EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020011503 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp38
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP 38 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1722 bases
Position: chr16:16998086-16999807
Accession: ZDB-GENE-040718-258
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020010607	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	3.5e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020017288	-	937	-	ENSORLP00020010607	288 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020011503	rpp38	90	40.520	ENSG00000152464	RPP38	88	47.712	Homo_sapiens
ENSORLG00020011503	rpp38	92	62.094	ENSAPOG00000001240	rpp38	95	62.132	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	43.333	ENSAMEG00000018832	RPP38	89	43.233	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020011503	rpp38	92	72.119	ENSACIG00000011592	rpp38	97	71.375	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020011503	rpp38	92	61.512	ENSAOCG00000017293	rpp38	96	61.189	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020011503	rpp38	92	65.328	ENSAPEG00000002315	rpp38	95	64.684	Amphiprion_percula
ENSORLG00020011503	rpp38	94	66.909	ENSATEG00000000731	rpp38	97	65.918	Anabas_testudineus
ENSORLG00020011503	rpp38	86	45.136	ENSAPLG00000002054	RPP38	90	44.061	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020011503	rpp38	92	69.057	ENSACLG00000016962	rpp38	96	69.925	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020011503	rpp38	92	68.679	ENSACLG00000016958	rpp38	96	69.549	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020011503	rpp38	86	45.490	ENSAMXG00000025023	rpp38	93	46.125	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020011503	rpp38	89	43.478	ENSBTAG00000007702	RPP38	88	45.247	Bos_taurus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	44.649	ENSCAFG00000024373	RPP38	89	45.174	Canis_familiaris
ENSORLG00020011503	rpp38	90	44.649	ENSCAFG00020008008	RPP38	89	45.174	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020011503	rpp38	89	43.682	ENSCHIG00000012484	RPP38	88	45.283	Capra_hircus
ENSORLG00020011503	rpp38	91	41.791	ENSCPOG00000003981	RPP38	89	42.188	Cavia_porcellus
ENSORLG00020011503	rpp38	91	40.860	ENSCLAG00000010194	RPP38	89	42.537	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020011503	rpp38	84	41.699	ENSCSAG00000019055	RPP38	88	41.825	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	43.571	ENSCHOG00000004335	RPP38	89	42.537	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020011503	rpp38	90	43.071	ENSCGRG00001001395	Rpp38	87	42.857	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020011503	rpp38	90	43.071	ENSCGRG00000017441	Rpp38	87	42.857	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020011503	rpp38	92	60.150	ENSCSEG00000001721	rpp38	96	60.300	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020011503	rpp38	92	60.440	ENSCVAG00000001676	rpp38	95	61.905	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020011503	rpp38	93	51.095	ENSDARG00000040350	rpp38	95	50.923	Danio_rerio
ENSORLG00020011503	rpp38	90	41.608	ENSDNOG00000040314	RPP38	89	41.948	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020011503	rpp38	89	41.948	ENSDORG00000009783	Rpp38	87	41.132	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020011503	rpp38	90	43.542	ENSETEG00000002839	RPP38	88	43.462	Echinops_telfairi
ENSORLG00020011503	rpp38	94	42.756	ENSEASG00005019783	RPP38	88	43.774	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	40.433	ENSEEUG00000014677	RPP38	89	40.000	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020011503	rpp38	92	53.242	ENSELUG00000010160	rpp38	97	52.397	Esox_lucius
ENSORLG00020011503	rpp38	90	40.426	ENSFCAG00000022449	RPP38	89	42.308	Felis_catus
ENSORLG00020011503	rpp38	86	44.030	ENSFALG00000014804	RPP38	88	43.396	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020011503	rpp38	91	41.367	ENSFDAG00000018669	RPP38	89	43.462	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020011503	rpp38	92	63.538	ENSFHEG00000013741	rpp38	96	63.177	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020011503	rpp38	87	44.828	ENSGALG00000008794	RPP38	86	44.061	Gallus_gallus
ENSORLG00020011503	rpp38	56	73.125	ENSGACG00000009258	rpp38	99	73.125	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020011503	rpp38	92	68.679	ENSHBUG00000010937	rpp38	96	69.549	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020011503	rpp38	91	41.727	ENSHGLG00000012144	RPP38	89	45.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020011503	rpp38	86	46.429	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	48.881	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	41.111	ENSSTOG00000025699	RPP38	86	42.424	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	40.860	ENSJJAG00000007523	Rpp38	89	43.629	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020011503	rpp38	88	65.385	ENSKMAG00000003986	rpp38	90	65.385	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020011503	rpp38	94	68.727	ENSLBEG00000006853	rpp38	97	67.658	Labrus_bergylta
ENSORLG00020011503	rpp38	92	42.708	ENSLACG00000006502	RPP38	62	51.351	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020011503	rpp38	95	45.361	ENSLOCG00000018347	rpp38	94	46.290	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	43.273	ENSLAFG00000000509	RPP38	88	41.445	Loxodonta_africana
ENSORLG00020011503	rpp38	84	41.313	ENSMMUG00000007679	RPP38	88	41.603	Macaca_mulatta
ENSORLG00020011503	rpp38	93	66.543	ENSMAMG00000012774	rpp38	95	65.909	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020011503	rpp38	92	69.434	ENSMZEG00005003189	rpp38	96	70.301	Maylandia_zebra
ENSORLG00020011503	rpp38	92	68.679	ENSMZEG00005003200	rpp38	96	69.549	Maylandia_zebra
ENSORLG00020011503	rpp38	87	45.174	ENSMGAG00000008217	RPP38	86	45.174	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020011503	rpp38	90	42.481	ENSMAUG00000003644	Rpp38	87	42.063	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	41.199	ENSMOCG00000007020	Rpp38	88	41.502	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020011503	rpp38	93	64.815	ENSMMOG00000003446	rpp38	96	65.038	Mola_mola
ENSORLG00020011503	rpp38	87	41.132	ENSMODG00000024091	RPP38	90	41.729	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020011503	rpp38	94	62.411	ENSMALG00000002356	rpp38	96	60.870	Monopterus_albus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	43.284	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	88	43.651	Mus_caroli
ENSORLG00020011503	rpp38	90	41.791	ENSMUSG00000049950	Rpp38	88	42.063	Mus_musculus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	43.446	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	88	42.636	Mus_pahari
ENSORLG00020011503	rpp38	90	41.791	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	88	42.063	Mus_spretus
ENSORLG00020011503	rpp38	91	44.853	ENSMPUG00000018523	RPP38	89	45.560	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020011503	rpp38	85	41.434	ENSMLUG00000002153	RPP38	89	42.471	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	42.910	ENSNGAG00000011066	Rpp38	88	43.750	Nannospalax_galili
ENSORLG00020011503	rpp38	89	69.380	ENSNBRG00000006994	rpp38	94	70.930	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020011503	rpp38	93	68.889	ENSONIG00000020467	rpp38	96	69.259	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020011503	rpp38	89	40.741	ENSOCUG00000024367	-	87	41.699	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020011503	rpp38	89	40.000	ENSOCUG00000022768	-	87	40.927	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020011503	rpp38	97	95.683	ENSORLG00000009219	rpp38	100	95.683	Oryzias_latipes
ENSORLG00020011503	rpp38	100	96.875	ENSORLG00015017702	rpp38	100	96.875	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020011503	rpp38	97	82.857	ENSOMEG00000005414	rpp38	100	83.571	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020011503	rpp38	90	41.958	ENSOGAG00000008059	RPP38	88	43.866	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020011503	rpp38	89	43.772	ENSOARG00000004534	RPP38	88	45.627	Ovis_aries
ENSORLG00020011503	rpp38	90	41.264	ENSPPAG00000041577	RPP38	80	42.803	Pan_paniscus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	40.357	ENSPPRG00000015329	RPP38	89	41.481	Panthera_pardus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	40.426	ENSPTIG00000007188	RPP38	89	41.912	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020011503	rpp38	90	41.264	ENSPTRG00000002318	RPP38	80	42.803	Pan_troglodytes
ENSORLG00020011503	rpp38	90	47.445	ENSPKIG00000025652	rpp38	94	47.143	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020011503	rpp38	91	43.542	ENSPSIG00000001527	RPP38	90	42.692	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020011503	rpp38	90	42.910	ENSPEMG00000008375	Rpp38	88	42.308	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020011503	rpp38	91	45.936	ENSPCIG00000009096	RPP38	85	46.617	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020011503	rpp38	72	61.137	ENSPFOG00000016823	rpp38	94	61.194	Poecilia_formosa
ENSORLG00020011503	rpp38	95	60.777	ENSPLAG00000007626	rpp38	96	59.707	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020011503	rpp38	92	56.296	ENSPMEG00000020392	rpp38	96	56.667	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020011503	rpp38	93	61.957	ENSPREG00000017744	rpp38	92	62.646	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020011503	rpp38	90	41.264	ENSPPYG00000002113	RPP38	88	42.803	Pongo_abelii
ENSORLG00020011503	rpp38	85	42.007	ENSPVAG00000007155	RPP38	89	43.985	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020011503	rpp38	92	69.057	ENSPNYG00000004293	rpp38	96	69.925	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020011503	rpp38	86	47.809	ENSPNAG00000010633	rpp38	94	47.566	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020011503	rpp38	87	46.484	ENSRNOG00000038025	Rpp38	88	46.667	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020011503	rpp38	91	42.908	ENSSHAG00000015529	RPP38	90	43.609	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020011503	rpp38	93	63.469	ENSSMAG00000018276	rpp38	95	63.878	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020011503	rpp38	92	65.530	ENSSDUG00000001651	rpp38	96	66.415	Seriola_dumerili
ENSORLG00020011503	rpp38	92	66.288	ENSSLDG00000014355	rpp38	96	66.792	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020011503	rpp38	96	38.462	ENSSARG00000012099	RPP38	86	39.921	Sorex_araneus
ENSORLG00020011503	rpp38	91	41.455	ENSSPUG00000008560	-	90	39.924	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020011503	rpp38	96	43.902	ENSSPUG00000018363	-	95	42.545	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020011503	rpp38	96	43.448	ENSSPUG00000005237	-	94	42.086	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020011503	rpp38	92	62.030	ENSSPAG00000020387	rpp38	95	61.654	Stegastes_partitus
ENSORLG00020011503	rpp38	89	40.357	ENSSSCG00000027110	RPP38	88	41.729	Sus_scrofa
ENSORLG00020011503	rpp38	86	44.747	ENSTGUG00000001366	RPP38	91	42.857	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020011503	rpp38	94	60.145	ENSTNIG00000001334	rpp38	96	61.194	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020011503	rpp38	91	43.841	ENSTTRG00000004420	RPP38	88	44.867	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020011503	rpp38	88	44.867	ENSUAMG00000002618	RPP38	89	43.985	Ursus_americanus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	44.118	ENSUMAG00000012382	RPP38	89	44.361	Ursus_maritimus
ENSORLG00020011503	rpp38	90	43.657	ENSVVUG00000005272	RPP38	89	43.609	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020011503	rpp38	92	41.219	ENSXETG00000003419	rpp38	96	41.091	Xenopus_tropicalis