EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020019504 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1092 bases
Position: chr10:10577377-10578468
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020033501	RVT_1	PF00078.27	1.6e-22	1	1

Transcripts

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ENSORLT00020027423	-	1092	-	ENSORLP00020033501	363 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSORLG00020019504	-	91	50.150	ENSORLG00020021677	-	67	50.150
ENSORLG00020019504	-	93	54.118	ENSORLG00020005478	-	98	54.118
ENSORLG00020019504	-	93	53.254	ENSORLG00020014641	-	72	53.254
ENSORLG00020019504	-	88	52.484	ENSORLG00020004992	-	63	52.484
ENSORLG00020019504	-	59	48.148	ENSORLG00020002465	-	53	48.148
ENSORLG00020019504	-	93	95.575	ENSORLG00020015429	-	60	95.575
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ENSORLG00020019504	-	87	98.408	ENSORLG00020011671	-	100	98.408
ENSORLG00020019504	-	92	41.543	ENSORLG00020003888	-	73	41.543
ENSORLG00020019504	-	93	52.924	ENSORLG00020006316	-	64	52.924
ENSORLG00020019504	-	93	97.640	ENSORLG00020019862	-	72	97.640
ENSORLG00020019504	-	93	54.142	ENSORLG00020022028	-	63	54.142
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ENSORLG00020019504	-	93	52.941	ENSORLG00020017390	-	64	52.941
ENSORLG00020019504	-	86	52.215	ENSORLG00020018053	-	62	52.215
ENSORLG00020019504	-	90	48.485	ENSORLG00020003398	-	98	48.485
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ENSORLG00020019504	-	93	52.924	ENSORLG00020014098	-	64	52.924
ENSORLG00020019504	-	93	52.632	ENSORLG00020008115	-	71	52.632
ENSORLG00020019504	-	93	96.755	ENSORLG00020012080	-	72	96.755
ENSORLG00020019504	-	93	52.632	ENSORLG00020008589	-	64	52.632
ENSORLG00020019504	-	93	54.438	ENSORLG00020022349	-	63	54.438
ENSORLG00020019504	-	88	52.322	ENSORLG00020009707	-	63	52.322
ENSORLG00020019504	-	61	45.249	ENSORLG00020016267	-	81	45.249
ENSORLG00020019504	-	92	42.433	ENSORLG00020017794	-	86	42.433
ENSORLG00020019504	-	74	53.309	ENSORLG00020021900	-	59	53.309
ENSORLG00020019504	-	93	43.860	ENSORLG00020012070	-	56	43.988
ENSORLG00020019504	-	93	53.254	ENSORLG00020011898	-	60	53.254
ENSORLG00020019504	-	87	53.628	ENSORLG00020016069	-	98	53.628
ENSORLG00020019504	-	93	97.345	ENSORLG00020019142	-	72	97.345
ENSORLG00020019504	-	93	53.846	ENSORLG00020000622	-	50	53.846
ENSORLG00020019504	-	92	47.493	ENSORLG00020008083	-	71	47.493

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020019504	-	93	46.608	ENSAOCG00000004576	-	92	46.608	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020019504	-	93	46.313	ENSAPEG00000024502	-	92	46.313	Amphiprion_percula
ENSORLG00020019504	-	93	50.442	ENSATEG00000015931	-	67	50.442	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019504	-	88	40.439	ENSATEG00000014055	-	55	40.439	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019504	-	93	51.032	ENSATEG00000014607	-	65	51.032	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019504	-	93	50.442	ENSATEG00000002739	-	55	50.442	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019504	-	91	50.450	ENSATEG00000004857	-	72	50.450	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019504	-	93	50.737	ENSATEG00000015490	-	55	50.737	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019504	-	92	41.493	ENSATEG00000004798	-	59	41.493	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019504	-	92	41.791	ENSATEG00000019241	-	95	41.791	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020019504	-	93	60.355	ENSACLG00000025562	-	77	60.355	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	49.706	ENSACLG00000024568	-	80	49.706	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	56.677	ENSACLG00000000230	-	71	56.677	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	86	49.524	ENSACLG00000023425	-	89	48.529	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	89	56.308	ENSACLG00000002171	-	99	56.308	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	44.248	ENSACLG00000025957	-	64	44.248	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020019504	-	93	43.824	ENSACLG00000005593	-	89	43.824	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	91	30.029	ENSACLG00000021775	-	85	30.029	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	69	45.817	ENSACLG00000015652	-	96	45.817	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	92	61.377	ENSACLG00000026769	-	76	61.377	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	60.651	ENSACLG00000000437	-	91	60.651	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	60.651	ENSACLG00000000182	-	60	60.651	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	44.543	ENSACLG00000026963	-	89	44.543	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	49.412	ENSACLG00000020926	-	89	49.412	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	61	59.459	ENSACLG00000005259	-	69	59.459	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	57	57.005	ENSACLG00000020388	-	59	57.746	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	73	43.985	ENSACLG00000002591	-	87	43.985	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	60.651	ENSACLG00000016639	-	74	60.651	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	91	48.036	ENSACLG00000005570	-	52	48.036	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	91	44.745	ENSACLG00000003937	-	84	44.745	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	47.647	ENSACLG00000005921	-	65	47.647	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	61.243	ENSACLG00000001405	-	50	61.243	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	87	45.426	ENSACLG00000027774	-	100	45.426	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	44.838	ENSACLG00000012076	-	90	44.838	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	48.529	ENSACLG00000010082	-	61	48.529	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	60.059	ENSACLG00000010080	-	77	60.059	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	60.651	ENSACLG00000017363	-	77	60.651	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	92	30.882	ENSACLG00000006688	-	71	30.882	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	60.059	ENSACLG00000001758	-	50	60.059	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	79	46.528	ENSACLG00000005126	-	88	46.528	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	48.961	ENSACLG00000013483	-	99	48.961	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020019504	-	72	46.008	ENSACLG00000013213	-	75	46.008	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	76	50.725	ENSACLG00000022277	-	67	50.725	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019504	-	93	60.355	ENSACLG00000000536	-	50	60.355	Astatotilapia_calliptera
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