EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017794 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1292 bases
Position: chr6:10666024-10667315
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020032311	RVT_1	PF00078.27	4.1e-31	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020034010	-	1292	-	ENSORLP00020032311	389 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020017794	-	96	30.504	ENSORLG00020009687	-	63	30.556
ENSORLG00020017794	-	93	31.522	ENSORLG00020017929	-	73	31.302
ENSORLG00020017794	-	68	48.120	ENSORLG00020017728	-	55	48.120
ENSORLG00020017794	-	67	38.224	ENSORLG00020021536	-	70	38.224
ENSORLG00020017794	-	93	44.110	ENSORLG00020004729	-	53	44.231
ENSORLG00020017794	-	98	41.406	ENSORLG00020010320	-	81	41.406
ENSORLG00020017794	-	86	42.433	ENSORLG00020019504	-	92	42.433
ENSORLG00020017794	-	98	51.688	ENSORLG00020020284	-	77	51.688
ENSORLG00020017794	-	98	48.438	ENSORLG00020008115	-	80	48.438
ENSORLG00020017794	-	93	49.171	ENSORLG00020018053	-	71	49.171
ENSORLG00020017794	-	98	44.241	ENSORLG00020021677	-	77	44.241
ENSORLG00020017794	-	85	49.096	ENSORLG00020018736	-	79	49.096
ENSORLG00020017794	-	63	48.374	ENSORLG00020003812	-	63	48.374
ENSORLG00020017794	-	89	42.776	ENSORLG00020017052	-	97	42.776
ENSORLG00020017794	-	97	70.635	ENSORLG00020012070	-	63	69.713
ENSORLG00020017794	-	75	43.197	ENSORLG00020001622	-	92	42.349
ENSORLG00020017794	-	96	45.526	ENSORLG00020022028	-	66	45.205
ENSORLG00020017794	-	97	48.813	ENSORLG00020015554	-	98	48.813
ENSORLG00020017794	-	58	48.000	ENSORLG00020007610	-	71	48.000
ENSORLG00020017794	-	62	64.050	ENSORLG00020002010	-	59	64.050
ENSORLG00020017794	-	94	48.913	ENSORLG00020015063	-	72	48.913
ENSORLG00020017794	-	74	48.966	ENSORLG00020018183	-	67	48.966
ENSORLG00020017794	-	98	42.448	ENSORLG00020017324	-	83	42.448
ENSORLG00020017794	-	96	46.053	ENSORLG00020022349	-	66	45.753
ENSORLG00020017794	-	96	44.533	ENSORLG00020011898	-	66	44.533
ENSORLG00020017794	-	98	43.229	ENSORLG00020014334	-	58	43.229
ENSORLG00020017794	-	98	48.177	ENSORLG00020006573	-	80	48.177
ENSORLG00020017794	-	97	48.556	ENSORLG00020003990	-	80	48.556
ENSORLG00020017794	-	51	43.216	ENSORLG00020012794	-	82	43.000
ENSORLG00020017794	-	98	41.927	ENSORLG00020011261	-	93	41.927
ENSORLG00020017794	-	94	48.913	ENSORLG00020009707	-	72	48.913
ENSORLG00020017794	-	98	41.927	ENSORLG00020019862	-	81	41.927
ENSORLG00020017794	-	98	42.448	ENSORLG00020019488	-	55	42.448
ENSORLG00020017794	-	93	43.169	ENSORLG00020011841	-	99	43.169
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ENSORLG00020017794	-	98	48.698	ENSORLG00020014098	-	72	48.698
ENSORLG00020017794	-	93	43.562	ENSORLG00020000622	-	53	43.681
ENSORLG00020017794	-	82	31.153	ENSORLG00020002243	-	67	31.104
ENSORLG00020017794	-	79	43.831	ENSORLG00020002204	-	97	43.831
ENSORLG00020017794	-	98	62.924	ENSORLG00020019399	-	69	63.969
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ENSORLG00020017794	-	74	48.611	ENSORLG00020009885	-	67	48.611
ENSORLG00020017794	-	98	48.698	ENSORLG00020021860	-	51	48.698
ENSORLG00020017794	-	96	45.263	ENSORLG00020020026	-	63	44.932
ENSORLG00020017794	-	78	49.175	ENSORLG00020013014	-	68	49.175
ENSORLG00020017794	-	62	42.105	ENSORLG00020016267	-	87	42.105
ENSORLG00020017794	-	98	48.177	ENSORLG00020014062	-	51	48.177
ENSORLG00020017794	-	79	43.322	ENSORLG00020004482	-	98	43.322
ENSORLG00020017794	-	88	40.816	ENSORLG00020015429	-	60	40.816
ENSORLG00020017794	-	85	45.345	ENSORLG00020003398	-	98	45.345
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ENSORLG00020017794	-	97	67.989	ENSORLG00020003888	-	82	67.989
ENSORLG00020017794	-	77	49.000	ENSORLG00020004056	-	67	49.000
ENSORLG00020017794	-	80	49.359	ENSORLG00020002173	-	68	49.359
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ENSORLG00020017794	-	98	41.146	ENSORLG00020012080	-	81	41.146
ENSORLG00020017794	-	77	44.850	ENSORLG00020004647	-	72	44.850
ENSORLG00020017794	-	68	46.442	ENSORLG00020015544	-	75	46.442
ENSORLG00020017794	-	74	42.414	ENSORLG00020015750	-	62	42.414
ENSORLG00020017794	-	98	48.564	ENSORLG00020008589	-	71	48.564
ENSORLG00020017794	-	98	42.188	ENSORLG00020007946	-	54	42.188
ENSORLG00020017794	-	51	88.500	ENSORLG00020007940	-	51	88.500
ENSORLG00020017794	-	98	48.698	ENSORLG00020010410	-	80	48.698
ENSORLG00020017794	-	63	45.200	ENSORLG00020015149	-	75	45.382
ENSORLG00020017794	-	98	42.969	ENSORLG00020013078	-	81	42.969
ENSORLG00020017794	-	98	48.958	ENSORLG00020000803	-	51	48.958
ENSORLG00020017794	-	96	44.533	ENSORLG00020014641	-	76	44.167
ENSORLG00020017794	-	81	64.557	ENSORLG00020002634	-	98	65.823
ENSORLG00020017794	-	93	46.995	ENSORLG00020001944	-	78	47.123
ENSORLG00020017794	-	86	48.955	ENSORLG00020010414	-	70	48.955
ENSORLG00020017794	-	96	30.239	ENSORLG00020009835	-	78	30.278
ENSORLG00020017794	-	98	48.438	ENSORLG00020016342	-	51	48.438
ENSORLG00020017794	-	97	45.526	ENSORLG00020008855	-	83	45.526
ENSORLG00020017794	-	94	48.913	ENSORLG00020004992	-	72	48.913
ENSORLG00020017794	-	98	48.438	ENSORLG00020017390	-	72	48.438
ENSORLG00020017794	-	80	45.714	ENSORLG00020016069	-	95	45.714
ENSORLG00020017794	-	93	31.522	ENSORLG00020019816	-	67	31.302
ENSORLG00020017794	-	86	42.090	ENSORLG00020016788	-	84	42.090
ENSORLG00020017794	-	98	42.597	ENSORLG00020008083	-	81	42.597
ENSORLG00020017794	-	60	45.923	ENSORLG00020013020	-	68	46.121
ENSORLG00020017794	-	98	41.927	ENSORLG00020018691	-	55	41.927
ENSORLG00020017794	-	62	32.645	ENSORLG00020009746	-	68	32.645
ENSORLG00020017794	-	67	47.328	ENSORLG00020002465	-	64	47.328
ENSORLG00020017794	-	98	48.438	ENSORLG00020006316	-	72	48.438
ENSORLG00020017794	-	52	36.765	ENSORLG00020016658	-	53	39.560
ENSORLG00020017794	-	84	44.954	ENSORLG00020016243	-	85	44.954
ENSORLG00020017794	-	98	42.188	ENSORLG00020006422	-	51	42.188
ENSORLG00020017794	-	94	48.913	ENSORLG00020011734	-	72	48.913
ENSORLG00020017794	-	88	45.058	ENSORLG00020005478	-	98	45.058
ENSORLG00020017794	-	68	48.485	ENSORLG00020001344	-	65	48.485
ENSORLG00020017794	-	98	87.206	ENSORLG00020021613	-	58	87.206
ENSORLG00020017794	-	54	41.589	ENSORLG00020005670	-	78	41.589
ENSORLG00020017794	-	80	49.359	ENSORLG00020009639	-	68	49.359
ENSORLG00020017794	-	98	61.780	ENSORLG00020016660	-	84	62.565
ENSORLG00020017794	-	98	41.558	ENSORLG00020019142	-	81	41.558
ENSORLG00020017794	-	79	43.831	ENSORLG00020011671	-	97	43.831
ENSORLG00020017794	-	89	87.679	ENSORLG00020000885	-	98	87.679
ENSORLG00020017794	-	98	47.917	ENSORLG00020012251	-	51	47.917
ENSORLG00020017794	-	67	45.865	ENSORLG00020011254	-	56	46.038
ENSORLG00020017794	-	51	44.059	ENSORLG00020005292	-	56	44.059
ENSORLG00020017794	-	98	85.901	ENSORLG00020006220	-	74	85.901
ENSORLG00020017794	-	70	48.352	ENSORLG00020020066	-	65	48.352
ENSORLG00020017794	-	98	48.698	ENSORLG00020008999	-	51	48.698
ENSORLG00020017794	-	81	49.371	ENSORLG00020021900	-	69	49.371

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020017794	-	98	53.886	ENSAPEG00000010166	-	70	53.886	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017794	-	71	46.763	ENSAPEG00000000917	-	75	45.936	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017794	-	92	49.315	ENSAPEG00000014087	-	70	50.000	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017794	-	97	48.021	ENSAPEG00000006041	-	54	48.021	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017794	-	78	45.902	ENSAPEG00000002418	-	76	45.902	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017794	-	79	54.545	ENSAPEG00000011071	-	89	54.545	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017794	-	65	67.717	ENSAPEG00000001164	-	99	67.717	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017794	-	81	55.063	ENSAPEG00000006031	-	77	55.063	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017794	-	61	49.160	ENSAPEG00000007939	-	58	48.148	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017794	-	86	54.925	ENSAPEG00000019125	-	73	54.925	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017794	-	97	48.549	ENSATEG00000016827	-	68	48.549	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017794	-	97	46.966	ENSATEG00000019303	-	61	46.966	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017794	-	56	45.909	ENSATEG00000002707	-	55	45.909	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017794	-	95	47.297	ENSATEG00000014141	-	96	47.368	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017794	-	80	48.232	ENSATEG00000002797	-	97	48.232	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017794	-	97	47.230	ENSATEG00000022498	-	68	47.230	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017794	-	97	47.493	ENSATEG00000007671	-	80	47.493	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017794	-	97	48.285	ENSATEG00000022917	-	71	48.285	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017794	-	97	46.966	ENSATEG00000023306	-	68	46.966	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017794	-	58	47.368	ENSATEG00000024731	-	96	47.489	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017794	-	60	48.927	ENSATEG00000010018	-	69	48.927	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017794	-	93	47.658	ENSATEG00000009738	-	89	47.658	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017794	-	76	38.511	ENSACAG00000029092	-	95	37.793	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020017794	-	88	38.592	ENSACAG00000028905	-	98	38.592	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020017794	-	88	41.127	ENSACAG00000028394	-	98	42.254	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020017794	-	88	38.873	ENSACAG00000028350	-	98	38.873	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020017794	-	88	38.873	ENSACAG00000029109	-	98	38.873	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020017794	-	88	38.592	ENSACAG00000029520	-	98	38.592	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020017794	-	99	42.145	ENSACAG00000028621	-	75	42.145	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020017794	-	79	39.048	ENSACAG00000028738	-	99	39.048	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020017794	-	87	42.693	ENSACAG00000028582	-	98	42.693	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020017794	-	88	40.346	ENSACAG00000028552	-	99	40.346	Anolis_carolinensis
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