EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020013041 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3744 bases
Position: chr18:25198575-25202318
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020012105	RVT_1	PF00078.27	4.3e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020019179	-	3744	-	ENSORLP00020012105	1063 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020013041	-	90	39.032	ENSORLG00020002198	-	99	39.032
ENSORLG00020013041	-	64	43.066	ENSORLG00020004729	-	99	43.066
ENSORLG00020013041	-	64	46.589	ENSORLG00020012063	-	92	46.589
ENSORLG00020013041	-	85	39.387	ENSORLG00020012549	-	99	39.387
ENSORLG00020013041	-	89	39.040	ENSORLG00020008961	-	98	39.040
ENSORLG00020013041	-	69	41.532	ENSORLG00020006422	-	98	41.532
ENSORLG00020013041	-	91	60.391	ENSORLG00020010431	-	99	60.597
ENSORLG00020013041	-	72	43.774	ENSORLG00020004554	-	99	43.774
ENSORLG00020013041	-	64	46.734	ENSORLG00020016342	-	92	46.734
ENSORLG00020013041	-	89	39.353	ENSORLG00020015822	-	98	39.353
ENSORLG00020013041	-	69	41.421	ENSORLG00020005659	-	99	41.090
ENSORLG00020013041	-	64	46.589	ENSORLG00020012251	-	92	46.589
ENSORLG00020013041	-	61	43.465	ENSORLG00020014334	-	98	43.465
ENSORLG00020013041	-	85	39.364	ENSORLG00020017660	-	99	39.364
ENSORLG00020013041	-	64	42.692	ENSORLG00020019488	-	99	42.692
ENSORLG00020013041	-	56	30.146	ENSORLG00020016931	-	86	30.146
ENSORLG00020013041	-	81	42.217	ENSORLG00020005060	-	99	42.217
ENSORLG00020013041	-	52	69.065	ENSORLG00020019399	-	99	69.065
ENSORLG00020013041	-	78	41.627	ENSORLG00020001972	-	99	41.627
ENSORLG00020013041	-	89	42.272	ENSORLG00020004158	-	94	42.343
ENSORLG00020013041	-	54	45.345	ENSORLG00020021237	-	91	45.345
ENSORLG00020013041	-	69	37.250	ENSORLG00020007799	-	97	37.250
ENSORLG00020013041	-	66	42.356	ENSORLG00020007946	-	99	42.356
ENSORLG00020013041	-	57	46.591	ENSORLG00020003779	-	91	46.591
ENSORLG00020013041	-	88	41.339	ENSORLG00020021850	-	85	41.445
ENSORLG00020013041	-	64	46.880	ENSORLG00020008999	-	92	46.880
ENSORLG00020013041	-	56	40.320	ENSORLG00020002120	-	95	40.354
ENSORLG00020013041	-	57	68.637	ENSORLG00020012070	-	99	68.637
ENSORLG00020013041	-	50	33.152	ENSORLG00020009687	-	95	32.790
ENSORLG00020013041	-	64	46.734	ENSORLG00020000803	-	92	46.734
ENSORLG00020013041	-	57	46.774	ENSORLG00020015125	-	89	46.774
ENSORLG00020013041	-	59	46.751	ENSORLG00020011031	-	90	46.774
ENSORLG00020013041	-	58	46.582	ENSORLG00020003775	-	90	46.774
ENSORLG00020013041	-	89	42.710	ENSORLG00020018578	-	98	42.710
ENSORLG00020013041	-	63	43.304	ENSORLG00020000622	-	99	43.304
ENSORLG00020013041	-	50	52.453	ENSORLG00020014098	-	99	52.453
ENSORLG00020013041	-	85	39.474	ENSORLG00020014097	-	99	39.474
ENSORLG00020013041	-	91	41.446	ENSORLG00020021297	-	86	41.471
ENSORLG00020013041	-	72	41.849	ENSORLG00020018405	-	100	41.849
ENSORLG00020013041	-	54	45.890	ENSORLG00020006111	-	90	45.890
ENSORLG00020013041	-	72	41.931	ENSORLG00020003828	-	99	41.931
ENSORLG00020013041	-	50	52.552	ENSORLG00020017390	-	99	52.552
ENSORLG00020013041	-	90	39.238	ENSORLG00020015506	-	99	39.238
ENSORLG00020013041	-	62	65.099	ENSORLG00020021613	-	99	65.099
ENSORLG00020013041	-	58	38.264	ENSORLG00020015429	-	99	38.264
ENSORLG00020013041	-	74	40.602	ENSORLG00020016659	-	98	40.602
ENSORLG00020013041	-	65	38.184	ENSORLG00020007840	-	98	38.040
ENSORLG00020013041	-	89	40.776	ENSORLG00020002718	-	98	40.776
ENSORLG00020013041	-	64	42.734	ENSORLG00020018691	-	99	42.734
ENSORLG00020013041	-	51	39.042	ENSORLG00020006907	-	99	39.042
ENSORLG00020013041	-	72	42.105	ENSORLG00020004099	-	99	42.105
ENSORLG00020013041	-	56	46.500	ENSORLG00020008289	-	91	46.500
ENSORLG00020013041	-	72	70.351	ENSORLG00020010019	-	96	70.351
ENSORLG00020013041	-	50	52.453	ENSORLG00020008589	-	99	52.453
ENSORLG00020013041	-	64	45.428	ENSORLG00020014062	-	92	45.428
ENSORLG00020013041	-	70	41.207	ENSORLG00020007092	-	95	41.419
ENSORLG00020013041	-	91	41.446	ENSORLG00020008178	-	86	41.471
ENSORLG00020013041	-	91	40.020	ENSORLG00020000004	-	95	38.235
ENSORLG00020013041	-	83	42.684	ENSORLG00020019417	-	99	42.684
ENSORLG00020013041	-	56	46.446	ENSORLG00020001010	-	91	46.446
ENSORLG00020013041	-	89	39.353	ENSORLG00020019255	-	98	39.353
ENSORLG00020013041	-	89	39.457	ENSORLG00020010964	-	98	39.457
ENSORLG00020013041	-	64	46.880	ENSORLG00020021860	-	92	46.880
ENSORLG00020013041	-	50	52.264	ENSORLG00020006316	-	99	52.264
ENSORLG00020013041	-	89	42.813	ENSORLG00020008688	-	98	42.813
ENSORLG00020013041	-	76	98.139	ENSORLG00020016049	-	100	98.139
ENSORLG00020013041	-	57	46.569	ENSORLG00020009908	-	90	46.569

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020013041	-	74	51.382	ENSAOCG00000011105	-	99	51.382	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020013041	-	64	46.830	ENSAPEG00000006041	-	99	46.830	Amphiprion_percula
ENSORLG00020013041	-	72	44.801	ENSATEG00000013493	-	94	44.801	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013041	-	58	41.363	ENSATEG00000009980	-	99	41.363	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013041	-	73	45.881	ENSATEG00000015818	-	99	45.881	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013041	-	52	53.047	ENSATEG00000016827	-	99	53.047	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013041	-	58	41.997	ENSATEG00000016515	-	99	41.997	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013041	-	52	53.321	ENSATEG00000023306	-	99	53.321	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013041	-	72	44.942	ENSATEG00000007199	-	99	44.942	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013041	-	73	45.881	ENSATEG00000010400	-	99	45.881	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013041	-	68	46.746	ENSATEG00000022147	-	91	46.746	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013041	-	52	52.603	ENSATEG00000022498	-	99	52.603	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013041	-	57	50.327	ENSATEG00000019303	-	98	50.327	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013041	-	73	45.374	ENSATEG00000019513	-	99	45.374	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013041	-	63	39.601	ENSACLG00000004144	-	92	39.601	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	78	44.783	ENSACLG00000021287	-	98	44.783	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	52	43.229	ENSACLG00000005642	-	99	43.229	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	61	48.086	ENSACLG00000008859	-	96	48.086	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	73	45.489	ENSACLG00000027996	-	99	45.489	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	60	48.903	ENSACLG00000005547	-	99	48.903	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	60	49.216	ENSACLG00000014746	-	99	49.216	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	60	49.216	ENSACLG00000003670	-	99	49.216	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	65	43.539	ENSACLG00000002614	-	99	43.539	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	50	48.417	ENSACLG00000017297	-	99	48.417	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	78	44.549	ENSACLG00000023885	-	98	44.549	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	53	46.359	ENSACLG00000015704	-	92	46.359	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	73	44.486	ENSACLG00000020864	-	99	44.486	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	78	44.549	ENSACLG00000008391	-	98	44.549	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	78	44.783	ENSACLG00000004826	-	98	44.783	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	78	44.666	ENSACLG00000002468	-	98	44.666	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	65	46.924	ENSACLG00000000736	-	99	46.924	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013041	-	57	44.911	ENSAMXG00000030235	-	98	44.911	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013041	-	57	47.961	ENSAMXG00000033549	-	99	47.961	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013041	-	99	60.788	ENSAMXG00000037852	-	99	60.788	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013041	-	86	41.810	ENSAMXG00000040782	-	99	41.810	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013041	-	52	51.159	ENSAMXG00000031289	-	99	51.159	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013041	-	78	40.850	ENSAMXG00000036981	-	100	40.850	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013041	-	68	40.756	ENSAMXG00000034383	-	97	40.756	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013041	-	55	46.912	ENSAMXG00000035603	-	99	47.421	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013041	-	86	42.320	ENSAMXG00000040632	-	99	42.320	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013041	-	64	44.868	ENSAMXG00000033627	-	98	44.868	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013041	-	52	50.446	ENSAMXG00000029030	-	99	50.446	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013041	-	86	42.213	ENSAMXG00000029285	-	99	42.213	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013041	-	52	50.265	ENSAMXG00000037727	-	97	50.265	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013041	-	61	46.988	ENSCSEG00000013241	-	99	46.988	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020013041	-	64	46.465	ENSCSEG00000013023	-	90	46.465	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020013041	-	78	42.924	ENSCSEG00000014137	-	99	42.924	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020013041	-	52	50.444	ENSIPUG00000004216	-	99	50.444	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020013041	-	60	45.315	ENSIPUG00000013666	-	100	45.315	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020013041	-	68	44.444	ENSKMAG00000001967	-	100	44.173	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020013041	-	60	45.706	ENSKMAG00000012984	-	100	45.399	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020013041	-	68	44.444	ENSKMAG00000000948	-	100	44.173	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020013041	-	68	44.444	ENSKMAG00000010396	-	100	44.173	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020013041	-	65	65.755	ENSKMAG00000014228	-	99	65.755	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020013041	-	57	48.697	ENSLBEG00000022785	-	99	48.697	Labrus_bergylta
ENSORLG00020013041	-	52	70.578	ENSLBEG00000016437	-	99	70.578	Labrus_bergylta
ENSORLG00020013041	-	60	51.558	ENSLBEG00000019587	-	99	51.558	Labrus_bergylta
ENSORLG00020013041	-	65	41.774	ENSLACG00000011269	-	99	41.774	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020013041	-	65	42.632	ENSLACG00000022513	-	99	42.632	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020013041	-	52	50.177	ENSMAMG00000021217	-	99	50.177	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020013041	-	88	42.842	ENSMAMG00000022385	-	94	42.842	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020013041	-	52	50.799	ENSMAMG00000013892	-	99	50.799	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020013041	-	64	46.087	ENSMAMG00000013896	-	93	46.087	Mastacembelus_armatus
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