EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020020500 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: snrpg
Alias: -
Full Name: small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1730 bases
Position: chr7:4817435-4819164
Accession: ZDB-GENE-040912-105
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020019493	LSM	PF01423.22	2.9e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020028614	-	225	-	ENSORLP00020019493	74 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020020500	snrpg	80	38.235	ENSORLG00020022226	lsm7	66	38.235

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSG00000143977	SNRPG	100	88.158	Homo_sapiens
ENSORLG00020020500	snrpg	77	98.246	ENSAPOG00000013277	snrpg	74	98.246	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	96.053	ENSAPOG00000009068	snrpg	100	96.053	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSAMEG00000016000	SNRPG	100	88.158	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020020500	snrpg	88	75.758	ENSACIG00000006560	snrpg	92	75.758	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	96.053	ENSAOCG00000006447	snrpg	100	96.053	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020020500	snrpg	100	96.053	ENSAPEG00000017249	snrpg	100	96.053	Amphiprion_percula
ENSORLG00020020500	snrpg	100	96.053	ENSATEG00000023229	snrpg	100	96.053	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020500	snrpg	76	77.193	ENSAPLG00000003951	-	70	77.193	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020020500	snrpg	100	80.263	ENSACAG00000007878	SNRPG	100	80.263	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020020500	snrpg	86	79.688	ENSANAG00000017661	-	74	79.688	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020500	snrpg	100	85.526	ENSANAG00000019882	-	100	85.526	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020500	snrpg	100	85.526	ENSANAG00000005705	-	100	85.526	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020500	snrpg	100	69.737	ENSANAG00000020869	-	98	69.737	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020500	snrpg	85	82.812	ENSANAG00000019847	-	100	82.812	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020500	snrpg	88	84.848	ENSANAG00000036971	-	92	84.848	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSANAG00000028737	SNRPG	100	88.158	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020500	snrpg	100	85.526	ENSANAG00000006710	-	100	85.526	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020500	snrpg	100	85.526	ENSANAG00000019432	-	100	85.526	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020500	snrpg	85	82.812	ENSANAG00000019989	-	100	82.812	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020500	snrpg	96	79.452	ENSANAG00000023461	-	99	79.452	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020500	snrpg	100	96.053	ENSACLG00000006323	snrpg	100	96.053	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020500	snrpg	100	94.737	ENSAMXG00000030568	snrpg	100	94.737	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020500	snrpg	85	81.250	ENSBTAG00000050695	-	100	81.250	Bos_taurus
ENSORLG00020020500	snrpg	85	82.812	ENSBTAG00000014104	-	100	82.812	Bos_taurus
ENSORLG00020020500	snrpg	96	83.562	ENSBTAG00000049132	-	99	83.562	Bos_taurus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	86.842	ENSBTAG00000038368	-	100	86.842	Bos_taurus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSBTAG00000034506	-	100	88.158	Bos_taurus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	78.947	ENSBTAG00000053210	SNRPG	100	78.947	Bos_taurus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	86.842	ENSCJAG00000022419	-	100	86.842	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSCJAG00000040628	-	100	88.158	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSCJAG00000019313	SNRPG	100	88.158	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020020500	snrpg	85	82.812	ENSCJAG00000046709	-	100	82.812	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	84.211	ENSCJAG00000042327	-	100	84.211	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	87.013	ENSCJAG00000019624	-	100	87.013	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	82.895	ENSCJAG00000045138	-	100	82.895	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSCAFG00000032595	SNRPG	100	88.158	Canis_familiaris
ENSORLG00020020500	snrpg	72	77.358	ENSCAFG00020023429	-	93	70.769	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020020500	snrpg	88	81.818	ENSCAFG00020007381	-	81	81.818	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSCAFG00020001862	-	100	88.158	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020020500	snrpg	100	61.842	ENSCHIG00000014762	-	80	61.842	Capra_hircus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	82.895	ENSCHIG00000009012	-	100	82.895	Capra_hircus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	84.211	ENSCHIG00000002486	-	100	84.211	Capra_hircus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	59.211	ENSCHIG00000022682	-	100	59.211	Capra_hircus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	85.526	ENSCHIG00000012507	-	100	85.526	Capra_hircus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSTSYG00000034550	SNRPG	100	88.158	Carlito_syrichta
ENSORLG00020020500	snrpg	97	71.622	ENSTSYG00000005729	-	100	71.622	Carlito_syrichta
ENSORLG00020020500	snrpg	85	79.365	ENSTSYG00000026369	-	100	79.365	Carlito_syrichta
ENSORLG00020020500	snrpg	77	87.719	ENSCAPG00000002047	-	100	87.719	Cavia_aperea
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSCPOG00000036891	-	100	88.158	Cavia_porcellus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSCCAG00000030474	SNRPG	100	88.158	Cebus_capucinus
ENSORLG00020020500	snrpg	97	67.568	ENSCATG00000000492	-	100	67.568	Cercocebus_atys
ENSORLG00020020500	snrpg	81	86.885	ENSCATG00000030279	-	90	86.885	Cercocebus_atys
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSCATG00000020914	SNRPG	100	88.158	Cercocebus_atys
ENSORLG00020020500	snrpg	78	82.759	ENSCATG00000016774	-	88	82.759	Cercocebus_atys
ENSORLG00020020500	snrpg	97	66.667	ENSCATG00000044172	-	100	66.667	Cercocebus_atys
ENSORLG00020020500	snrpg	96	86.301	ENSCATG00000031023	-	99	86.301	Cercocebus_atys
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSCLAG00000012216	-	100	88.158	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSCSAG00000015147	-	100	88.158	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	86.842	ENSCSAG00000000372	-	100	86.842	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSCHOG00000000130	-	100	88.158	Choloepus_hoffmanni
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ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSCANG00000008822	SNRPG	100	88.158	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	69.737	ENSCANG00000032309	-	100	69.737	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	72.368	ENSCANG00000027827	-	100	72.368	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSORLG00020020500	snrpg	89	80.597	ENSCGRG00001013591	-	97	80.597	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSCGRG00001011831	-	100	88.158	Cricetulus_griseus_chok1gshd
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ENSORLG00020020500	snrpg	100	76.316	ENSCGRG00001000446	-	100	76.316	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020020500	snrpg	89	80.597	ENSCGRG00000011028	-	97	80.597	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020020500	snrpg	100	76.316	ENSCGRG00000008511	-	100	76.316	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020020500	snrpg	100	75.000	ENSCGRG00000000133	-	100	75.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSCGRG00000002261	Snrpg	100	88.158	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020020500	snrpg	100	75.294	ENSCSEG00000003401	snrpg	100	75.294	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020020500	snrpg	100	96.053	ENSCVAG00000012770	snrpg	100	96.053	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	90.789	ENSDARG00000099667	snrpg	100	90.789	Danio_rerio
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSDNOG00000019446	-	100	88.158	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020020500	snrpg	95	54.930	ENSDNOG00000045718	-	95	61.972	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020020500	snrpg	85	79.688	ENSDORG00000030093	-	100	79.688	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSDORG00000023335	-	100	88.158	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020020500	snrpg	89	85.075	ENSDORG00000005623	-	99	85.075	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020020500	snrpg	100	68.421	FBgn0261791	SNRPG	100	68.421	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020020500	snrpg	99	88.000	ENSETEG00000010028	-	100	88.000	Echinops_telfairi
ENSORLG00020020500	snrpg	85	67.188	ENSEASG00005011820	-	100	67.188	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020020500	snrpg	82	71.212	ENSEASG00005007399	SNRPG	56	71.212	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020020500	snrpg	88	78.788	ENSEASG00005008384	-	94	78.788	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020020500	snrpg	85	67.188	ENSECAG00000038646	-	100	67.188	Equus_caballus
ENSORLG00020020500	snrpg	82	71.212	ENSECAG00000019989	SNRPG	56	71.212	Equus_caballus
ENSORLG00020020500	snrpg	88	78.788	ENSECAG00000001370	-	94	78.788	Equus_caballus
ENSORLG00020020500	snrpg	97	86.486	ENSEEUG00000006991	-	100	86.486	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020020500	snrpg	86	86.154	ENSEEUG00000001932	-	100	86.154	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	92.105	ENSELUG00000013944	snrpg	100	92.105	Esox_lucius
ENSORLG00020020500	snrpg	96	72.603	ENSFCAG00000035486	-	98	72.603	Felis_catus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	85.526	ENSFCAG00000024033	-	100	85.526	Felis_catus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSFCAG00000045921	-	100	88.158	Felis_catus
ENSORLG00020020500	snrpg	82	58.065	ENSFCAG00000008118	-	87	58.065	Felis_catus
ENSORLG00020020500	snrpg	89	71.642	ENSFCAG00000028363	-	100	71.642	Felis_catus
ENSORLG00020020500	snrpg	93	85.714	ENSFALG00000008384	SNRPG	100	85.714	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020020500	snrpg	100	69.333	ENSFDAG00000009371	-	100	69.333	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020020500	snrpg	100	80.263	ENSFDAG00000005075	-	83	80.263	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSFDAG00000012567	-	100	88.158	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020020500	snrpg	100	94.737	ENSFHEG00000012063	snrpg	100	94.737	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020020500	snrpg	54	92.857	ENSGMOG00000006239	snrpg	100	92.857	Gadus_morhua
ENSORLG00020020500	snrpg	100	90.789	ENSGALG00000028409	SNRPG	100	90.789	Gallus_gallus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	97.368	ENSGAFG00000000100	snrpg	100	97.368	Gambusia_affinis
ENSORLG00020020500	snrpg	55	90.698	ENSGACG00000013201	snrpg	100	90.698	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	90.789	ENSGAGG00000007536	SNRPG	100	90.789	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020020500	snrpg	97	65.753	ENSGGOG00000036975	-	100	65.753	Gorilla_gorilla
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ENSORLG00020020500	snrpg	81	77.049	ENSGGOG00000022169	-	95	77.049	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSGGOG00000039645	SNRPG	100	88.158	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020020500	snrpg	86	78.462	ENSGGOG00000040381	-	97	78.462	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020020500	snrpg	100	96.053	ENSHBUG00000006405	snrpg	100	96.053	Haplochromis_burtoni
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ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSNGAG00000020309	-	100	88.158	Nannospalax_galili
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ENSORLG00020020500	snrpg	97	83.784	ENSPPYG00000009646	-	100	83.784	Pongo_abelii
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ENSORLG00020020500	snrpg	97	85.135	ENSPCOG00000003538	-	100	85.135	Propithecus_coquereli
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ENSORLG00020020500	snrpg	96	86.301	ENSPCOG00000024442	-	99	86.301	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020020500	snrpg	100	65.789	ENSPCOG00000021128	-	100	65.789	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSPVAG00000004855	-	100	88.158	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	96.053	ENSPNYG00000008962	snrpg	100	96.053	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020020500	snrpg	100	93.421	ENSPNAG00000022455	snrpg	100	93.421	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSRNOG00000032232	Snrpg	100	88.158	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020020500	snrpg	99	76.000	ENSRNOG00000058521	AABR07042226.1	99	76.000	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSRNOG00000016507	LOC687679	100	88.158	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020020500	snrpg	85	84.375	ENSRBIG00000036899	-	100	84.375	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020020500	snrpg	88	86.364	ENSRBIG00000030046	-	92	86.364	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSRBIG00000039564	-	100	88.158	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020020500	snrpg	96	86.301	ENSRBIG00000026802	-	99	86.301	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020020500	snrpg	96	86.301	ENSRROG00000032968	-	99	86.301	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020020500	snrpg	96	86.301	ENSRROG00000037134	-	99	86.301	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSRROG00000045586	-	100	88.158	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020020500	snrpg	100	72.368	ENSRROG00000034265	-	100	72.368	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020020500	snrpg	81	80.328	ENSRROG00000029552	-	92	80.328	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020020500	snrpg	88	84.848	ENSRROG00000045277	-	92	84.848	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020020500	snrpg	100	86.842	ENSSBOG00000004446	-	78	86.842	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020020500	snrpg	100	78.947	ENSSBOG00000020739	-	100	78.947	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020020500	snrpg	88	77.273	ENSSBOG00000022826	-	73	77.273	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020020500	snrpg	100	80.263	ENSSBOG00000022793	-	100	80.263	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020020500	snrpg	96	79.167	ENSSBOG00000026763	-	99	79.167	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020020500	snrpg	100	73.333	ENSSBOG00000028922	-	100	73.333	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSSBOG00000023307	SNRPG	100	88.158	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020020500	snrpg	100	90.789	ENSSHAG00000012395	SNRPG	100	90.789	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020020500	snrpg	100	96.053	ENSSFOG00015019030	snrpg	100	96.053	Scleropages_formosus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	92.105	ENSSMAG00000001167	snrpg	100	92.105	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	96.053	ENSSDUG00000014103	snrpg	100	96.053	Seriola_dumerili
ENSORLG00020020500	snrpg	100	96.053	ENSSLDG00000015482	snrpg	100	96.053	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020020500	snrpg	100	89.474	ENSSPUG00000008514	SNRPG	100	89.474	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020020500	snrpg	69	84.314	ENSSPAG00000008300	snrpg	85	84.314	Stegastes_partitus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSSSCG00000024776	-	100	88.158	Sus_scrofa
ENSORLG00020020500	snrpg	100	81.333	ENSTGUG00000004149	SNRPG	100	81.333	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020020500	snrpg	100	77.500	ENSTRUG00000004040	snrpg	100	77.500	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020020500	snrpg	100	90.789	ENSTNIG00000003506	snrpg	100	90.789	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020020500	snrpg	100	82.895	ENSTBEG00000017381	-	100	82.895	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020020500	snrpg	97	70.667	ENSTBEG00000000061	-	100	70.667	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020020500	snrpg	86	87.692	ENSTTRG00000001197	-	100	87.692	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020020500	snrpg	97	64.865	ENSUAMG00000020319	-	100	64.865	Ursus_americanus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSUAMG00000025835	-	100	88.158	Ursus_americanus
ENSORLG00020020500	snrpg	82	71.429	ENSUAMG00000008324	-	60	71.429	Ursus_americanus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSUMAG00000021476	-	100	88.158	Ursus_maritimus
ENSORLG00020020500	snrpg	97	66.216	ENSUMAG00000016465	-	100	66.216	Ursus_maritimus
ENSORLG00020020500	snrpg	78	65.000	ENSUMAG00000003604	-	59	65.000	Ursus_maritimus
ENSORLG00020020500	snrpg	80	68.852	ENSUMAG00000005603	-	65	68.852	Ursus_maritimus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSVPAG00000007452	-	100	88.158	Vicugna_pacos
ENSORLG00020020500	snrpg	55	82.927	ENSVPAG00000007454	-	100	82.927	Vicugna_pacos
ENSORLG00020020500	snrpg	88	87.879	ENSVVUG00000000890	-	92	87.879	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020020500	snrpg	68	78.000	ENSVVUG00000005535	-	90	70.968	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSVVUG00000002858	-	100	88.158	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020020500	snrpg	82	83.871	ENSVVUG00000000415	-	100	83.871	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSVVUG00000019343	-	100	88.158	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020020500	snrpg	100	88.158	ENSXETG00000008512	snrpg	100	88.158	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020020500	snrpg	100	93.671	ENSXCOG00000000088	snrpg	100	93.671	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020020500	snrpg	100	97.368	ENSXMAG00000004353	snrpg	100	97.368	Xiphophorus_maculatus