EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020010953 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 45321 bases
Position: chr2:4415653-4460973
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020010056	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-46	1	7
ENSORLP00020010056	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-46	2	7
ENSORLP00020010056	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-46	3	7
ENSORLP00020010056	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-46	4	7
ENSORLP00020010056	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-46	5	7
ENSORLP00020010056	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-46	6	7
ENSORLP00020010056	zf-C2H2	PF00096.26	9.2e-46	7	7
ENSORLP00020010056	zf-met	PF12874.7	6.3e-13	1	4
ENSORLP00020010056	zf-met	PF12874.7	6.3e-13	2	4
ENSORLP00020010056	zf-met	PF12874.7	6.3e-13	3	4
ENSORLP00020010056	zf-met	PF12874.7	6.3e-13	4	4

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020016653	-	897	-	ENSORLP00020010056	298 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020010953	-	78	46.154	ENSORLG00020010038	-	56	46.715
ENSORLG00020010953	-	77	53.750	ENSORLG00020009965	-	90	47.283
ENSORLG00020010953	-	96	65.399	ENSORLG00020010171	-	95	67.932
ENSORLG00020010953	-	86	44.144	ENSORLG00020006144	-	81	37.447
ENSORLG00020010953	-	74	45.570	ENSORLG00020010932	-	71	45.570
ENSORLG00020010953	-	77	48.276	ENSORLG00020019341	-	65	70.833
ENSORLG00020010953	-	78	43.939	ENSORLG00020009554	-	82	43.939
ENSORLG00020010953	-	95	55.102	ENSORLG00020020419	-	94	55.102
ENSORLG00020010953	-	97	71.311	ENSORLG00020010916	-	91	71.311
ENSORLG00020010953	-	94	37.500	ENSORLG00020000009	znf710b	62	37.500
ENSORLG00020010953	-	78	38.235	ENSORLG00020001758	-	55	38.235
ENSORLG00020010953	-	77	40.254	ENSORLG00020008744	-	67	40.254
ENSORLG00020010953	-	78	59.906	ENSORLG00020004353	-	99	59.906
ENSORLG00020010953	-	96	60.000	ENSORLG00020010636	-	90	68.203
ENSORLG00020010953	-	90	52.364	ENSORLG00020004370	-	99	55.805
ENSORLG00020010953	-	95	42.056	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	55	42.056
ENSORLG00020010953	-	77	42.537	ENSORLG00020003719	GFI1B	54	42.537
ENSORLG00020010953	-	89	63.481	ENSORLG00020010647	-	97	63.481
ENSORLG00020010953	-	85	62.439	ENSORLG00020006148	-	81	60.714
ENSORLG00020010953	-	96	68.504	ENSORLG00020010804	-	93	68.889
ENSORLG00020010953	-	96	76.190	ENSORLG00020010560	-	97	76.190
ENSORLG00020010953	-	95	35.897	ENSORLG00020018921	-	96	35.897
ENSORLG00020010953	-	94	37.457	ENSORLG00020016666	-	88	37.457
ENSORLG00020010953	-	96	42.761	ENSORLG00020001707	-	93	50.510
ENSORLG00020010953	-	98	54.245	ENSORLG00020017850	-	98	54.245
ENSORLG00020010953	-	79	49.123	ENSORLG00020004162	znf341	51	42.373
ENSORLG00020010953	-	96	37.500	ENSORLG00020011478	scrt2	65	37.500
ENSORLG00020010953	-	78	48.000	ENSORLG00020018791	-	82	41.045
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ENSORLG00020010953	-	77	38.660	ENSORLG00020007790	zbtb48	55	38.660
ENSORLG00020010953	-	98	66.667	ENSORLG00020010880	-	90	73.228
ENSORLG00020010953	-	78	40.909	ENSORLG00020002817	GFI1	50	40.909
ENSORLG00020010953	-	79	41.772	ENSORLG00020012967	scrt1b	52	41.772
ENSORLG00020010953	-	87	65.625	ENSORLG00020010020	-	92	65.625
ENSORLG00020010953	-	87	61.927	ENSORLG00020011234	-	90	61.468
ENSORLG00020010953	-	79	41.224	ENSORLG00020018495	-	73	41.224
ENSORLG00020010953	-	98	59.322	ENSORLG00020007967	-	98	57.203
ENSORLG00020010953	-	94	78.571	ENSORLG00020009419	-	97	78.571
ENSORLG00020010953	-	96	58.768	ENSORLG00020008424	-	92	54.110
ENSORLG00020010953	-	95	59.048	ENSORLG00020008240	-	72	44.220
ENSORLG00020010953	-	96	68.018	ENSORLG00020021857	-	83	68.018
ENSORLG00020010953	-	94	41.206	ENSORLG00020000264	-	68	45.455
ENSORLG00020010953	-	92	60.584	ENSORLG00020000161	-	92	60.584
ENSORLG00020010953	-	84	65.702	ENSORLG00020011149	-	96	65.702
ENSORLG00020010953	-	78	51.546	ENSORLG00020017528	-	73	51.546
ENSORLG00020010953	-	82	38.400	ENSORLG00020018503	-	76	39.583
ENSORLG00020010953	-	95	64.889	ENSORLG00020008346	-	100	65.179
ENSORLG00020010953	-	95	64.889	ENSORLG00020008891	-	99	65.126
ENSORLG00020010953	-	80	54.348	ENSORLG00020009139	-	98	46.119
ENSORLG00020010953	-	70	39.130	ENSORLG00020001791	-	51	39.130
ENSORLG00020010953	-	94	44.604	ENSORLG00020008787	snai2	75	44.604
ENSORLG00020010953	-	96	68.519	ENSORLG00020009943	-	99	68.519
ENSORLG00020010953	-	89	45.662	ENSORLG00020007599	-	87	45.662
ENSORLG00020010953	-	78	38.211	ENSORLG00020018685	znf319b	90	38.211
ENSORLG00020010953	-	87	54.545	ENSORLG00020008484	-	97	57.246
ENSORLG00020010953	-	78	42.009	ENSORLG00020009680	znf652	53	48.276
ENSORLG00020010953	-	91	59.072	ENSORLG00020017164	-	96	59.072
ENSORLG00020010953	-	95	50.000	ENSORLG00020000639	-	58	50.000
ENSORLG00020010953	-	92	54.626	ENSORLG00020017483	-	96	54.626
ENSORLG00020010953	-	77	53.731	ENSORLG00020016037	-	93	51.196
ENSORLG00020010953	-	92	54.202	ENSORLG00020009184	-	99	54.202
ENSORLG00020010953	-	96	38.559	ENSORLG00020002128	-	94	38.559
ENSORLG00020010953	-	87	66.109	ENSORLG00020009857	-	99	63.713
ENSORLG00020010953	-	78	67.660	ENSORLG00020011075	-	92	65.546
ENSORLG00020010953	-	90	36.842	ENSORLG00020010285	znf646	71	37.647
ENSORLG00020010953	-	87	58.120	ENSORLG00020007018	-	86	59.783
ENSORLG00020010953	-	95	71.362	ENSORLG00020009089	-	85	71.362
ENSORLG00020010953	-	92	41.004	ENSORLG00020018051	prdm5	73	41.004
ENSORLG00020010953	-	95	53.138	ENSORLG00020018069	-	95	53.138
ENSORLG00020010953	-	96	47.902	ENSORLG00020004313	-	64	47.841
ENSORLG00020010953	-	95	60.504	ENSORLG00020008018	-	91	60.504
ENSORLG00020010953	-	93	68.067	ENSORLG00020000246	-	99	68.067
ENSORLG00020010953	-	78	51.948	ENSORLG00020010950	-	95	51.948
ENSORLG00020010953	-	92	65.217	ENSORLG00020008933	-	99	66.346
ENSORLG00020010953	-	85	33.529	ENSORLG00020010937	patz1	52	33.529
ENSORLG00020010953	-	93	59.155	ENSORLG00020016754	-	86	59.155
ENSORLG00020010953	-	94	50.228	ENSORLG00020015703	-	51	50.228
ENSORLG00020010953	-	77	50.459	ENSORLG00020021196	-	50	50.459
ENSORLG00020010953	-	87	38.060	ENSORLG00020006820	-	76	38.060
ENSORLG00020010953	-	77	58.678	ENSORLG00020007074	-	93	58.678
ENSORLG00020010953	-	97	66.807	ENSORLG00020010250	-	91	66.807
ENSORLG00020010953	-	95	56.579	ENSORLG00020000481	-	98	55.508
ENSORLG00020010953	-	78	54.505	ENSORLG00020017514	-	77	54.505
ENSORLG00020010953	-	79	42.500	ENSORLG00020004889	ZNF319	92	42.727
ENSORLG00020010953	-	78	48.276	ENSORLG00020001922	-	60	46.226
ENSORLG00020010953	-	95	46.531	ENSORLG00020000219	-	83	46.531
ENSORLG00020010953	-	84	47.826	ENSORLG00020001912	znf236	71	47.826
ENSORLG00020010953	-	90	68.027	ENSORLG00020009180	-	89	68.027
ENSORLG00020010953	-	72	31.364	ENSORLG00020005815	-	75	31.982
ENSORLG00020010953	-	93	47.248	ENSORLG00020005132	-	95	47.248

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020010953	-	76	60.526	ENSAPOG00000016615	-	92	60.526	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010953	-	98	52.222	ENSAPOG00000010645	-	93	52.222	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010953	-	76	57.895	ENSAPOG00000003414	-	99	57.895	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010953	-	95	47.619	ENSAPOG00000014372	-	85	47.619	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010953	-	77	56.000	ENSAPOG00000000601	-	78	49.444	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010953	-	77	53.774	ENSAPOG00000010330	-	74	53.774	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010953	-	77	45.946	ENSAOCG00000007347	-	64	45.946	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010953	-	94	48.913	ENSAPEG00000004256	-	99	48.913	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010953	-	95	58.716	ENSATEG00000007658	-	74	58.716	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010953	-	82	49.515	ENSAMXG00000013492	-	96	47.186	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010953	-	78	47.706	ENSCING00000024717	-	82	47.706	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020010953	-	95	41.007	ENSCVAG00000018383	-	95	39.407	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020010953	-	78	45.116	ENSEBUG00000003232	-	56	46.622	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010953	-	81	43.478	ENSEBUG00000000422	-	65	43.478	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010953	-	78	46.914	ENSEBUG00000015472	-	66	46.914	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010953	-	79	45.679	ENSEBUG00000003418	-	93	45.679	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010953	-	92	50.628	ENSEBUG00000001569	-	86	50.628	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010953	-	78	41.143	ENSEBUG00000001308	-	64	41.143	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010953	-	78	49.784	ENSEBUG00000006666	-	83	49.784	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010953	-	88	45.000	ENSEBUG00000013874	-	58	45.000	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010953	-	78	48.837	ENSEBUG00000014768	-	67	48.837	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010953	-	78	43.407	ENSEBUG00000000436	-	67	43.407	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020010953	-	79	49.160	ENSELUG00000022942	-	62	49.160	Esox_lucius
ENSORLG00020010953	-	97	50.314	ENSELUG00000000281	-	82	55.769	Esox_lucius
ENSORLG00020010953	-	85	52.632	ENSELUG00000022965	-	54	52.632	Esox_lucius
ENSORLG00020010953	-	97	51.556	ENSELUG00000007694	-	91	51.556	Esox_lucius
ENSORLG00020010953	-	78	49.254	ENSGMOG00000005588	-	100	49.254	Gadus_morhua
ENSORLG00020010953	-	84	44.167	ENSGMOG00000016007	-	89	44.167	Gadus_morhua
ENSORLG00020010953	-	91	49.528	ENSGAFG00000021139	-	99	49.528	Gambusia_affinis
ENSORLG00020010953	-	95	55.556	ENSGAFG00000021143	-	92	55.556	Gambusia_affinis
ENSORLG00020010953	-	77	51.205	ENSGAGG00000010492	-	81	48.925	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020010953	-	77	48.571	ENSHBUG00000003529	-	86	48.571	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020010953	-	78	48.193	ENSHBUG00000007316	-	67	40.394	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020010953	-	94	48.837	ENSHCOG00000014777	-	70	49.789	Hippocampus_comes
ENSORLG00020010953	-	96	51.667	ENSHCOG00000001870	-	77	51.667	Hippocampus_comes
ENSORLG00020010953	-	97	48.133	ENSHCOG00000001318	-	99	49.057	Hippocampus_comes
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ENSORLG00020010953	-	94	50.000	ENSXMAG00000028785	-	73	50.000	Xiphophorus_maculatus