EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020014225 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14280 bases
Position: chr9:28926364-28940643
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020029992	MMR_HSR1	PF01926.23	1.8e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020020697	-	4870	-	ENSORLP00020029992	1130 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020014225	-	72	38.662	ENSORLG00020008404	-	74	38.662
ENSORLG00020014225	-	71	47.699	ENSORLG00020021874	si:ch211-113e8.5	89	37.975
ENSORLG00020014225	-	61	39.357	ENSORLG00020005613	-	66	34.121
ENSORLG00020014225	-	92	37.212	ENSORLG00020016100	-	91	37.058
ENSORLG00020014225	-	77	30.374	ENSORLG00020011284	-	81	30.374
ENSORLG00020014225	-	61	42.857	ENSORLG00020006506	-	65	42.857
ENSORLG00020014225	-	57	31.600	ENSORLG00020008286	-	93	31.600
ENSORLG00020014225	-	60	44.651	ENSORLG00020012266	-	75	44.651
ENSORLG00020014225	-	62	35.577	ENSORLG00020017350	-	96	35.577
ENSORLG00020014225	-	55	61.307	ENSORLG00020015638	si:ch73-285p12.4	88	60.513

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020014225	-	96	40.167	ENSAPOG00000008987	-	99	39.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020014225	-	93	38.394	ENSAPOG00000009034	-	99	38.220	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020014225	-	69	50.000	ENSAPOG00000001447	-	84	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020014225	-	92	42.939	ENSAPOG00000017368	-	91	42.176	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020014225	-	85	44.181	ENSACIG00000005198	-	94	44.181	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020014225	-	67	65.254	ENSACIG00000012648	-	82	65.254	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020014225	-	70	50.602	ENSACIG00000007191	-	72	49.612	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020014225	-	59	54.327	ENSACIG00000012718	-	94	54.327	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020014225	-	95	42.946	ENSAOCG00000022545	-	91	42.473	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020014225	-	69	52.679	ENSAOCG00000002389	-	94	52.679	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020014225	-	97	39.610	ENSAOCG00000001095	-	91	40.994	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020014225	-	73	48.118	ENSAOCG00000013686	-	94	48.118	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020014225	-	74	49.242	ENSAPEG00000021634	-	93	49.242	Amphiprion_percula
ENSORLG00020014225	-	91	46.577	ENSATEG00000012058	-	93	47.024	Anabas_testudineus
ENSORLG00020014225	-	88	40.685	ENSATEG00000011330	-	84	41.432	Anabas_testudineus
ENSORLG00020014225	-	92	40.451	ENSATEG00000011336	-	92	39.976	Anabas_testudineus
ENSORLG00020014225	-	80	42.486	ENSATEG00000011735	-	94	42.486	Anabas_testudineus
ENSORLG00020014225	-	95	43.046	ENSATEG00000011352	-	94	43.337	Anabas_testudineus
ENSORLG00020014225	-	96	40.242	ENSACLG00000024857	-	90	42.098	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020014225	-	68	47.703	ENSACLG00000009780	-	90	46.780	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020014225	-	67	53.818	ENSACLG00000005669	-	88	56.078	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020014225	-	99	45.089	ENSACLG00000012195	-	96	45.296	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020014225	-	59	65.517	ENSACLG00000005066	-	89	65.517	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020014225	-	80	43.392	ENSACLG00000005679	-	82	44.295	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020014225	-	69	57.207	ENSACLG00000024836	-	82	57.207	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020014225	-	68	47.038	ENSACLG00000009774	-	77	47.038	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020014225	-	75	47.570	ENSACLG00000005220	-	89	48.656	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020014225	-	99	42.404	ENSACLG00000004980	-	94	43.084	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020014225	-	75	48.540	ENSACLG00000024854	-	89	48.540	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020014225	-	88	40.312	ENSACLG00000024859	-	86	38.877	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020014225	-	70	44.094	ENSAMXG00000024930	-	86	44.094	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020014225	-	59	42.408	ENSAMXG00000039685	-	96	42.473	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020014225	-	53	42.715	ENSAMXG00000030288	-	74	44.118	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020014225	-	54	38.400	ENSAMXG00000036745	-	86	38.400	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020014225	-	85	33.290	ENSAMXG00000041224	-	63	35.256	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020014225	-	74	40.461	ENSAMXG00000037741	-	99	40.461	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020014225	-	84	37.884	ENSAMXG00000030783	-	94	37.884	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020014225	-	80	44.703	ENSCVAG00000023267	-	95	41.255	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020014225	-	97	36.249	ENSCVAG00000018481	-	92	37.277	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020014225	-	75	35.747	ENSDARG00000086048	si:ch211-229i14.2	96	33.504	Danio_rerio
ENSORLG00020014225	-	76	41.575	ENSELUG00000005405	-	87	47.266	Esox_lucius
ENSORLG00020014225	-	76	40.123	ENSELUG00000015076	si:ch211-229i14.2	62	39.318	Esox_lucius
ENSORLG00020014225	-	80	38.292	ENSELUG00000015135	-	80	38.174	Esox_lucius
ENSORLG00020014225	-	91	36.205	ENSELUG00000015106	-	88	35.444	Esox_lucius
ENSORLG00020014225	-	65	51.295	ENSFHEG00000021828	-	90	51.295	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020014225	-	65	56.300	ENSFHEG00000019202	-	85	45.827	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020014225	-	89	44.359	ENSFHEG00000013865	-	89	44.977	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020014225	-	99	50.346	ENSFHEG00000011334	-	99	50.000	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020014225	-	93	44.157	ENSFHEG00000000207	-	90	44.131	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020014225	-	94	37.130	ENSGAFG00000015999	-	92	37.090	Gambusia_affinis
ENSORLG00020014225	-	99	42.151	ENSGAFG00000015917	-	96	42.384	Gambusia_affinis
ENSORLG00020014225	-	97	39.872	ENSGAFG00000001852	-	90	42.393	Gambusia_affinis
ENSORLG00020014225	-	90	39.821	ENSGAFG00000015908	-	79	39.068	Gambusia_affinis
ENSORLG00020014225	-	62	53.211	ENSGACG00000002627	-	92	52.542	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020014225	-	87	40.077	ENSGACG00000013107	-	96	40.308	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020014225	-	52	68.862	ENSHBUG00000020672	-	82	68.862	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020014225	-	63	59.813	ENSHBUG00000000157	-	82	60.000	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020014225	-	86	44.202	ENSHBUG00000013269	-	87	44.407	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020014225	-	68	56.439	ENSHBUG00000011156	-	82	56.439	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020014225	-	73	52.222	ENSHBUG00000002999	-	95	52.222	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020014225	-	80	46.517	ENSHBUG00000020633	-	85	44.764	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020014225	-	93	40.000	ENSHBUG00000003015	-	84	40.938	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020014225	-	60	56.805	ENSHBUG00000003010	-	64	56.805	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020014225	-	66	57.037	ENSHBUG00000006928	-	83	57.037	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020014225	-	99	45.424	ENSHBUG00000010247	-	96	45.296	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020014225	-	73	35.886	ENSIPUG00000004131	-	98	32.424	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020014225	-	96	33.245	ENSIPUG00000004161	-	91	32.938	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020014225	-	99	49.204	ENSKMAG00000010851	-	99	49.204	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020014225	-	94	38.298	ENSKMAG00000010293	-	94	38.148	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020014225	-	68	39.831	ENSLBEG00000008506	-	71	39.831	Labrus_bergylta
ENSORLG00020014225	-	84	48.703	ENSLBEG00000012647	-	91	48.703	Labrus_bergylta
ENSORLG00020014225	-	84	48.706	ENSLBEG00000022878	-	99	48.706	Labrus_bergylta
ENSORLG00020014225	-	72	54.750	ENSLBEG00000028623	-	99	52.791	Labrus_bergylta
ENSORLG00020014225	-	63	53.000	ENSLBEG00000006614	-	81	53.000	Labrus_bergylta
ENSORLG00020014225	-	72	46.345	ENSLBEG00000017021	-	96	46.345	Labrus_bergylta
ENSORLG00020014225	-	78	45.981	ENSLBEG00000010625	-	97	45.981	Labrus_bergylta
ENSORLG00020014225	-	72	50.202	ENSMAMG00000017892	-	85	50.202	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020014225	-	88	46.839	ENSMAMG00000018162	si:ch211-229i14.2	96	47.690	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020014225	-	93	37.137	ENSMAMG00000017849	-	79	38.991	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020014225	-	63	56.000	ENSMAMG00000017874	-	79	56.000	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020014225	-	87	37.531	ENSMAMG00000018061	-	94	37.640	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020014225	-	89	36.943	ENSMAMG00000017906	-	76	41.713	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020014225	-	97	48.578	ENSMAMG00000018170	-	97	48.910	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020014225	-	99	45.006	ENSMAMG00000018175	-	99	43.742	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020014225	-	86	40.625	ENSMAMG00000017884	-	83	41.071	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020014225	-	68	57.937	ENSMZEG00005014235	-	89	57.937	Maylandia_zebra
ENSORLG00020014225	-	65	55.024	ENSMZEG00005021721	-	86	54.955	Maylandia_zebra
ENSORLG00020014225	-	75	48.540	ENSMZEG00005021723	-	84	48.540	Maylandia_zebra
ENSORLG00020014225	-	50	66.871	ENSMZEG00005027848	-	93	66.871	Maylandia_zebra
ENSORLG00020014225	-	69	49.042	ENSMZEG00005021732	-	78	49.042	Maylandia_zebra
ENSORLG00020014225	-	54	38.940	ENSMZEG00005028364	-	88	39.401	Maylandia_zebra
ENSORLG00020014225	-	63	48.696	ENSMMOG00000010425	-	90	48.696	Mola_mola
ENSORLG00020014225	-	99	40.134	ENSMALG00000001082	-	98	40.452	Monopterus_albus
ENSORLG00020014225	-	87	34.826	ENSMALG00000004282	-	94	34.931	Monopterus_albus
ENSORLG00020014225	-	68	53.785	ENSNBRG00000019119	-	76	53.543	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020014225	-	66	51.786	ENSNBRG00000019143	-	83	51.786	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020014225	-	73	50.607	ENSNBRG00000014905	-	89	47.887	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020014225	-	71	55.000	ENSNBRG00000003060	-	83	55.000	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020014225	-	82	46.035	ENSNBRG00000003245	-	86	44.960	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020014225	-	88	40.000	ENSNBRG00000014894	-	80	40.592	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020014225	-	91	34.751	ENSONIG00000004482	-	98	51.172	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020014225	-	91	39.151	ENSONIG00000010736	-	100	39.315	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020014225	-	69	52.717	ENSONIG00000013819	-	99	53.261	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020014225	-	74	45.917	ENSONIG00000000233	-	97	42.967	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020014225	-	73	45.104	ENSONIG00000014210	-	98	45.104	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020014225	-	71	54.810	ENSONIG00000000314	-	93	53.763	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020014225	-	85	44.015	ENSONIG00000011313	-	96	45.038	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020014225	-	88	40.741	ENSONIG00000013863	-	96	41.589	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020014225	-	72	53.739	ENSONIG00000012315	-	99	50.595	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020014225	-	76	52.601	ENSORLG00000025924	si:ch211-229i14.2	85	46.542	Oryzias_latipes
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