EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020018333 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA-splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8580 bases
Position: chr22:16576936-16585515
Accession: ZDB-GENE-040801-170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020017290	SYF2	PF08231.12	2.3e-53	1	1
ENSORLP00020017305	SYF2	PF08231.12	2.4e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020025804	-	725	-	ENSORLP00020017290	237 (aa)	-	-
ENSORLT00020025808	-	4260	-	ENSORLP00020017305	238 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020018333's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020018333's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020018333	syf2	91	83.333	ENSG00000117614	SYF2	96	78.481	Homo_sapiens
ENSORLG00020018333	syf2	100	89.076	ENSAPOG00000001174	syf2	100	89.076	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020018333	syf2	81	83.854	ENSAMEG00000010134	-	98	83.854	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020018333	syf2	99	76.763	ENSAMEG00000010115	-	99	76.763	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020018333	syf2	98	90.086	ENSACIG00000023688	syf2	93	90.086	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020018333	syf2	100	88.655	ENSAOCG00000022046	syf2	100	88.655	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020018333	syf2	93	87.783	ENSAOCG00000010912	syf2	69	87.783	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020018333	syf2	100	88.655	ENSAPEG00000018858	syf2	92	88.655	Amphiprion_percula
ENSORLG00020018333	syf2	92	92.627	ENSATEG00000007745	syf2	100	87.395	Anabas_testudineus
ENSORLG00020018333	syf2	84	85.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.500	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020018333	syf2	86	83.333	ENSACAG00000013653	-	100	83.333	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020018333	syf2	70	70.659	ENSACAG00000026777	-	100	70.659	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020018333	syf2	91	83.796	ENSANAG00000032473	SYF2	96	78.903	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020018333	syf2	100	89.076	ENSACLG00000019916	syf2	100	89.076	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020018333	syf2	100	81.590	ENSAMXG00000004051	syf2	100	81.590	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020018333	syf2	98	80.172	ENSBTAG00000001651	SYF2	97	80.172	Bos_taurus
ENSORLG00020018333	syf2	88	53.333	WBGene00019402	syf-2	90	52.607	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020018333	syf2	91	83.796	ENSCJAG00000046570	SYF2	96	79.079	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020018333	syf2	91	82.407	ENSCAFG00000012895	-	89	81.735	Canis_familiaris
ENSORLG00020018333	syf2	100	72.574	ENSCAFG00000030331	-	98	72.574	Canis_familiaris
ENSORLG00020018333	syf2	91	82.407	ENSCAFG00020021091	-	89	81.735	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020018333	syf2	76	74.176	ENSCAFG00020021094	-	95	74.176	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020018333	syf2	98	79.741	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	76.543	Capra_hircus
ENSORLG00020018333	syf2	99	77.021	ENSTSYG00000005114	SYF2	97	77.021	Carlito_syrichta
ENSORLG00020018333	syf2	84	82.828	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	82.828	Cavia_aperea
ENSORLG00020018333	syf2	99	77.686	ENSCPOG00000005326	SYF2	99	77.686	Cavia_porcellus
ENSORLG00020018333	syf2	91	83.796	ENSCCAG00000022459	SYF2	96	78.903	Cebus_capucinus
ENSORLG00020018333	syf2	100	76.667	ENSCATG00000026917	SYF2	99	76.667	Cercocebus_atys
ENSORLG00020018333	syf2	99	78.099	ENSCLAG00000008474	SYF2	99	78.099	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020018333	syf2	100	76.667	ENSCSAG00000000948	SYF2	99	76.667	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020018333	syf2	70	64.458	ENSCHOG00000005273	-	91	64.458	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020018333	syf2	94	82.432	ENSCPBG00000025073	SYF2	98	77.273	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020018333	syf2	89	54.460	ENSCING00000003017	-	89	54.930	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020018333	syf2	89	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSORLG00020018333	syf2	100	67.500	ENSCANG00000037322	SYF2	99	67.500	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020018333	syf2	99	77.083	ENSCGRG00001020733	Syf2	99	77.083	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020018333	syf2	83	83.163	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.333	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020018333	syf2	92	88.991	ENSCSEG00000000117	syf2	97	85.345	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020018333	syf2	94	92.793	ENSCVAG00000019543	syf2	100	89.121	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020018333	syf2	100	81.092	ENSDARG00000004706	syf2	100	81.092	Danio_rerio
ENSORLG00020018333	syf2	94	81.532	ENSDNOG00000047605	SYF2	91	81.532	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020018333	syf2	100	76.230	ENSDORG00000001274	Syf2	100	76.230	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020018333	syf2	90	56.019	FBgn0033556	CG12343	94	56.019	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020018333	syf2	94	65.022	ENSETEG00000015729	SYF2	96	65.022	Echinops_telfairi
ENSORLG00020018333	syf2	83	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020018333	syf2	92	83.562	ENSEASG00005004224	-	89	83.562	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020018333	syf2	100	68.595	ENSEASG00005004232	-	100	68.595	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020018333	syf2	100	78.571	ENSECAG00000012023	-	96	78.571	Equus_caballus
ENSORLG00020018333	syf2	92	83.562	ENSECAG00000010440	-	92	83.562	Equus_caballus
ENSORLG00020018333	syf2	68	70.807	ENSEEUG00000015084	SYF2	88	70.807	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020018333	syf2	100	82.700	ENSELUG00000003465	syf2	100	82.353	Esox_lucius
ENSORLG00020018333	syf2	92	83.562	ENSFCAG00000010324	-	76	83.562	Felis_catus
ENSORLG00020018333	syf2	92	82.648	ENSFCAG00000043095	-	89	82.648	Felis_catus
ENSORLG00020018333	syf2	86	83.333	ENSFALG00000000460	SYF2	88	82.870	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020018333	syf2	99	77.593	ENSFDAG00000008310	SYF2	99	77.593	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020018333	syf2	95	76.991	ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.991	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020018333	syf2	91	87.907	ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.907	Gadus_morhua
ENSORLG00020018333	syf2	92	84.862	ENSGALG00000013639	SYF2	87	84.862	Gallus_gallus
ENSORLG00020018333	syf2	100	88.655	ENSGAFG00000019435	syf2	100	88.655	Gambusia_affinis
ENSORLG00020018333	syf2	95	92.411	ENSGACG00000007305	syf2	100	89.583	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020018333	syf2	94	82.883	ENSGAGG00000010670	SYF2	98	77.686	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020018333	syf2	91	83.333	ENSGGOG00000012796	SYF2	96	78.481	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020018333	syf2	100	89.076	ENSHBUG00000020477	syf2	99	90.086	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020018333	syf2	94	72.072	ENSHGLG00000004304	-	100	68.908	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020018333	syf2	94	81.982	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.982	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020018333	syf2	94	81.982	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.982	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020018333	syf2	100	85.714	ENSHCOG00000012904	syf2	78	85.714	Hippocampus_comes
ENSORLG00020018333	syf2	100	82.773	ENSIPUG00000019859	syf2	100	82.773	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020018333	syf2	62	77.397	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	77.397	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020018333	syf2	84	83.417	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020018333	syf2	100	90.336	ENSKMAG00000013856	syf2	100	90.336	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020018333	syf2	100	89.076	ENSLBEG00000014425	syf2	100	89.076	Labrus_bergylta
ENSORLG00020018333	syf2	91	81.944	ENSLACG00000012064	SYF2	91	81.944	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020018333	syf2	100	82.353	ENSLOCG00000002728	syf2	95	82.353	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020018333	syf2	77	55.435	ENSLAFG00000030814	-	100	55.435	Loxodonta_africana
ENSORLG00020018333	syf2	94	81.982	ENSLAFG00000023150	-	91	81.982	Loxodonta_africana
ENSORLG00020018333	syf2	100	76.667	ENSMFAG00000041831	SYF2	99	76.667	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020018333	syf2	91	82.407	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	81.735	Macaca_mulatta
ENSORLG00020018333	syf2	100	76.667	ENSMNEG00000030180	SYF2	99	76.667	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020018333	syf2	100	76.667	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	76.667	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020018333	syf2	92	92.627	ENSMAMG00000010403	syf2	98	86.975	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020018333	syf2	100	88.655	ENSMZEG00005006429	syf2	100	88.655	Maylandia_zebra
ENSORLG00020018333	syf2	84	85.427	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	85.427	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020018333	syf2	99	77.824	ENSMAUG00000018974	Syf2	92	82.432	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020018333	syf2	84	82.412	ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	Microcebus_murinus
ENSORLG00020018333	syf2	99	77.917	ENSMOCG00000022938	Syf2	99	77.917	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020018333	syf2	95	88.444	ENSMMOG00000002396	syf2	94	88.444	Mola_mola
ENSORLG00020018333	syf2	92	77.828	ENSMODG00000013951	-	97	77.828	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020018333	syf2	100	85.892	ENSMALG00000010706	syf2	100	86.307	Monopterus_albus
ENSORLG00020018333	syf2	94	82.432	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	92	82.432	Mus_caroli
ENSORLG00020018333	syf2	94	82.432	ENSMUSG00000028821	Syf2	92	82.432	Mus_musculus
ENSORLG00020018333	syf2	94	82.432	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	92	82.432	Mus_pahari
ENSORLG00020018333	syf2	94	82.432	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	92	82.432	Mus_spretus
ENSORLG00020018333	syf2	92	82.648	ENSMPUG00000015801	-	89	82.648	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020018333	syf2	91	82.407	ENSMPUG00000015802	-	89	81.735	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020018333	syf2	100	78.571	ENSMLUG00000001885	SYF2	96	78.571	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020018333	syf2	99	76.230	ENSNGAG00000007912	Syf2	99	76.230	Nannospalax_galili
ENSORLG00020018333	syf2	100	79.752	ENSNBRG00000010720	syf2	99	79.752	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020018333	syf2	91	83.333	ENSNLEG00000035185	SYF2	96	78.481	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020018333	syf2	94	81.081	ENSOPRG00000012870	SYF2	99	75.934	Ochotona_princeps
ENSORLG00020018333	syf2	94	71.171	ENSODEG00000014338	-	92	71.171	Octodon_degus
ENSORLG00020018333	syf2	97	77.311	ENSODEG00000017664	-	100	77.311	Octodon_degus
ENSORLG00020018333	syf2	100	88.235	ENSONIG00000008213	syf2	100	88.235	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020018333	syf2	85	82.673	ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.673	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020018333	syf2	91	83.796	ENSOCUG00000013050	SYF2	91	81.982	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020018333	syf2	98	99.571	ENSORLG00000028820	syf2	100	99.571	Oryzias_latipes
ENSORLG00020018333	syf2	100	99.160	ENSORLG00015014665	syf2	100	99.160	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020018333	syf2	100	94.958	ENSOMEG00000013911	syf2	100	94.958	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020018333	syf2	94	81.532	ENSOGAG00000009962	SYF2	91	81.532	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020018333	syf2	82	55.897	ENSOARG00000006269	-	100	55.897	Ovis_aries
ENSORLG00020018333	syf2	98	79.060	ENSOARG00000006348	-	94	79.060	Ovis_aries
ENSORLG00020018333	syf2	91	83.333	ENSPPAG00000036579	SYF2	96	78.481	Pan_paniscus
ENSORLG00020018333	syf2	92	82.648	ENSPPRG00000001651	-	89	82.648	Panthera_pardus
ENSORLG00020018333	syf2	92	83.562	ENSPPRG00000001638	-	89	83.562	Panthera_pardus
ENSORLG00020018333	syf2	92	82.648	ENSPTIG00000007036	-	89	82.648	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020018333	syf2	99	77.686	ENSPTIG00000005711	-	88	77.686	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020018333	syf2	91	83.333	ENSPTRG00000000352	SYF2	96	78.481	Pan_troglodytes
ENSORLG00020018333	syf2	100	76.667	ENSPANG00000008139	SYF2	99	76.667	Papio_anubis
ENSORLG00020018333	syf2	100	81.933	ENSPKIG00000008130	syf2	100	81.933	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020018333	syf2	92	82.569	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	78.059	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020018333	syf2	100	83.613	ENSPMGG00000008755	syf2	93	83.613	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020018333	syf2	99	77.500	ENSPEMG00000008283	Syf2	99	77.500	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020018333	syf2	92	83.486	ENSPCIG00000014235	SYF2	87	83.486	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020018333	syf2	97	89.956	ENSPFOG00000004116	syf2	95	89.956	Poecilia_formosa
ENSORLG00020018333	syf2	99	88.511	ENSPLAG00000006691	syf2	98	90.393	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020018333	syf2	100	84.874	ENSPMEG00000011684	syf2	100	85.408	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020018333	syf2	91	93.519	ENSPREG00000003009	syf2	100	88.235	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020018333	syf2	92	82.648	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	82.648	Pongo_abelii
ENSORLG00020018333	syf2	99	52.697	ENSPCOG00000027011	SYF2	99	52.697	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020018333	syf2	99	70.339	ENSPVAG00000005841	SYF2	96	69.748	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020018333	syf2	100	89.076	ENSPNYG00000004979	syf2	100	89.076	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020018333	syf2	100	81.092	ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.092	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020018333	syf2	94	82.432	ENSRNOG00000060597	Syf2	92	82.432	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020018333	syf2	92	79.452	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	79.452	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020018333	syf2	100	76.667	ENSRROG00000001347	SYF2	99	76.667	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020018333	syf2	91	83.333	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	82.648	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020018333	syf2	94	81.081	ENSSHAG00000015630	-	89	81.081	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020018333	syf2	86	83.010	ENSSHAG00000007152	-	100	83.010	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020018333	syf2	100	79.325	ENSSFOG00015023647	syf2	100	79.325	Scleropages_formosus
ENSORLG00020018333	syf2	100	85.714	ENSSMAG00000009867	syf2	100	85.714	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020018333	syf2	92	93.119	ENSSDUG00000013072	syf2	100	87.815	Seriola_dumerili
ENSORLG00020018333	syf2	92	93.119	ENSSLDG00000012677	syf2	100	87.815	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020018333	syf2	94	63.514	ENSSARG00000012889	SYF2	91	63.514	Sorex_araneus
ENSORLG00020018333	syf2	99	79.574	ENSSPUG00000005251	SYF2	92	79.574	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020018333	syf2	100	89.076	ENSSPAG00000009626	syf2	100	89.076	Stegastes_partitus
ENSORLG00020018333	syf2	93	81.900	ENSSSCG00000037481	SYF2	90	81.900	Sus_scrofa
ENSORLG00020018333	syf2	63	54.967	ENSTGUG00000001126	SYF2	80	56.442	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020018333	syf2	100	83.817	ENSTRUG00000001499	syf2	94	84.681	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020018333	syf2	94	86.486	ENSTNIG00000016912	syf2	99	86.486	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020018333	syf2	94	60.360	ENSTBEG00000017370	SYF2	89	60.360	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020018333	syf2	91	83.333	ENSTTRG00000003550	SYF2	91	81.532	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020018333	syf2	92	81.735	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	81.735	Ursus_americanus
ENSORLG00020018333	syf2	91	81.944	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.279	Ursus_maritimus
ENSORLG00020018333	syf2	94	81.614	ENSVPAG00000005705	SYF2	91	81.614	Vicugna_pacos
ENSORLG00020018333	syf2	91	82.407	ENSVVUG00000027175	-	89	81.735	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020018333	syf2	86	82.439	ENSVVUG00000027181	-	96	77.637	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020018333	syf2	98	77.253	ENSXETG00000022797	syf2	94	77.253	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020018333	syf2	100	87.395	ENSXMAG00000022698	syf2	100	87.395	Xiphophorus_maculatus