EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020015216 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1 (Drosophila)
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13432 bases
Position: chr12:2040448-2053879
Accession: ZDB-GENE-080522-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020030638	ResIII	PF04851.15	8.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020021930	-	6381	-	ENSORLP00020030638	1401 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020015216	sbno1	70	65.138	ENSORLG00020010978	si:ch73-63e15.2	69	58.004

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020015216	sbno1	99	74.736	ENSG00000139697	SBNO1	99	74.877	Homo_sapiens
ENSORLG00020015216	sbno1	82	92.876	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	92.789	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.351	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.070	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020015216	sbno1	100	85.462	ENSACIG00000008088	sbno1	99	85.321	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020015216	sbno1	100	89.837	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	89.979	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020015216	sbno1	100	89.837	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	89.979	Amphiprion_percula
ENSORLG00020015216	sbno1	100	89.922	ENSATEG00000006667	sbno1	100	89.922	Anabas_testudineus
ENSORLG00020015216	sbno1	98	75.430	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.687	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020015216	sbno1	98	74.499	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.173	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.577	ENSANAG00000029958	-	99	82.194	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020015216	sbno1	100	83.607	ENSACLG00000024913	sbno1	100	83.464	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015216	sbno1	100	81.321	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	81.334	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015216	sbno1	100	75.176	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	75.316	Bos_taurus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	74.877	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.018	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.264	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	83.532	Canis_familiaris
ENSORLG00020015216	sbno1	95	80.325	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	80.325	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.852	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	82.852	Capra_hircus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.088	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	75.906	Carlito_syrichta
ENSORLG00020015216	sbno1	89	83.002	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	83.002	Cavia_aperea
ENSORLG00020015216	sbno1	95	83.002	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	83.002	Cavia_porcellus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	70.886	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	71.429	Cebus_capucinus
ENSORLG00020015216	sbno1	93	82.406	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	82.406	Cercocebus_atys
ENSORLG00020015216	sbno1	95	83.002	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	83.002	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020015216	sbno1	82	81.357	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	81.615	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020015216	sbno1	96	72.872	ENSCHOG00000008814	SBNO1	99	69.669	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020015216	sbno1	98	74.946	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	75.071	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020015216	sbno1	99	71.449	ENSCANG00000042688	-	99	71.338	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020015216	sbno1	95	81.441	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	81.441	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020015216	sbno1	95	81.441	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	81.441	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020015216	sbno1	100	87.784	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	87.500	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020015216	sbno1	100	89.623	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	89.908	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	80.114	ENSDARG00000099080	sbno1	99	80.912	Danio_rerio
ENSORLG00020015216	sbno1	99	77.757	ENSDNOG00000017147	SBNO1	95	80.198	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	67.890	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	80.503	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020015216	sbno1	93	72.013	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.013	Echinops_telfairi
ENSORLG00020015216	sbno1	75	61.162	ENSEBUG00000013823	sbno1	77	70.673	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020015216	sbno1	51	73.103	ENSEASG00005012595	-	92	73.343	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.158	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	75.962	Equus_caballus
ENSORLG00020015216	sbno1	81	77.596	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	77.596	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020015216	sbno1	100	82.566	ENSELUG00000002886	sbno1	99	83.215	Esox_lucius
ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.457	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	75.246	Felis_catus
ENSORLG00020015216	sbno1	98	75.287	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	75.670	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020015216	sbno1	100	74.366	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	74.366	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020015216	sbno1	100	89.410	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	89.189	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020015216	sbno1	94	84.488	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	84.111	Gadus_morhua
ENSORLG00020015216	sbno1	88	75.378	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.777	Gallus_gallus
ENSORLG00020015216	sbno1	100	89.758	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	89.687	Gambusia_affinis
ENSORLG00020015216	sbno1	94	87.228	ENSGACG00000015633	sbno1	99	87.303	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020015216	sbno1	94	82.963	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	74.726	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.821	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	82.821	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020015216	sbno1	100	77.596	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	77.738	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020015216	sbno1	95	83.122	ENSHGLG00000014165	-	99	82.616	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020015216	sbno1	92	92.475	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	92.475	Hippocampus_comes
ENSORLG00020015216	sbno1	100	81.121	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	81.722	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.852	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	82.852	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020015216	sbno1	95	79.242	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	79.242	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	89.459	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	89.601	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020015216	sbno1	100	88.173	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	88.102	Labrus_bergylta
ENSORLG00020015216	sbno1	100	71.741	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.383	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020015216	sbno1	100	80.704	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.845	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	74.666	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.789	Loxodonta_africana
ENSORLG00020015216	sbno1	95	79.643	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	79.643	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020015216	sbno1	95	79.643	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	79.643	Macaca_mulatta
ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.671	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	82.671	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020015216	sbno1	100	90.327	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	90.398	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020015216	sbno1	98	75.612	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	75.847	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020015216	sbno1	51	72.969	ENSMAUG00000004834	-	99	73.109	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020015216	sbno1	95	79.673	ENSMICG00000006573	-	99	79.317	Microcebus_murinus
ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.310	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	82.310	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020015216	sbno1	100	81.818	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	82.741	Mola_mola
ENSORLG00020015216	sbno1	99	74.647	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	75.000	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020015216	sbno1	100	88.857	ENSMALG00000001056	sbno1	100	89.212	Monopterus_albus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.405	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	91.228	Mus_caroli
ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.387	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	91.228	Mus_musculus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.527	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	91.228	Mus_pahari
ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.352	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	91.228	Mus_spretus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.581	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	75.369	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.176	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	74.806	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020015216	sbno1	92	83.497	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	83.497	Nannospalax_galili
ENSORLG00020015216	sbno1	100	84.319	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	84.391	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020015216	sbno1	99	71.890	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	74.910	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020015216	sbno1	63	70.625	ENSMEUG00000008768	-	93	71.875	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020015216	sbno1	99	74.701	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.350	Ochotona_princeps
ENSORLG00020015216	sbno1	95	83.183	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	83.183	Octodon_degus
ENSORLG00020015216	sbno1	100	88.486	ENSONIG00000015348	sbno1	100	88.557	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020015216	sbno1	98	74.536	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	74.267	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020015216	sbno1	100	99.287	ENSORLG00000001593	sbno1	100	99.287	Oryzias_latipes
ENSORLG00020015216	sbno1	100	99.358	ENSORLG00015002726	sbno1	100	99.358	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020015216	sbno1	100	96.574	ENSOMEG00000019313	sbno1	100	96.574	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020015216	sbno1	51	72.331	ENSOGAG00000010781	-	99	72.574	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020015216	sbno1	100	74.807	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.211	Ovis_aries
ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.821	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	82.821	Pan_paniscus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.457	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.246	Panthera_pardus
ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.476	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.352	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.821	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	82.821	Pan_troglodytes
ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.671	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	82.671	Papio_anubis
ENSORLG00020015216	sbno1	99	80.255	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.538	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020015216	sbno1	98	74.785	ENSPSIG00000009572	-	99	74.684	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020015216	sbno1	92	71.701	ENSPSIG00000009256	-	99	72.464	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.130	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.130	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020015216	sbno1	99	74.841	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	74.982	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020015216	sbno1	100	90.185	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	90.114	Poecilia_formosa
ENSORLG00020015216	sbno1	100	90.185	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	90.114	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020015216	sbno1	100	90.192	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	90.121	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020015216	sbno1	100	89.552	ENSPREG00000017746	sbno1	100	89.481	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020015216	sbno1	99	74.930	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	75.000	Pongo_abelii
ENSORLG00020015216	sbno1	84	76.018	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	68.442	Procavia_capensis
ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.514	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	82.514	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020015216	sbno1	87	83.499	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	83.499	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020015216	sbno1	100	88.273	ENSPNYG00000004291	sbno1	100	88.344	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020015216	sbno1	100	80.723	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	80.510	Pygocentrus_nattereri
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ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.671	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	82.671	Rhinopithecus_roxellana
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