EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017012 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: cnot1
Alias: -
Full Name: CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 21676 bases
Position: chr6:23422054-23443729
Accession: 101156649
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020015928	Not1	PF04054.15	6.1e-122	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020024082	-	6990	XM_011476366	ENSORLP00020015928	2329 (aa)	XP_011474668	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020017012's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020017012's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.777	ENSG00000125107	CNOT1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.498	ENSAPOG00000005042	cnot1	100	91.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.819	ENSAMEG00000017298	CNOT1	100	89.141	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020017012	cnot1	90	92.807	ENSACIG00000016003	cnot1	100	93.181	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	93.519	ENSAPEG00000022342	cnot1	100	93.645	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.334	ENSATEG00000012892	cnot1	100	91.334	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.260	ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	88.386	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020017012	cnot1	92	88.873	ENSACAG00000001602	CNOT1	98	88.961	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020017012	cnot1	100	89.117	ENSANAG00000038198	CNOT1	100	89.447	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.810	ENSACLG00000014234	cnot1	100	91.894	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.870	ENSAMXG00000013170	cnot1	100	92.039	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.633	ENSBTAG00000020782	CNOT1	100	88.954	Bos_taurus
ENSORLG00020017012	cnot1	76	40.382	WBGene00002845	let-711	81	40.193	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.465	ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	88.786	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.196	ENSCAFG00000008426	CNOT1	100	88.516	Canis_familiaris
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.403	ENSCAFG00020010156	CNOT1	100	90.734	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.633	ENSCHIG00000010452	CNOT1	100	88.954	Capra_hircus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.531	ENSTSYG00000006888	CNOT1	100	90.862	Carlito_syrichta
ENSORLG00020017012	cnot1	100	86.675	ENSCPOG00000013026	CNOT1	100	86.615	Cavia_porcellus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.903	ENSCCAG00000026333	CNOT1	100	89.018	Cebus_capucinus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.488	ENSCATG00000032625	CNOT1	100	90.819	Cercocebus_atys
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.549	ENSCLAG00000006289	CNOT1	100	88.870	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.549	ENSCSAG00000004731	CNOT1	100	88.870	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020017012	cnot1	80	97.727	ENSCHOG00000009712	CNOT1	83	96.296	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020017012	cnot1	98	88.670	ENSCPBG00000026222	CNOT1	99	88.583	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020017012	cnot1	100	56.752	ENSCING00000009149	-	100	56.579	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020017012	cnot1	92	58.607	ENSCSAVG00000002414	-	93	79.470	Ciona_savignyi
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.865	ENSCANG00000040534	CNOT1	100	88.979	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.446	ENSCGRG00001016365	Cnot1	100	90.648	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.446	ENSCGRG00000001714	Cnot1	100	90.648	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020017012	cnot1	97	92.707	ENSCVAG00000018930	cnot1	100	92.707	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.180	ENSDARG00000004174	cnot1	100	90.886	Danio_rerio
ENSORLG00020017012	cnot1	100	86.566	ENSDNOG00000013250	CNOT1	100	86.692	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020017012	cnot1	99	45.371	FBgn0085436	Not1	96	47.380	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020017012	cnot1	84	87.651	ENSETEG00000012806	CNOT1	84	87.651	Echinops_telfairi
ENSORLG00020017012	cnot1	81	81.180	ENSEBUG00000011534	cnot1	95	81.180	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017012	cnot1	100	85.529	ENSEASG00005005819	CNOT1	100	87.625	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.758	ENSECAG00000009889	CNOT1	100	88.996	Equus_caballus
ENSORLG00020017012	cnot1	89	88.768	ENSEEUG00000006015	CNOT1	90	89.210	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.508	ENSELUG00000014085	cnot1	100	91.629	Esox_lucius
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.331	ENSFCAG00000025155	CNOT1	100	88.652	Felis_catus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.450	ENSFALG00000007285	CNOT1	100	88.576	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.446	ENSFDAG00000013399	CNOT1	100	90.776	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020017012	cnot1	100	93.401	ENSFHEG00000020574	cnot1	100	93.401	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020017012	cnot1	92	94.107	ENSGMOG00000012864	cnot1	100	93.503	Gadus_morhua
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.282	ENSGALG00000002301	CNOT1	100	88.408	Gallus_gallus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	92.126	ENSGAFG00000015005	cnot1	100	92.168	Gambusia_affinis
ENSORLG00020017012	cnot1	92	95.501	ENSGACG00000002606	cnot1	99	95.362	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.744	ENSGAGG00000022646	CNOT1	100	88.702	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.591	ENSGGOG00000009547	CNOT1	100	88.912	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.894	ENSHBUG00000001729	cnot1	100	91.978	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.488	ENSHGLG00000014322	CNOT1	100	90.776	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020017012	cnot1	100	93.079	ENSHCOG00000006501	cnot1	100	92.953	Hippocampus_comes
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.004	ENSIPUG00000011915	cnot1	100	89.962	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.360	ENSSTOG00000005490	CNOT1	100	90.691	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	89.889	ENSJJAG00000000633	Cnot1	100	90.219	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	93.913	ENSKMAG00000006149	cnot1	100	93.367	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020017012	cnot1	95	94.292	ENSLBEG00000004740	cnot1	100	94.007	Labrus_bergylta
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.870	ENSLACG00000010869	CNOT1	100	88.828	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.726	ENSLOCG00000006324	cnot1	100	91.768	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.433	ENSLAFG00000000098	CNOT1	100	88.754	Loxodonta_africana
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.488	ENSMFAG00000035888	CNOT1	100	90.819	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.446	ENSMMUG00000014625	CNOT1	94	98.545	Macaca_mulatta
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.218	ENSMNEG00000031820	CNOT1	100	88.257	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020017012	cnot1	100	89.374	ENSMLEG00000040933	CNOT1	100	89.704	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.498	ENSMAMG00000016524	cnot1	100	91.498	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.651	ENSMZEG00005016210	cnot1	100	88.441	Maylandia_zebra
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.552	ENSMGAG00000001908	CNOT1	100	88.678	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.554	ENSMICG00000007071	CNOT1	100	90.773	Microcebus_murinus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.446	ENSMOCG00000017969	Cnot1	100	90.691	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.646	ENSMMOG00000019134	cnot1	100	90.561	Mola_mola
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.302	ENSMODG00000014199	CNOT1	100	88.665	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.919	ENSMALG00000008645	cnot1	100	91.919	Monopterus_albus
ENSORLG00020017012	cnot1	95	95.238	MGP_CAROLIEiJ_G0031430	Cnot1	92	95.238	Mus_caroli
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.488	ENSMUSG00000036550	Cnot1	100	90.734	Mus_musculus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.488	MGP_PahariEiJ_G0023028	Cnot1	100	90.734	Mus_pahari
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.488	MGP_SPRETEiJ_G0032549	Cnot1	100	90.734	Mus_spretus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.591	ENSMPUG00000004830	CNOT1	100	88.912	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.087	ENSMLUG00000003728	CNOT1	100	88.450	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.317	ENSNGAG00000018628	Cnot1	100	90.648	Nannospalax_galili
ENSORLG00020017012	cnot1	94	92.987	ENSNBRG00000019358	cnot1	100	92.987	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.488	ENSNLEG00000003566	CNOT1	100	90.819	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020017012	cnot1	86	91.275	ENSMEUG00000006145	CNOT1	86	91.275	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020017012	cnot1	85	96.117	ENSOPRG00000005604	CNOT1	86	96.117	Ochotona_princeps
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.403	ENSODEG00000016337	CNOT1	100	90.734	Octodon_degus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	93.574	ENSONIG00000007358	cnot1	100	93.490	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020017012	cnot1	92	89.786	ENSOANG00000012109	CNOT1	99	90.237	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.549	ENSOCUG00000006911	CNOT1	100	88.912	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	97.939	ENSORLG00000013734	cnot1	100	97.939	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017012	cnot1	100	99.871	ENSORLG00015007091	cnot1	100	99.871	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020017012	cnot1	100	98.500	ENSOMEG00000015124	cnot1	100	98.500	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.633	ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	88.758	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.633	ENSOARG00000001567	CNOT1	100	88.954	Ovis_aries
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.488	ENSPPAG00000022013	CNOT1	100	90.819	Pan_paniscus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.591	ENSPPRG00000004867	CNOT1	100	88.912	Panthera_pardus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.591	ENSPTIG00000012589	CNOT1	100	88.912	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.488	ENSPTRG00000008183	CNOT1	100	90.819	Pan_troglodytes
ENSORLG00020017012	cnot1	100	87.350	ENSPANG00000020901	CNOT1	100	87.463	Papio_anubis
ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.635	ENSPKIG00000023538	CNOT1	100	91.383	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020017012	cnot1	97	88.483	ENSPKIG00000002914	CNOT1	99	88.483	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.408	ENSPSIG00000005499	CNOT1	100	88.534	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020017012	cnot1	100	77.923	ENSPMAG00000009381	cnot1	100	78.133	Petromyzon_marinus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.360	ENSPCIG00000007343	CNOT1	100	90.605	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020017012	cnot1	99	94.648	ENSPFOG00000003497	cnot1	98	94.735	Poecilia_formosa
ENSORLG00020017012	cnot1	95	93.405	ENSPLAG00000014018	cnot1	100	93.519	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020017012	cnot1	95	91.411	ENSPMEG00000005868	cnot1	100	91.468	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020017012	cnot1	95	93.576	ENSPREG00000018793	cnot1	100	93.690	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.507	ENSPPYG00000007410	CNOT1	100	88.828	Pongo_abelii
ENSORLG00020017012	cnot1	87	88.830	ENSPCAG00000003241	CNOT1	88	88.830	Procavia_capensis
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.597	ENSPCOG00000027139	CNOT1	100	90.815	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020017012	cnot1	100	85.780	ENSPVAG00000004243	CNOT1	100	86.350	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.480	ENSPNYG00000012919	cnot1	100	90.270	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.733	ENSPNAG00000000246	cnot1	100	90.733	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.507	ENSRNOG00000012271	Cnot1	100	88.744	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.560	ENSRBIG00000044598	CNOT1	100	88.674	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020017012	cnot1	100	90.488	ENSRROG00000000906	CNOT1	100	90.819	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020017012	cnot1	100	86.453	ENSSBOG00000029155	CNOT1	100	86.564	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.339	ENSSHAG00000012187	CNOT1	100	88.702	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020017012	cnot1	100	93.884	ENSSFOG00015017614	cnot1	100	93.627	Scleropages_formosus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	93.566	ENSSMAG00000013844	cnot1	100	93.566	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.039	ENSSDUG00000021491	cnot1	100	91.039	Seriola_dumerili
ENSORLG00020017012	cnot1	100	94.396	ENSSLDG00000014816	cnot1	100	94.396	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020017012	cnot1	85	97.400	ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.400	Sorex_araneus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	92.932	ENSSPAG00000018802	cnot1	100	92.890	Stegastes_partitus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.423	ENSSSCG00000002799	CNOT1	100	88.744	Sus_scrofa
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.339	ENSTGUG00000005919	CNOT1	100	88.465	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.722	ENSTNIG00000018706	cnot1	100	91.597	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020017012	cnot1	80	97.887	ENSTBEG00000000720	CNOT1	80	97.887	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020017012	cnot1	95	87.007	ENSTTRG00000008460	CNOT1	95	87.159	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.591	ENSUAMG00000009251	CNOT1	100	88.912	Ursus_americanus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.591	ENSUMAG00000021291	CNOT1	100	88.912	Ursus_maritimus
ENSORLG00020017012	cnot1	97	86.891	ENSVPAG00000008846	CNOT1	97	86.891	Vicugna_pacos
ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.860	ENSVVUG00000024037	CNOT1	100	88.975	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020017012	cnot1	100	83.641	ENSXETG00000015900	cnot1	100	83.711	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020017012	cnot1	100	92.168	ENSXCOG00000013552	cnot1	100	92.211	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020017012	cnot1	100	92.211	ENSXMAG00000006031	cnot1	100	92.253	Xiphophorus_maculatus