EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017660 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3310 bases
Position: chr16:24112660-24115969
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020032232	RVT_1	PF00078.27	1.6e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020024960	-	3310	-	ENSORLP00020032232	901 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSORLG00020017660	-	66	46.700	ENSORLG00020001010	-	91	46.700
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ENSORLG00020017660	-	81	98.909	ENSORLG00020006422	-	98	98.909
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ENSORLG00020017660	-	52	97.021	ENSORLG00020012080	-	100	97.021
ENSORLG00020017660	-	59	53.471	ENSORLG00020022349	-	99	53.471
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ENSORLG00020017660	-	64	45.826	ENSORLG00020006111	-	91	45.826
ENSORLG00020017660	-	52	33.543	ENSORLG00020017929	-	96	33.543
ENSORLG00020017660	-	77	98.559	ENSORLG00020007946	-	98	98.559
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ENSORLG00020017660	-	81	47.283	ENSORLG00020005659	-	99	47.283
ENSORLG00020017660	-	55	54.800	ENSORLG00020014098	-	98	53.510
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ENSORLG00020017660	-	75	49.341	ENSORLG00020004729	-	99	49.341
ENSORLG00020017660	-	98	42.795	ENSORLG00020019417	-	99	42.795
ENSORLG00020017660	-	100	96.337	ENSORLG00020019255	-	94	96.337
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ENSORLG00020017660	-	53	54.886	ENSORLG00020015063	-	99	53.543
ENSORLG00020017660	-	87	96.688	ENSORLG00020016659	-	99	96.688
ENSORLG00020017660	-	54	33.131	ENSORLG00020019816	-	92	33.131
ENSORLG00020017660	-	52	98.085	ENSORLG00020019862	-	100	98.085
ENSORLG00020017660	-	73	96.347	ENSORLG00020014334	-	100	96.347
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ENSORLG00020017660	-	100	96.670	ENSORLG00020010964	-	94	96.670
ENSORLG00020017660	-	52	55.672	ENSORLG00020006573	-	99	55.672
ENSORLG00020017660	-	99	39.364	ENSORLG00020013041	-	85	39.364
ENSORLG00020017660	-	85	48.124	ENSORLG00020003828	-	99	48.124
ENSORLG00020017660	-	53	54.678	ENSORLG00020009707	-	99	53.346
ENSORLG00020017660	-	52	56.303	ENSORLG00020010410	-	99	56.303
ENSORLG00020017660	-	100	42.982	ENSORLG00020021297	-	81	42.982
ENSORLG00020017660	-	53	54.792	ENSORLG00020004992	-	99	53.452

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020017660	-	51	54.684	ENSATEG00000004857	-	99	54.684	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017660	-	58	37.288	ENSATEG00000014055	-	85	37.288	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017660	-	89	37.531	ENSATEG00000005707	-	99	37.759	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017660	-	69	40.829	ENSATEG00000023197	-	98	41.111	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017660	-	68	48.780	ENSATEG00000015490	-	99	48.780	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017660	-	61	44.022	ENSATEG00000004798	-	97	43.986	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017660	-	99	36.923	ENSATEG00000012907	-	93	37.130	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017660	-	94	45.455	ENSATEG00000010674	-	99	45.455	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017660	-	56	53.438	ENSATEG00000014607	-	98	53.438	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017660	-	68	48.943	ENSATEG00000002739	-	99	48.943	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017660	-	94	45.455	ENSATEG00000019512	-	99	45.455	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017660	-	55	53.693	ENSATEG00000015931	-	99	53.693	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017660	-	52	58.140	ENSACLG00000025009	-	99	58.140	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	75	46.324	ENSACLG00000005017	-	99	46.324	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	100	55.408	ENSACLG00000025376	-	100	55.408	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	74	59.016	ENSACLG00000001405	-	100	59.016	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	59	57.356	ENSACLG00000015507	-	99	57.356	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	77	50.868	ENSACLG00000013805	-	81	50.868	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	67	52.138	ENSACLG00000012279	-	98	52.138	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	83	41.284	ENSACLG00000019194	-	99	41.284	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	58	54.808	ENSACLG00000022853	-	97	54.808	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	59	57.356	ENSACLG00000009903	-	95	57.356	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	50	45.011	ENSACLG00000008836	-	86	45.011	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	55	43.529	ENSACLG00000008832	-	99	43.529	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	91	56.448	ENSACLG00000017448	-	99	56.448	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	82	42.951	ENSACLG00000012019	-	99	42.951	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	100	55.519	ENSACLG00000012014	-	100	55.519	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017660	-	100	55.519	ENSACLG00000015650	-	100	55.519	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020017660	-	53	48.739	ENSOMEG00000009164	-	56	50.109	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020017660	-	94	55.958	ENSOMEG00000014758	-	99	55.958	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020017660	-	56	32.819	ENSOMEG00000023554	-	78	32.819	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020017660	-	52	50.737	ENSPKIG00000025243	-	99	50.737	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020017660	-	56	51.186	ENSPREG00000002150	-	95	51.186	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020017660	-	50	51.762	ENSPREG00000011748	-	86	51.762	Poecilia_reticulata
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ENSORLG00020017660	-	74	58.420	ENSPNYG00000008434	-	100	58.420	Pundamilia_nyererei
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ENSORLG00020017660	-	58	58.365	ENSPNAG00000001796	-	99	58.365	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020017660	-	58	33.647	ENSSFOG00015004172	-	90	33.647	Scleropages_formosus
ENSORLG00020017660	-	64	42.687	ENSSLDG00000007615	-	97	42.399	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020017660	-	50	33.991	ENSSPAG00000002518	-	91	33.991	Stegastes_partitus
ENSORLG00020017660	-	99	41.575	ENSXMAG00000021735	-	81	41.575	Xiphophorus_maculatus
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