EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017598 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2994 bases
Position: chr8:1789492-1792485
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020016567	RVT_1	PF00078.27	3.8e-41	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020024897	-	2994	-	ENSORLP00020016567	997 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020017598	-	100	98.195	ENSORLG00020003054	-	100	98.195
ENSORLG00020017598	-	78	97.570	ENSORLG00020015867	-	100	97.570
ENSORLG00020017598	-	100	98.094	ENSORLG00020005358	-	99	98.094
ENSORLG00020017598	-	88	31.692	ENSORLG00020020316	-	95	31.533
ENSORLG00020017598	-	85	97.770	ENSORLG00020002609	-	100	97.770
ENSORLG00020017598	-	100	98.195	ENSORLG00020009527	-	100	98.195
ENSORLG00020017598	-	91	33.088	ENSORLG00020009508	-	86	32.409
ENSORLG00020017598	-	78	96.292	ENSORLG00020004369	-	100	96.292
ENSORLG00020017598	-	70	32.377	ENSORLG00020001879	-	91	31.615
ENSORLG00020017598	-	91	31.856	ENSORLG00020009614	-	95	31.931
ENSORLG00020017598	-	78	97.059	ENSORLG00020005006	-	100	97.059
ENSORLG00020017598	-	100	97.894	ENSORLG00020014382	-	100	97.894
ENSORLG00020017598	-	100	96.690	ENSORLG00020004913	-	100	96.690
ENSORLG00020017598	-	100	97.894	ENSORLG00020010522	-	100	97.894
ENSORLG00020017598	-	100	97.693	ENSORLG00020014816	-	100	97.693
ENSORLG00020017598	-	100	97.693	ENSORLG00020015225	-	100	97.693
ENSORLG00020017598	-	100	97.392	ENSORLG00020017275	-	100	97.392
ENSORLG00020017598	-	100	97.392	ENSORLG00020009902	-	100	97.392
ENSORLG00020017598	-	83	32.050	ENSORLG00020002875	-	97	32.163
ENSORLG00020017598	-	72	30.829	ENSORLG00020005057	-	100	30.534
ENSORLG00020017598	-	100	98.195	ENSORLG00020007996	-	100	98.195
ENSORLG00020017598	-	90	33.049	ENSORLG00020007707	-	86	32.262
ENSORLG00020017598	-	76	95.910	ENSORLG00020020442	-	100	95.910
ENSORLG00020017598	-	100	97.894	ENSORLG00020012851	-	100	97.894
ENSORLG00020017598	-	53	33.925	ENSORLG00020011847	-	97	33.095
ENSORLG00020017598	-	100	98.094	ENSORLG00020010084	-	100	98.094
ENSORLG00020017598	-	50	35.317	ENSORLG00020018851	-	88	34.623
ENSORLG00020017598	-	100	97.793	ENSORLG00020020339	-	100	97.793
ENSORLG00020017598	-	100	98.295	ENSORLG00020011016	-	100	98.295
ENSORLG00020017598	-	69	96.372	ENSORLG00020002162	-	99	96.372
ENSORLG00020017598	-	100	97.894	ENSORLG00020001429	-	100	97.894
ENSORLG00020017598	-	100	98.094	ENSORLG00020003643	-	100	98.094
ENSORLG00020017598	-	100	97.994	ENSORLG00020020415	-	100	97.994
ENSORLG00020017598	-	100	97.994	ENSORLG00020002402	-	99	97.994
ENSORLG00020017598	-	100	98.094	ENSORLG00020018358	-	100	98.094
ENSORLG00020017598	-	100	98.195	ENSORLG00020000686	-	100	98.195
ENSORLG00020017598	-	93	97.840	ENSORLG00020010495	-	100	97.840
ENSORLG00020017598	-	100	97.793	ENSORLG00020022082	-	99	97.793

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020017598	-	85	94.333	ENSATEG00000007887	-	99	94.333	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017598	-	95	95.652	ENSATEG00000009051	-	99	95.652	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017598	-	100	94.885	ENSATEG00000022633	-	100	94.885	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017598	-	100	95.386	ENSATEG00000005213	-	100	95.386	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017598	-	87	95.365	ENSATEG00000017712	-	100	95.365	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017598	-	70	93.516	ENSATEG00000004689	-	100	93.516	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017598	-	100	94.283	ENSATEG00000020668	-	99	94.283	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017598	-	99	95.166	ENSATEG00000009591	-	100	95.166	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017598	-	99	75.700	ENSCSEG00000010768	-	98	75.600	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020017598	-	95	77.037	ENSCSEG00000004965	-	93	77.037	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020017598	-	99	75.855	ENSCSEG00000014508	-	98	75.755	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020017598	-	93	77.322	ENSCSEG00000015459	-	100	77.322	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020017598	-	68	33.137	ENSLOCG00000001168	-	92	34.421	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020017598	-	100	97.793	ENSORLG00000022044	-	100	97.793	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	93	97.300	ENSORLG00000022049	-	100	97.300	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.593	ENSORLG00000030281	-	100	97.593	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.994	ENSORLG00000030142	-	100	97.994	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	96.200	ENSORLG00000027325	-	100	96.200	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	93	96.888	ENSORLG00000021932	-	96	96.888	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.693	ENSORLG00000027738	-	100	97.693	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	96	97.377	ENSORLG00000030541	-	99	97.377	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.793	ENSORLG00000027942	-	100	97.793	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	95	97.893	ENSORLG00000027945	-	100	97.893	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.492	ENSORLG00000026112	-	100	97.492	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.593	ENSORLG00000027645	-	100	97.593	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.593	ENSORLG00000025556	-	100	97.593	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.392	ENSORLG00000028249	-	100	97.392	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	98	97.636	ENSORLG00000024646	-	99	97.636	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.693	ENSORLG00000025512	-	100	97.693	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.793	ENSORLG00000027354	-	100	97.793	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.693	ENSORLG00000028712	-	100	97.693	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.793	ENSORLG00000028713	-	100	97.793	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.593	ENSORLG00000028694	-	100	97.593	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	88	97.153	ENSORLG00000023760	-	100	97.153	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.192	ENSORLG00000030535	-	100	97.192	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.793	ENSORLG00000028859	-	100	97.793	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	93	97.624	ENSORLG00000022934	-	100	97.624	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.693	ENSORLG00000025393	-	100	97.693	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	98.094	ENSORLG00000021860	-	100	98.094	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.793	ENSORLG00000026767	-	100	97.793	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	91	97.680	ENSORLG00000026815	-	95	97.680	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	67	96.572	ENSORLG00000029231	-	100	96.572	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.492	ENSORLG00000026499	-	100	97.492	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020017598	-	100	98.094	ENSORLG00000023676	-	100	98.094	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020017598	-	100	97.693	ENSORLG00000028518	-	100	97.693	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020017598	-	100	97.492	ENSORLG00000027111	-	100	97.492	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020017598	-	100	97.392	ENSORLG00000027598	-	100	97.392	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	90	97.783	ENSORLG00000029790	-	99	97.783	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.994	ENSORLG00000023871	-	100	97.994	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020017598	-	90	97.204	ENSORLG00000030514	-	95	97.204	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.693	ENSORLG00000024822	-	100	97.693	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020017598	-	100	97.693	ENSORLG00000023380	-	100	97.693	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.693	ENSORLG00000025030	-	100	97.693	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	88	96.796	ENSORLG00000022101	-	99	96.796	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.593	ENSORLG00000022102	-	100	97.593	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017598	-	100	97.693	ENSORLG00000029283	-	100	97.693	Oryzias_latipes
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