EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020013710 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pusl1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11791 bases
Position: chr5:28783061-28794851
Accession: 101163566
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020012777	PseudoU_synth_1	PF01416.20	4.6e-33	1	2
ENSORLP00020012777	PseudoU_synth_1	PF01416.20	4.6e-33	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020020049	-	2881	XM_004069169	ENSORLP00020012777	296 (aa)	XP_004069217	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020013710	pusl1	97	49.481	ENSG00000169972	PUSL1	97	47.154	Homo_sapiens
ENSORLG00020013710	pusl1	99	70.890	ENSAPOG00000016290	pusl1	98	70.890	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020013710	pusl1	95	48.432	ENSAMEG00000013752	PUSL1	94	48.432	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020013710	pusl1	93	71.533	ENSACIG00000015240	pusl1	100	71.533	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020013710	pusl1	97	69.338	ENSAOCG00000019419	pusl1	86	69.338	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020013710	pusl1	99	69.863	ENSAPEG00000005452	pusl1	98	69.863	Amphiprion_percula
ENSORLG00020013710	pusl1	96	72.632	ENSATEG00000024154	pusl1	95	72.632	Anabas_testudineus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	52.347	ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	52.347	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020013710	pusl1	87	49.807	ENSACAG00000014111	PUSL1	98	49.807	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020013710	pusl1	97	49.481	ENSANAG00000037456	PUSL1	93	49.481	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020013710	pusl1	96	74.386	ENSACLG00000008675	pusl1	95	74.386	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020013710	pusl1	95	59.574	ENSAMXG00000044007	pusl1	95	59.574	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	51.087	ENSBTAG00000007619	PUSL1	94	51.087	Bos_taurus
ENSORLG00020013710	pusl1	97	48.789	ENSCJAG00000010972	PUSL1	93	48.789	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	48.188	ENSCAFG00000019291	PUSL1	90	48.188	Canis_familiaris
ENSORLG00020013710	pusl1	93	49.275	ENSCAFG00020011568	PUSL1	89	49.275	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020013710	pusl1	93	50.725	ENSCHIG00000012615	PUSL1	95	50.725	Capra_hircus
ENSORLG00020013710	pusl1	92	48.000	ENSCPOG00000005149	PUSL1	89	48.000	Cavia_porcellus
ENSORLG00020013710	pusl1	97	48.789	ENSCCAG00000027475	PUSL1	93	48.789	Cebus_capucinus
ENSORLG00020013710	pusl1	97	49.481	ENSCATG00000018260	PUSL1	93	49.481	Cercocebus_atys
ENSORLG00020013710	pusl1	95	48.936	ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	48.936	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020013710	pusl1	97	50.172	ENSCSAG00000000680	PUSL1	93	50.172	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020013710	pusl1	94	55.556	ENSCPBG00000022621	PUSL1	95	55.556	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020013710	pusl1	97	49.481	ENSCANG00000034373	PUSL1	93	49.481	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	48.913	ENSCGRG00001012429	Pusl1	94	48.913	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020013710	pusl1	93	48.551	ENSCGRG00000006466	Pusl1	94	48.551	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020013710	pusl1	97	68.293	ENSCSEG00000005159	pusl1	96	68.293	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020013710	pusl1	80	58.506	ENSCVAG00000012923	pusl1	91	58.506	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020013710	pusl1	94	64.875	ENSDARG00000074565	pusl1	97	64.621	Danio_rerio
ENSORLG00020013710	pusl1	94	33.115	FBgn0083976	CG34140	99	33.115	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020013710	pusl1	92	51.273	ENSECAG00000006248	PUSL1	89	51.273	Equus_caballus
ENSORLG00020013710	pusl1	95	47.535	ENSEEUG00000000837	PUSL1	95	47.535	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020013710	pusl1	95	64.184	ENSELUG00000015945	pusl1	96	64.184	Esox_lucius
ENSORLG00020013710	pusl1	97	49.827	ENSFCAG00000007617	PUSL1	94	49.827	Felis_catus
ENSORLG00020013710	pusl1	100	74.411	ENSFHEG00000006370	pusl1	99	74.411	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020013710	pusl1	95	70.567	ENSGMOG00000019388	pusl1	100	70.567	Gadus_morhua
ENSORLG00020013710	pusl1	94	51.971	ENSGALG00000001714	PUSL1	96	51.971	Gallus_gallus
ENSORLG00020013710	pusl1	96	71.378	ENSGAFG00000007546	pusl1	96	71.378	Gambusia_affinis
ENSORLG00020013710	pusl1	99	68.475	ENSGACG00000007848	pusl1	97	68.475	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020013710	pusl1	94	55.197	ENSGAGG00000004730	PUSL1	95	55.197	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020013710	pusl1	85	50.000	ENSGGOG00000005364	PUSL1	96	50.000	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020013710	pusl1	96	74.386	ENSHBUG00000001264	pusl1	95	74.386	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020013710	pusl1	93	49.458	ENSHGLG00000017570	PUSL1	89	49.458	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020013710	pusl1	83	49.799	ENSHGLG00100007641	PUSL1	82	49.799	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020013710	pusl1	95	68.683	ENSHCOG00000010077	pusl1	100	69.565	Hippocampus_comes
ENSORLG00020013710	pusl1	94	63.309	ENSIPUG00000023921	pusl1	95	63.309	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	50.725	ENSSTOG00000001783	PUSL1	85	50.725	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020013710	pusl1	99	47.279	ENSJJAG00000020471	Pusl1	93	49.638	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020013710	pusl1	94	66.906	ENSKMAG00000005154	pusl1	95	66.906	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020013710	pusl1	97	71.777	ENSLBEG00000013469	pusl1	98	71.777	Labrus_bergylta
ENSORLG00020013710	pusl1	65	55.440	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	55.440	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020013710	pusl1	96	55.282	ENSLOCG00000002210	pusl1	96	55.282	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020013710	pusl1	88	50.763	ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	50.763	Loxodonta_africana
ENSORLG00020013710	pusl1	97	49.481	ENSMFAG00000046288	PUSL1	93	49.481	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020013710	pusl1	97	43.253	ENSMMUG00000016279	PUSL1	92	43.253	Macaca_mulatta
ENSORLG00020013710	pusl1	93	50.000	ENSMNEG00000037989	PUSL1	90	50.000	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020013710	pusl1	97	68.990	ENSMAMG00000016538	pusl1	95	68.990	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020013710	pusl1	96	74.386	ENSMZEG00005026990	pusl1	95	74.386	Maylandia_zebra
ENSORLG00020013710	pusl1	94	51.254	ENSMGAG00000003037	PUSL1	95	51.254	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020013710	pusl1	93	48.551	ENSMAUG00000019924	Pusl1	94	48.551	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	52.347	ENSMICG00000014171	PUSL1	93	52.347	Microcebus_murinus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	50.000	ENSMOCG00000005602	Pusl1	94	50.000	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020013710	pusl1	94	69.643	ENSMMOG00000003269	pusl1	100	69.643	Mola_mola
ENSORLG00020013710	pusl1	97	71.181	ENSMALG00000021686	pusl1	95	71.181	Monopterus_albus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	48.561	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	94	48.561	Mus_caroli
ENSORLG00020013710	pusl1	93	48.561	ENSMUSG00000051557	Pusl1	94	48.561	Mus_musculus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	48.921	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	94	48.921	Mus_pahari
ENSORLG00020013710	pusl1	93	48.921	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	94	48.921	Mus_spretus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	50.360	ENSMPUG00000014313	PUSL1	90	50.360	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020013710	pusl1	93	50.000	ENSNGAG00000004647	Pusl1	82	50.000	Nannospalax_galili
ENSORLG00020013710	pusl1	95	63.958	ENSNBRG00000014762	pusl1	96	63.958	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020013710	pusl1	88	51.538	ENSNLEG00000000051	PUSL1	93	51.538	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020013710	pusl1	93	51.625	ENSMEUG00000011649	-	96	51.625	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020013710	pusl1	92	40.942	ENSMEUG00000005176	-	98	40.942	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020013710	pusl1	95	49.645	ENSODEG00000008247	PUSL1	90	49.645	Octodon_degus
ENSORLG00020013710	pusl1	96	74.035	ENSONIG00000019361	pusl1	94	74.035	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020013710	pusl1	100	97.297	ENSORLG00000016228	pusl1	100	97.297	Oryzias_latipes
ENSORLG00020013710	pusl1	95	98.221	ENSORLG00015008715	pusl1	99	98.221	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020013710	pusl1	97	87.456	ENSOMEG00000018897	pusl1	99	87.456	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020013710	pusl1	93	51.079	ENSOGAG00000031692	PUSL1	95	51.079	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020013710	pusl1	83	51.613	ENSOARG00000004905	PUSL1	92	51.613	Ovis_aries
ENSORLG00020013710	pusl1	97	50.173	ENSPPAG00000029283	PUSL1	93	50.173	Pan_paniscus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	50.725	ENSPPRG00000023329	PUSL1	91	50.725	Panthera_pardus
ENSORLG00020013710	pusl1	83	51.613	ENSPTIG00000018532	PUSL1	91	51.613	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020013710	pusl1	97	49.827	ENSPTRG00000000021	PUSL1	93	49.827	Pan_troglodytes
ENSORLG00020013710	pusl1	97	49.481	ENSPANG00000000591	PUSL1	93	49.481	Papio_anubis
ENSORLG00020013710	pusl1	95	61.702	ENSPKIG00000002447	pusl1	97	61.702	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020013710	pusl1	85	56.746	ENSPSIG00000002781	PUSL1	93	56.746	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020013710	pusl1	93	65.217	ENSPMGG00000011051	pusl1	99	65.217	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	50.000	ENSPEMG00000013541	Pusl1	94	50.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020013710	pusl1	94	50.534	ENSPCIG00000007816	-	64	50.883	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020013710	pusl1	98	70.690	ENSPFOG00000015448	pusl1	96	70.690	Poecilia_formosa
ENSORLG00020013710	pusl1	97	71.080	ENSPLAG00000004348	pusl1	97	71.080	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020013710	pusl1	97	71.080	ENSPMEG00000000931	pusl1	97	71.080	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020013710	pusl1	97	70.383	ENSPREG00000002324	pusl1	97	70.383	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020013710	pusl1	90	46.269	ENSPPYG00000002014	PUSL1	94	46.269	Pongo_abelii
ENSORLG00020013710	pusl1	79	44.255	ENSPCAG00000002272	PUSL1	95	44.255	Procavia_capensis
ENSORLG00020013710	pusl1	68	51.389	ENSPVAG00000001016	PUSL1	66	51.389	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020013710	pusl1	81	75.833	ENSPNYG00000006588	pusl1	100	75.833	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020013710	pusl1	95	61.210	ENSPNAG00000024441	pusl1	97	61.210	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020013710	pusl1	93	49.275	ENSRNOG00000022354	Pusl1	94	49.275	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020013710	pusl1	97	49.135	ENSRBIG00000036842	PUSL1	93	49.135	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020013710	pusl1	97	49.135	ENSRROG00000030704	PUSL1	93	49.135	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020013710	pusl1	88	48.659	ENSSBOG00000032249	PUSL1	92	48.659	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020013710	pusl1	52	50.323	ENSSHAG00000004840	-	84	48.171	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020013710	pusl1	97	60.764	ENSSFOG00015008281	pusl1	95	60.764	Scleropages_formosus
ENSORLG00020013710	pusl1	97	70.732	ENSSMAG00000007187	pusl1	95	70.732	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020013710	pusl1	97	72.474	ENSSDUG00000000287	pusl1	89	72.474	Seriola_dumerili
ENSORLG00020013710	pusl1	97	72.474	ENSSLDG00000009605	pusl1	92	72.474	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020013710	pusl1	55	51.220	ENSSARG00000005323	-	86	51.220	Sorex_araneus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	66.058	ENSSPAG00000002528	pusl1	100	66.058	Stegastes_partitus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	51.264	ENSSSCG00000003338	PUSL1	89	51.264	Sus_scrofa
ENSORLG00020013710	pusl1	92	51.460	ENSTGUG00000003214	PUSL1	96	51.636	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020013710	pusl1	96	72.085	ENSTRUG00000010102	pusl1	95	72.085	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020013710	pusl1	61	65.193	ENSTNIG00000005789	pusl1	82	65.193	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020013710	pusl1	59	46.629	ENSTBEG00000005001	PUSL1	74	46.629	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020013710	pusl1	93	44.404	ENSTTRG00000017030	PUSL1	90	44.404	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020013710	pusl1	87	48.077	ENSUAMG00000012801	PUSL1	83	48.077	Ursus_americanus
ENSORLG00020013710	pusl1	87	48.462	ENSUMAG00000002084	PUSL1	83	48.462	Ursus_maritimus
ENSORLG00020013710	pusl1	93	49.275	ENSVVUG00000004320	PUSL1	90	43.175	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020013710	pusl1	77	54.348	ENSXETG00000011145	pusl1	100	54.348	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020013710	pusl1	95	66.904	ENSXCOG00000017748	pusl1	99	66.904	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020013710	pusl1	97	71.429	ENSXMAG00000018846	pusl1	97	71.429	Xiphophorus_maculatus