EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017324 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1803 bases
Position: chr4:28394147-28395949
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020016291	RVT_1	PF00078.27	1.2e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020033828	-	1803	-	ENSORLP00020016291	458 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020017324	-	65	93.919	ENSORLG00020001799	-	63	93.919
ENSORLG00020017324	-	57	38.148	ENSORLG00020001304	-	64	38.672
ENSORLG00020017324	-	65	55.518	ENSORLG00020007610	-	94	55.518
ENSORLG00020017324	-	99	56.018	ENSORLG00020005659	-	62	56.018
ENSORLG00020017324	-	99	55.991	ENSORLG00020008589	-	85	55.991
ENSORLG00020017324	-	99	98.031	ENSORLG00020013078	-	97	98.031
ENSORLG00020017324	-	99	98.246	ENSORLG00020019488	-	66	98.246
ENSORLG00020017324	-	99	56.893	ENSORLG00020000622	-	68	56.893
ENSORLG00020017324	-	98	34.061	ENSORLG00020019816	-	85	34.061
ENSORLG00020017324	-	99	57.330	ENSORLG00020004729	-	67	57.330
ENSORLG00020017324	-	98	34.061	ENSORLG00020017929	-	92	34.061
ENSORLG00020017324	-	99	56.332	ENSORLG00020016342	-	61	56.332
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ENSORLG00020017324	-	99	96.061	ENSORLG00020019862	-	97	96.061
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ENSORLG00020017324	-	99	98.031	ENSORLG00020014334	-	69	98.031
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ENSORLG00020017324	-	99	57.549	ENSORLG00020004554	-	59	57.549
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ENSORLG00020017324	-	99	95.405	ENSORLG00020016659	-	57	95.405
ENSORLG00020017324	-	62	37.324	ENSORLG00020016658	-	85	37.324
ENSORLG00020017324	-	98	53.333	ENSORLG00020021677	-	91	53.333
ENSORLG00020017324	-	54	56.504	ENSORLG00020008245	-	77	56.735
ENSORLG00020017324	-	99	56.550	ENSORLG00020021860	-	61	56.550
ENSORLG00020017324	-	99	55.991	ENSORLG00020006316	-	85	56.114
ENSORLG00020017324	-	94	55.889	ENSORLG00020018053	-	85	55.889
ENSORLG00020017324	-	99	96.718	ENSORLG00020007946	-	65	96.718
ENSORLG00020017324	-	98	49.339	ENSORLG00020008855	-	99	49.339
ENSORLG00020017324	-	56	47.843	ENSORLG00020005670	-	95	47.843
ENSORLG00020017324	-	98	56.291	ENSORLG00020003990	-	95	56.291
ENSORLG00020017324	-	74	56.395	ENSORLG00020020066	-	82	56.560
ENSORLG00020017324	-	99	56.209	ENSORLG00020006805	-	96	56.209
ENSORLG00020017324	-	99	96.937	ENSORLG00020017660	-	51	96.937
ENSORLG00020017324	-	72	52.121	ENSORLG00020021536	-	90	52.121
ENSORLG00020017324	-	63	55.172	ENSORLG00020001622	-	96	55.172
ENSORLG00020017324	-	72	54.354	ENSORLG00020002465	-	82	54.518
ENSORLG00020017324	-	52	51.029	ENSORLG00020012794	-	100	51.029
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ENSORLG00020017324	-	75	54.913	ENSORLG00020005478	-	99	54.913
ENSORLG00020017324	-	97	47.216	ENSORLG00020006220	-	87	47.216
ENSORLG00020017324	-	99	96.288	ENSORLG00020019142	-	97	96.288
ENSORLG00020017324	-	88	57.353	ENSORLG00020010414	-	85	57.353
ENSORLG00020017324	-	99	56.427	ENSORLG00020010410	-	96	56.427
ENSORLG00020017324	-	77	46.459	ENSORLG00020017052	-	99	46.459

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020017324	-	80	47.838	ENSAOCG00000004576	-	99	47.838	Amphiprion_ocellaris
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