EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020019768 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2153 bases
Position: chr1:15862006-15864158
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020033669	RVT_1	PF00078.27	3.2e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020034934	-	2153	-	ENSORLP00020033669	515 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020019768	-	88	45.714	ENSORLG00020004729	-	66	45.714
ENSORLG00020019768	-	100	99.029	ENSORLG00020018578	-	52	99.029
ENSORLG00020019768	-	64	51.807	ENSORLG00020002010	-	78	51.807
ENSORLG00020019768	-	75	47.165	ENSORLG00020022231	-	95	47.165
ENSORLG00020019768	-	100	99.806	ENSORLG00020008688	-	52	99.806
ENSORLG00020019768	-	99	94.314	ENSORLG00020015125	-	72	94.685
ENSORLG00020019768	-	83	98.592	ENSORLG00020017918	-	100	98.592
ENSORLG00020019768	-	100	99.612	ENSORLG00020003775	-	75	99.612
ENSORLG00020019768	-	100	99.612	ENSORLG00020003779	-	76	99.612
ENSORLG00020019768	-	74	48.564	ENSORLG00020012070	-	61	48.564
ENSORLG00020019768	-	51	57.034	ENSORLG00020021677	-	53	57.034
ENSORLG00020019768	-	86	47.640	ENSORLG00020004554	-	57	47.640
ENSORLG00020019768	-	50	35.115	ENSORLG00020013935	-	52	35.115
ENSORLG00020019768	-	76	35.459	ENSORLG00020015429	-	59	35.190
ENSORLG00020019768	-	100	99.806	ENSORLG00020008289	-	78	99.806
ENSORLG00020019768	-	100	98.447	ENSORLG00020005777	-	95	98.447
ENSORLG00020019768	-	100	100.000	ENSORLG00020012664	-	99	100.000
ENSORLG00020019768	-	65	47.463	ENSORLG00020020026	-	58	47.463
ENSORLG00020019768	-	50	37.984	ENSORLG00020011014	-	52	37.984
ENSORLG00020019768	-	58	99.666	ENSORLG00020009707	-	58	99.666
ENSORLG00020019768	-	100	96.311	ENSORLG00020007092	-	63	96.311
ENSORLG00020019768	-	100	100.000	ENSORLG00020001010	-	77	100.000
ENSORLG00020019768	-	65	48.657	ENSORLG00020011254	-	72	48.657
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ENSORLG00020019768	-	100	99.806	ENSORLG00020009908	-	76	99.806
ENSORLG00020019768	-	58	98.662	ENSORLG00020003812	-	76	98.662
ENSORLG00020019768	-	99	39.612	ENSORLG00020002198	-	51	39.612
ENSORLG00020019768	-	56	52.414	ENSORLG00020022028	-	54	52.414
ENSORLG00020019768	-	58	96.990	ENSORLG00020002465	-	73	96.990
ENSORLG00020019768	-	51	59.848	ENSORLG00020020284	-	53	59.848
ENSORLG00020019768	-	58	99.666	ENSORLG00020017390	-	56	99.666
ENSORLG00020019768	-	94	44.215	ENSORLG00020006907	-	87	44.215
ENSORLG00020019768	-	99	40.388	ENSORLG00020008961	-	51	39.072
ENSORLG00020019768	-	85	33.034	ENSORLG00020002955	-	56	32.088
ENSORLG00020019768	-	57	97.627	ENSORLG00020017728	-	61	97.627
ENSORLG00020019768	-	56	52.414	ENSORLG00020022349	-	54	52.414
ENSORLG00020019768	-	58	99.666	ENSORLG00020006316	-	56	99.666
ENSORLG00020019768	-	66	49.560	ENSORLG00020011898	-	59	49.560
ENSORLG00020019768	-	100	99.223	ENSORLG00020019476	-	96	99.223
ENSORLG00020019768	-	100	100.000	ENSORLG00020005060	-	58	100.000
ENSORLG00020019768	-	86	46.742	ENSORLG00020016049	-	54	46.742
ENSORLG00020019768	-	100	98.641	ENSORLG00020000803	-	68	98.641
ENSORLG00020019768	-	58	100.000	ENSORLG00020004992	-	58	100.000
ENSORLG00020019768	-	58	100.000	ENSORLG00020016174	-	98	100.000
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ENSORLG00020019768	-	88	32.104	ENSORLG00020016931	-	63	32.035
ENSORLG00020019768	-	100	99.806	ENSORLG00020016342	-	68	99.806
ENSORLG00020019768	-	94	44.033	ENSORLG00020004099	-	62	44.033
ENSORLG00020019768	-	100	100.000	ENSORLG00020021860	-	68	100.000
ENSORLG00020019768	-	100	99.417	ENSORLG00020012251	-	68	99.417
ENSORLG00020019768	-	99	39.806	ENSORLG00020007799	-	65	39.806
ENSORLG00020019768	-	100	97.476	ENSORLG00020014062	-	68	97.476
ENSORLG00020019768	-	100	100.000	ENSORLG00020008999	-	68	100.000
ENSORLG00020019768	-	58	100.000	ENSORLG00020021900	-	65	100.000
ENSORLG00020019768	-	58	99.666	ENSORLG00020009885	-	69	99.666
ENSORLG00020019768	-	78	45.813	ENSORLG00020021212	-	98	45.813
ENSORLG00020019768	-	58	98.997	ENSORLG00020013014	-	67	98.997
ENSORLG00020019768	-	86	46.771	ENSORLG00020001972	-	52	46.771
ENSORLG00020019768	-	88	43.202	ENSORLG00020014097	-	50	43.202
ENSORLG00020019768	-	82	49.528	ENSORLG00020021613	-	63	49.057
ENSORLG00020019768	-	58	99.666	ENSORLG00020014098	-	56	99.666
ENSORLG00020019768	-	100	99.806	ENSORLG00020019417	-	56	99.806
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ENSORLG00020019768	-	88	43.640	ENSORLG00020019488	-	65	43.640
ENSORLG00020019768	-	89	45.514	ENSORLG00020003828	-	58	45.514
ENSORLG00020019768	-	58	99.666	ENSORLG00020009639	-	65	99.666
ENSORLG00020019768	-	57	35.855	ENSORLG00020011701	-	62	37.358
ENSORLG00020019768	-	58	99.331	ENSORLG00020011734	-	58	99.331
ENSORLG00020019768	-	99	40.039	ENSORLG00020010964	-	51	40.039
ENSORLG00020019768	-	100	99.806	ENSORLG00020011031	-	74	99.806
ENSORLG00020019768	-	99	40.388	ENSORLG00020015822	-	51	40.388
ENSORLG00020019768	-	58	99.331	ENSORLG00020020066	-	71	99.331
ENSORLG00020019768	-	82	30.365	ENSORLG00020022681	-	50	30.046
ENSORLG00020019768	-	58	99.331	ENSORLG00020018183	-	69	99.331
ENSORLG00020019768	-	58	100.000	ENSORLG00020008589	-	56	100.000
ENSORLG00020019768	-	58	100.000	ENSORLG00020015063	-	58	100.000
ENSORLG00020019768	-	99	39.845	ENSORLG00020012549	-	54	38.491
ENSORLG00020019768	-	99	40.232	ENSORLG00020007840	-	71	40.619
ENSORLG00020019768	-	58	99.666	ENSORLG00020008245	-	93	99.666
ENSORLG00020019768	-	58	98.662	ENSORLG00020001344	-	73	98.662
ENSORLG00020019768	-	100	100.000	ENSORLG00020021237	-	80	100.000
ENSORLG00020019768	-	58	98.328	ENSORLG00020021067	-	75	98.328
ENSORLG00020019768	-	88	43.202	ENSORLG00020018691	-	65	43.202
ENSORLG00020019768	-	69	52.260	ENSORLG00020007940	-	88	51.412
ENSORLG00020019768	-	88	42.795	ENSORLG00020007946	-	63	42.795
ENSORLG00020019768	-	79	47.101	ENSORLG00020003864	-	76	47.368
ENSORLG00020019768	-	85	45.682	ENSORLG00020000622	-	65	45.682
ENSORLG00020019768	-	64	49.550	ENSORLG00020018011	-	87	49.550
ENSORLG00020019768	-	100	99.806	ENSORLG00020006111	-	80	99.806
ENSORLG00020019768	-	88	43.202	ENSORLG00020006422	-	60	43.202
ENSORLG00020019768	-	100	97.476	ENSORLG00020002120	-	79	97.476
ENSORLG00020019768	-	58	100.000	ENSORLG00020002173	-	65	100.000
ENSORLG00020019768	-	54	50.000	ENSORLG00020005292	-	76	51.321
ENSORLG00020019768	-	58	100.000	ENSORLG00020018053	-	59	100.000
ENSORLG00020019768	-	57	35.526	ENSORLG00020001304	-	66	36.981
ENSORLG00020019768	-	58	100.000	ENSORLG00020004056	-	67	100.000
ENSORLG00020019768	-	99	40.388	ENSORLG00020019255	-	51	40.388
ENSORLG00020019768	-	76	44.275	ENSORLG00020001799	-	81	44.275
ENSORLG00020019768	-	51	59.848	ENSORLG00020006220	-	51	59.848
ENSORLG00020019768	-	100	99.029	ENSORLG00020004158	-	50	99.029
ENSORLG00020019768	-	84	44.064	ENSORLG00020014334	-	65	42.466
ENSORLG00020019768	-	94	44.444	ENSORLG00020018405	-	62	44.444
ENSORLG00020019768	-	99	39.612	ENSORLG00020016659	-	62	39.612
ENSORLG00020019768	-	50	37.209	ENSORLG00020016658	-	77	37.209
ENSORLG00020019768	-	52	55.720	ENSORLG00020004647	-	64	55.805
ENSORLG00020019768	-	58	100.000	ENSORLG00020010414	-	62	100.000
ENSORLG00020019768	-	100	100.000	ENSORLG00020012063	-	68	100.000
ENSORLG00020019768	-	56	52.448	ENSORLG00020015750	-	58	54.135
ENSORLG00020019768	-	89	45.295	ENSORLG00020005659	-	61	45.295

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020019768	-	91	48.000	ENSAOCG00000011105	-	59	48.000	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020019768	-	64	66.767	ENSAPEG00000007939	-	79	66.767	Amphiprion_percula
ENSORLG00020019768	-	91	63.034	ENSAPEG00000006041	-	66	63.034	Amphiprion_percula
ENSORLG00020019768	-	62	49.844	ENSAPEG00000024080	-	97	50.000	Amphiprion_percula
ENSORLG00020019768	-	56	54.545	ENSAPEG00000014087	-	56	54.545	Amphiprion_percula
ENSORLG00020019768	-	98	55.159	ENSATEG00000010400	-	62	55.159	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	87	59.193	ENSATEG00000013493	-	53	59.193	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	63	68.807	ENSATEG00000004853	-	100	68.807	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	98	54.365	ENSATEG00000009980	-	78	54.365	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	64	60.606	ENSATEG00000022498	-	58	60.606	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	98	54.960	ENSATEG00000019513	-	62	54.960	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	64	61.212	ENSATEG00000023306	-	58	61.212	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	98	53.373	ENSATEG00000007199	-	62	53.373	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	74	60.000	ENSATEG00000019303	-	60	60.000	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	56	75.433	ENSATEG00000022917	-	54	75.433	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	64	69.091	ENSATEG00000021051	-	94	69.091	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	99	55.469	ENSATEG00000007276	-	94	54.883	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	62	68.454	ENSATEG00000015488	-	100	68.454	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	80	60.096	ENSATEG00000014522	-	89	60.096	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	98	55.556	ENSATEG00000016515	-	78	55.556	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	95	54.713	ENSATEG00000007647	-	88	54.713	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	64	69.091	ENSATEG00000016827	-	58	69.091	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	98	55.556	ENSATEG00000015818	-	62	55.556	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	64	60.909	ENSATEG00000002707	-	81	60.909	Anabas_testudineus
ENSORLG00020019768	-	56	47.751	ENSACAG00000028621	-	55	47.751	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020019768	-	57	48.797	ENSACAG00000028543	-	54	48.797	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020019768	-	56	48.097	ENSACAG00000028434	-	95	48.097	Anolis_carolinensis
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