.667	ENSAOCG00000013578	-	75	46.667	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010950	-	97	49.524	ENSAOCG00000018484	-	93	49.524	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010950	-	100	42.727	ENSAOCG00000020624	-	74	43.119	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010950	-	95	47.664	ENSAOCG00000010954	-	65	41.284	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010950	-	97	51.020	ENSAPEG00000008020	-	98	50.575	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010950	-	98	87.736	ENSAPEG00000018460	-	99	68.189	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010950	-	96	65.714	ENSAPEG00000018471	-	98	46.604	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010950	-	97	50.617	ENSAPEG00000011020	-	96	50.476	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010950	-	100	46.667	ENSAPEG00000009515	-	87	46.667	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010950	-	97	48.750	ENSAPEG00000013031	-	85	48.750	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010950	-	95	48.077	ENSAPEG00000005678	-	76	41.284	Amphiprion_percula
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ENSORLG00020010950	-	72	42.604	ENSPREG00000016116	-	94	38.806	Poecilia_reticulata
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ENSORLG00020010950	-	96	47.059	ENSXMAG00000028351	-	70	47.059	Xiphophorus_maculatus