EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017679 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: smarca5
Alias: -
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 5
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12963 bases
Position: chr1:17136076-17149038
Accession: ZDB-GENE-021125-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020016610	ResIII	PF04851.15	8.5e-11	1	1
ENSORLP00020016610	DEAD	PF00270.29	4.3e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020024962	-	8134	-	ENSORLP00020016610	1038 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020017679	smarca5	51	40.070	ENSORLG00020021891	chd6	74	40.102
ENSORLG00020017679	smarca5	50	41.806	ENSORLG00020003952	hells	74	41.908
ENSORLG00020017679	smarca5	57	40.167	ENSORLG00020005123	chd1l	89	42.236

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020017679	smarca5	95	82.929	ENSG00000102038	SMARCA1	92	83.742	Homo_sapiens
ENSORLG00020017679	smarca5	100	97.016	ENSAPOG00000016035	smarca5	100	97.016	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017679	smarca5	95	82.036	ENSAMEG00000015218	SMARCA1	92	82.727	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020017679	smarca5	87	97.336	ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.336	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020017679	smarca5	100	97.016	ENSAOCG00000015578	smarca5	100	97.016	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017679	smarca5	100	97.016	ENSAPEG00000011117	smarca5	99	98.463	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.532	ENSATEG00000012894	smarca5	100	96.532	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017679	smarca5	94	84.725	ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.867	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020017679	smarca5	99	81.513	ENSACAG00000011376	SMARCA1	93	85.378	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020017679	smarca5	95	78.182	ENSANAG00000023098	SMARCA1	92	78.937	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.150	ENSACLG00000025356	smarca5	100	95.380	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017679	smarca5	98	92.098	ENSAMXG00000005709	smarca5	97	92.864	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020017679	smarca5	89	84.748	ENSAMXG00000011227	smarca1	99	85.887	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020017679	smarca5	96	82.477	ENSBTAG00000002292	SMARCA1	90	83.596	Bos_taurus
ENSORLG00020017679	smarca5	96	62.562	WBGene00002169	isw-1	92	65.352	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020017679	smarca5	94	83.605	ENSCJAG00000002868	SMARCA1	92	83.742	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020017679	smarca5	95	73.585	ENSCAFG00000018673	SMARCA1	99	75.410	Canis_familiaris
ENSORLG00020017679	smarca5	95	83.131	ENSCAFG00020001751	SMARCA1	92	83.845	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020017679	smarca5	96	82.182	ENSCHIG00000009837	SMARCA1	92	83.436	Capra_hircus
ENSORLG00020017679	smarca5	95	83.131	ENSTSYG00000004240	SMARCA1	94	84.624	Carlito_syrichta
ENSORLG00020017679	smarca5	95	81.727	ENSCPOG00000013601	SMARCA1	93	82.419	Cavia_porcellus
ENSORLG00020017679	smarca5	95	80.303	ENSCCAG00000030817	SMARCA1	92	81.084	Cebus_capucinus
ENSORLG00020017679	smarca5	93	83.954	ENSCATG00000015921	SMARCA1	90	84.878	Cercocebus_atys
ENSORLG00020017679	smarca5	96	81.682	ENSCLAG00000002171	SMARCA1	92	83.027	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020017679	smarca5	95	82.929	ENSCSAG00000008460	SMARCA1	92	83.742	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020017679	smarca5	95	84.701	ENSCPBG00000001146	SMARCA1	92	85.174	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020017679	smarca5	96	73.857	ENSCING00000004110	swi/snf	97	75.204	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020017679	smarca5	97	73.013	ENSCSAVG00000004620	-	99	76.063	Ciona_savignyi
ENSORLG00020017679	smarca5	95	83.030	ENSCANG00000007183	SMARCA1	92	83.845	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020017679	smarca5	95	82.121	ENSCGRG00001010776	Smarca1	92	82.822	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020017679	smarca5	94	81.560	ENSCGRG00000015301	Smarca1	94	83.263	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020017679	smarca5	100	95.954	ENSCSEG00000000328	smarca5	100	95.665	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020017679	smarca5	100	95.665	ENSCVAG00000008668	smarca5	99	97.403	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020017679	smarca5	100	91.049	ENSDARG00000052348	smarca5	97	92.666	Danio_rerio
ENSORLG00020017679	smarca5	94	83.350	ENSDARG00000012776	smarca1	96	83.350	Danio_rerio
ENSORLG00020017679	smarca5	94	82.755	ENSDNOG00000004315	SMARCA1	91	84.558	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020017679	smarca5	96	81.882	ENSDORG00000009270	Smarca1	93	82.577	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020017679	smarca5	95	74.472	FBgn0011604	Iswi	99	72.158	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020017679	smarca5	78	81.818	ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	Echinops_telfairi
ENSORLG00020017679	smarca5	97	81.033	ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.939	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017679	smarca5	95	78.471	ENSEASG00005008218	SMARCA1	99	79.878	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020017679	smarca5	96	82.482	ENSECAG00000012106	SMARCA1	92	83.742	Equus_caballus
ENSORLG00020017679	smarca5	76	83.775	ENSEEUG00000014927	SMARCA1	80	83.775	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020017679	smarca5	94	84.734	ENSELUG00000010515	smarca1	95	85.647	Esox_lucius
ENSORLG00020017679	smarca5	97	81.990	ENSFCAG00000018496	SMARCA1	92	83.742	Felis_catus
ENSORLG00020017679	smarca5	88	85.886	ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.886	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020017679	smarca5	95	81.263	ENSFDAG00000009818	SMARCA1	93	83.176	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020017679	smarca5	100	94.847	ENSFHEG00000007687	smarca5	100	94.742	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020017679	smarca5	95	83.535	ENSGALG00000008431	SMARCA1	95	85.789	Gallus_gallus
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.532	ENSGAFG00000017731	smarca5	100	96.532	Gambusia_affinis
ENSORLG00020017679	smarca5	93	85.185	ENSGAGG00000023575	SMARCA1	99	85.185	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020017679	smarca5	70	96.000	ENSGGOG00000012841	-	91	80.029	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020017679	smarca5	96	81.481	ENSHGLG00000003080	SMARCA1	92	82.822	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020017679	smarca5	95	81.627	ENSHGLG00100001102	SMARCA1	98	82.317	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020017679	smarca5	100	97.016	ENSHCOG00000005458	smarca5	100	97.016	Hippocampus_comes
ENSORLG00020017679	smarca5	97	81.729	ENSIPUG00000016905	Smarca1	99	84.324	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020017679	smarca5	98	91.732	ENSIPUG00000005229	SMARCA5	99	92.537	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020017679	smarca5	96	81.972	ENSSTOG00000014524	SMARCA1	95	83.316	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020017679	smarca5	96	80.754	ENSJJAG00000002593	Smarca1	93	82.299	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.724	ENSKMAG00000003777	smarca5	100	96.724	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020017679	smarca5	94	96.224	ENSLBEG00000013295	SMARCA1	100	97.595	Labrus_bergylta
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.146	ENSLBEG00000018112	smarca5	100	96.146	Labrus_bergylta
ENSORLG00020017679	smarca5	93	85.670	ENSLACG00000016697	SMARCA1	95	85.670	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020017679	smarca5	95	85.787	ENSLOCG00000014591	smarca1	95	86.182	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020017679	smarca5	95	81.827	ENSLAFG00000000896	SMARCA1	98	82.520	Loxodonta_africana
ENSORLG00020017679	smarca5	95	82.929	ENSMFAG00000002117	SMARCA1	93	84.697	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020017679	smarca5	93	83.954	ENSMMUG00000008818	SMARCA1	97	84.665	Macaca_mulatta
ENSORLG00020017679	smarca5	93	83.954	ENSMNEG00000041768	SMARCA1	93	84.697	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020017679	smarca5	95	82.929	ENSMLEG00000043198	SMARCA1	92	83.742	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.353	ENSMAMG00000014294	smarca5	100	96.353	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.150	ENSMZEG00005009369	smarca5	100	95.380	Maylandia_zebra
ENSORLG00020017679	smarca5	94	83.702	ENSMGAG00000007042	SMARCA1	97	83.838	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020017679	smarca5	93	82.286	ENSMAUG00000008133	Smarca1	90	83.051	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020017679	smarca5	97	82.289	ENSMICG00000015768	SMARCA1	95	81.962	Microcebus_murinus
ENSORLG00020017679	smarca5	99	78.978	ENSMOCG00000009464	Smarca1	92	82.096	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020017679	smarca5	96	95.770	ENSMMOG00000005547	smarca5	100	95.770	Mola_mola
ENSORLG00020017679	smarca5	94	84.615	ENSMODG00000013187	-	94	84.615	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.250	ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.250	Monopterus_albus
ENSORLG00020017679	smarca5	97	80.336	MGP_CAROLIEiJ_G0033034	Smarca1	92	82.299	Mus_caroli
ENSORLG00020017679	smarca5	97	80.594	ENSMUSG00000031099	Smarca1	92	82.299	Mus_musculus
ENSORLG00020017679	smarca5	96	80.758	MGP_PahariEiJ_G0031579	Smarca1	92	82.582	Mus_pahari
ENSORLG00020017679	smarca5	97	80.594	MGP_SPRETEiJ_G0034192	Smarca1	92	82.299	Mus_spretus
ENSORLG00020017679	smarca5	95	82.136	ENSMPUG00000017423	SMARCA1	87	82.828	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020017679	smarca5	96	80.435	ENSMLUG00000029614	SMARCA1	93	81.250	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020017679	smarca5	94	82.227	ENSNGAG00000006492	Smarca1	90	83.581	Nannospalax_galili
ENSORLG00020017679	smarca5	96	97.284	ENSNBRG00000004463	smarca5	99	97.284	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020017679	smarca5	95	81.433	ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	83.970	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020017679	smarca5	89	76.257	ENSMEUG00000008819	SMARCA1	97	76.534	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020017679	smarca5	96	80.297	ENSODEG00000012163	SMARCA1	93	80.957	Octodon_degus
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.246	ENSONIG00000009993	smarca5	100	96.246	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020017679	smarca5	93	85.391	ENSOANG00000002862	SMARCA1	99	85.391	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020017679	smarca5	96	82.482	ENSOCUG00000001047	SMARCA1	92	83.845	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020017679	smarca5	100	99.711	ENSORLG00000021998	smarca5	100	99.711	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017679	smarca5	100	99.229	ENSORLG00015017210	smarca5	100	99.229	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020017679	smarca5	100	98.748	ENSOMEG00000000086	smarca5	100	98.748	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020017679	smarca5	93	83.676	ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	84.227	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020017679	smarca5	94	83.436	ENSOARG00000014638	SMARCA1	99	83.436	Ovis_aries
ENSORLG00020017679	smarca5	95	82.929	ENSPPAG00000034647	SMARCA1	92	83.742	Pan_paniscus
ENSORLG00020017679	smarca5	97	82.090	ENSPPRG00000008929	SMARCA1	92	83.845	Panthera_pardus
ENSORLG00020017679	smarca5	95	81.331	ENSPTIG00000000915	SMARCA1	96	82.010	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020017679	smarca5	95	82.929	ENSPTRG00000049876	SMARCA1	90	84.878	Pan_troglodytes
ENSORLG00020017679	smarca5	95	82.929	ENSPANG00000003871	SMARCA1	92	83.742	Papio_anubis
ENSORLG00020017679	smarca5	94	82.600	ENSPKIG00000013411	smarca1	96	84.332	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020017679	smarca5	95	83.684	ENSPSIG00000010101	SMARCA1	99	85.185	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020017679	smarca5	93	82.595	ENSPEMG00000017503	Smarca1	90	83.369	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020017679	smarca5	94	85.041	ENSPCIG00000015460	SMARCA1	96	85.041	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.435	ENSPFOG00000007649	smarca5	100	96.435	Poecilia_formosa
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.435	ENSPLAG00000003363	smarca5	100	96.435	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.532	ENSPMEG00000019849	smarca5	100	96.532	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.435	ENSPREG00000023250	smarca5	100	96.435	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020017679	smarca5	95	80.101	ENSPPYG00000020703	SMARCA1	92	80.879	Pongo_abelii
ENSORLG00020017679	smarca5	75	78.125	ENSPCOG00000020722	SMARCA1	93	80.267	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020017679	smarca5	88	83.484	ENSPVAG00000003805	SMARCA1	84	83.574	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020017679	smarca5	58	97.625	ENSPNYG00000012299	smarca5	92	97.625	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020017679	smarca5	97	80.896	ENSRNOG00000003762	Smarca1	92	82.618	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020017679	smarca5	95	83.030	ENSRROG00000034167	SMARCA1	92	83.845	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020017679	smarca5	94	83.640	ENSSBOG00000020641	SMARCA1	99	83.640	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020017679	smarca5	93	80.247	ENSSHAG00000013518	SMARCA1	99	80.247	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020017679	smarca5	93	93.395	ENSSFOG00015016794	smarca5	100	93.299	Scleropages_formosus
ENSORLG00020017679	smarca5	97	83.021	ENSSFOG00015009043	smarca1	96	85.348	Scleropages_formosus
ENSORLG00020017679	smarca5	100	95.665	ENSSMAG00000004801	smarca5	100	95.568	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.532	ENSSDUG00000020690	smarca5	100	96.532	Seriola_dumerili
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.532	ENSSLDG00000025190	smarca5	100	96.532	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020017679	smarca5	78	83.986	ENSSARG00000000842	SMARCA1	81	83.986	Sorex_araneus
ENSORLG00020017679	smarca5	93	85.300	ENSSPUG00000000590	SMARCA1	93	85.789	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.920	ENSSPAG00000002894	smarca5	100	96.920	Stegastes_partitus
ENSORLG00020017679	smarca5	93	83.851	ENSSSCG00000012649	SMARCA1	95	83.316	Sus_scrofa
ENSORLG00020017679	smarca5	94	84.521	ENSTGUG00000003899	-	99	84.663	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020017679	smarca5	100	95.087	ENSTRUG00000014094	smarca5	100	94.894	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020017679	smarca5	98	94.975	ENSTNIG00000017717	smarca5	97	95.248	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020017679	smarca5	86	82.483	ENSTBEG00000014973	SMARCA1	89	82.525	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020017679	smarca5	93	79.877	ENSTTRG00000006168	SMARCA1	96	80.336	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020017679	smarca5	95	82.828	ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	83.538	Ursus_americanus
ENSORLG00020017679	smarca5	97	77.438	ENSUMAG00000004073	SMARCA1	95	85.185	Ursus_maritimus
ENSORLG00020017679	smarca5	73	87.171	ENSVPAG00000010492	-	77	87.543	Vicugna_pacos
ENSORLG00020017679	smarca5	95	83.131	ENSVVUG00000008878	SMARCA1	98	84.984	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020017679	smarca5	94	84.639	ENSXETG00000001526	smarca1	98	85.113	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020017679	smarca5	97	97.024	ENSXCOG00000011170	smarca5	100	97.024	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.435	ENSXMAG00000009678	smarca5	100	96.435	Xiphophorus_maculatus