EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017528 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2362 bases
Position: chr17:9133569-9135930
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020032132	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-38	1	6
ENSORLP00020032132	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-38	2	6
ENSORLP00020032132	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-38	3	6
ENSORLP00020032132	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-38	4	6
ENSORLP00020032132	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-38	5	6
ENSORLP00020032132	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-38	6	6
ENSORLP00020032132	zf-met	PF12874.7	1.7e-11	1	2
ENSORLP00020032132	zf-met	PF12874.7	1.7e-11	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020024793	-	873	-	ENSORLP00020032132	290 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020017528	-	94	45.370	ENSORLG00020012199	zic1	76	43.860
ENSORLG00020017528	-	76	52.261	ENSORLG00020016666	-	65	51.196
ENSORLG00020017528	-	86	42.079	ENSORLG00020006144	-	74	42.079
ENSORLG00020017528	-	74	54.327	ENSORLG00020007018	-	77	54.327
ENSORLG00020017528	-	73	53.234	ENSORLG00020010916	-	55	53.234
ENSORLG00020017528	-	77	51.835	ENSORLG00020011234	-	79	51.835
ENSORLG00020017528	-	72	52.105	ENSORLG00020009089	-	53	52.105
ENSORLG00020017528	-	74	49.664	ENSORLG00020009965	-	71	49.664
ENSORLG00020017528	-	70	50.000	ENSORLG00020019341	-	88	63.636
ENSORLG00020017528	-	71	54.386	ENSORLG00020016037	-	94	50.971
ENSORLG00020017528	-	84	49.231	ENSORLG00020010171	-	91	52.332
ENSORLG00020017528	-	89	51.111	ENSORLG00020010560	-	99	51.111
ENSORLG00020017528	-	72	49.758	ENSORLG00020004353	-	96	49.758
ENSORLG00020017528	-	75	41.420	ENSORLG00020018051	prdm5	75	41.420
ENSORLG00020017528	-	74	36.216	ENSORLG00020005815	-	73	37.097
ENSORLG00020017528	-	80	45.968	ENSORLG00020005132	-	70	43.541
ENSORLG00020017528	-	76	32.653	ENSORLG00020000009	znf710b	53	32.653
ENSORLG00020017528	-	90	53.431	ENSORLG00020010804	-	93	53.431
ENSORLG00020017528	-	79	48.889	ENSORLG00020000161	-	84	48.889
ENSORLG00020017528	-	84	52.451	ENSORLG00020008018	-	60	52.451
ENSORLG00020017528	-	90	52.451	ENSORLG00020009943	-	92	53.266
ENSORLG00020017528	-	71	52.577	ENSORLG00020010647	-	74	52.577
ENSORLG00020017528	-	74	48.718	ENSORLG00020018921	-	73	48.718
ENSORLG00020017528	-	72	36.434	ENSORLG00020001758	-	59	36.434
ENSORLG00020017528	-	99	53.810	ENSORLG00020017514	-	96	53.810
ENSORLG00020017528	-	91	54.167	ENSORLG00020009184	-	94	54.167
ENSORLG00020017528	-	84	59.444	ENSORLG00020009180	-	90	59.444
ENSORLG00020017528	-	98	57.647	ENSORLG00020017164	-	99	55.429
ENSORLG00020017528	-	71	50.000	ENSORLG00020002817	GFI1	52	50.000
ENSORLG00020017528	-	76	42.500	ENSORLG00020018503	-	70	42.446
ENSORLG00020017528	-	75	55.122	ENSORLG00020011075	-	75	55.122
ENSORLG00020017528	-	84	38.286	ENSORLG00020018685	znf319b	85	38.286
ENSORLG00020017528	-	92	50.685	ENSORLG00020000264	-	67	50.685
ENSORLG00020017528	-	70	56.069	ENSORLG00020004370	-	76	56.069
ENSORLG00020017528	-	77	53.030	ENSORLG00020010636	-	73	53.030
ENSORLG00020017528	-	97	47.368	ENSORLG00020001791	-	51	47.368
ENSORLG00020017528	-	85	54.808	ENSORLG00020011149	-	82	54.808
ENSORLG00020017528	-	84	51.415	ENSORLG00020010250	-	87	49.275
ENSORLG00020017528	-	70	44.286	ENSORLG00020009554	-	78	44.286
ENSORLG00020017528	-	70	43.396	ENSORLG00020008787	snai2	55	43.396
ENSORLG00020017528	-	87	33.511	ENSORLG00020014595	PRDM15	52	33.511
ENSORLG00020017528	-	97	47.312	ENSORLG00020009139	-	98	49.479
ENSORLG00020017528	-	76	40.517	ENSORLG00020018791	-	81	40.517
ENSORLG00020017528	-	87	42.759	ENSORLG00020002128	-	93	42.759
ENSORLG00020017528	-	94	45.283	ENSORLG00020006820	-	66	45.283
ENSORLG00020017528	-	72	38.525	ENSORLG00020012967	scrt1b	51	38.525
ENSORLG00020017528	-	74	53.704	ENSORLG00020019227	-	56	53.153
ENSORLG00020017528	-	97	56.044	ENSORLG00020017483	-	85	56.044
ENSORLG00020017528	-	89	36.567	ENSORLG00020010285	znf646	72	36.567
ENSORLG00020017528	-	70	48.571	ENSORLG00020010950	-	97	48.571
ENSORLG00020017528	-	73	44.000	ENSORLG00020007599	-	71	44.000
ENSORLG00020017528	-	69	42.857	ENSORLG00020010932	-	68	42.857
ENSORLG00020017528	-	97	57.962	ENSORLG00020000481	-	92	55.721
ENSORLG00020017528	-	73	49.020	ENSORLG00020020419	-	85	49.020
ENSORLG00020017528	-	91	50.698	ENSORLG00020016754	-	95	50.698
ENSORLG00020017528	-	87	50.725	ENSORLG00020007967	-	93	50.725
ENSORLG00020017528	-	71	58.000	ENSORLG00020001707	-	75	58.000
ENSORLG00020017528	-	99	58.081	ENSORLG00020017850	-	96	56.650
ENSORLG00020017528	-	79	56.566	ENSORLG00020008346	-	99	56.566
ENSORLG00020017528	-	81	45.882	ENSORLG00020001912	znf236	66	45.882
ENSORLG00020017528	-	73	50.820	ENSORLG00020000246	-	86	50.820
ENSORLG00020017528	-	89	42.708	ENSORLG00020008744	-	67	43.434
ENSORLG00020017528	-	84	33.981	ENSORLG00020010937	patz1	50	33.981
ENSORLG00020017528	-	96	57.711	ENSORLG00020018069	-	93	57.711
ENSORLG00020017528	-	79	38.411	ENSORLG00020007790	zbtb48	59	38.411
ENSORLG00020017528	-	75	42.038	ENSORLG00020003719	GFI1B	55	42.038
ENSORLG00020017528	-	74	55.340	ENSORLG00020015703	-	52	55.340
ENSORLG00020017528	-	72	48.454	ENSORLG00020021196	-	50	48.454
ENSORLG00020017528	-	81	41.667	ENSORLG00020001922	-	66	41.525
ENSORLG00020017528	-	88	47.549	ENSORLG00020008484	-	97	47.549
ENSORLG00020017528	-	96	51.741	ENSORLG00020010020	-	99	51.741
ENSORLG00020017528	-	70	57.732	ENSORLG00020010880	-	75	57.732
ENSORLG00020017528	-	73	49.398	ENSORLG00020000219	-	72	49.398
ENSORLG00020017528	-	84	53.234	ENSORLG00020008891	-	86	53.448
ENSORLG00020017528	-	73	51.546	ENSORLG00020010953	-	78	51.546
ENSORLG00020017528	-	76	53.797	ENSORLG00020008424	-	85	53.797
ENSORLG00020017528	-	74	55.172	ENSORLG00020007074	-	97	52.976
ENSORLG00020017528	-	73	54.067	ENSORLG00020008933	-	69	54.067
ENSORLG00020017528	-	63	45.918	ENSORLG00020006433	-	80	45.918
ENSORLG00020017528	-	81	55.238	ENSORLG00020009419	-	93	50.495
ENSORLG00020017528	-	98	54.680	ENSORLG00020009857	-	95	54.795
ENSORLG00020017528	-	83	41.714	ENSORLG00020004889	ZNF319	87	41.714
ENSORLG00020017528	-	71	47.120	ENSORLG00020010038	-	58	47.120
ENSORLG00020017528	-	71	38.500	ENSORLG00020018495	-	73	38.500
ENSORLG00020017528	-	72	36.111	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	65	36.111

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020017528	-	69	68.421	ENSAPOG00000016615	-	92	68.421	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017528	-	71	59.167	ENSAPOG00000010330	-	72	59.167	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017528	-	69	66.000	ENSAPOG00000003414	-	97	66.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017528	-	75	50.000	ENSAPOG00000010645	-	59	49.275	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017528	-	76	56.548	ENSAPOG00000000601	-	73	56.548	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017528	-	70	53.684	ENSAPOG00000014372	-	65	53.684	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017528	-	69	48.780	ENSAOCG00000007347	-	79	48.780	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017528	-	69	55.738	ENSAPEG00000004256	-	75	55.738	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017528	-	70	47.317	ENSATEG00000007658	-	70	47.317	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017528	-	81	48.485	ENSAMXG00000013492	-	97	44.843	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020017528	-	76	44.000	ENSCING00000024717	-	78	44.000	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020017528	-	91	53.333	ENSCVAG00000018383	-	95	53.333	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020017528	-	83	41.350	ENSEBUG00000015472	-	68	42.714	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017528	-	79	44.615	ENSEBUG00000000422	-	63	44.615	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017528	-	84	47.396	ENSEBUG00000003232	-	57	47.396	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017528	-	73	50.000	ENSEBUG00000013874	-	52	50.000	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017528	-	97	43.814	ENSEBUG00000001308	-	81	43.814	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017528	-	73	48.171	ENSEBUG00000000436	-	74	48.171	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017528	-	78	46.766	ENSEBUG00000014768	-	76	46.766	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017528	-	83	45.588	ENSEBUG00000001569	-	83	45.588	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017528	-	73	51.282	ENSEBUG00000004992	-	52	51.282	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017528	-	90	44.262	ENSEBUG00000006666	-	87	44.262	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017528	-	79	48.750	ENSEBUG00000012543	-	50	47.590	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017528	-	66	45.000	ENSEBUG00000013126	-	52	45.000	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017528	-	73	51.546	ENSEBUG00000003418	-	92	51.546	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017528	-	83	48.120	ENSELUG00000000281	-	77	48.120	Esox_lucius
ENSORLG00020017528	-	82	53.093	ENSELUG00000007694	-	87	53.093	Esox_lucius
ENSORLG00020017528	-	74	51.402	ENSELUG00000022942	-	66	51.402	Esox_lucius
ENSORLG00020017528	-	82	47.748	ENSELUG00000000423	-	53	47.748	Esox_lucius
ENSORLG00020017528	-	72	55.263	ENSGMOG00000005588	-	100	55.263	Gadus_morhua
ENSORLG00020017528	-	73	43.443	ENSGMOG00000016007	-	84	43.443	Gadus_morhua
ENSORLG00020017528	-	80	52.991	ENSGAFG00000021139	-	86	52.991	Gambusia_affinis
ENSORLG00020017528	-	80	55.294	ENSGAFG00000021143	-	69	55.294	Gambusia_affinis
ENSORLG00020017528	-	84	52.976	ENSGAGG00000010492	-	77	52.976	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020017528	-	70	50.649	ENSHBUG00000003529	-	86	50.649	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020017528	-	83	41.622	ENSHBUG00000007316	-	77	41.622	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020017528	-	69	59.259	ENSHCOG00000015355	-	86	59.259	Hippocampus_comes
ENSORLG00020017528	-	69	48.756	ENSHCOG00000001242	-	67	48.756	Hippocampus_comes
ENSORLG00020017528	-	70	46.746	ENSHCOG00000020924	-	71	46.746	Hippocampus_comes
ENSORLG00020017528	-	95	50.581	ENSHCOG00000001318	-	98	47.264	Hippocampus_comes
ENSORLG00020017528	-	96	43.902	ENSHCOG00000014781	-	77	43.902	Hippocampus_comes
ENSORLG00020017528	-	71	51.807	ENSHCOG00000014792	-	51	51.807	Hippocampus_comes
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ENSORLG00020017528	-	70	48.101	ENSXCOG00000009674	-	81	48.101	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020017528	-	71	47.333	ENSXMAG00000028785	-	72	47.333	Xiphophorus_maculatus