EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017483 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 132591 bases
Position: chr17:9158346-9290936
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020016404	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-72	1	12
ENSORLP00020016404	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-72	2	12
ENSORLP00020016404	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-72	3	12
ENSORLP00020016404	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-72	4	12
ENSORLP00020016404	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-72	5	12
ENSORLP00020016404	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-72	6	12
ENSORLP00020016404	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-72	7	12
ENSORLP00020016404	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-72	8	12
ENSORLP00020016404	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-72	9	12
ENSORLP00020016404	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-72	10	12
ENSORLP00020016404	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-72	11	12
ENSORLP00020016404	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-72	12	12
ENSORLP00020016213	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-61	1	10
ENSORLP00020016213	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-61	2	10
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ENSORLP00020016213	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-61	4	10
ENSORLP00020016213	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-61	5	10
ENSORLP00020016213	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-61	6	10
ENSORLP00020016213	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-61	7	10
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ENSORLP00020016213	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-61	9	10
ENSORLP00020016213	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-61	10	10
ENSORLP00020016234	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-48	1	8
ENSORLP00020016234	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-48	2	8
ENSORLP00020016234	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-48	3	8
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ENSORLP00020016234	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-48	8	8
ENSORLP00020016404	zf-met	PF12874.7	9.6e-30	1	5
ENSORLP00020016404	zf-met	PF12874.7	9.6e-30	2	5
ENSORLP00020016404	zf-met	PF12874.7	9.6e-30	3	5
ENSORLP00020016404	zf-met	PF12874.7	9.6e-30	4	5
ENSORLP00020016404	zf-met	PF12874.7	9.6e-30	5	5
ENSORLP00020016213	zf-met	PF12874.7	3.3e-26	1	4
ENSORLP00020016213	zf-met	PF12874.7	3.3e-26	2	4
ENSORLP00020016213	zf-met	PF12874.7	3.3e-26	3	4
ENSORLP00020016213	zf-met	PF12874.7	3.3e-26	4	4
ENSORLP00020016234	zf-met	PF12874.7	2.7e-12	1	3
ENSORLP00020016234	zf-met	PF12874.7	2.7e-12	2	3
ENSORLP00020016234	zf-met	PF12874.7	2.7e-12	3	3
ENSORLP00020016404	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	9.4e-33	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020024437	-	1209	-	ENSORLP00020016213	402 (aa)	-	-
ENSORLT00020024471	-	1275	-	ENSORLP00020016234	424 (aa)	-	-
ENSORLT00020024671	-	1356	-	ENSORLP00020016404	451 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020017483	-	97	55.396	ENSORLG00020010636	-	91	56.170
ENSORLG00020017483	-	97	51.327	ENSORLG00020010250	-	99	50.213
ENSORLG00020017483	-	96	54.144	ENSORLG00020004370	-	98	54.144
ENSORLG00020017483	-	88	43.902	ENSORLG00020002817	GFI1	67	45.370
ENSORLG00020017483	-	96	52.282	ENSORLG00020010916	-	94	48.318
ENSORLG00020017483	-	99	40.000	ENSORLG00020002128	-	99	40.000
ENSORLG00020017483	-	100	53.698	ENSORLG00020018069	-	98	55.187
ENSORLG00020017483	-	91	44.348	ENSORLG00020019341	-	82	57.143
ENSORLG00020017483	-	93	54.545	ENSORLG00020000161	-	94	54.545
ENSORLG00020017483	-	95	37.117	ENSORLG00020018685	znf319b	90	36.885
ENSORLG00020017483	-	94	52.688	ENSORLG00020011149	-	97	52.493
ENSORLG00020017483	-	96	37.857	ENSORLG00020010285	znf646	99	37.857
ENSORLG00020017483	-	88	53.509	ENSORLG00020007074	-	97	53.509
ENSORLG00020017483	-	96	40.683	ENSORLG00020004889	ZNF319	95	40.625
ENSORLG00020017483	-	87	42.373	ENSORLG00020008787	snai2	63	42.373
ENSORLG00020017483	-	98	54.167	ENSORLG00020007967	-	95	54.167
ENSORLG00020017483	-	100	44.904	ENSORLG00020020419	-	92	46.482
ENSORLG00020017483	-	92	39.145	ENSORLG00020018051	prdm5	78	38.710
ENSORLG00020017483	-	96	44.304	ENSORLG00020003719	GFI1B	60	43.373
ENSORLG00020017483	-	96	46.847	ENSORLG00020000639	-	80	47.000
ENSORLG00020017483	-	97	56.432	ENSORLG00020010560	-	99	53.112
ENSORLG00020017483	-	95	47.525	ENSORLG00020009139	-	98	50.909
ENSORLG00020017483	-	82	55.276	ENSORLG00020017514	-	99	50.000
ENSORLG00020017483	-	97	50.549	ENSORLG00020004313	-	68	50.549
ENSORLG00020017483	-	85	56.044	ENSORLG00020017528	-	97	56.044
ENSORLG00020017483	-	89	41.284	ENSORLG00020019789	snai1a	74	40.909
ENSORLG00020017483	-	96	45.374	ENSORLG00020010038	-	84	45.000
ENSORLG00020017483	-	86	48.454	ENSORLG00020006433	-	88	44.762
ENSORLG00020017483	-	92	32.218	ENSORLG00020010937	patz1	54	32.367
ENSORLG00020017483	-	96	52.809	ENSORLG00020021857	-	77	50.237
ENSORLG00020017483	-	97	54.237	ENSORLG00020008240	-	71	54.237
ENSORLG00020017483	-	89	37.143	ENSORLG00020007790	zbtb48	64	37.589
ENSORLG00020017483	-	97	68.354	ENSORLG00020016754	-	89	69.620
ENSORLG00020017483	-	96	41.228	ENSORLG00020018503	-	77	42.647
ENSORLG00020017483	-	94	47.164	ENSORLG00020008484	-	98	45.833
ENSORLG00020017483	-	94	42.213	ENSORLG00020008744	-	69	45.946
ENSORLG00020017483	-	85	50.746	ENSORLG00020010932	-	80	50.746
ENSORLG00020017483	-	85	55.556	ENSORLG00020010020	-	87	55.556
ENSORLG00020017483	-	98	51.765	ENSORLG00020000264	-	71	51.765
ENSORLG00020017483	-	93	53.991	ENSORLG00020011234	-	76	56.349
ENSORLG00020017483	-	95	42.424	ENSORLG00020017974	e4f1	60	43.077
ENSORLG00020017483	-	94	59.259	ENSORLG00020008346	-	98	59.259
ENSORLG00020017483	-	85	43.657	ENSORLG00020018791	-	85	42.810
ENSORLG00020017483	-	86	35.417	ENSORLG00020012967	scrt1b	58	36.620
ENSORLG00020017483	-	93	33.540	ENSORLG00020004162	znf341	53	33.540
ENSORLG00020017483	-	96	44.811	ENSORLG00020021196	-	73	44.811
ENSORLG00020017483	-	99	51.892	ENSORLG00020009857	-	97	53.747
ENSORLG00020017483	-	97	44.681	ENSORLG00020001912	znf236	74	45.161
ENSORLG00020017483	-	99	51.894	ENSORLG00020008891	-	98	52.692
ENSORLG00020017483	-	93	49.798	ENSORLG00020008424	-	98	51.479
ENSORLG00020017483	-	97	53.358	ENSORLG00020009419	-	95	57.273
ENSORLG00020017483	-	92	38.217	ENSORLG00020000009	znf710b	51	38.217
ENSORLG00020017483	-	88	51.020	ENSORLG00020009965	-	98	46.798
ENSORLG00020017483	-	71	47.222	ENSORLG00020002700	znf367	64	55.932
ENSORLG00020017483	-	90	38.971	ENSORLG00020009554	-	88	36.015
ENSORLG00020017483	-	97	51.376	ENSORLG00020019227	-	74	51.376
ENSORLG00020017483	-	99	38.571	ENSORLG00020001791	-	76	38.571
ENSORLG00020017483	-	96	54.626	ENSORLG00020010953	-	92	54.626
ENSORLG00020017483	-	98	45.105	ENSORLG00020010950	-	98	49.057
ENSORLG00020017483	-	95	45.789	ENSORLG00020016666	-	96	45.789
ENSORLG00020017483	-	88	45.000	ENSORLG00020006144	-	84	40.000
ENSORLG00020017483	-	96	44.106	ENSORLG00020006148	-	84	48.276
ENSORLG00020017483	-	98	52.381	ENSORLG00020009184	-	99	52.381
ENSORLG00020017483	-	93	53.719	ENSORLG00020009180	-	99	51.837
ENSORLG00020017483	-	92	53.153	ENSORLG00020001707	-	98	53.153
ENSORLG00020017483	-	97	59.312	ENSORLG00020017850	-	99	55.422
ENSORLG00020017483	-	93	34.234	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	62	35.802
ENSORLG00020017483	-	97	51.402	ENSORLG00020015703	-	78	51.402
ENSORLG00020017483	-	90	46.218	ENSORLG00020001922	-	90	44.275
ENSORLG00020017483	-	97	46.336	ENSORLG00020000246	-	99	46.961
ENSORLG00020017483	-	97	53.476	ENSORLG00020016037	-	97	51.709
ENSORLG00020017483	-	96	44.828	ENSORLG00020007599	-	86	45.960
ENSORLG00020017483	-	86	40.385	ENSORLG00020001758	-	55	40.385
ENSORLG00020017483	-	93	53.202	ENSORLG00020004353	-	95	53.202
ENSORLG00020017483	-	96	44.248	ENSORLG00020018921	-	98	43.069
ENSORLG00020017483	-	96	54.400	ENSORLG00020010804	-	97	54.400
ENSORLG00020017483	-	95	52.830	ENSORLG00020010171	-	99	52.830
ENSORLG00020017483	-	96	59.242	ENSORLG00020000481	-	97	56.388
ENSORLG00020017483	-	99	49.807	ENSORLG00020011075	-	87	48.756
ENSORLG00020017483	-	92	34.667	ENSORLG00020005815	-	90	35.849
ENSORLG00020017483	-	97	46.032	ENSORLG00020005132	-	91	46.032
ENSORLG00020017483	-	95	57.812	ENSORLG00020010880	-	96	55.135
ENSORLG00020017483	-	90	35.439	ENSORLG00020012229	zbtb41	54	35.439
ENSORLG00020017483	-	98	46.640	ENSORLG00020000219	-	96	46.640
ENSORLG00020017483	-	98	67.937	ENSORLG00020017164	-	100	63.178
ENSORLG00020017483	-	96	52.968	ENSORLG00020008018	-	91	52.903
ENSORLG00020017483	-	99	52.226	ENSORLG00020009943	-	99	52.941
ENSORLG00020017483	-	93	54.585	ENSORLG00020010647	-	89	54.585
ENSORLG00020017483	-	92	48.951	ENSORLG00020006820	-	78	48.951
ENSORLG00020017483	-	97	50.980	ENSORLG00020009089	-	88	52.510
ENSORLG00020017483	-	87	53.793	ENSORLG00020007018	-	92	53.793
ENSORLG00020017483	-	98	50.376	ENSORLG00020008933	-	99	50.376
ENSORLG00020017483	-	98	40.556	ENSORLG00020018495	-	66	41.854

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020017483	-	92	41.406	ENSAPOG00000005023	-	93	41.406	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017483	-	97	37.931	ENSACIG00000008611	-	93	33.500	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020017483	-	95	42.857	ENSACIG00000013946	-	73	42.857	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020017483	-	97	38.908	ENSACIG00000016117	-	88	44.275	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020017483	-	97	52.877	ENSAPEG00000010602	-	97	52.877	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017483	-	99	47.748	ENSBTAG00000053591	-	97	49.735	Bos_taurus
ENSORLG00020017483	-	91	43.793	ENSCING00000022017	-	97	43.929	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020017483	-	95	39.781	ENSCING00000024222	-	94	39.781	Ciona_intestinalis
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ENSORLG00020017483	-	96	49.321	ENSSLDG00000001850	-	79	49.321	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020017483	-	86	45.333	ENSSPUG00000015952	-	50	45.333	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020017483	-	93	41.489	ENSXCOG00000009772	-	78	41.489	Xiphophorus_couchianus
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