EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020020268 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4579 bases
Position: chr8:10477880-10482458
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020033997	RVT_1	PF00078.27	6.5e-29	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020035097	-	4579	-	ENSORLP00020033997	1471 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020020268's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020020268's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020020268	-	51	38.817	ENSORLG00020009070	-	52	38.817
ENSORLG00020020268	-	50	40.779	ENSORLG00020003988	-	52	40.779
ENSORLG00020020268	-	100	54.759	ENSORLG00020001422	-	98	54.759
ENSORLG00020020268	-	50	40.779	ENSORLG00020020735	-	52	40.779
ENSORLG00020020268	-	50	40.519	ENSORLG00020011789	-	65	40.519
ENSORLG00020020268	-	51	38.872	ENSORLG00020000592	-	88	38.872
ENSORLG00020020268	-	51	38.817	ENSORLG00020001553	-	52	38.817
ENSORLG00020020268	-	53	35.043	ENSORLG00020007237	-	54	35.043
ENSORLG00020020268	-	55	36.501	ENSORLG00020014981	-	60	36.501
ENSORLG00020020268	-	99	63.764	ENSORLG00020008293	-	94	64.944
ENSORLG00020020268	-	51	39.394	ENSORLG00020013042	-	78	39.394
ENSORLG00020020268	-	53	40.874	ENSORLG00020005141	-	57	40.874
ENSORLG00020020268	-	50	40.157	ENSORLG00020000745	-	52	39.332
ENSORLG00020020268	-	50	40.519	ENSORLG00020011308	-	66	39.899
ENSORLG00020020268	-	57	44.573	ENSORLG00020021286	-	55	44.573
ENSORLG00020020268	-	50	40.519	ENSORLG00020005114	-	70	40.519
ENSORLG00020020268	-	51	39.846	ENSORLG00020008167	-	52	39.846
ENSORLG00020020268	-	50	40.420	ENSORLG00020013601	-	52	39.589
ENSORLG00020020268	-	54	41.886	ENSORLG00020000868	-	66	41.886
ENSORLG00020020268	-	51	39.899	ENSORLG00020004934	-	69	39.899
ENSORLG00020020268	-	51	40.874	ENSORLG00020003377	-	65	40.874
ENSORLG00020020268	-	100	99.932	ENSORLG00020003869	-	98	99.932
ENSORLG00020020268	-	55	37.172	ENSORLG00020009176	-	58	37.172
ENSORLG00020020268	-	54	41.447	ENSORLG00020016398	-	64	41.447
ENSORLG00020020268	-	51	30.488	ENSORLG00020014275	-	68	30.488
ENSORLG00020020268	-	51	40.260	ENSORLG00020005485	-	64	40.260
ENSORLG00020020268	-	52	39.642	ENSORLG00020021845	-	79	39.642
ENSORLG00020020268	-	60	35.272	ENSORLG00020022538	-	63	35.084
ENSORLG00020020268	-	55	41.485	ENSORLG00020007648	-	69	41.485
ENSORLG00020020268	-	56	34.047	ENSORLG00020013085	-	56	34.047
ENSORLG00020020268	-	51	39.846	ENSORLG00020003499	-	52	39.846
ENSORLG00020020268	-	57	40.343	ENSORLG00020016001	-	66	40.343
ENSORLG00020020268	-	51	39.846	ENSORLG00020000947	-	52	39.846
ENSORLG00020020268	-	51	35.930	ENSORLG00020004971	-	81	35.930
ENSORLG00020020268	-	50	40.779	ENSORLG00020021168	-	52	40.779
ENSORLG00020020268	-	51	39.846	ENSORLG00020011809	-	52	39.846
ENSORLG00020020268	-	100	99.932	ENSORLG00020014203	-	98	99.932

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020020268	-	50	44.617	ENSAPOG00000013817	-	99	44.617	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020268	-	75	68.502	ENSAPOG00000012135	-	97	68.626	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020268	-	63	54.780	ENSAPOG00000008045	-	97	54.780	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020268	-	53	43.643	ENSAPOG00000013711	-	97	43.643	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020268	-	89	34.520	ENSACLG00000000499	-	86	34.520	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	57	40.668	ENSACLG00000018181	-	90	40.668	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	55	35.119	ENSACLG00000015735	-	98	35.350	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	67	64.886	ENSACLG00000001563	-	100	64.886	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	85	39.084	ENSACLG00000018060	-	85	39.084	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	99	45.235	ENSACLG00000024091	-	93	46.629	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	89	34.662	ENSACLG00000017808	-	86	34.662	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	50	51.827	ENSACLG00000008862	-	100	51.827	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	60	42.105	ENSACLG00000000367	-	95	41.889	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	96	47.832	ENSACLG00000026879	-	96	47.832	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	88	41.374	ENSACLG00000014619	-	89	41.374	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	88	41.374	ENSACLG00000019876	-	88	41.374	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	74	38.214	ENSACLG00000010042	-	87	38.214	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	89	34.662	ENSACLG00000014870	-	86	34.662	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	99	45.302	ENSACLG00000009628	-	95	46.154	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	98	45.113	ENSACLG00000017161	-	88	47.731	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	88	34.613	ENSACLG00000002180	-	88	34.535	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	53	57.069	ENSACLG00000007343	-	95	57.069	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	89	33.027	ENSACLG00000013572	-	87	32.918	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	89	34.473	ENSACLG00000027291	-	89	33.978	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	71	43.352	ENSACLG00000027730	-	92	43.352	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	99	45.369	ENSACLG00000025719	-	93	46.770	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020268	-	89	34.579	ENSAMXG00000040892	-	86	34.673	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020268	-	90	41.168	ENSAMXG00000030987	-	89	41.392	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020268	-	84	31.595	ENSAMXG00000030902	-	90	31.665	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020268	-	87	34.195	ENSAMXG00000038578	-	99	34.195	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020268	-	56	30.638	ENSAMXG00000041112	-	77	30.054	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020268	-	82	41.432	ENSAMXG00000038169	-	93	41.432	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020268	-	89	33.955	ENSAMXG00000031698	-	85	34.173	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020268	-	55	43.410	ENSCPBG00000011626	-	98	43.410	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020020268	-	52	38.433	ENSCVAG00000009912	-	98	38.433	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020020268	-	60	38.769	ENSELUG00000000948	-	80	37.917	Esox_lucius
ENSORLG00020020268	-	76	57.830	ENSFHEG00000000971	-	99	57.480	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020020268	-	50	56.498	ENSGAFG00000009062	-	97	56.498	Gambusia_affinis
ENSORLG00020020268	-	60	46.213	ENSGAGG00000014450	-	81	46.213	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020020268	-	69	41.313	ENSGAGG00000025282	-	88	41.313	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020020268	-	54	44.926	ENSGAGG00000012039	-	97	44.926	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020020268	-	54	44.926	ENSGAGG00000020521	-	97	44.926	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020020268	-	83	43.886	ENSGAGG00000022240	-	81	42.968	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020020268	-	56	50.726	ENSIPUG00000000601	-	91	50.726	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020020268	-	52	38.405	ENSKMAG00000018163	-	81	42.813	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020020268	-	70	35.956	ENSMAMG00000018393	-	99	35.956	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020020268	-	57	41.427	ENSMZEG00005000633	-	80	41.427	Maylandia_zebra
ENSORLG00020020268	-	89	50.262	ENSORLG00000028795	-	88	50.262	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	99	45.828	ENSORLG00000026665	-	93	47.005	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	99	63.831	ENSORLG00000030265	-	94	65.014	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	83	49.561	ENSORLG00000022369	-	88	49.561	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	90	34.276	ENSORLG00000029874	-	87	34.276	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	89	33.961	ENSORLG00000026873	-	86	34.153	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	61	38.544	ENSORLG00000026676	-	97	38.559	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	50	58.243	ENSORLG00000025478	-	95	58.243	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	99	63.831	ENSORLG00000025739	-	98	63.490	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	89	33.888	ENSORLG00000026629	-	86	34.081	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	67	38.641	ENSORLG00000028632	-	95	38.738	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	89	33.888	ENSORLG00000023181	-	86	34.081	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	90	34.298	ENSORLG00000029675	-	87	34.298	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	99	63.563	ENSORLG00000027568	-	94	64.735	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	89	47.210	ENSORLG00000027831	-	90	47.210	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	99	45.626	ENSORLG00000024233	-	93	46.685	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	100	97.825	ENSORLG00000024904	-	98	97.825	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	89	50.374	ENSORLG00000030542	-	88	50.374	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	89	50.524	ENSORLG00000028609	-	88	50.524	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	99	63.527	ENSORLG00000024220	-	98	63.186	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	99	45.491	ENSORLG00000026546	-	93	46.474	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020268	-	89	50.491	ENSORLG00015017778	-	88	50.603	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020020268	-	89	50.337	ENSORLG00015018878	-	88	50.449	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020020268	-	98	47.700	ENSOMEG00000003712	-	95	48.542	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020020268	-	89	33.475	ENSOMEG00000009987	-	89	33.475	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020020268	-	90	41.112	ENSPSIG00000000489	-	97	39.918	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020020268	-	54	52.993	ENSPSIG00000001658	-	92	52.993	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020020268	-	51	51.326	ENSPSIG00000013781	-	99	51.326	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020020268	-	86	41.284	ENSPSIG00000000767	-	93	41.284	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020020268	-	72	45.767	ENSPSIG00000000353	-	90	45.767	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020020268	-	88	41.374	ENSPSIG00000000994	-	93	41.356	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020020268	-	52	57.752	ENSPMEG00000019585	-	98	57.752	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020020268	-	80	48.318	ENSPMEG00000016355	-	99	48.318	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020020268	-	89	33.806	ENSPREG00000000390	-	88	33.806	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020020268	-	90	31.754	ENSPREG00000004954	-	91	31.870	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020020268	-	82	48.743	ENSSDUG00000002460	-	98	48.743	Seriola_dumerili
ENSORLG00020020268	-	54	43.879	ENSSLDG00000004385	-	85	44.121	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020020268	-	90	33.763	ENSXMAG00000023503	-	89	33.763	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020020268	-	89	34.585	ENSXMAG00000021213	-	89	34.585	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020020268	-	88	33.955	ENSXMAG00000021298	-	88	33.682	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020020268	-	90	33.763	ENSXMAG00000023079	-	89	33.881	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020020268	-	88	33.812	ENSXMAG00000023319	-	88	33.682	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020020268	-	99	65.515	ENSXMAG00000026031	-	97	65.176	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020020268	-	95	64.656	ENSXMAG00000030100	-	99	64.230	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020020268	-	89	34.989	ENSXMAG00000026594	-	89	34.989	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020020268	-	62	39.833	ENSXMAG00000030089	-	89	39.833	Xiphophorus_maculatus