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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020011559 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 25699 bases
Position: chr12:4766293-4791991
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020010639	IBN_N	PF03810.19	9.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020017333	-	2658	-	ENSORLP00020010639	885 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020011559	tnpo1	56	83.400	ENSORLG00020001020	TNPO2	99	83.600
ENSORLG00020011559	tnpo1	100	86.502	ENSORLG00020015785	tnpo2	100	86.389

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.264	Homo_sapiens
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.745	ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	97.745	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	91.397	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.179	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020011559	tnpo1	87	97.143	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.143	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.745	ENSAOCG00000008154	tnpo1	99	97.745	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.745	ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	97.745	Amphiprion_percula
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.069	ENSATEG00000010408	tnpo1	99	97.069	Anabas_testudineus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	88.952	ENSAPLG00000009619	-	97	89.679	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.574	ENSACAG00000009599	TNPO1	99	93.574	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.559	ENSANAG00000022453	-	99	92.559	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	57.842	ENSANAG00000027118	-	97	61.239	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	82.864	ENSANAG00000025351	-	99	82.864	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.041	ENSACLG00000027223	tnpo1	99	96.041	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	94.376	ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	94.038	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	92.897	Bos_taurus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.672	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.672	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020011559	tnpo1	96	92.882	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.882	Canis_familiaris
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	90.530	ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	90.530	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.010	Capra_hircus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	89.379	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.696	Carlito_syrichta
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.559	ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	92.559	Cebus_capucinus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSCATG00000043792	TNPO1	99	93.010	Cercocebus_atys
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.672	ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	92.672	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.010	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020011559	tnpo1	94	81.579	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.579	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.574	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.574	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020011559	tnpo1	100	76.596	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.596	Ciona_savignyi
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.010	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.897	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020011559	tnpo1	96	92.982	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	92.982	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	95.039	ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	95.039	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.843	ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	96.843	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	94.369	ENSDARG00000035390	tnpo1	99	94.257	Danio_rerio
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	87.599	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.599	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020011559	tnpo1	93	93.133	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.124	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020011559	tnpo1	100	58.174	FBgn0035693	CG8219	99	57.835	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020011559	tnpo1	86	94.007	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.007	Echinops_telfairi
ENSORLG00020011559	tnpo1	95	85.000	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.762	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSEASG00005018055	TNPO1	99	93.010	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.010	Equus_caballus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	88.415	ENSELUG00000002821	tnpo1	99	87.978	Esox_lucius
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSFCAG00000013181	TNPO1	99	93.010	Felis_catus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.461	ENSFALG00000010292	TNPO1	99	93.461	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.672	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.672	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.959	ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	96.959	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.584	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.584	Gadus_morhua
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.672	ENSGALG00000015014	TNPO1	99	92.672	Gallus_gallus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.625	ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	96.625	Gambusia_affinis
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	95.490	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.490	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.574	ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	93.574	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	77.953	ENSGGOG00000022535	-	98	77.953	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSGGOG00000026800	TNPO1	99	93.010	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.182	ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	97.182	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.672	ENSHGLG00000000970	-	99	92.672	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020011559	tnpo1	97	72.442	ENSHGLG00100000963	-	99	71.860	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020011559	tnpo1	96	92.640	ENSHGLG00100017090	-	99	92.640	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.123	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	96	93.123	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.505	ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	96.505	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020011559	tnpo1	91	93.193	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	92.574	Labrus_bergylta
ENSORLG00020011559	tnpo1	96	87.093	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.093	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	94.814	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.814	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020011559	tnpo1	98	92.263	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.263	Loxodonta_africana
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.010	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.897	Macaca_mulatta
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.010	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.010	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.745	ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	97.745	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.398	ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	97.398	Maylandia_zebra
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	92.897	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	89.402	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.402	Microcebus_murinus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.897	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020011559	tnpo1	87	96.378	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.378	Mola_mola
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.404	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.404	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	95.829	ENSMALG00000009782	tnpo1	99	95.829	Monopterus_albus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.672	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	99	92.910	Mus_caroli
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	99	93.159	Mus_musculus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.785	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	93.035	Mus_pahari
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	99	93.159	Mus_spretus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.010	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020011559	tnpo1	96	92.549	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.549	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.010	Nannospalax_galili
ENSORLG00020011559	tnpo1	87	97.656	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	97.656	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSNLEG00000004572	TNPO1	99	93.010	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020011559	tnpo1	90	87.730	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.730	Ochotona_princeps
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.672	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.672	Octodon_degus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.417	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.417	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020011559	tnpo1	92	93.902	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.902	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020011559	tnpo1	96	86.799	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.449	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020011559	tnpo1	87	99.610	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	99.610	Oryzias_latipes
ENSORLG00020011559	tnpo1	100	99.662	ENSORLG00015019113	tnpo1	100	99.662	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020011559	tnpo1	100	98.761	ENSOMEG00000014567	tnpo1	100	98.761	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.010	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	ENSOARG00000005038	TNPO1	83	92.897	Ovis_aries
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.010	Pan_paniscus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSPPRG00000022336	TNPO1	99	93.010	Panthera_pardus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSPTIG00000018839	TNPO1	99	93.010	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.010	Pan_troglodytes
ENSORLG00020011559	tnpo1	94	81.856	ENSPTRG00000047731	-	99	81.856	Pan_troglodytes
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.010	Papio_anubis
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	90.868	ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	90.868	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.687	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.687	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.243	ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	93.468	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020011559	tnpo1	96	92.982	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.982	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.912	ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	93.912	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.854	ENSPFOG00000011447	tnpo1	99	96.854	Poecilia_formosa
ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.854	ENSPLAG00000018696	tnpo1	99	96.854	Poecilia_latipinna
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ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.897	Pongo_abelii
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ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.897	Pteropus_vampyrus
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