EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017052 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1272 bases
Position: chr1:17861947-17863218
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020016029	RVT_1	PF00078.27	1.3e-21	1	1

Transcripts

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ENSORLT00020024203	-	1272	-	ENSORLP00020016029	354 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSORLG00020017052	-	83	48.829	ENSORLG00020018736	-	71	48.829
ENSORLG00020017052	-	97	64.162	ENSORLG00020021677	-	70	64.162
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ENSORLG00020017052	-	98	45.251	ENSORLG00020012070	-	58	45.179
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ENSORLG00020017052	-	87	46.774	ENSORLG00020011671	-	98	46.774
ENSORLG00020017052	-	99	45.609	ENSORLG00020010320	-	75	45.609
ENSORLG00020017052	-	99	43.503	ENSORLG00020019399	-	63	43.785
ENSORLG00020017052	-	95	44.510	ENSORLG00020011841	-	92	44.510
ENSORLG00020017052	-	94	49.851	ENSORLG00020011734	-	65	49.851
ENSORLG00020017052	-	100	49.721	ENSORLG00020015554	-	93	49.721
ENSORLG00020017052	-	97	50.287	ENSORLG00020003990	-	73	50.287
ENSORLG00020017052	-	59	46.479	ENSORLG00020003812	-	54	46.479
ENSORLG00020017052	-	99	46.307	ENSORLG00020019488	-	51	46.307
ENSORLG00020017052	-	97	50.862	ENSORLG00020005478	-	99	50.862
ENSORLG00020017052	-	99	49.859	ENSORLG00020008589	-	66	49.859
ENSORLG00020017052	-	99	50.000	ENSORLG00020017390	-	67	50.000

Orthologs

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ENSORLG00020017052	-	99	54.930	ENSAOCG00000004576	-	96	54.930	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017052	-	52	37.968	ENSAOCG00000022972	-	98	37.968	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017052	-	99	54.366	ENSAPEG00000024502	-	96	54.366	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017052	-	96	41.520	ENSATEG00000004798	-	60	41.520	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017052	-	97	52.286	ENSATEG00000004857	-	75	52.286	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017052	-	95	38.462	ENSATEG00000014055	-	59	38.192	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017052	-	99	52.809	ENSATEG00000015931	-	70	52.809	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017052	-	99	52.809	ENSATEG00000015490	-	57	52.809	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017052	-	97	41.570	ENSATEG00000019241	-	98	41.379	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017052	-	99	52.809	ENSATEG00000014607	-	68	52.809	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017052	-	99	52.528	ENSATEG00000002739	-	57	52.528	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020017052	-	83	46.441	ENSACLG00000001865	-	81	46.441	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	78	63.406	ENSACLG00000000907	-	73	63.406	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	99	44.034	ENSACLG00000025562	-	80	44.034	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	62	52.968	ENSACLG00000004754	-	51	52.968	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	99	49.153	ENSACLG00000020926	-	92	49.153	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	99	44.602	ENSACLG00000005212	-	53	44.602	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	99	53.955	ENSACLG00000022741	-	98	53.955	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	99	44.602	ENSACLG00000013944	-	80	44.602	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	96	63.743	ENSACLG00000005570	-	53	63.743	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	97	52.312	ENSACLG00000003937	-	87	52.312	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	99	52.825	ENSACLG00000022877	-	79	52.825	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	97	48.116	ENSACLG00000027135	-	99	48.116	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	99	44.318	ENSACLG00000016639	-	77	44.318	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020017052	-	100	53.521	ENSACLG00000017402	-	76	53.521	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	99	43.182	ENSACLG00000024184	-	80	43.182	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017052	-	92	58.154	ENSACLG00000005711	-	100	58.154	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020017052	-	64	35.776	ENSSFOG00015016391	-	64	35.371	Scleropages_formosus
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ENSORLG00020017052	-	72	48.263	ENSTRUG00000025266	-	92	48.263	Takifugu_rubripes
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