EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020019661 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2292 bases
Position: chr17:8193621-8195912
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020018704	RVT_1	PF00078.27	1.5e-47	1	1

Transcripts

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ENSORLT00020034854	-	2292	-	ENSORLP00020018704	532 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSORLG00020019661	-	65	35.376	ENSORLG00020015544	-	99	35.376
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ENSORLG00020019661	-	96	30.189	ENSORLG00020003828	-	68	30.189
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ENSORLG00020019661	-	67	35.695	ENSORLG00020020066	-	86	35.695
ENSORLG00020019661	-	57	33.550	ENSORLG00020018011	-	83	33.550
ENSORLG00020019661	-	85	31.681	ENSORLG00020008083	-	98	31.681
ENSORLG00020019661	-	91	30.539	ENSORLG00020014098	-	96	30.134
ENSORLG00020019661	-	62	34.412	ENSORLG00020001799	-	72	34.412
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ENSORLG00020019661	-	88	30.353	ENSORLG00020005060	-	53	30.353
ENSORLG00020019661	-	54	39.116	ENSORLG00020022231	-	73	39.116
ENSORLG00020019661	-	59	30.960	ENSORLG00020003046	-	72	30.960
ENSORLG00020019661	-	95	30.326	ENSORLG00020000803	-	68	30.326
ENSORLG00020019661	-	88	31.056	ENSORLG00020004992	-	96	31.048
ENSORLG00020019661	-	88	30.785	ENSORLG00020009707	-	97	30.357
ENSORLG00020019661	-	54	37.457	ENSORLG00020022160	-	86	37.457
ENSORLG00020019661	-	91	30.938	ENSORLG00020006316	-	96	30.518
ENSORLG00020019661	-	63	33.431	ENSORLG00020021536	-	93	33.431
ENSORLG00020019661	-	87	30.271	ENSORLG00020006573	-	99	30.271
ENSORLG00020019661	-	91	30.539	ENSORLG00020012063	-	66	30.539
ENSORLG00020019661	-	79	33.179	ENSORLG00020003779	-	63	33.179
ENSORLG00020019661	-	79	32.644	ENSORLG00020003775	-	62	32.644
ENSORLG00020019661	-	73	34.336	ENSORLG00020006111	-	61	34.250
ENSORLG00020019661	-	71	34.860	ENSORLG00020021237	-	61	34.860
ENSORLG00020019661	-	50	38.889	ENSORLG00020016174	-	95	37.586
ENSORLG00020019661	-	92	30.162	ENSORLG00020009374	-	50	30.162
ENSORLG00020019661	-	50	38.519	ENSORLG00020008245	-	90	37.241

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020019661	-	85	56.541	ENSAPEG00000014494	-	99	56.541	Amphiprion_percula
ENSORLG00020019661	-	69	54.372	ENSACLG00000027508	-	80	54.372	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	86	33.983	ENSACLG00000006988	-	68	33.983	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	83	64.560	ENSACLG00000026433	-	99	64.560	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	98	59.923	ENSACLG00000017241	-	86	59.923	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	51	55.556	ENSACLG00000005509	-	60	55.556	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	98	54.423	ENSACLG00000013374	-	60	54.423	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	98	62.042	ENSACLG00000004427	-	64	62.042	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	85	62.222	ENSACLG00000010366	-	99	62.222	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	92	58.691	ENSACLG00000027577	-	79	58.691	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	97	57.915	ENSACLG00000020849	-	79	57.915	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	98	59.730	ENSACLG00000017200	-	50	59.730	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	75	61.596	ENSACLG00000001773	-	53	61.596	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	98	63.969	ENSACLG00000019498	-	73	63.969	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	97	57.722	ENSACLG00000008988	-	56	57.722	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	75	62.843	ENSACLG00000009848	-	91	62.843	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	97	57.722	ENSACLG00000003707	-	62	57.722	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	83	59.729	ENSACLG00000027127	-	59	59.729	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	72	37.240	ENSACLG00000021422	-	97	37.240	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	86	33.983	ENSACLG00000016231	-	79	33.983	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	74	63.452	ENSACLG00000021942	-	57	63.452	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	63	39.403	ENSACLG00000004613	-	81	39.403	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	96	64.844	ENSACLG00000018002	-	60	64.844	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	73	32.821	ENSACLG00000025576	-	52	32.821	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	98	64.162	ENSACLG00000007650	-	50	64.162	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	98	58.767	ENSACLG00000000579	-	79	58.767	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	83	53.986	ENSACLG00000019219	-	97	53.986	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	56	58.725	ENSACLG00000001254	-	99	58.725	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	53	64.311	ENSACLG00000000505	-	80	64.311	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	82	63.825	ENSACLG00000008558	-	92	63.825	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	95	54.941	ENSACLG00000008551	-	92	54.941	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	59	67.308	ENSACLG00000016290	-	100	67.308	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	72	57.743	ENSACLG00000010907	-	97	57.743	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019661	-	91	62.863	ENSACLG00000023590	-	97	62.863	Astatotilapia_calliptera
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