EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020015203 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3231 bases
Position: chr5:27703817-27707047
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020014215	RVT_1	PF00078.27	1.6e-22	1	1

Transcripts

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ENSORLT00020021918	-	3231	-	ENSORLP00020014215	1076 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020015203	-	80	37.085	ENSORLG00020007237	-	62	36.013
ENSORLG00020015203	-	77	37.646	ENSORLG00020018561	-	86	37.545
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ENSORLG00020015203	-	77	30.806	ENSORLG00020021286	-	50	30.806
ENSORLG00020015203	-	71	35.979	ENSORLG00020001422	-	50	35.979
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ENSORLG00020015203	-	65	35.233	ENSORLG00020011789	-	64	35.233
ENSORLG00020015203	-	80	32.651	ENSORLG00020016001	-	65	32.651
ENSORLG00020015203	-	65	35.233	ENSORLG00020005114	-	64	35.233
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ENSORLG00020015203	-	80	39.747	ENSORLG00020007648	-	70	39.747
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ENSORLG00020015203	-	69	40.897	ENSORLG00020017608	-	72	40.897
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ENSORLG00020015203	-	57	34.974	ENSORLG00020013042	-	77	34.974
ENSORLG00020015203	-	83	36.212	ENSORLG00020013085	-	60	36.627
ENSORLG00020015203	-	99	99.813	ENSORLG00020022538	-	75	99.813
ENSORLG00020015203	-	73	38.205	ENSORLG00020008293	-	50	38.205
ENSORLG00020015203	-	80	38.673	ENSORLG00020000868	-	67	38.673
ENSORLG00020015203	-	95	48.942	ENSORLG00020015468	-	52	49.179
ENSORLG00020015203	-	57	34.974	ENSORLG00020017439	-	55	34.974
ENSORLG00020015203	-	81	39.049	ENSORLG00020009176	-	60	39.049
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ENSORLG00020015203	-	65	35.751	ENSORLG00020003988	-	51	35.751
ENSORLG00020015203	-	63	35.751	ENSORLG00020013601	-	50	35.751
ENSORLG00020015203	-	57	34.456	ENSORLG00020004934	-	54	34.456
ENSORLG00020015203	-	95	48.942	ENSORLG00020005747	-	52	49.179

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020015203	-	80	41.630	ENSAPOG00000005387	-	70	38.406	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020015203	-	81	36.441	ENSAPOG00000000887	-	61	36.547	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020015203	-	96	37.321	ENSAPOG00000022647	-	75	37.040	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020015203	-	59	36.797	ENSAPOG00000015320	-	61	36.797	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020015203	-	84	38.420	ENSAPOG00000011081	-	60	38.907	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020015203	-	80	55.882	ENSAPEG00000015494	-	80	50.568	Amphiprion_percula
ENSORLG00020015203	-	50	36.972	ENSAPEG00000006765	-	86	37.324	Amphiprion_percula
ENSORLG00020015203	-	84	40.847	ENSAPEG00000002424	-	65	41.189	Amphiprion_percula
ENSORLG00020015203	-	95	37.996	ENSAPEG00000024442	-	70	38.683	Amphiprion_percula
ENSORLG00020015203	-	51	39.609	ENSAPEG00000002572	-	56	39.609	Amphiprion_percula
ENSORLG00020015203	-	80	55.882	ENSAPEG00000015779	-	69	50.568	Amphiprion_percula
ENSORLG00020015203	-	75	35.665	ENSATEG00000006997	-	91	35.665	Anabas_testudineus
ENSORLG00020015203	-	80	54.776	ENSATEG00000016298	-	82	54.776	Anabas_testudineus
ENSORLG00020015203	-	76	33.413	ENSATEG00000018698	-	71	33.413	Anabas_testudineus
ENSORLG00020015203	-	82	36.038	ENSACLG00000013171	-	63	36.316	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	82	53.289	ENSACLG00000027618	-	68	48.496	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	95	50.144	ENSACLG00000002182	-	75	50.479	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	98	49.449	ENSACLG00000000384	-	70	49.953	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	52	54.690	ENSACLG00000012278	-	72	54.690	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	69	60.643	ENSACLG00000024387	-	62	60.643	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	81	38.530	ENSACLG00000027747	-	59	38.393	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	81	41.886	ENSACLG00000020275	-	57	41.886	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	85	39.684	ENSACLG00000012963	-	58	40.435	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	99	61.325	ENSACLG00000004344	-	74	61.325	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	96	48.536	ENSACLG00000018454	-	91	48.962	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	80	42.905	ENSACLG00000005531	-	65	42.905	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	75	32.685	ENSACLG00000016581	-	67	32.685	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	98	36.557	ENSACLG00000010542	-	70	39.397	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	80	37.656	ENSACLG00000013947	-	80	37.656	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	95	39.186	ENSACLG00000001282	-	75	39.367	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	80	37.232	ENSACLG00000021546	-	61	37.232	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020015203	-	95	38.879	ENSACLG00000016624	-	65	41.832	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020015203	-	81	42.325	ENSACLG00000013455	-	62	42.325	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015203	-	99	38.129	ENSACLG00000009118	-	64	41.943	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020015203	-	92	38.601	ENSACLG00000012657	-	95	38.645	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020015203	-	80	35.532	ENSACLG00000008010	-	81	35.532	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020015203	-	80	38.966	ENSAMXG00000038338	-	64	38.808	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	60	39.912	ENSAMXG00000038480	-	95	39.912	Astyanax_mexicanus
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ENSORLG00020015203	-	68	38.792	ENSAMXG00000033197	-	99	39.195	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	70	36.880	ENSAMXG00000030908	-	68	36.880	Astyanax_mexicanus
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ENSORLG00020015203	-	62	35.821	ENSAMXG00000043821	-	97	35.821	Astyanax_mexicanus
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ENSORLG00020015203	-	88	36.636	ENSAMXG00000030479	-	63	37.935	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	74	33.213	ENSAMXG00000032559	-	72	33.213	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	81	37.057	ENSAMXG00000035138	-	61	37.057	Astyanax_mexicanus
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ENSORLG00020015203	-	69	36.291	ENSAMXG00000037864	-	60	36.291	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	80	38.940	ENSAMXG00000035335	-	61	39.401	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	84	39.753	ENSAMXG00000032330	-	63	40.693	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	74	36.646	ENSAMXG00000041114	-	86	36.784	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	78	32.080	ENSAMXG00000039114	-	79	32.080	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	81	42.082	ENSAMXG00000039110	-	78	38.427	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	73	37.733	ENSAMXG00000035923	-	99	37.733	Astyanax_mexicanus
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ENSORLG00020015203	-	81	41.761	ENSAMXG00000040885	-	66	41.761	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	96	38.462	ENSAMXG00000038997	-	72	38.462	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	90	37.500	ENSAMXG00000043385	-	64	39.631	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	96	37.723	ENSAMXG00000030747	-	53	37.159	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015203	-	81	36.910	ENSAMXG00000039912	-	62	36.910	Astyanax_mexicanus
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ENSORLG00020015203	-	95	37.989	ENSXMAG00000022175	-	70	38.359	Xiphophorus_maculatus