EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020017929 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1674 bases
Position: chr14:19362038-19363711
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020032408	RVT_1	PF00078.27	2.7e-47	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020025276	-	1674	-	ENSORLP00020032408	489 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020017929	-	97	31.942	ENSORLG00020000622	-	71	31.942
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ENSORLG00020017929	-	83	71.535	ENSORLG00020002955	-	52	71.535
ENSORLG00020017929	-	71	36.467	ENSORLG00020009746	-	99	36.467
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ENSORLG00020017929	-	92	34.267	ENSORLG00020015063	-	89	34.267
ENSORLG00020017929	-	97	34.021	ENSORLG00020000803	-	63	34.021
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ENSORLG00020017929	-	96	33.333	ENSORLG00020007946	-	66	33.542
ENSORLG00020017929	-	58	39.863	ENSORLG00020007940	-	73	39.863
ENSORLG00020017929	-	79	34.015	ENSORLG00020001010	-	59	34.184
ENSORLG00020017929	-	96	34.238	ENSORLG00020021677	-	96	34.238
ENSORLG00020017929	-	97	33.951	ENSORLG00020006316	-	89	33.951
ENSORLG00020017929	-	74	35.772	ENSORLG00020020066	-	87	35.772

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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ENSORLG00020017929	-	94	34.409	ENSATEG00000015490	-	75	34.409	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017929	-	93	34.416	ENSATEG00000015931	-	91	34.416	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017929	-	93	34.416	ENSATEG00000014607	-	88	34.416	Anabas_testudineus
ENSORLG00020017929	-	85	32.938	ENSATEG00000023197	-	66	32.938	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020017929	-	94	34.194	ENSATEG00000019512	-	54	34.194	Anabas_testudineus
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