EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020020339 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3239 bases
Position: chr13:1854182-1857420
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020019355	RVT_1	PF00078.27	5.1e-43	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020028434	-	3239	-	ENSORLP00020019355	997 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020020339	-	100	97.492	ENSORLG00020004913	-	100	97.492
ENSORLG00020020339	-	76	96.702	ENSORLG00020020442	-	100	96.702
ENSORLG00020020339	-	100	98.395	ENSORLG00020009902	-	100	98.395
ENSORLG00020020339	-	91	32.508	ENSORLG00020009614	-	95	32.613
ENSORLG00020020339	-	100	99.097	ENSORLG00020018358	-	100	99.097
ENSORLG00020020339	-	78	97.826	ENSORLG00020005006	-	100	97.826
ENSORLG00020020339	-	100	98.295	ENSORLG00020014382	-	100	98.295
ENSORLG00020020339	-	100	98.395	ENSORLG00020020415	-	100	98.395
ENSORLG00020020339	-	100	98.094	ENSORLG00020014816	-	100	98.094
ENSORLG00020020339	-	100	98.696	ENSORLG00020010522	-	100	98.696
ENSORLG00020020339	-	100	98.596	ENSORLG00020003054	-	100	98.596
ENSORLG00020020339	-	100	97.793	ENSORLG00020017598	-	100	97.793
ENSORLG00020020339	-	100	99.097	ENSORLG00020005358	-	99	99.097
ENSORLG00020020339	-	72	31.258	ENSORLG00020005057	-	100	30.955
ENSORLG00020020339	-	100	98.295	ENSORLG00020011016	-	100	98.295
ENSORLG00020020339	-	88	32.369	ENSORLG00020020316	-	95	32.216
ENSORLG00020020339	-	100	98.295	ENSORLG00020012851	-	100	98.295
ENSORLG00020020339	-	100	98.997	ENSORLG00020002402	-	99	98.997
ENSORLG00020020339	-	53	34.458	ENSORLG00020011847	-	97	33.453
ENSORLG00020020339	-	100	98.495	ENSORLG00020010084	-	100	98.495
ENSORLG00020020339	-	70	32.787	ENSORLG00020001879	-	80	33.801
ENSORLG00020020339	-	78	97.826	ENSORLG00020015867	-	100	97.826
ENSORLG00020020339	-	90	33.369	ENSORLG00020007707	-	86	32.583
ENSORLG00020020339	-	78	97.059	ENSORLG00020004369	-	100	97.059
ENSORLG00020020339	-	100	98.596	ENSORLG00020007996	-	100	98.596
ENSORLG00020020339	-	100	97.793	ENSORLG00020017275	-	100	97.793
ENSORLG00020020339	-	93	98.272	ENSORLG00020010495	-	100	98.272
ENSORLG00020020339	-	100	98.696	ENSORLG00020015225	-	100	98.696
ENSORLG00020020339	-	85	98.357	ENSORLG00020002609	-	100	98.357
ENSORLG00020020339	-	83	32.766	ENSORLG00020002875	-	97	32.880
ENSORLG00020020339	-	100	98.796	ENSORLG00020022082	-	99	98.796
ENSORLG00020020339	-	100	98.094	ENSORLG00020001429	-	100	98.094
ENSORLG00020020339	-	100	98.495	ENSORLG00020003643	-	100	98.495
ENSORLG00020020339	-	100	98.596	ENSORLG00020009527	-	100	98.596
ENSORLG00020020339	-	69	97.097	ENSORLG00020002162	-	99	97.097
ENSORLG00020020339	-	100	98.395	ENSORLG00020000686	-	100	98.395
ENSORLG00020020339	-	50	36.276	ENSORLG00020018851	-	88	35.590
ENSORLG00020020339	-	91	33.403	ENSORLG00020009508	-	86	32.729

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020020339	-	87	95.597	ENSATEG00000017712	-	100	95.597	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020339	-	100	94.985	ENSATEG00000022633	-	100	94.985	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020339	-	95	96.076	ENSATEG00000009051	-	99	96.076	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020339	-	99	95.468	ENSATEG00000009591	-	100	95.468	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020339	-	85	94.805	ENSATEG00000007887	-	99	94.805	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020339	-	100	95.888	ENSATEG00000005213	-	100	95.888	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020339	-	100	94.784	ENSATEG00000020668	-	99	94.784	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020339	-	70	94.236	ENSATEG00000004689	-	100	94.236	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020339	-	99	76.660	ENSCSEG00000014508	-	98	76.559	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020020339	-	99	76.500	ENSCSEG00000010768	-	98	76.400	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020020339	-	95	77.884	ENSCSEG00000004965	-	93	77.884	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020020339	-	93	78.186	ENSCSEG00000015459	-	100	78.186	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020020339	-	68	34.904	ENSLOCG00000001168	-	92	34.125	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020020339	-	100	98.395	ENSORLG00000026400	-	100	98.395	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.495	ENSORLG00000022897	-	100	98.495	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	67	97.317	ENSORLG00000029231	-	100	97.317	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	90	98.670	ENSORLG00000029790	-	99	98.670	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.195	ENSORLG00000025896	-	100	98.195	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.596	ENSORLG00000023104	-	100	98.596	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.696	ENSORLG00000025030	-	100	98.696	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.495	ENSORLG00000023217	-	100	98.495	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.596	ENSORLG00000024793	-	100	98.596	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.495	ENSORLG00000025512	-	100	98.495	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.796	ENSORLG00000027942	-	100	98.796	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	95	98.630	ENSORLG00000027945	-	100	98.630	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	97.896	ENSORLG00000027434	-	100	97.896	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.696	ENSORLG00000027439	-	100	98.696	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	70	98.714	ENSORLG00000025112	-	100	98.714	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.096	ENSORLG00000024556	-	100	98.096	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	99.097	ENSORLG00000023676	-	100	99.097	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.395	ENSORLG00000024298	-	100	98.395	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.897	ENSORLG00000026509	-	100	98.897	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.596	ENSORLG00000026507	-	100	98.596	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	97.091	ENSORLG00000028546	-	100	97.091	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	93	97.747	ENSORLG00000021932	-	96	97.747	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.395	ENSORLG00000026477	-	100	98.395	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.596	ENSORLG00000023992	-	100	98.596	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	93	98.164	ENSORLG00000022049	-	100	98.164	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.997	ENSORLG00000029193	-	100	98.997	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	93	98.272	ENSORLG00000022924	-	100	98.272	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.596	ENSORLG00000023380	-	100	98.596	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.596	ENSORLG00000024101	-	100	98.596	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.696	ENSORLG00000024801	-	100	98.696	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.897	ENSORLG00000021825	-	100	98.897	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.696	ENSORLG00000028304	-	100	98.696	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.796	ENSORLG00000028694	-	100	98.796	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.395	ENSORLG00000026499	-	100	98.395	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.395	ENSORLG00000022645	-	100	98.395	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.796	ENSORLG00000030097	-	100	98.796	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.796	ENSORLG00000028713	-	100	98.796	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.696	ENSORLG00000028712	-	100	98.696	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.497	ENSORLG00000029332	-	100	98.497	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.395	ENSORLG00000026650	-	100	98.395	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.796	ENSORLG00000027354	-	100	98.796	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	97.994	ENSORLG00000030118	-	100	97.994	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.395	ENSORLG00000024048	-	100	98.395	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020020339	-	91	99.006	ENSORLG00000026815	-	95	99.006	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.897	ENSORLG00000027738	-	100	98.897	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020020339	-	100	99.198	ENSORLG00000029331	-	100	99.198	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	88	97.494	ENSORLG00000023760	-	100	97.494	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.495	ENSORLG00000028249	-	100	98.495	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020020339	-	93	98.488	ENSORLG00000022934	-	100	98.488	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.395	ENSORLG00000025298	-	100	98.395	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.495	ENSORLG00000027111	-	100	98.495	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.796	ENSORLG00000029692	-	100	98.796	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	93	98.920	ENSORLG00000021832	-	100	98.920	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.997	ENSORLG00000025556	-	100	98.997	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.295	ENSORLG00000030347	-	100	98.295	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.596	ENSORLG00000030142	-	100	98.596	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.897	ENSORLG00000024473	-	100	98.897	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	96	97.901	ENSORLG00000030541	-	99	97.901	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	97.994	ENSORLG00000030535	-	100	97.994	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.696	ENSORLG00000024342	-	100	98.696	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	93	99.028	ENSORLG00000024645	-	100	99.028	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	98	98.458	ENSORLG00000024646	-	99	98.458	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.295	ENSORLG00000027598	-	100	98.295	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020020339	-	100	98.395	ENSORLG00000024537	-	100	98.395	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	93	98.704	ENSORLG00000026392	-	100	98.704	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.796	ENSORLG00000022044	-	100	98.796	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	100	98.195	ENSORLG00000024897	-	100	98.195	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020020339	-	100	98.997	ENSORLG00000023871	-	100	98.997	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020339	-	85	98.700	ENSORLG00000030467	-	95	98.700	Oryzias_latipes
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