EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020011014 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2170 bases
Position: chr4:15761825-15763994
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020010113	RVT_1	PF00078.27	1.1e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020016690	-	2170	-	ENSORLP00020010113	488 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020011014	-	99	33.468	ENSORLG00020019417	-	54	33.468
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Orthologs

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ENSORLG00020011014	-	98	33.809	ENSOMEG00000018218	-	53	33.809	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020011014	-	74	31.880	ENSOMEG00000019904	-	97	31.880	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020011014	-	98	33.878	ENSOMEG00000014130	-	93	33.878	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020011014	-	98	33.878	ENSOMEG00000000651	-	93	33.878	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020011014	-	53	36.765	ENSPKIG00000025564	-	99	36.765	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020011014	-	94	33.404	ENSPKIG00000025243	-	98	33.404	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020011014	-	61	49.175	ENSPKIG00000004150	-	87	49.175	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020011014	-	53	37.643	ENSPFOG00000024796	-	89	37.643	Poecilia_formosa
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ENSORLG00020011014	-	92	32.051	ENSPREG00000011748	-	87	32.051	Poecilia_reticulata
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ENSORLG00020011014	-	74	31.956	ENSPNYG00000008746	-	97	32.231	Pundamilia_nyererei
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ENSORLG00020011014	-	64	32.188	ENSPNAG00000003449	-	95	32.188	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020011014	-	70	38.506	ENSPNAG00000001796	-	65	38.506	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020011014	-	64	34.591	ENSSFOG00015016391	-	88	34.591	Scleropages_formosus
ENSORLG00020011014	-	72	34.270	ENSSFOG00015008653	-	89	34.270	Scleropages_formosus
ENSORLG00020011014	-	63	36.991	ENSSDUG00000000707	-	98	36.991	Seriola_dumerili
ENSORLG00020011014	-	69	30.499	ENSSPAG00000023050	-	97	30.499	Stegastes_partitus
ENSORLG00020011014	-	82	33.824	ENSSPAG00000002518	-	83	33.824	Stegastes_partitus
ENSORLG00020011014	-	98	30.470	ENSXMAG00000027740	-	87	30.470	Xiphophorus_maculatus
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ENSORLG00020011014	-	54	40.672	ENSXMAG00000025482	-	73	40.672	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020011014	-	98	30.470	ENSXMAG00000020915	-	87	30.470	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020011014	-	98	33.881	ENSXMAG00000024274	-	90	33.881	Xiphophorus_maculatus
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ENSORLG00020011014	-	86	32.710	ENSXMAG00000020920	-	59	32.710	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020011014	-	91	30.580	ENSXMAG00000019880	-	67	30.580	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020011014	-	62	37.217	ENSXMAG00000019451	-	84	37.217	Xiphophorus_maculatus