EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020019706 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: yaf2
Alias: -
Full Name: YY1 associated factor 2
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19522 bases
Position: chr23:11223272-11242793
Accession: ZDB-GENE-041210-115
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020033623	zf-RanBP	PF00641.18	2e-08	1	1
ENSORLP00020018742	zf-RanBP	PF00641.18	9.1e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020034872	-	4512	-	ENSORLP00020018742	186 (aa)	-	-
ENSORLT00020027647	-	228	-	ENSORLP00020033623	75 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020019706	yaf2	100	76.882	ENSORLG00020017893	YAF2	99	75.806
ENSORLG00020019706	yaf2	75	73.214	ENSORLG00020003724	rybpb	56	73.611

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020019706	yaf2	95	42.661	ENSG00000163602	RYBP	99	50.691	Homo_sapiens
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.032	ENSG00000015153	YAF2	100	88.571	Homo_sapiens
ENSORLG00020019706	yaf2	100	93.011	ENSAPOG00000012651	yaf2	100	93.011	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	78.495	ENSAPOG00000016986	YAF2	100	77.957	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020019706	yaf2	75	73.214	ENSAPOG00000014342	rybpb	57	72.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020019706	yaf2	91	78.824	ENSAMEG00000013846	YAF2	100	78.235	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020019706	yaf2	64	75.000	ENSAMEG00000015131	RYBP	69	49.772	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020019706	yaf2	100	80.645	ENSACIG00000002635	YAF2	100	79.570	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020019706	yaf2	69	96.154	ENSACIG00000015979	-	80	96.154	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020019706	yaf2	75	73.214	ENSACIG00000021280	rybpb	95	49.048	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020019706	yaf2	75	73.214	ENSAOCG00000001679	rybpb	57	72.000	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.570	ENSAOCG00000024572	YAF2	100	79.032	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020019706	yaf2	100	93.011	ENSAOCG00000015759	yaf2	100	93.011	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020019706	yaf2	100	93.011	ENSAPEG00000017939	yaf2	100	93.011	Amphiprion_percula
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.032	ENSAPEG00000005856	YAF2	100	78.495	Amphiprion_percula
ENSORLG00020019706	yaf2	75	73.214	ENSAPEG00000021704	rybpb	57	72.000	Amphiprion_percula
ENSORLG00020019706	yaf2	100	91.935	ENSATEG00000012513	yaf2	100	91.935	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	74.194	ENSATEG00000018504	YAF2	100	76.882	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019706	yaf2	75	73.214	ENSATEG00000008482	rybpb	57	72.000	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019706	yaf2	96	45.000	ENSAPLG00000013882	RYBP	97	50.000	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.570	ENSACAG00000003204	YAF2	100	79.570	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSACAG00000014789	RYBP	99	51.327	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSANAG00000027832	RYBP	99	52.212	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020019706	yaf2	100	71.569	ENSANAG00000021963	YAF2	100	71.569	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020019706	yaf2	100	94.624	ENSACLG00000001098	yaf2	100	94.624	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019706	yaf2	100	76.882	ENSACLG00000000456	YAF2	100	75.806	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019706	yaf2	75	73.214	ENSACLG00000023062	rybpb	57	72.000	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020019706	yaf2	100	77.957	ENSAMXG00000035723	YAF2	100	77.957	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020019706	yaf2	73	79.630	ENSAMXG00000034604	rybpb	95	46.330	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.032	ENSAMXG00000036088	YAF2	100	80.108	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.032	ENSBTAG00000015025	YAF2	100	79.032	Bos_taurus
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSBTAG00000022689	RYBP	99	52.212	Bos_taurus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.032	ENSCJAG00000017762	YAF2	100	79.032	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSCJAG00000045849	RYBP	99	52.212	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020019706	yaf2	96	69.307	ENSCAFG00000009789	YAF2	100	69.307	Canis_familiaris
ENSORLG00020019706	yaf2	64	75.000	ENSCAFG00000006441	RYBP	90	50.917	Canis_familiaris
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSCAFG00020016734	RYBP	99	52.212	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020019706	yaf2	100	78.495	ENSCHIG00000025941	YAF2	100	78.495	Capra_hircus
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSCHIG00000026041	RYBP	99	52.212	Capra_hircus
ENSORLG00020019706	yaf2	95	75.706	ENSCPOG00000015156	YAF2	100	77.966	Cavia_porcellus
ENSORLG00020019706	yaf2	61	73.913	ENSCPOG00000032177	RYBP	95	50.463	Cavia_porcellus
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSCCAG00000025583	RYBP	99	52.212	Cebus_capucinus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.032	ENSCCAG00000018849	YAF2	100	79.032	Cebus_capucinus
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSCATG00000034872	RYBP	99	52.212	Cercocebus_atys
ENSORLG00020019706	yaf2	100	78.495	ENSCATG00000034263	YAF2	100	78.495	Cercocebus_atys
ENSORLG00020019706	yaf2	95	42.661	ENSCLAG00000006008	RYBP	99	50.691	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSCSAG00000011518	RYBP	99	52.212	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020019706	yaf2	90	78.443	ENSCHOG00000002266	YAF2	100	77.844	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020019706	yaf2	64	75.000	ENSCHOG00000011528	RYBP	78	64.762	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020019706	yaf2	96	45.205	ENSCPBG00000006439	RYBP	88	50.228	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.570	ENSCPBG00000015509	YAF2	95	86.538	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020019706	yaf2	76	54.386	ENSCING00000019824	-	86	43.382	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020019706	yaf2	100	78.495	ENSCANG00000042756	YAF2	100	78.495	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020019706	yaf2	73	65.517	ENSCANG00000013251	RYBP	99	49.561	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	76.882	ENSCGRG00001021765	Yaf2	100	76.344	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSCGRG00001020152	Rybp	99	51.327	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020019706	yaf2	64	75.000	ENSCGRG00000009553	Rybp	90	50.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020019706	yaf2	100	90.909	ENSCSEG00000010509	yaf2	100	90.909	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020019706	yaf2	84	70.667	ENSCSEG00000007805	rybpb	95	46.364	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020019706	yaf2	100	77.957	ENSCSEG00000004331	YAF2	100	77.419	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020019706	yaf2	100	91.398	ENSCVAG00000001056	yaf2	100	91.398	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020019706	yaf2	93	65.934	ENSCVAG00000020045	rybpb	95	50.732	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	75.401	ENSCVAG00000002793	YAF2	100	74.866	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.032	ENSDARG00000015966	yaf2	100	80.108	Danio_rerio
ENSORLG00020019706	yaf2	75	75.000	ENSDARG00000053459	rybpb	96	43.600	Danio_rerio
ENSORLG00020019706	yaf2	94	78.736	ENSDORG00000024619	Yaf2	100	78.736	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020019706	yaf2	95	48.058	ENSDORG00000015021	Rybp	96	53.140	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020019706	yaf2	69	65.385	FBgn0034763	RYBP	86	48.507	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020019706	yaf2	91	54.706	ENSETEG00000001634	-	99	54.118	Echinops_telfairi
ENSORLG00020019706	yaf2	64	72.917	ENSETEG00000015145	RYBP	99	49.541	Echinops_telfairi
ENSORLG00020019706	yaf2	77	70.690	ENSEBUG00000004738	RYBP	68	60.938	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020019706	yaf2	69	73.585	ENSEBUG00000010088	RYBP	54	62.857	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.570	ENSEASG00005023490	YAF2	100	79.570	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSEASG00005002228	RYBP	99	52.212	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSECAG00000000266	RYBP	99	52.212	Equus_caballus
ENSORLG00020019706	yaf2	89	77.576	ENSEEUG00000004713	YAF2	100	77.576	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020019706	yaf2	96	42.991	ENSEEUG00000011620	-	100	47.664	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	73.936	ENSELUG00000020855	yaf2	100	72.193	Esox_lucius
ENSORLG00020019706	yaf2	100	78.075	ENSELUG00000009802	YAF2	100	78.610	Esox_lucius
ENSORLG00020019706	yaf2	90	67.442	ENSELUG00000003503	rybpb	95	57.627	Esox_lucius
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSFCAG00000043691	RYBP	99	52.212	Felis_catus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.032	ENSFCAG00000030082	YAF2	100	79.032	Felis_catus
ENSORLG00020019706	yaf2	94	44.907	ENSFALG00000013425	RYBP	84	51.142	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020019706	yaf2	97	43.694	ENSFDAG00000012183	RYBP	99	50.691	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020019706	yaf2	100	90.323	ENSFHEG00000007387	yaf2	100	90.323	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020019706	yaf2	94	59.140	ENSFHEG00000017560	rybpb	56	73.611	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	75.936	ENSFHEG00000005397	YAF2	100	75.401	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	78.495	ENSGALG00000009540	YAF2	100	78.495	Gallus_gallus
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSGALG00000033025	RYBP	99	51.770	Gallus_gallus
ENSORLG00020019706	yaf2	99	88.649	ENSGAFG00000017418	yaf2	99	88.649	Gambusia_affinis
ENSORLG00020019706	yaf2	93	68.132	ENSGAFG00000015676	rybpb	57	72.000	Gambusia_affinis
ENSORLG00020019706	yaf2	100	74.731	ENSGAFG00000001176	YAF2	100	74.731	Gambusia_affinis
ENSORLG00020019706	yaf2	96	45.000	ENSGAGG00000004755	RYBP	91	50.228	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.570	ENSGAGG00000000538	YAF2	100	78.495	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020019706	yaf2	63	72.340	ENSGAGG00000004763	-	83	56.164	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020019706	yaf2	95	78.531	ENSGGOG00000007230	-	99	78.531	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020019706	yaf2	100	94.624	ENSHBUG00000006345	yaf2	100	94.624	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020019706	yaf2	100	76.882	ENSHBUG00000001690	YAF2	100	75.806	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020019706	yaf2	75	73.214	ENSHBUG00000010844	rybpb	57	72.000	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020019706	yaf2	75	76.786	ENSHGLG00000003273	RYBP	99	52.212	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020019706	yaf2	98	41.256	ENSHGLG00000009354	-	99	40.724	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.032	ENSHGLG00000001299	YAF2	100	79.032	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020019706	yaf2	94	77.714	ENSHGLG00100016138	YAF2	98	78.488	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020019706	yaf2	98	41.256	ENSHGLG00100001264	-	99	40.724	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020019706	yaf2	96	44.749	ENSHGLG00100010608	-	95	50.691	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020019706	yaf2	100	90.909	ENSHCOG00000009074	yaf2	100	90.909	Hippocampus_comes
ENSORLG00020019706	yaf2	93	64.894	ENSHCOG00000010777	rybpb	56	72.222	Hippocampus_comes
ENSORLG00020019706	yaf2	100	67.914	ENSHCOG00000006027	YAF2	92	70.588	Hippocampus_comes
ENSORLG00020019706	yaf2	99	52.717	ENSIPUG00000007091	rybpa	74	78.431	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020019706	yaf2	75	71.429	ENSIPUG00000001221	rybpb	94	44.601	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	79.032	ENSSTOG00000007224	YAF2	100	79.032	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSORLG00020019706	yaf2	63	74.468	ENSJJAG00000017045	Rybp	99	50.691	Jaculus_jaculus
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ENSORLG00020019706	yaf2	100	80.108	ENSSHAG00000007145	YAF2	100	79.032	Sarcophilus_harrisii
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ENSORLG00020019706	yaf2	75	73.214	ENSSLDG00000013888	rybpb	57	72.000	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSORLG00020019706	yaf2	89	75.152	ENSTRUG00000016786	YAF2	100	71.515	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020019706	yaf2	92	63.333	ENSTRUG00000009347	rybpb	58	60.577	Takifugu_rubripes
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ENSORLG00020019706	yaf2	100	86.559	ENSTNIG00000018505	yaf2	100	88.172	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020019706	yaf2	75	75.000	ENSTNIG00000007355	rybpb	71	58.559	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020019706	yaf2	64	75.000	ENSTBEG00000003789	RYBP	99	50.917	Tupaia_belangeri
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ENSORLG00020019706	yaf2	95	77.841	ENSTTRG00000001376	YAF2	99	77.273	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020019706	yaf2	99	77.540	ENSUAMG00000016872	YAF2	99	77.540	Ursus_americanus
ENSORLG00020019706	yaf2	92	43.662	ENSUAMG00000008323	RYBP	99	50.000	Ursus_americanus
ENSORLG00020019706	yaf2	96	44.749	ENSUMAG00000024028	RYBP	76	49.772	Ursus_maritimus
ENSORLG00020019706	yaf2	95	79.096	ENSVPAG00000012039	YAF2	100	78.531	Vicugna_pacos
ENSORLG00020019706	yaf2	56	71.429	ENSVPAG00000007715	RYBP	76	62.626	Vicugna_pacos
ENSORLG00020019706	yaf2	95	44.495	ENSVVUG00000013920	RYBP	92	50.459	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020019706	yaf2	100	78.495	ENSXETG00000006795	yaf2	100	77.957	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020019706	yaf2	75	75.000	ENSXCOG00000009651	rybpb	96	50.000	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020019706	yaf2	68	98.039	ENSXCOG00000014893	-	78	98.039	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	67.742	ENSXCOG00000020837	YAF2	100	68.817	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020019706	yaf2	99	89.189	ENSXMAG00000009358	yaf2	99	89.189	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020019706	yaf2	93	68.132	ENSXMAG00000027089	rybpb	57	72.000	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020019706	yaf2	100	74.866	ENSXMAG00000025433	YAF2	100	74.866	Xiphophorus_maculatus