EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020015965 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nrde2
Alias: -
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 25254 bases
Position: chr22:19347553-19372806
Accession: 101159398
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020014917	NRDE-2	PF08424.10	8.4e-102	1	1
ENSORLP00020014953	NRDE-2	PF08424.10	9e-102	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020022782	-	3814	-	ENSORLP00020014917	1153 (aa)	-	-
ENSORLT00020022877	-	3955	XM_020713690	ENSORLP00020014953	1200 (aa)	XP_020569349	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020015965's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020015965's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.665	ENSG00000119720	NRDE2	100	68.137	Homo_sapiens
ENSORLG00020015965	nrde2	100	72.803	ENSAPOG00000009202	nrde2	99	72.268	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.571	ENSAMEG00000001807	NRDE2	100	44.598	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020015965	nrde2	97	69.676	ENSACIG00000014783	nrde2	100	69.159	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020015965	nrde2	100	71.854	ENSAOCG00000015576	nrde2	99	72.720	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020015965	nrde2	100	71.772	ENSAPEG00000001711	nrde2	99	72.637	Amphiprion_percula
ENSORLG00020015965	nrde2	100	70.530	ENSATEG00000010247	nrde2	99	69.619	Anabas_testudineus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.050	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	45.289	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.072	ENSACAG00000014571	NRDE2	100	43.912	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020015965	nrde2	99	42.751	ENSANAG00000025313	NRDE2	100	41.972	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020015965	nrde2	100	70.364	ENSACLG00000025154	nrde2	100	70.116	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020015965	nrde2	81	69.767	ENSAMXG00000034642	nrde2	92	49.644	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.499	ENSBTAG00000005427	NRDE2	100	45.741	Bos_taurus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.207	ENSCJAG00000017711	NRDE2	100	44.481	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	43.105	ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	42.432	Canis_familiaris
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.298	ENSCAFG00020016346	NRDE2	89	47.230	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.362	ENSCHIG00000005876	NRDE2	100	44.426	Capra_hircus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.775	ENSTSYG00000000161	NRDE2	100	44.980	Carlito_syrichta
ENSORLG00020015965	nrde2	91	47.180	ENSCAPG00000012039	NRDE2	88	48.516	Cavia_aperea
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.895	ENSCPOG00000002428	NRDE2	100	45.735	Cavia_porcellus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.050	ENSCCAG00000024917	NRDE2	91	46.126	Cebus_capucinus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.260	ENSCLAG00000015185	NRDE2	88	47.746	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.215	ENSCSAG00000011451	NRDE2	100	44.808	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020015965	nrde2	74	45.667	ENSCHOG00000006165	NRDE2	75	45.578	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.943	ENSCPBG00000008537	NRDE2	98	45.359	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.380	ENSCANG00000029067	NRDE2	100	45.053	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.992	ENSCGRG00001015658	Nrde2	89	46.787	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.350	ENSCGRG00000005062	Nrde2	100	44.662	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020015965	nrde2	97	63.870	ENSCSEG00000000089	nrde2	98	66.175	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020015965	nrde2	100	69.345	ENSCVAG00000023105	nrde2	100	68.683	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020015965	nrde2	100	54.208	ENSDARG00000074726	nrde2	100	54.012	Danio_rerio
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.447	ENSDNOG00000024057	NRDE2	100	45.610	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020015965	nrde2	81	47.650	ENSDORG00000003197	Nrde2	96	48.254	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020015965	nrde2	65	49.091	ENSETEG00000000198	NRDE2	65	49.091	Echinops_telfairi
ENSORLG00020015965	nrde2	99	38.596	ENSEBUG00000014552	nrde2	99	38.030	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.164	ENSEASG00005020675	NRDE2	100	45.130	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.492	ENSECAG00000003862	NRDE2	100	45.321	Equus_caballus
ENSORLG00020015965	nrde2	65	57.143	ENSEEUG00000004026	-	74	57.143	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020015965	nrde2	100	56.735	ENSELUG00000005973	nrde2	100	56.653	Esox_lucius
ENSORLG00020015965	nrde2	100	45.248	ENSFCAG00000011312	NRDE2	100	45.248	Felis_catus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	46.248	ENSFALG00000012260	NRDE2	99	45.840	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.095	ENSFDAG00000021350	NRDE2	100	44.517	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020015965	nrde2	100	70.107	ENSFHEG00000021385	nrde2	99	69.860	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020015965	nrde2	66	69.647	ENSGMOG00000015815	nrde2	90	70.084	Gadus_morhua
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.298	ENSGALG00000010677	NRDE2	99	44.926	Gallus_gallus
ENSORLG00020015965	nrde2	92	67.296	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	70.701	Gambusia_affinis
ENSORLG00020015965	nrde2	100	67.599	ENSGACG00000012619	nrde2	100	67.352	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.261	ENSGAGG00000003252	NRDE2	100	45.307	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.514	ENSGGOG00000008835	NRDE2	100	44.580	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020015965	nrde2	100	70.447	ENSHBUG00000016736	nrde2	100	70.281	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020015965	nrde2	99	46.078	ENSHGLG00000006731	NRDE2	100	45.854	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020015965	nrde2	97	46.050	ENSHGLG00100017736	NRDE2	90	48.222	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020015965	nrde2	92	62.016	ENSHCOG00000009559	nrde2	97	62.250	Hippocampus_comes
ENSORLG00020015965	nrde2	100	48.762	ENSIPUG00000016129	nrde2	100	48.185	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.499	ENSSTOG00000001678	NRDE2	100	45.306	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.299	ENSJJAG00000000907	Nrde2	100	45.203	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020015965	nrde2	100	70.554	ENSKMAG00000008647	nrde2	100	71.133	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020015965	nrde2	91	69.120	ENSLBEG00000021428	nrde2	98	67.486	Labrus_bergylta
ENSORLG00020015965	nrde2	75	49.653	ENSLACG00000013921	NRDE2	98	49.882	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020015965	nrde2	100	52.766	ENSLOCG00000009037	nrde2	99	53.009	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020015965	nrde2	98	45.025	ENSLAFG00000004966	NRDE2	91	47.086	Loxodonta_africana
ENSORLG00020015965	nrde2	84	47.331	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	67.647	Macaca_mulatta
ENSORLG00020015965	nrde2	100	70.647	ENSMAMG00000013452	nrde2	99	70.481	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020015965	nrde2	100	70.447	ENSMZEG00005008319	nrde2	100	70.199	Maylandia_zebra
ENSORLG00020015965	nrde2	89	46.272	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	46.227	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.646	ENSMAUG00000018578	Nrde2	100	44.906	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	46.078	ENSMICG00000016741	NRDE2	88	48.387	Microcebus_murinus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	43.301	ENSMOCG00000014472	Nrde2	100	42.857	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020015965	nrde2	76	67.117	ENSMMOG00000004703	nrde2	92	66.779	Mola_mola
ENSORLG00020015965	nrde2	94	44.030	ENSMODG00000002711	NRDE2	85	46.925	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020015965	nrde2	91	67.909	ENSMALG00000021869	nrde2	99	66.869	Monopterus_albus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.726	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	47.952	Mus_caroli
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.114	ENSMUSG00000021179	Nrde2	86	48.186	Mus_musculus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.335	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	44.959	Mus_pahari
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.350	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	88	67.925	Mus_spretus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.261	ENSMPUG00000008135	NRDE2	100	44.199	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.691	ENSMLUG00000007484	NRDE2	89	46.812	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.098	ENSNGAG00000002993	Nrde2	100	44.625	Nannospalax_galili
ENSORLG00020015965	nrde2	92	69.086	ENSNBRG00000010184	nrde2	99	69.881	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020015965	nrde2	97	44.839	ENSNLEG00000017032	NRDE2	100	43.570	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020015965	nrde2	77	48.221	ENSMEUG00000011097	NRDE2	74	47.826	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020015965	nrde2	58	58.889	ENSOPRG00000001375	-	60	61.386	Ochotona_princeps
ENSORLG00020015965	nrde2	97	43.939	ENSODEG00000012422	NRDE2	89	46.785	Octodon_degus
ENSORLG00020015965	nrde2	100	68.946	ENSONIG00000019512	nrde2	100	69.110	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.582	ENSOCUG00000010083	NRDE2	88	47.567	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020015965	nrde2	96	89.625	ENSORLG00000017730	nrde2	99	89.364	Oryzias_latipes
ENSORLG00020015965	nrde2	100	98.000	ENSORLG00015012437	nrde2	100	98.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020015965	nrde2	100	86.047	ENSOMEG00000010890	nrde2	100	86.296	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.754	ENSOGAG00000006624	NRDE2	88	47.970	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020015965	nrde2	97	43.529	ENSOARG00000003475	NRDE2	90	45.051	Ovis_aries
ENSORLG00020015965	nrde2	97	45.608	ENSPPAG00000034133	NRDE2	96	48.626	Pan_paniscus
ENSORLG00020015965	nrde2	100	45.358	ENSPPRG00000006422	NRDE2	100	45.240	Panthera_pardus
ENSORLG00020015965	nrde2	100	45.603	ENSPTIG00000009989	NRDE2	100	45.484	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.665	ENSPTRG00000023399	NRDE2	100	44.726	Pan_troglodytes
ENSORLG00020015965	nrde2	100	49.183	ENSPKIG00000009331	nrde2	100	49.795	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.354	ENSPSIG00000005588	NRDE2	87	46.858	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020015965	nrde2	97	62.288	ENSPMGG00000024089	nrde2	93	63.521	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.262	ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	47.838	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020015965	nrde2	52	42.645	ENSPMAG00000003270	-	99	43.243	Petromyzon_marinus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.581	ENSPCIG00000018567	NRDE2	100	45.499	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020015965	nrde2	100	67.519	ENSPFOG00000013217	nrde2	99	67.766	Poecilia_formosa
ENSORLG00020015965	nrde2	100	69.167	ENSPLAG00000022350	nrde2	99	69.326	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020015965	nrde2	100	68.997	ENSPMEG00000000778	nrde2	99	69.243	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020015965	nrde2	100	69.465	ENSPREG00000009066	nrde2	99	69.712	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020015965	nrde2	88	45.463	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	45.805	Pongo_abelii
ENSORLG00020015965	nrde2	69	64.615	ENSPCAG00000016399	NRDE2	69	64.615	Procavia_capensis
ENSORLG00020015965	nrde2	95	44.836	ENSPCOG00000024684	NRDE2	100	44.062	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020015965	nrde2	97	42.523	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	41.255	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	69.496	ENSPNYG00000022833	nrde2	97	72.698	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020015965	nrde2	92	53.147	ENSPNAG00000015807	nrde2	95	53.218	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020015965	nrde2	91	44.047	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	43.986	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.124	ENSSBOG00000024346	NRDE2	100	44.563	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020015965	nrde2	99	45.656	ENSSHAG00000016736	NRDE2	97	45.403	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020015965	nrde2	100	51.232	ENSSFOG00015011794	nrde2	100	51.393	Scleropages_formosus
ENSORLG00020015965	nrde2	100	68.234	ENSSMAG00000011671	nrde2	99	68.395	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020015965	nrde2	100	72.254	ENSSDUG00000017948	nrde2	99	71.841	Seriola_dumerili
ENSORLG00020015965	nrde2	88	75.622	ENSSLDG00000023798	nrde2	99	85.354	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020015965	nrde2	92	46.948	ENSSPUG00000006348	NRDE2	98	47.470	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020015965	nrde2	95	70.455	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	71.762	Stegastes_partitus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.890	ENSSSCG00000002434	NRDE2	100	44.310	Sus_scrofa
ENSORLG00020015965	nrde2	98	46.494	ENSTGUG00000012462	-	99	46.045	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020015965	nrde2	82	67.194	ENSTRUG00000002798	nrde2	97	66.034	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020015965	nrde2	86	50.549	ENSTBEG00000011834	NRDE2	83	51.481	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.108	ENSTTRG00000013583	NRDE2	100	44.274	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020015965	nrde2	90	45.845	ENSUAMG00000004159	NRDE2	93	46.510	Ursus_americanus
ENSORLG00020015965	nrde2	93	41.501	ENSUMAG00000006393	NRDE2	96	44.467	Ursus_maritimus
ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.724	ENSVVUG00000018202	NRDE2	87	47.479	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020015965	nrde2	92	43.677	ENSXETG00000015708	nrde2	100	42.518	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020015965	nrde2	92	66.547	ENSXCOG00000013298	nrde2	96	66.576	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020015965	nrde2	100	69.680	ENSXMAG00000009320	nrde2	100	69.597	Xiphophorus_maculatus