EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017818 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: htatsf1
Alias: -
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3935 bases
Position: chr14:6973173-6977107
Accession: ZDB-GENE-040426-1578
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020032320	RRM_1	PF00076.22	4.7e-17	1	2
ENSORLP00020032320	RRM_1	PF00076.22	4.7e-17	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020025135	-	2223	-	ENSORLP00020032320	472 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020017818's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020017818's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020017818	htatsf1	80	63.990	ENSG00000102241	HTATSF1	97	56.356	Homo_sapiens
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	76.805	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	76.368	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	76.638	ENSACIG00000020459	htatsf1	100	78.166	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	75.647	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	75.862	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	77.007	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	76.790	Amphiprion_percula
ENSORLG00020017818	htatsf1	88	78.846	ENSATEG00000008903	htatsf1	93	78.846	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017818	htatsf1	89	63.333	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.500	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020017818	htatsf1	75	64.972	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	60.697	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	75.870	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	75.870	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	67.241	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	67.026	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020017818	htatsf1	81	62.211	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	50	62.211	Bos_taurus
ENSORLG00020017818	htatsf1	73	38.462	WBGene00022025	Y65B4A.1	75	38.746	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020017818	htatsf1	81	63.171	ENSCCAG00000025329	-	58	60.386	Cebus_capucinus
ENSORLG00020017818	htatsf1	85	61.594	ENSCCAG00000022701	-	50	64.286	Cebus_capucinus
ENSORLG00020017818	htatsf1	95	62.857	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	62.857	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020017818	htatsf1	88	43.947	ENSCING00000005914	-	88	45.531	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020017818	htatsf1	81	44.386	ENSCSAVG00000000371	-	77	43.342	Ciona_savignyi
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	76.754	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	78.289	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	66.087	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	65.517	Danio_rerio
ENSORLG00020017818	htatsf1	74	47.458	FBgn0037081	barc	62	48.870	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020017818	htatsf1	87	51.422	ENSEBUG00000001534	htatsf1	82	52.555	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	61.422	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	63.136	Esox_lucius
ENSORLG00020017818	htatsf1	95	60.262	ENSFALG00000003728	HTATSF1	99	60.262	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	77.511	ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	77.293	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020017818	htatsf1	77	72.253	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	72.131	Gadus_morhua
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	63.181	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	62.745	Gallus_gallus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	76.586	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	76.586	Gambusia_affinis
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	75.877	ENSGACG00000020459	htatsf1	100	75.219	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	75.652	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	75.652	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	67.325	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	67.396	Hippocampus_comes
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	62.368	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	62.869	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020017818	htatsf1	91	59.497	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	50	64.615	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	80.263	ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	79.825	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	74.675	ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	74.026	Labrus_bergylta
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	59.870	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	59.737	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	45.860	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	44.958	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020017818	htatsf1	81	64.359	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	61.795	Loxodonta_africana
ENSORLG00020017818	htatsf1	80	63.846	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	54	63.333	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	73.846	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	74.066	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	76.087	ENSMZEG00005000485	htatsf1	100	76.087	Maylandia_zebra
ENSORLG00020017818	htatsf1	90	64.569	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	97	64.569	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020017818	htatsf1	81	63.496	ENSMICG00000009348	HTATSF1	50	63.496	Microcebus_murinus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	75.219	ENSMMOG00000011013	htatsf1	100	74.342	Mola_mola
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	60.991	ENSMODG00000014087	-	97	60.991	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020017818	htatsf1	54	58.555	ENSMODG00000000199	-	91	56.612	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	74.781	ENSMALG00000019977	htatsf1	100	74.561	Monopterus_albus
ENSORLG00020017818	htatsf1	93	55.481	ENSMLUG00000009234	-	51	61.440	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020017818	htatsf1	87	61.667	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	53	62.350	Nannospalax_galili
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	76.304	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	76.304	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020017818	htatsf1	86	61.779	ENSMEUG00000004133	-	96	61.538	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	75.870	ENSONIG00000008638	htatsf1	100	75.870	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020017818	htatsf1	88	59.005	ENSOANG00000011674	-	99	59.479	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	98.904	ENSORLG00000002356	htatsf1	100	98.904	Oryzias_latipes
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	98.026	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	98.026	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020017818	htatsf1	98	89.371	ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	90.132	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	65.076	ENSPKIG00000024852	htatsf1	99	65.076	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020017818	htatsf1	73	66.952	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	98	66.952	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	70.241	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	70.241	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020017818	htatsf1	87	61.283	ENSPCIG00000030173	-	93	61.283	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	57.734	ENSPCIG00000018896	-	99	57.734	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	77.243	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	77.243	Poecilia_formosa
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	76.974	ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	76.754	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	77.632	ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	77.632	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	77.412	ENSPREG00000007811	htatsf1	100	77.412	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020017818	htatsf1	81	57.326	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	52	57.474	Procavia_capensis
ENSORLG00020017818	htatsf1	81	62.821	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	63.171	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	76.304	ENSPNYG00000016693	htatsf1	100	76.304	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	64.632	ENSPNAG00000006166	htatsf1	99	65.678	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020017818	htatsf1	85	60.911	ENSSBOG00000027186	-	50	63.544	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020017818	htatsf1	85	61.139	ENSSBOG00000017914	-	52	61.347	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020017818	htatsf1	79	67.196	ENSSHAG00000006440	-	94	67.196	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	59.483	ENSSHAG00000018908	-	98	59.483	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	62.156	ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.979	Scleropages_formosus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	73.160	ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	72.944	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020017818	htatsf1	98	73.102	ENSSDUG00000020002	htatsf1	99	73.465	Seriola_dumerili
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	77.412	ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	77.412	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020017818	htatsf1	84	59.559	ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	62.176	Sorex_araneus
ENSORLG00020017818	htatsf1	95	59.912	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	98	59.912	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	77.223	ENSSPAG00000000732	htatsf1	100	77.223	Stegastes_partitus
ENSORLG00020017818	htatsf1	81	65.039	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	54	64.706	Sus_scrofa
ENSORLG00020017818	htatsf1	96	60.652	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	99	60.475	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	71.491	ENSTRUG00000013383	htatsf1	100	71.616	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	71.895	ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	71.834	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020017818	htatsf1	74	62.465	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	58	62.465	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	58.531	ENSXETG00000019749	htatsf1	85	57.906	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	72.083	ENSXCOG00000006912	htatsf1	96	77.336	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020017818	htatsf1	97	76.974	ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	76.974	Xiphophorus_maculatus