EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020012063 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3319 bases
Position: chr22:10063024-10066342
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020028545	RVT_1	PF00078.27	6.3e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020017965	-	3319	-	ENSORLP00020028545	753 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020012063	-	56	53.555	ENSORLG00020015750	-	87	54.726
ENSORLG00020012063	-	54	47.101	ENSORLG00020003864	-	76	47.368
ENSORLG00020012063	-	61	44.469	ENSORLG00020001799	-	95	44.565
ENSORLG00020012063	-	89	47.917	ENSORLG00020014334	-	99	46.875
ENSORLG00020012063	-	54	97.789	ENSORLG00020017728	-	85	97.789
ENSORLG00020012063	-	99	44.993	ENSORLG00020008961	-	75	44.075
ENSORLG00020012063	-	90	95.448	ENSORLG00020015125	-	97	95.729
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ENSORLG00020012063	-	75	97.703	ENSORLG00020002120	-	86	97.703
ENSORLG00020012063	-	67	99.211	ENSORLG00020018053	-	100	99.211
ENSORLG00020012063	-	61	99.562	ENSORLG00020009639	-	100	99.562
ENSORLG00020012063	-	57	98.592	ENSORLG00020017918	-	100	98.592
ENSORLG00020012063	-	63	55.508	ENSORLG00020012080	-	99	55.508
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ENSORLG00020012063	-	58	99.310	ENSORLG00020018183	-	100	99.310
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ENSORLG00020012063	-	92	47.391	ENSORLG00020014097	-	75	47.391
ENSORLG00020012063	-	62	48.491	ENSORLG00020011254	-	98	48.491
ENSORLG00020012063	-	56	97.625	ENSORLG00020018736	-	100	97.625
ENSORLG00020012063	-	62	98.511	ENSORLG00020003990	-	98	98.511
ENSORLG00020012063	-	71	98.510	ENSORLG00020006316	-	100	98.510
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ENSORLG00020012063	-	53	31.592	ENSORLG00020001021	-	98	31.592
ENSORLG00020012063	-	61	99.784	ENSORLG00020021900	-	100	99.784
ENSORLG00020012063	-	95	44.847	ENSORLG00020004099	-	92	44.847
ENSORLG00020012063	-	63	56.356	ENSORLG00020013078	-	99	56.356
ENSORLG00020012063	-	54	98.778	ENSORLG00020001344	-	100	98.778
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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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