EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020018451 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ehd1a
Alias: -
Full Name: EH-domain containing 1a
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14821 bases
Position: chr10:11070510-11085330
Accession: ZDB-GENE-040426-2518
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020017410	MMR_HSR1	PF01926.23	9.2e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020025930	-	5006	-	ENSORLP00020017394	511 (aa)	-	-
ENSORLT00020025938	-	5069	-	ENSORLP00020017410	532 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020018451's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020018451's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	75.337	ENSORLG00020001245	ehd4	95	75.337
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	86.154	ENSORLG00020002121	ehd3	97	86.154
ENSORLG00020018451	ehd1a	70	32.990	ENSORLG00020018173	SRL	86	32.990
ENSORLG00020018451	ehd1a	70	31.282	ENSORLG00020019784	srl	74	31.868
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	57.169	ENSORLG00020013250	-	99	57.169
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	70.076	ENSORLG00020017051	ehd2b	98	70.455

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSG00000110047	EHD1	100	93.827	Homo_sapiens
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	93.609	ENSAPOG00000013440	ehd1a	100	93.609	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	86.731	ENSAMEG00000017785	EHD1	94	86.731	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	94.340	ENSACIG00000022182	ehd1a	99	94.340	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	93.974	ENSAOCG00000016322	ehd1a	99	93.974	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	93.974	ENSAPEG00000010363	ehd1a	99	93.974	Amphiprion_percula
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	93.220	ENSATEG00000013980	ehd1a	99	93.220	Anabas_testudineus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSANAG00000034810	EHD1	97	87.308	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	94.906	ENSACLG00000016016	ehd1a	99	94.906	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	86.069	ENSAMXG00000031892	-	98	86.069	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	89.981	ENSAMXG00000039344	ehd1a	99	89.981	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSBTAG00000050712	EHD1	97	87.308	Bos_taurus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	68.302	WBGene00004373	rme-1	95	68.302	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSCJAG00000002660	EHD1	97	87.308	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020018451	ehd1a	77	86.618	ENSCAFG00000014128	EHD1	90	86.288	Canis_familiaris
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSCAFG00020014846	EHD1	97	87.308	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSCHIG00000020707	-	97	87.308	Capra_hircus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSCPOG00000008157	EHD1	97	87.308	Cavia_porcellus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSCCAG00000004590	EHD1	97	87.308	Cebus_capucinus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSCATG00000010658	EHD1	95	87.308	Cercocebus_atys
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSCLAG00000016412	EHD1	97	87.308	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSCSAG00000007397	EHD1	97	87.500	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020018451	ehd1a	97	85.328	ENSCPBG00000023692	EHD1	96	85.328	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSCANG00000042123	EHD1	97	87.500	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.115	ENSCGRG00001019701	Ehd1	97	87.115	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020018451	ehd1a	94	86.600	ENSCGRG00000000662	Ehd1	99	86.600	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	91.509	ENSCSEG00000006078	ehd1a	99	91.509	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	93.609	ENSCVAG00000012152	ehd1a	100	93.609	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	90.385	ENSDARG00000098853	ehd1a	98	90.385	Danio_rerio
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	90.769	ENSDARG00000014793	ehd1b	98	90.769	Danio_rerio
ENSORLG00020018451	ehd1a	66	88.539	ENSDNOG00000017834	EHD1	93	88.539	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSDORG00000030186	Ehd1	97	87.308	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	69.187	FBgn0016693	Past1	99	69.187	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020018451	ehd1a	58	80.519	ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.519	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	76.426	ENSEBUG00000009968	EHD1	98	76.426	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.692	ENSEASG00005018250	EHD1	97	87.692	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.692	ENSECAG00000011638	EHD1	97	87.692	Equus_caballus
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	90.323	ENSELUG00000016093	ehd1b	99	90.323	Esox_lucius
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	90.133	ENSELUG00000007973	-	99	90.133	Esox_lucius
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.692	ENSFCAG00000027734	EHD1	95	87.692	Felis_catus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSFDAG00000007697	EHD1	97	87.308	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	94.329	ENSFHEG00000002690	ehd1a	99	94.329	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	93.156	ENSGMOG00000012192	ehd1a	100	93.156	Gadus_morhua
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	93.996	ENSGAFG00000000730	ehd1a	100	93.996	Gambusia_affinis
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	93.421	ENSGACG00000017605	ehd1a	100	93.421	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	86.154	ENSGAGG00000001677	-	90	86.154	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	94.717	ENSHBUG00000012087	ehd1a	99	94.717	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSHGLG00000010254	EHD1	97	87.308	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSHGLG00100014206	EHD1	97	87.308	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	92.105	ENSHCOG00000006825	ehd1a	100	92.105	Hippocampus_comes
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	91.429	ENSIPUG00000002819	ehd1a	98	91.429	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	85.962	ENSIPUG00000017390	EHD1	97	85.962	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSSTOG00000009829	EHD1	97	87.500	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	86.923	ENSJJAG00000022299	Ehd1	97	86.923	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	93.609	ENSKMAG00000004764	ehd1a	100	93.609	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	93.797	ENSLBEG00000004390	ehd1a	100	93.797	Labrus_bergylta
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	86.973	ENSLACG00000018148	EHD1	97	86.973	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	83.939	ENSLOCG00000000924	ehd1b	94	83.939	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	84.615	ENSLAFG00000011643	EHD1	97	84.615	Loxodonta_africana
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSMFAG00000032608	EHD1	97	87.500	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSMMUG00000003972	EHD1	95	87.500	Macaca_mulatta
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSMNEG00000031673	EHD1	97	87.500	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSMLEG00000031992	EHD1	97	87.500	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	93.785	ENSMAMG00000021737	ehd1a	99	93.785	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	94.906	ENSMZEG00005004305	ehd1a	99	94.906	Maylandia_zebra
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.115	ENSMAUG00000013823	Ehd1	97	87.115	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSMICG00000001239	EHD1	96	86.574	Microcebus_murinus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSMOCG00000015517	Ehd1	97	87.308	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	93.785	ENSMMOG00000003005	ehd1a	100	93.785	Mola_mola
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	94.727	ENSMALG00000012679	ehd1a	99	94.727	Monopterus_albus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.115	MGP_CAROLIEiJ_G0022603	Ehd1	97	87.115	Mus_caroli
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.115	ENSMUSG00000024772	Ehd1	97	87.115	Mus_musculus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	86.923	MGP_PahariEiJ_G0014097	Ehd1	97	86.923	Mus_pahari
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.115	MGP_SPRETEiJ_G0023514	Ehd1	97	87.115	Mus_spretus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSMPUG00000012497	EHD1	97	87.500	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSNGAG00000020358	Ehd1	97	87.308	Nannospalax_galili
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	94.528	ENSNBRG00000002933	ehd1a	99	94.528	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSNLEG00000005375	EHD1	97	87.500	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	86.731	ENSOPRG00000011350	EHD1	97	86.731	Ochotona_princeps
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSODEG00000014527	EHD1	97	87.500	Octodon_degus
ENSORLG00020018451	ehd1a	59	90.735	ENSOCUG00000029532	EHD1	92	90.735	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	99.812	ENSORLG00000022561	ehd1a	100	99.812	Oryzias_latipes
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	100.000	ENSORLG00015017672	ehd1a	100	100.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	97.556	ENSOMEG00000019329	ehd1a	100	97.556	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSOGAG00000009351	EHD1	97	87.308	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020018451	ehd1a	91	87.835	ENSOARG00000010447	EHD1	99	87.835	Ovis_aries
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSPPAG00000037178	EHD1	97	87.500	Pan_paniscus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	85.385	ENSPPRG00000006031	EHD1	95	85.385	Panthera_pardus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSPTRG00000003851	EHD1	95	87.500	Pan_troglodytes
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSPANG00000023358	EHD1	95	87.500	Papio_anubis
ENSORLG00020018451	ehd1a	66	94.269	ENSPKIG00000020297	-	85	94.269	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	88.213	ENSPKIG00000023165	-	99	88.213	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	86.346	ENSPSIG00000005727	EHD1	97	86.346	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	93.346	ENSPMGG00000017810	ehd1a	99	92.830	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSPEMG00000010917	Ehd1	97	87.308	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSPCIG00000014850	EHD1	97	87.500	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020018451	ehd1a	72	70.079	ENSPCIG00000017053	-	94	70.079	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	93.433	ENSPFOG00000010613	ehd1a	99	93.433	Poecilia_formosa
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	93.433	ENSPLAG00000023296	ehd1a	100	93.433	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	93.621	ENSPMEG00000003397	ehd1a	100	93.621	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	93.433	ENSPREG00000015893	ehd1a	100	93.433	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSPPYG00000003093	EHD1	97	87.500	Pongo_abelii
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSPCOG00000010309	EHD1	97	87.308	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	86.923	ENSPVAG00000007890	EHD1	97	86.923	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	94.717	ENSPNYG00000015448	ehd1a	99	94.717	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	88.952	ENSPNAG00000007408	EHD1	99	88.952	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	90.857	ENSPNAG00000023091	ehd1a	98	90.857	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.115	ENSRNOG00000043503	Ehd1	97	87.115	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSRBIG00000039111	EHD1	97	87.500	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.500	ENSRROG00000026366	EHD1	97	87.500	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSSBOG00000023399	EHD1	97	87.308	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020018451	ehd1a	74	68.922	ENSSHAG00000007430	-	96	66.747	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	91.363	ENSSFOG00015006481	-	98	91.363	Scleropages_formosus
ENSORLG00020018451	ehd1a	91	89.918	ENSSFOG00015019587	EHD1	99	89.918	Scleropages_formosus
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	93.045	ENSSMAG00000018210	ehd1a	100	93.045	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	94.549	ENSSDUG00000016436	ehd1a	100	94.549	Seriola_dumerili
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	94.549	ENSSLDG00000015328	ehd1a	100	94.549	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	94.140	ENSSPAG00000008682	ehd1a	99	94.140	Stegastes_partitus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSSSCG00000013017	EHD1	97	87.308	Sus_scrofa
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	93.797	ENSTRUG00000025890	ehd1a	99	93.797	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	93.384	ENSTNIG00000016792	ehd1a	98	93.384	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020018451	ehd1a	76	78.079	ENSTBEG00000007057	EHD1	98	78.079	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.115	ENSTTRG00000008887	EHD1	97	87.115	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSUAMG00000012071	EHD1	97	87.308	Ursus_americanus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	85.389	ENSUMAG00000007890	EHD1	98	86.207	Ursus_maritimus
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	87.308	ENSVVUG00000027552	EHD1	82	87.308	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020018451	ehd1a	98	86.346	ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.346	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020018451	ehd1a	99	93.045	ENSXCOG00000001781	ehd1a	99	93.045	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020018451	ehd1a	100	93.433	ENSXMAG00000005301	ehd1a	100	93.433	Xiphophorus_maculatus