EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020013350 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: si:dkey-98f17.5
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12499 bases
Position: chr9:12747555-12760053
Accession: ZDB-GENE-060526-354
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020012401	MMR_HSR1	PF01926.23	4.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020019564	-	3659	-	ENSORLP00020012401	448 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	59.556

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	89.732	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	58.093	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Amphiprion_percula
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Amphiprion_percula
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	87.723	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	87.723	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	99	57.589	ENSACAG00000028632	-	99	57.589	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	89.732	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	58.407	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	58.407	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	59.692	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.692	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	79.065	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.065	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	79	61.798	ENSCING00000020807	-	94	61.798	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	98	55.682	ENSCSAVG00000009987	-	98	56.136	Ciona_savignyi
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	87.054	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	84.434	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	58.093	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	88.616	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	98	81.818	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	81.818	Danio_rerio
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	74.490	Danio_rerio
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	82	54.717	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	97	54.717	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	99	80.493	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	80.493	Esox_lucius
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	88.170	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	88.170	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	58.315	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	58.315	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	89	54.613	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	54.613	Gadus_morhua
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	88.616	Gambusia_affinis
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Gambusia_affinis
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	85	62.827	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	60.848	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	58	93.023	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	93.023	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	58.628	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	58.628	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	99	82.658	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	82.658	Hippocampus_comes
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	58.000	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	58.000	Hippocampus_comes
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	96	58.430	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	58.430	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	76.169	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	76.169	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	84	57.181	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	57.181	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	58.444	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	88.170	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	88.170	Labrus_bergylta
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	61.470	ENSLACG00000004899	-	99	61.470	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	99	68.694	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.694	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	99	61.798	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	61.798	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	99	72.483	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.483	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	96	59.584	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	59.584	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	88.170	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	88.170	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	58.186	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	58.186	Maylandia_zebra
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Maylandia_zebra
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	57.206	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.206	Mola_mola
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Monopterus_albus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	98	88.155	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	88.155	Monopterus_albus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	89.286	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	89.286	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	96	59.122	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	59.122	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	58.407	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	58.407	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Oryzias_latipes
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	95.312	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	95.312	Oryzias_latipes
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	98.661	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	98.661	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	95.982	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	95.982	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	57.016	ENSPKIG00000023918	-	98	57.016	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	59.424	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	76.392	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	76.392	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	58.407	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	58.407	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	83.705	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	83.705	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	88.470	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	88.470	Poecilia_formosa
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Poecilia_formosa
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSPLAG00000019794	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	88.839	ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	88.839	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	88.616	Poecilia_mexicana
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