EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020016456 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pelo
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9641 bases
Position: chr19:6464550-6474190
Accession: ZDB-GENE-040426-1074
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020015432	eRF1_2	PF03464.15	2.3e-34	1	1
ENSORLP00020031413	eRF1_2	PF03464.15	2.4e-34	1	1
ENSORLP00020015432	eRF1_3	PF03465.15	8.1e-26	1	1
ENSORLP00020015432	eRF1_1	PF03463.15	2e-51	1	1
ENSORLP00020031413	eRF1_1	PF03463.15	2.1e-51	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020023411	-	1110	-	ENSORLP00020031413	369 (aa)	-	-
ENSORLT00020033448	-	2607	-	ENSORLP00020015432	385 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020016456's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020016456's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.299	ENSG00000152684	PELO	100	81.299	Homo_sapiens
ENSORLG00020016456	pelo	100	91.948	ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020016456	pelo	67	91.498	ENSAPOG00000023700	-	90	91.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020016456	pelo	67	91.498	ENSAPOG00000000616	pelo	90	91.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSAMEG00000007734	PELO	100	81.558	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020016456	pelo	97	87.131	ENSACIG00000014386	pelo	97	92.899	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020016456	pelo	100	92.208	ENSAOCG00000023717	pelo	100	92.208	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020016456	pelo	100	92.208	ENSAPEG00000011235	pelo	100	92.208	Amphiprion_percula
ENSORLG00020016456	pelo	100	92.727	ENSATEG00000019550	pelo	100	92.727	Anabas_testudineus
ENSORLG00020016456	pelo	77	72.483	ENSAPLG00000013265	PELO	100	72.483	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020016456	pelo	97	80.800	ENSACAG00000004352	PELO	100	80.260	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.299	ENSANAG00000014096	PELO	100	81.299	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020016456	pelo	100	90.130	ENSACLG00000010305	pelo	100	90.130	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020016456	pelo	97	91.153	ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.674	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.039	ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.039	Bos_taurus
ENSORLG00020016456	pelo	100	59.481	WBGene00011280	pelo-1	100	59.481	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.558	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.818	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020016456	pelo	100	80.779	ENSCHIG00000016410	PELO	99	80.779	Capra_hircus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSTSYG00000005203	PELO	100	81.818	Carlito_syrichta
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.558	Cavia_porcellus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSCCAG00000035600	PELO	100	81.558	Cebus_capucinus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSCATG00000011829	PELO	100	81.818	Cercocebus_atys
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.039	ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.039	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.818	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.299	ENSCHOG00000000523	PELO	100	81.299	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020016456	pelo	97	81.867	ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.299	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020016456	pelo	97	63.271	ENSCING00000001979	-	100	63.377	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020016456	pelo	100	65.195	ENSCSAVG00000006158	-	100	65.195	Ciona_savignyi
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSCANG00000023382	PELO	100	81.818	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020016456	pelo	97	80.965	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	81.039	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020016456	pelo	97	81.769	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	81.818	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020016456	pelo	100	91.688	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.688	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020016456	pelo	100	91.948	ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.948	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020016456	pelo	100	88.312	ENSDARG00000055477	pelo	100	88.312	Danio_rerio
ENSORLG00020016456	pelo	100	79.016	ENSDNOG00000036721	PELO	100	79.016	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.818	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020016456	pelo	96	69.189	FBgn0011207	pelo	97	67.885	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020016456	pelo	71	76.608	ENSEBUG00000004955	pelo	99	76.608	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.039	ENSEASG00005013348	PELO	100	81.039	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020016456	pelo	100	90.130	ENSELUG00000023229	pelo	100	90.130	Esox_lucius
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.299	ENSFCAG00000032341	PELO	100	81.299	Felis_catus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.039	ENSFALG00000004559	PELO	100	81.039	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020016456	pelo	77	82.042	ENSFDAG00000002076	PELO	88	82.042	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020016456	pelo	100	90.649	ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.649	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020016456	pelo	98	89.125	ENSGMOG00000005849	pelo	100	89.091	Gadus_morhua
ENSORLG00020016456	pelo	100	90.390	ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.390	Gambusia_affinis
ENSORLG00020016456	pelo	100	93.247	ENSGACG00000007245	pelo	100	93.247	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020016456	pelo	97	81.600	ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.039	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSGGOG00000012635	PELO	100	81.818	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020016456	pelo	100	90.130	ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.130	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSHGLG00000005932	PELO	100	81.558	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020016456	pelo	100	79.481	ENSHGLG00100017627	PELO	100	79.481	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020016456	pelo	100	89.091	ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.091	Hippocampus_comes
ENSORLG00020016456	pelo	100	87.273	ENSIPUG00000020627	pelo	100	87.273	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.558	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020016456	pelo	100	79.221	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	79.221	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020016456	pelo	100	92.727	ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.727	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020016456	pelo	100	90.909	ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	Labrus_bergylta
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.299	ENSLAFG00000020551	PELO	100	81.299	Loxodonta_africana
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSMFAG00000000651	PELO	100	81.818	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSMMUG00000039101	PELO	100	81.818	Macaca_mulatta
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSMNEG00000035538	PELO	100	81.818	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSMLEG00000039113	PELO	100	81.818	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020016456	pelo	97	94.638	ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.026	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020016456	pelo	100	90.130	ENSMZEG00005014258	pelo	100	90.130	Maylandia_zebra
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.039	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	81.039	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSMICG00000044040	PELO	100	81.558	Microcebus_murinus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	81.558	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020016456	pelo	100	90.909	ENSMMOG00000001324	pelo	100	90.909	Mola_mola
ENSORLG00020016456	pelo	100	92.208	ENSMALG00000008194	pelo	100	92.208	Monopterus_albus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.039	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	81.039	Mus_caroli
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.039	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	81.039	Mus_musculus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.299	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	81.299	Mus_pahari
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	81.558	Mus_spretus
ENSORLG00020016456	pelo	100	80.779	ENSMLUG00000024132	PELO	100	80.779	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	81.818	Nannospalax_galili
ENSORLG00020016456	pelo	100	90.130	ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.130	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSNLEG00000035970	PELO	100	81.818	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020016456	pelo	100	80.000	ENSMEUG00000005468	PELO	100	80.000	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020016456	pelo	98	80.739	ENSOPRG00000018793	PELO	100	80.739	Ochotona_princeps
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.039	ENSODEG00000017579	PELO	100	81.039	Octodon_degus
ENSORLG00020016456	pelo	96	91.105	ENSONIG00000011511	pelo	100	90.909	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.558	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020016456	pelo	100	99.740	ENSORLG00000005827	pelo	100	99.740	Oryzias_latipes
ENSORLG00020016456	pelo	100	98.961	ENSORLG00015014447	pelo	100	98.961	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020016456	pelo	100	96.883	ENSOMEG00000021567	pelo	100	96.883	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020016456	pelo	100	82.078	ENSOGAG00000027940	PELO	100	82.078	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.039	ENSOARG00000008324	PELO	99	81.039	Ovis_aries
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSPPAG00000038951	PELO	100	81.818	Pan_paniscus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.299	ENSPPRG00000018800	PELO	100	81.299	Panthera_pardus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.299	ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.299	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.558	Pan_troglodytes
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSPANG00000010902	PELO	100	81.818	Papio_anubis
ENSORLG00020016456	pelo	100	89.091	ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.091	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020016456	pelo	97	81.600	ENSPSIG00000004971	PELO	100	81.039	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020016456	pelo	70	90.310	ENSPMGG00000014561	pelo	95	90.310	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.299	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	81.299	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020016456	pelo	100	80.519	ENSPCIG00000004880	PELO	100	80.519	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020016456	pelo	100	91.688	ENSPFOG00000007277	pelo	100	91.688	Poecilia_formosa
ENSORLG00020016456	pelo	100	91.688	ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.688	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020016456	pelo	100	91.688	ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.688	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020016456	pelo	100	91.688	ENSPREG00000023071	pelo	100	91.688	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020016456	pelo	97	82.038	ENSPPYG00000015451	PELO	96	81.818	Pongo_abelii
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSPCOG00000021178	PELO	100	81.558	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020016456	pelo	100	90.130	ENSPNYG00000017325	pelo	100	90.130	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020016456	pelo	97	89.812	ENSPNAG00000012458	pelo	99	88.571	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	81.558	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSRBIG00000007299	PELO	100	81.818	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSRROG00000035507	PELO	100	81.818	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020016456	pelo	97	33.158	YNL001W	-	97	33.158	Saccharomyces_cerevisiae
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.299	ENSSBOG00000036140	PELO	100	81.299	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020016456	pelo	63	79.508	ENSSHAG00000010770	PELO	100	79.508	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020016456	pelo	98	89.920	ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.870	Scleropages_formosus
ENSORLG00020016456	pelo	100	92.987	ENSSMAG00000017171	pelo	100	92.987	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020016456	pelo	100	92.208	ENSSDUG00000022938	pelo	100	92.208	Seriola_dumerili
ENSORLG00020016456	pelo	100	88.571	ENSSLDG00000017884	pelo	100	88.571	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020016456	pelo	97	81.600	ENSSPUG00000005545	PELO	100	81.039	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020016456	pelo	98	92.838	ENSSPAG00000008501	pelo	100	92.727	Stegastes_partitus
ENSORLG00020016456	pelo	100	79.740	ENSSSCG00000016884	PELO	100	79.740	Sus_scrofa
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.558	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020016456	pelo	100	91.429	ENSTRUG00000005809	pelo	100	91.429	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020016456	pelo	100	91.948	ENSTNIG00000018937	pelo	100	91.948	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020016456	pelo	100	80.779	ENSTTRG00000001857	PELO	100	80.779	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSUAMG00000002535	PELO	100	81.558	Ursus_americanus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	ENSUMAG00000005809	PELO	100	81.558	Ursus_maritimus
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.299	ENSVPAG00000001113	PELO	100	81.299	Vicugna_pacos
ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	ENSVVUG00000025499	PELO	100	81.818	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020016456	pelo	81	77.097	ENSXETG00000018368	pelo	100	75.460	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020016456	pelo	100	92.208	ENSXMAG00000018474	pelo	100	92.208	Xiphophorus_maculatus