EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020019361 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tyw1
Alias: -
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog (S. cerevisiae)
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 45486 bases
Position: chr13:2507585-2553070
Accession: ZDB-GENE-060929-688
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020033359	Wyosine_form	PF08608.12	1.4e-26	1	1
ENSORLP00020018385	Wyosine_form	PF08608.12	1.5e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020034708	-	2091	-	ENSORLP00020033359	696 (aa)	-	-
ENSORLT00020034718	-	2778	-	ENSORLP00020018385	736 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.556	ENSG00000198874	TYW1	98	66.713	Homo_sapiens
ENSORLG00020019361	tyw1	98	57.222	ENSG00000277149	TYW1B	98	59.104	Homo_sapiens
ENSORLG00020019361	tyw1	100	79.893	ENSAPOG00000014391	tyw1	100	79.494	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020019361	tyw1	96	78.732	ENSACIG00000007325	tyw1	99	78.762	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020019361	tyw1	100	77.968	ENSAOCG00000016792	tyw1	100	79.654	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020019361	tyw1	100	78.100	ENSAPEG00000015939	tyw1	100	79.787	Amphiprion_percula
ENSORLG00020019361	tyw1	90	77.566	ENSATEG00000006856	tyw1	94	77.566	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	64.167	ENSANAG00000037051	-	98	65.193	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020019361	tyw1	100	79.920	ENSACLG00000018688	tyw1	100	78.954	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019361	tyw1	99	71.111	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	74.100	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	66.158	ENSBTAG00000008446	TYW1	98	67.265	Bos_taurus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	64.444	ENSCJAG00000004295	-	98	65.746	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	67.614	ENSCAFG00000010867	-	98	67.549	Canis_familiaris
ENSORLG00020019361	tyw1	92	63.775	ENSCAFG00020005367	-	99	62.734	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020019361	tyw1	98	66.436	ENSCHIG00000019510	-	98	67.403	Capra_hircus
ENSORLG00020019361	tyw1	88	64.451	ENSTSYG00000008236	-	98	65.438	Carlito_syrichta
ENSORLG00020019361	tyw1	86	62.773	ENSCAPG00000013569	-	100	63.707	Cavia_aperea
ENSORLG00020019361	tyw1	98	62.932	ENSCPOG00000011182	-	98	64.071	Cavia_porcellus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	64.583	ENSCCAG00000026643	-	98	65.884	Cebus_capucinus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.000	ENSCATG00000043677	-	98	66.160	Cercocebus_atys
ENSORLG00020019361	tyw1	98	63.824	ENSCLAG00000006321	-	98	64.384	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020019361	tyw1	89	68.877	ENSCSAG00000018274	-	98	70.201	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020019361	tyw1	52	82.051	ENSCHOG00000003801	-	55	82.051	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020019361	tyw1	98	67.775	ENSCPBG00000014896	-	99	70.459	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020019361	tyw1	79	60.498	ENSCING00000004125	-	97	61.002	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020019361	tyw1	87	57.282	ENSCSAVG00000005712	-	100	57.581	Ciona_savignyi
ENSORLG00020019361	tyw1	98	64.861	ENSCANG00000033209	-	98	65.884	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020019361	tyw1	66	81.510	ENSCGRG00001003679	Tyw1	89	74.945	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020019361	tyw1	99	76.139	ENSCSEG00000005810	tyw1	98	75.603	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020019361	tyw1	90	77.645	ENSCVAG00000001054	tyw1	95	77.645	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020019361	tyw1	99	70.994	ENSDARG00000062987	tyw1	95	74.003	Danio_rerio
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.556	ENSDNOG00000024165	-	98	66.851	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020019361	tyw1	96	57.261	ENSDORG00000014772	Tyw1	97	57.762	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020019361	tyw1	60	72.222	ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.222	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.833	ENSEASG00005008818	-	98	67.265	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	64.826	ENSECAG00000023164	-	98	64.774	Equus_caballus
ENSORLG00020019361	tyw1	55	78.571	ENSEEUG00000005950	-	56	78.571	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020019361	tyw1	99	71.390	ENSELUG00000008449	tyw1	98	72.419	Esox_lucius
ENSORLG00020019361	tyw1	98	66.383	ENSFCAG00000014262	-	98	66.241	Felis_catus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	63.445	ENSFALG00000013810	-	99	65.331	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020019361	tyw1	98	63.194	ENSFDAG00000013270	-	98	64.641	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020019361	tyw1	82	78.664	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	78.303	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	64.917	ENSGALG00000001110	-	98	66.529	Gallus_gallus
ENSORLG00020019361	tyw1	97	77.534	ENSGACG00000012692	tyw1	99	77.717	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	67.197	ENSGAGG00000022393	-	98	67.630	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020019361	tyw1	88	56.878	ENSGGOG00000001473	TYW1	98	58.218	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020019361	tyw1	100	79.652	ENSHBUG00000002640	tyw1	100	78.686	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020019361	tyw1	87	70.248	ENSHGLG00000012093	-	100	69.318	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020019361	tyw1	98	63.839	ENSHGLG00100011743	TYW1	98	65.103	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020019361	tyw1	99	70.386	ENSHCOG00000019949	tyw1	97	69.658	Hippocampus_comes
ENSORLG00020019361	tyw1	99	72.096	ENSIPUG00000016330	tyw1	100	72.497	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020019361	tyw1	97	64.817	ENSSTOG00000004067	-	90	66.116	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	63.408	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	64.566	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020019361	tyw1	99	78.562	ENSKMAG00000018599	tyw1	100	77.733	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020019361	tyw1	99	62.433	ENSLACG00000018917	tyw1	97	65.047	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020019361	tyw1	98	69.499	ENSLOCG00000004035	tyw1	95	70.056	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.278	ENSMFAG00000035457	-	98	66.575	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.278	ENSMMUG00000030374	-	98	66.575	Macaca_mulatta
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.139	ENSMNEG00000041992	-	98	70.201	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.139	ENSMLEG00000039741	-	98	66.298	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	80.218	ENSMAMG00000016089	tyw1	99	78.267	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020019361	tyw1	91	83.433	ENSMZEG00005024386	tyw1	99	83.036	Maylandia_zebra
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.014	ENSMGAG00000002176	-	98	66.621	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020019361	tyw1	96	67.129	ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	67.129	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.139	ENSMICG00000014374	-	99	66.436	Microcebus_murinus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	64.286	ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.992	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020019361	tyw1	99	74.037	ENSMMOG00000005064	tyw1	99	74.359	Mola_mola
ENSORLG00020019361	tyw1	96	67.125	ENSMODG00000025697	-	98	67.263	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020019361	tyw1	100	78.162	ENSMALG00000010238	tyw1	100	77.733	Monopterus_albus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.278	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	98	66.990	Mus_caroli
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.272	ENSMUSG00000056310	Tyw1	98	67.129	Mus_musculus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.782	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	98	66.806	Mus_pahari
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.090	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	98	66.713	Mus_spretus
ENSORLG00020019361	tyw1	92	69.207	ENSMPUG00000016191	-	97	69.008	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020019361	tyw1	98	61.833	ENSMLUG00000013582	-	98	64.110	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.867	ENSNGAG00000002742	Tyw1	98	67.978	Nannospalax_galili
ENSORLG00020019361	tyw1	93	82.132	ENSNBRG00000016996	tyw1	99	81.532	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020019361	tyw1	98	64.673	ENSNLEG00000013210	-	97	65.331	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020019361	tyw1	85	61.611	ENSOPRG00000008734	-	75	67.391	Ochotona_princeps
ENSORLG00020019361	tyw1	98	59.249	ENSODEG00000014729	-	98	60.870	Octodon_degus
ENSORLG00020019361	tyw1	100	78.905	ENSONIG00000005872	tyw1	100	77.807	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	64.714	ENSOCUG00000003173	-	98	66.207	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020019361	tyw1	100	98.777	ENSORLG00000001393	tyw1	100	98.420	Oryzias_latipes
ENSORLG00020019361	tyw1	100	98.645	ENSORLG00015008095	tyw1	99	98.645	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020019361	tyw1	92	68.886	ENSOGAG00000016555	-	99	64.785	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020019361	tyw1	98	66.253	ENSOARG00000010673	-	98	66.804	Ovis_aries
ENSORLG00020019361	tyw1	98	66.429	ENSPPRG00000004945	-	98	66.294	Panthera_pardus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	66.429	ENSPTIG00000019545	-	98	66.294	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020019361	tyw1	98	60.138	ENSPTRG00000023076	TYW1B	97	61.464	Pan_troglodytes
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.278	ENSPANG00000019053	-	98	66.022	Papio_anubis
ENSORLG00020019361	tyw1	99	67.292	ENSPKIG00000006545	tyw1	99	67.651	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020019361	tyw1	93	74.894	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	74.894	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	64.681	ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	67.316	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020019361	tyw1	100	78.238	ENSPFOG00000015855	tyw1	100	78.104	Poecilia_formosa
ENSORLG00020019361	tyw1	100	78.029	ENSPLAG00000000838	tyw1	100	77.896	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020019361	tyw1	100	78.104	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	77.971	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020019361	tyw1	98	75.374	ENSPREG00000018773	tyw1	99	75.102	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.508	ENSPPYG00000017514	TYW1	98	66.575	Pongo_abelii
ENSORLG00020019361	tyw1	98	51.318	ENSPCOG00000015294	-	98	53.103	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020019361	tyw1	100	80.054	ENSPNYG00000022381	tyw1	100	79.088	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020019361	tyw1	96	74.238	ENSPNAG00000009001	tyw1	99	74.827	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020019361	tyw1	98	63.984	ENSRNOG00000024352	Tyw1	98	66.390	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.417	ENSRBIG00000039619	-	98	66.851	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.278	ENSRROG00000039780	-	98	66.713	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020019361	tyw1	91	41.358	YPL207W	-	75	41.049	Saccharomyces_cerevisiae
ENSORLG00020019361	tyw1	98	63.978	ENSSBOG00000025873	-	98	65.193	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020019361	tyw1	96	65.840	ENSSHAG00000010346	-	99	66.061	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020019361	tyw1	99	70.323	ENSSFOG00015001054	tyw1	99	71.659	Scleropages_formosus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	79.452	ENSSMAG00000020514	tyw1	100	78.284	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020019361	tyw1	100	79.735	ENSSDUG00000001552	tyw1	95	85.052	Seriola_dumerili
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ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.455	ENSSPUG00000002715	-	98	65.465	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	65.694	ENSSSCG00000007733	-	98	66.897	Sus_scrofa
ENSORLG00020019361	tyw1	89	64.869	ENSTGUG00000003428	-	98	67.176	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020019361	tyw1	99	77.016	ENSTRUG00000016107	tyw1	97	76.882	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020019361	tyw1	88	81.559	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	80.269	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020019361	tyw1	98	67.092	ENSUMAG00000015343	-	98	67.083	Ursus_maritimus
ENSORLG00020019361	tyw1	98	67.475	ENSVVUG00000016457	-	98	67.364	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020019361	tyw1	99	65.342	ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.120	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020019361	tyw1	100	76.273	ENSXMAG00000013125	tyw1	98	83.200	Xiphophorus_maculatus