EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017514 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11462 bases
Position: chr17:9142635-9154096
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020016492	zf-C2H2	PF00096.26	9e-52	1	8
ENSORLP00020016492	zf-C2H2	PF00096.26	9e-52	2	8
ENSORLP00020016492	zf-C2H2	PF00096.26	9e-52	3	8
ENSORLP00020016492	zf-C2H2	PF00096.26	9e-52	4	8
ENSORLP00020016492	zf-C2H2	PF00096.26	9e-52	5	8
ENSORLP00020016492	zf-C2H2	PF00096.26	9e-52	6	8
ENSORLP00020016492	zf-C2H2	PF00096.26	9e-52	7	8
ENSORLP00020016492	zf-C2H2	PF00096.26	9e-52	8	8
ENSORLP00020016492	zf-met	PF12874.7	9.3e-22	1	5
ENSORLP00020016492	zf-met	PF12874.7	9.3e-22	2	5
ENSORLP00020016492	zf-met	PF12874.7	9.3e-22	3	5
ENSORLP00020016492	zf-met	PF12874.7	9.3e-22	4	5
ENSORLP00020016492	zf-met	PF12874.7	9.3e-22	5	5

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020024773	-	987	-	ENSORLP00020016492	328 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020017514	-	75	51.464	ENSORLG00020008424	-	94	51.464
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ENSORLG00020017514	-	74	57.273	ENSORLG00020010916	-	56	57.273
ENSORLG00020017514	-	90	52.119	ENSORLG00020007967	-	91	51.429
ENSORLG00020017514	-	77	58.929	ENSORLG00020010880	-	74	58.929
ENSORLG00020017514	-	90	47.872	ENSORLG00020001922	-	59	45.000
ENSORLG00020017514	-	98	53.448	ENSORLG00020009943	-	99	56.250
ENSORLG00020017514	-	99	53.368	ENSORLG00020008891	-	87	51.931
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ENSORLG00020017514	-	93	57.328	ENSORLG00020009857	-	93	57.328
ENSORLG00020017514	-	91	60.000	ENSORLG00020010560	-	98	56.129
ENSORLG00020017514	-	90	49.345	ENSORLG00020009184	-	81	53.750
ENSORLG00020017514	-	67	41.844	ENSORLG00020008787	snai2	53	41.844
ENSORLG00020017514	-	69	51.163	ENSORLG00020010932	-	76	51.163
ENSORLG00020017514	-	73	38.158	ENSORLG00020001791	-	54	38.158
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ENSORLG00020017514	-	90	57.277	ENSORLG00020010647	-	95	57.277
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ENSORLG00020017514	-	99	54.683	ENSORLG00020017164	-	99	60.326
ENSORLG00020017514	-	75	51.240	ENSORLG00020002817	GFI1	67	51.240
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ENSORLG00020017514	-	87	47.085	ENSORLG00020008744	-	67	47.085
ENSORLG00020017514	-	90	53.211	ENSORLG00020011075	-	75	53.211
ENSORLG00020017514	-	97	52.252	ENSORLG00020010250	-	98	50.704
ENSORLG00020017514	-	86	46.903	ENSORLG00020019341	-	79	59.459
ENSORLG00020017514	-	94	41.485	ENSORLG00020018791	-	91	37.193
ENSORLG00020017514	-	73	54.709	ENSORLG00020001707	-	75	54.709
ENSORLG00020017514	-	72	53.846	ENSORLG00020019227	-	52	53.846
ENSORLG00020017514	-	96	53.810	ENSORLG00020017528	-	99	53.810
ENSORLG00020017514	-	90	36.986	ENSORLG00020018685	znf319b	76	36.120
ENSORLG00020017514	-	91	55.612	ENSORLG00020000161	-	76	55.612
ENSORLG00020017514	-	89	39.286	ENSORLG00020012967	scrt1b	56	39.286
ENSORLG00020017514	-	93	43.617	ENSORLG00020010950	-	96	50.943
ENSORLG00020017514	-	80	56.571	ENSORLG00020004370	-	79	56.571
ENSORLG00020017514	-	84	42.342	ENSORLG00020000009	znf710b	54	42.342
ENSORLG00020017514	-	72	40.458	ENSORLG00020004889	ZNF319	83	43.590
ENSORLG00020017514	-	87	48.768	ENSORLG00020021196	-	50	48.768
ENSORLG00020017514	-	93	51.965	ENSORLG00020009180	-	88	51.965
ENSORLG00020017514	-	93	48.691	ENSORLG00020009965	-	80	51.370
ENSORLG00020017514	-	90	45.588	ENSORLG00020007599	-	70	42.623
ENSORLG00020017514	-	92	37.229	ENSORLG00020018495	-	66	37.634
ENSORLG00020017514	-	90	50.435	ENSORLG00020010038	-	58	50.435
ENSORLG00020017514	-	91	44.578	ENSORLG00020001602	gfi1ab	59	44.578
ENSORLG00020017514	-	87	52.941	ENSORLG00020008346	-	86	54.008
ENSORLG00020017514	-	96	35.274	ENSORLG00020018503	-	72	34.884
ENSORLG00020017514	-	90	47.826	ENSORLG00020006820	-	66	47.826
ENSORLG00020017514	-	98	56.667	ENSORLG00020009419	-	95	54.911
ENSORLG00020017514	-	90	60.714	ENSORLG00020017850	-	99	60.714
ENSORLG00020017514	-	99	58.130	ENSORLG00020018069	-	95	58.130
ENSORLG00020017514	-	89	39.149	ENSORLG00020006144	-	72	40.223
ENSORLG00020017514	-	87	56.637	ENSORLG00020009089	-	68	56.637
ENSORLG00020017514	-	90	52.604	ENSORLG00020009139	-	99	52.604
ENSORLG00020017514	-	99	53.719	ENSORLG00020011234	-	90	53.719
ENSORLG00020017514	-	77	55.983	ENSORLG00020010020	-	69	55.983
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ENSORLG00020017514	-	98	52.991	ENSORLG00020010804	-	94	50.417
ENSORLG00020017514	-	99	52.261	ENSORLG00020016666	-	86	52.261
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ENSORLG00020017514	-	93	50.980	ENSORLG00020008018	-	75	47.000
ENSORLG00020017514	-	94	48.571	ENSORLG00020001912	znf236	72	48.571
ENSORLG00020017514	-	90	52.632	ENSORLG00020007018	-	73	52.632
ENSORLG00020017514	-	98	53.125	ENSORLG00020010171	-	97	51.653
ENSORLG00020017514	-	99	54.412	ENSORLG00020015703	-	71	54.950
ENSORLG00020017514	-	90	47.260	ENSORLG00020003719	GFI1B	55	47.260
ENSORLG00020017514	-	99	50.920	ENSORLG00020000219	-	86	50.920
ENSORLG00020017514	-	80	48.760	ENSORLG00020008484	-	83	48.760
ENSORLG00020017514	-	90	55.556	ENSORLG00020004353	-	96	55.556

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020017514	-	99	52.866	ENSAPOG00000022273	-	62	52.866	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017514	-	89	50.909	ENSAPOG00000022007	-	67	50.909	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017514	-	83	46.154	ENSAPOG00000020125	-	59	46.154	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017514	-	92	48.117	ENSAPOG00000021997	-	57	48.117	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017514	-	90	44.776	ENSAPOG00000003193	znf1056	88	44.776	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017514	-	96	48.969	ENSAPOG00000021367	-	52	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017514	-	90	52.023	ENSAPOG00000022267	-	57	52.023	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017514	-	90	49.167	ENSACIG00000013470	-	64	49.167	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020017514	-	87	50.840	ENSACIG00000010637	-	53	50.840	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020017514	-	90	50.980	ENSACIG00000006806	-	59	50.980	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020017514	-	90	51.381	ENSACIG00000009755	-	85	51.381	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020017514	-	90	52.968	ENSACIG00000011515	-	65	52.968	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020017514	-	90	50.505	ENSACIG00000009780	-	69	50.505	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020017514	-	88	51.515	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	90	51.515	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020017514	-	90	50.909	ENSAOCG00000010498	-	68	51.269	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017514	-	90	45.455	ENSAOCG00000003494	si:dkey-7i4.5	89	45.455	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017514	-	90	49.603	ENSAOCG00000012829	-	56	49.603	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017514	-	92	48.117	ENSAOCG00000000655	-	51	48.117	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017514	-	99	52.229	ENSAOCG00000007146	-	62	52.229	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017514	-	92	48.117	ENSAPEG00000013105	-	51	48.117	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017514	-	99	52.229	ENSAPEG00000011646	-	62	52.229	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017514	-	98	42.564	ENSAPEG00000012963	-	78	43.431	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017514	-	88	45.833	ENSAPEG00000012243	-	67	48.193	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017514	-	90	49.603	ENSAPEG00000018332	-	56	49.603	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017514	-	90	51.829	ENSAPEG00000013113	-	65	41.667	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017514	-	90	45.455	ENSAPEG00000004427	si:ch73-144d13.7	89	45.455	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017514	-	90	49.603	ENSAPEG00000018316	-	56	49.603	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017514	-	92	44.175	ENSAPEG00000013088	-	84	44.175	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017514	-	90	52.451	ENSATEG00000008320	-	87	51.528	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017514	-	93	46.748	ENSATEG00000011212	-	71	46.748	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017514	-	93	53.881	ENSACLG00000020615	-	69	53.881	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017514	-	88	51.261	ENSACLG00000021056	-	53	51.261	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017514	-	90	45.136	ENSACLG00000020268	-	62	45.136	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017514	-	90	46.218	ENSACLG00000020260	-	100	46.218	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017514	-	90	52.542	ENSACLG00000006870	-	56	52.542	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017514	-	92	48.163	ENSACLG00000020339	-	60	48.729	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017514	-	90	52.027	ENSACLG00000021045	-	77	52.027	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017514	-	77	42.254	ENSAMXG00000041862	-	94	42.268	Astyanax_mexicanus
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