EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020012284 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7291 bases
Position: chr14:22193485-22200775
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020011345	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-06	1	1

Transcripts

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ENSORLT00020018220	-	831	-	ENSORLP00020011345	276 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020012284	-	61	46.471	ENSORLG00020015638	si:ch73-285p12.4	76	46.154
ENSORLG00020012284	-	61	37.121	ENSORLG00020011284	-	60	37.121
ENSORLG00020012284	-	61	34.911	ENSORLG00020006259	-	50	34.911
ENSORLG00020012284	-	61	38.824	ENSORLG00020009815	-	51	38.824
ENSORLG00020012284	-	61	37.647	ENSORLG00020017350	-	75	37.647
ENSORLG00020012284	-	63	35.556	ENSORLG00020008286	-	67	35.556
ENSORLG00020012284	-	63	32.515	ENSORLG00020008323	-	52	32.515
ENSORLG00020012284	-	60	32.738	ENSORLG00020017380	-	52	32.738
ENSORLG00020012284	-	59	34.132	ENSORLG00020017387	-	71	34.132
ENSORLG00020012284	-	85	36.017	ENSORLG00020012266	-	76	36.017
ENSORLG00020012284	-	58	43.750	ENSORLG00020021874	si:ch211-113e8.5	61	43.750

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020012284	-	58	35.976	ENSAPOG00000008529	-	63	35.976	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	55	31.169	ENSAPOG00000008819	-	69	32.468	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	61	40.000	ENSAPOG00000010738	-	55	40.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	61	40.000	ENSAPOG00000022321	-	78	40.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	61	42.197	ENSAPOG00000001075	-	79	42.197	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	61	31.548	ENSAPOG00000009288	-	63	31.548	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	58	37.195	ENSAPOG00000007631	-	76	37.195	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	61	41.860	ENSAPOG00000007123	-	64	41.860	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	60	34.132	ENSAPOG00000002527	-	55	34.132	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	61	42.442	ENSAPOG00000018915	-	74	42.442	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	61	38.690	ENSAPOG00000021365	-	55	38.690	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	58	33.742	ENSAPOG00000002517	-	56	33.742	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	71	37.811	ENSAPOG00000009059	-	90	38.095	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	72	39.535	ENSAPOG00000002337	-	63	39.535	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020012284	-	66	38.542	ENSACIG00000005223	-	74	38.542	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	63	31.638	ENSACIG00000014670	-	68	31.638	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	57	32.927	ENSACIG00000014730	zgc:172131	81	32.927	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	61	35.028	ENSACIG00000014737	-	82	35.028	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	61	41.176	ENSACIG00000012707	-	65	41.176	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	58	34.146	ENSACIG00000019509	-	76	34.146	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	61	32.298	ENSACIG00000005573	-	72	32.298	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	63	41.477	ENSACIG00000007178	-	61	41.477	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	75	35.160	ENSACIG00000003050	-	95	35.160	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	59	42.857	ENSACIG00000012204	-	72	42.857	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	60	34.524	ENSACIG00000005587	-	58	34.524	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	61	43.860	ENSACIG00000016635	-	65	43.860	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	63	41.573	ENSACIG00000006478	-	66	41.573	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	62	41.714	ENSACIG00000022355	-	59	41.714	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	61	40.698	ENSACIG00000006484	-	53	40.698	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	59	37.500	ENSACIG00000012061	-	52	36.000	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	57	41.104	ENSACIG00000022374	-	83	41.104	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	64	40.556	ENSACIG00000019149	-	55	40.556	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	61	41.420	ENSACIG00000012714	-	57	41.420	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	61	40.462	ENSACIG00000005780	-	52	40.462	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	72	59.901	ENSACIG00000015088	-	79	59.901	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	63	38.547	ENSACIG00000012761	-	75	38.547	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	58	43.827	ENSACIG00000016313	-	51	43.827	Amphilophus_citrinellus
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ENSORLG00020012284	-	61	40.351	ENSACIG00000007158	-	51	41.358	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	61	42.353	ENSACIG00000022222	-	54	42.353	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020012284	-	62	39.181	ENSAOCG00000015984	-	56	39.181	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020012284	-	61	37.647	ENSAOCG00000013326	-	60	37.647	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020012284	-	62	40.805	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	69	40.805	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020012284	-	61	40.120	ENSAOCG00000007815	-	61	40.741	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020012284	-	61	41.279	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	75	48.598	Amphiprion_percula
ENSORLG00020012284	-	62	30.233	ENSAPEG00000002163	-	60	30.233	Amphiprion_percula
ENSORLG00020012284	-	61	38.012	ENSAPEG00000019003	-	67	38.012	Amphiprion_percula
ENSORLG00020012284	-	62	39.766	ENSAPEG00000003513	-	79	40.351	Amphiprion_percula
ENSORLG00020012284	-	61	36.905	ENSAPEG00000013532	-	86	36.905	Amphiprion_percula
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ENSORLG00020012284	-	59	40.123	ENSAPEG00000013378	-	58	41.139	Amphiprion_percula
ENSORLG00020012284	-	73	31.280	ENSATEG00000011021	-	59	31.280	Anabas_testudineus
ENSORLG00020012284	-	58	45.062	ENSATEG00000011789	-	50	45.062	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020012284	-	57	38.889	ENSATEG00000011978	-	81	38.889	Anabas_testudineus
ENSORLG00020012284	-	57	43.750	ENSATEG00000011979	-	75	43.750	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020012284	-	57	38.889	ENSATEG00000012017	-	66	38.889	Anabas_testudineus
ENSORLG00020012284	-	61	38.728	ENSATEG00000011712	-	67	38.728	Anabas_testudineus
ENSORLG00020012284	-	61	41.618	ENSATEG00000011931	-	72	41.618	Anabas_testudineus
ENSORLG00020012284	-	61	41.618	ENSATEG00000011820	-	62	41.618	Anabas_testudineus
ENSORLG00020012284	-	61	41.176	ENSATEG00000011594	-	68	41.176	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020012284	-	58	32.317	ENSATEG00000010978	-	62	32.317	Anabas_testudineus
ENSORLG00020012284	-	61	41.040	ENSATEG00000011814	-	52	42.945	Anabas_testudineus
ENSORLG00020012284	-	61	39.884	ENSATEG00000011918	-	58	39.884	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020012284	-	60	32.335	ENSACLG00000001790	-	55	32.335	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020012284	-	64	39.785	ENSAMXG00000035925	-	83	39.785	Astyanax_mexicanus
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ENSORLG00020012284	-	59	33.750	ENSAMXG00000040863	-	79	33.750	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020012284	-	61	36.471	ENSAMXG00000041969	si:ch1073-185p12.2	52	36.471	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020012284	-	62	36.416	ENSAMXG00000043950	-	84	36.416	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020012284	-	61	36.207	ENSAMXG00000013452	-	50	36.207	Astyanax_mexicanus
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