EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017850 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13166 bases
Position: chr17:9099630-9112795
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020016789	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-68	1	13
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ENSORLP00020016789	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-68	7	13
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ENSORLP00020016789	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-68	9	13
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ENSORLP00020016789	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-68	13	13
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ENSORLP00020016751	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-64	10	11
ENSORLP00020016751	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-64	11	11
ENSORLP00020016656	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-54	1	10
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ENSORLP00020016656	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-54	10	10
ENSORLP00020016727	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-54	1	10
ENSORLP00020016727	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-54	2	10
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ENSORLP00020016727	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-54	10	10
ENSORLP00020016577	zf-C2H2	PF00096.26	3e-54	1	10
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ENSORLP00020016577	zf-C2H2	PF00096.26	3e-54	10	10
ENSORLP00020016577	zf-met	PF12874.7	1.7e-13	1	2
ENSORLP00020016577	zf-met	PF12874.7	1.7e-13	2	2
ENSORLP00020016727	zf-met	PF12874.7	5.8e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020033994	-	1182	-	ENSORLP00020016656	393 (aa)	-	-
ENSORLT00020025169	-	1155	-	ENSORLP00020016751	384 (aa)	-	-
ENSORLT00020025088	-	1203	-	ENSORLP00020016727	400 (aa)	-	-
ENSORLT00020024914	-	1194	-	ENSORLP00020016577	397 (aa)	-	-
ENSORLT00020034040	-	1449	-	ENSORLP00020016789	482 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020017850	-	95	50.189	ENSORLG00020008933	-	99	49.624
ENSORLG00020017850	-	89	47.458	ENSORLG00020017974	e4f1	60	47.458
ENSORLG00020017850	-	100	44.961	ENSORLG00020008744	-	78	44.961
ENSORLG00020017850	-	97	52.841	ENSORLG00020004313	-	72	52.841
ENSORLG00020017850	-	88	49.558	ENSORLG00020019341	-	82	62.500
ENSORLG00020017850	-	95	38.636	ENSORLG00020011808	-	71	38.636
ENSORLG00020017850	-	100	52.147	ENSORLG00020009857	-	99	55.725
ENSORLG00020017850	-	99	55.422	ENSORLG00020017483	-	97	59.312
ENSORLG00020017850	-	76	37.805	ENSORLG00020020094	-	50	32.530
ENSORLG00020017850	-	88	36.909	ENSORLG00020018685	znf319b	90	36.280
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ENSORLG00020017850	-	88	42.537	ENSORLG00020008787	snai2	63	41.791
ENSORLG00020017850	-	97	30.645	ENSORLG00020015911	-	81	30.645
ENSORLG00020017850	-	99	60.714	ENSORLG00020017514	-	90	60.714
ENSORLG00020017850	-	98	40.923	ENSORLG00020010950	-	97	50.000
ENSORLG00020017850	-	99	46.256	ENSORLG00020010038	-	85	46.256
ENSORLG00020017850	-	99	54.015	ENSORLG00020010636	-	89	52.518
ENSORLG00020017850	-	98	50.973	ENSORLG00020020419	-	94	52.761
ENSORLG00020017850	-	96	53.571	ENSORLG00020009965	-	92	54.217
ENSORLG00020017850	-	98	55.967	ENSORLG00020009180	-	96	55.967
ENSORLG00020017850	-	95	37.398	ENSORLG00020010285	znf646	90	39.326
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ENSORLG00020017850	-	100	51.442	ENSORLG00020010171	-	100	50.920
ENSORLG00020017850	-	95	57.762	ENSORLG00020007018	-	79	57.762
ENSORLG00020017850	-	95	47.239	ENSORLG00020006820	-	71	48.466
ENSORLG00020017850	-	95	54.040	ENSORLG00020000161	-	94	56.061
ENSORLG00020017850	-	83	44.444	ENSORLG00020018503	-	71	43.210
ENSORLG00020017850	-	96	59.471	ENSORLG00020000481	-	97	59.471
ENSORLG00020017850	-	94	44.898	ENSORLG00020004162	znf341	52	45.098
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ENSORLG00020017850	-	93	51.087	ENSORLG00020007599	-	85	45.299
ENSORLG00020017850	-	100	52.060	ENSORLG00020008891	-	99	52.190
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ENSORLG00020017850	-	89	35.374	ENSORLG00020001758	-	58	38.636
ENSORLG00020017850	-	99	56.818	ENSORLG00020009943	-	96	60.440
ENSORLG00020017850	-	91	45.385	ENSORLG00020001922	-	88	43.243
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ENSORLG00020017850	-	99	51.124	ENSORLG00020008018	-	91	51.124
ENSORLG00020017850	-	92	40.323	ENSORLG00020012967	scrt1b	64	40.278
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ENSORLG00020017850	-	95	61.728	ENSORLG00020016754	-	96	56.790
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ENSORLG00020017850	-	95	44.172	ENSORLG00020002817	GFI1	63	45.399
ENSORLG00020017850	-	98	46.696	ENSORLG00020018921	-	96	44.351
ENSORLG00020017850	-	87	32.751	ENSORLG00020014595	PRDM15	50	34.737
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ENSORLG00020017850	-	93	33.333	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	97	34.066
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ENSORLG00020017850	-	98	47.324	ENSORLG00020008484	-	99	48.551
ENSORLG00020017850	-	92	34.375	ENSORLG00020005815	-	89	35.714
ENSORLG00020017850	-	98	53.583	ENSORLG00020018069	-	97	59.236
ENSORLG00020017850	-	82	52.174	ENSORLG00020002700	znf367	53	45.902
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ENSORLG00020017850	-	99	52.941	ENSORLG00020010804	-	99	52.098
ENSORLG00020017850	-	91	44.211	ENSORLG00020018791	-	84	41.812
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