EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017795 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6861 bases
Position: chr4:28026823-28033683
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020032431	RVT_1	PF00078.27	2e-49	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020025097	-	3699	-	ENSORLP00020032431	1232 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020017795	-	97	32.202	ENSORLG00020001169	-	94	32.202
ENSORLG00020017795	-	78	33.402	ENSORLG00020002715	-	97	33.402
ENSORLG00020017795	-	97	34.265	ENSORLG00020000006	-	95	34.265
ENSORLG00020017795	-	95	33.893	ENSORLG00020006395	-	98	33.893
ENSORLG00020017795	-	96	34.138	ENSORLG00020020951	-	95	34.138
ENSORLG00020017795	-	77	33.646	ENSORLG00020022564	-	76	33.646
ENSORLG00020017795	-	97	33.388	ENSORLG00020005656	-	95	33.388
ENSORLG00020017795	-	94	34.097	ENSORLG00020012298	-	94	34.097
ENSORLG00020017795	-	97	34.265	ENSORLG00020013447	-	95	34.265
ENSORLG00020017795	-	67	36.495	ENSORLG00020003980	-	99	36.495
ENSORLG00020017795	-	95	34.230	ENSORLG00020017758	-	93	34.230
ENSORLG00020017795	-	99	34.365	ENSORLG00020008142	-	96	34.365
ENSORLG00020017795	-	64	35.891	ENSORLG00020010757	-	95	35.891
ENSORLG00020017795	-	89	34.813	ENSORLG00020005675	-	91	34.813
ENSORLG00020017795	-	95	33.361	ENSORLG00020011033	-	94	33.361
ENSORLG00020017795	-	56	30.282	ENSORLG00020013755	-	88	30.282
ENSORLG00020017795	-	95	33.893	ENSORLG00020018889	-	94	33.893
ENSORLG00020017795	-	86	32.588	ENSORLG00020006733	-	96	32.588
ENSORLG00020017795	-	70	34.932	ENSORLG00020001651	-	99	34.932
ENSORLG00020017795	-	69	30.947	ENSORLG00020016539	-	97	30.947
ENSORLG00020017795	-	97	32.210	ENSORLG00020019330	-	96	32.210
ENSORLG00020017795	-	56	30.282	ENSORLG00020013618	-	87	30.282
ENSORLG00020017795	-	96	33.837	ENSORLG00020022514	-	82	33.837
ENSORLG00020017795	-	97	99.916	ENSORLG00020004108	-	95	99.916
ENSORLG00020017795	-	95	33.809	ENSORLG00020002923	-	94	33.809
ENSORLG00020017795	-	95	33.893	ENSORLG00020004575	-	94	33.893
ENSORLG00020017795	-	97	100.000	ENSORLG00020002457	-	96	100.000
ENSORLG00020017795	-	78	33.230	ENSORLG00020007463	-	82	33.230
ENSORLG00020017795	-	97	99.916	ENSORLG00020011252	-	96	99.916
ENSORLG00020017795	-	76	33.754	ENSORLG00020000993	-	99	33.754
ENSORLG00020017795	-	74	36.030	ENSORLG00020013149	-	99	36.030
ENSORLG00020017795	-	96	31.176	ENSORLG00020000561	-	94	31.176
ENSORLG00020017795	-	74	34.159	ENSORLG00020005776	-	97	34.159

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020017795	-	89	33.333	ENSAPOG00000011184	-	97	33.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017795	-	96	39.432	ENSAPOG00000013536	-	95	39.432	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017795	-	65	32.015	ENSAOCG00000013559	-	96	32.015	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017795	-	86	34.425	ENSAOCG00000019370	-	97	34.425	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017795	-	62	31.953	ENSAOCG00000022482	-	96	31.953	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017795	-	96	32.426	ENSAOCG00000021572	-	97	32.426	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017795	-	87	31.843	ENSAOCG00000011998	-	99	31.843	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017795	-	96	32.508	ENSAOCG00000017326	-	91	32.508	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017795	-	76	32.180	ENSAOCG00000017045	-	82	32.180	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017795	-	97	71.464	ENSAPEG00000003616	-	95	71.464	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	95	34.486	ENSAPEG00000002768	-	84	34.486	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	95	38.540	ENSAPEG00000003655	-	80	38.540	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	96	32.261	ENSAPEG00000001971	-	97	32.261	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	96	32.343	ENSAPEG00000006674	-	97	32.343	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	92	32.062	ENSAPEG00000007540	-	96	32.062	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	66	31.649	ENSAPEG00000010007	-	99	31.649	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	69	35.198	ENSAPEG00000003065	-	99	35.198	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	61	32.990	ENSAPEG00000015961	-	95	32.990	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	78	32.551	ENSAPEG00000019256	-	98	32.551	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	96	32.013	ENSAPEG00000017003	-	97	32.013	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	73	34.341	ENSAPEG00000017325	-	99	34.341	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	97	71.464	ENSAPEG00000013213	-	95	71.464	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	69	35.198	ENSAPEG00000002696	-	99	35.198	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017795	-	98	40.132	ENSACLG00000002829	-	90	40.132	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	76	32.808	ENSACLG00000027433	-	97	32.808	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	97	40.199	ENSACLG00000014342	-	85	40.199	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	97	33.333	ENSACLG00000023597	-	94	33.333	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	67	34.814	ENSACLG00000020021	-	99	34.814	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	94	35.234	ENSACLG00000025597	-	95	35.234	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	95	34.465	ENSACLG00000023216	-	79	34.465	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	74	35.637	ENSACLG00000007324	-	96	35.637	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	62	36.506	ENSACLG00000008786	-	95	36.506	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	62	36.176	ENSACLG00000020106	-	97	36.176	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	93	35.512	ENSACLG00000009895	-	90	35.653	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	66	35.810	ENSACLG00000014178	-	86	35.810	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	66	32.569	ENSACLG00000011463	-	99	32.569	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	84	33.960	ENSACLG00000015440	-	95	34.053	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	70	35.877	ENSACLG00000003130	-	96	35.877	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	81	33.105	ENSACLG00000012223	-	97	33.105	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	62	35.798	ENSACLG00000020885	-	95	35.798	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	97	39.867	ENSACLG00000022582	-	84	39.867	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	97	32.643	ENSACLG00000005466	-	94	32.643	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	97	33.887	ENSACLG00000019378	-	81	33.887	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	86	33.522	ENSACLG00000010561	-	98	33.522	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	69	35.138	ENSACLG00000018473	-	95	35.138	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017795	-	95	32.797	ENSACLG00000003800	-	93	32.797	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020017795	-	83	34.976	ENSAMXG00000041150	-	99	34.976	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020017795	-	63	35.422	ENSAMXG00000040121	-	92	35.414	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020017795	-	62	36.869	ENSDARG00000086420	CABZ01046949.1	97	36.869	Danio_rerio
ENSORLG00020017795	-	96	36.249	ENSDARG00000088493	si:ch211-149k12.3	94	36.249	Danio_rerio
ENSORLG00020017795	-	66	33.414	ENSDARG00000103562	CU462878.2	96	33.215	Danio_rerio
ENSORLG00020017795	-	96	31.146	ENSKMAG00000008495	-	94	31.146	Kryptolebias_marmoratus
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ENSORLG00020017795	-	89	35.289	ENSKMAG00000000885	-	98	35.289	Kryptolebias_marmoratus
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ENSORLG00020017795	-	51	39.465	ENSLBEG00000015758	-	94	39.465	Labrus_bergylta
ENSORLG00020017795	-	60	39.300	ENSMZEG00005021767	-	93	39.300	Maylandia_zebra
ENSORLG00020017795	-	97	40.199	ENSMZEG00005026873	-	83	40.199	Maylandia_zebra
ENSORLG00020017795	-	79	39.816	ENSMZEG00005020294	-	85	39.816	Maylandia_zebra
ENSORLG00020017795	-	97	39.134	ENSMZEG00005024554	-	81	39.134	Maylandia_zebra
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ENSORLG00020017795	-	97	99.749	ENSORLG00000022346	-	99	99.749	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020017795	-	96	34.160	ENSORLG00000027152	-	99	34.160	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020017795	-	88	32.843	ENSXMAG00000023746	-	96	32.843	Xiphophorus_maculatus