EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020020542 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: dus4l
Alias: -
Full Name: dihydrouridine synthase 4-like (S. cerevisiae)
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4647 bases
Position: chr13:16252997-16257643
Accession: ZDB-GENE-040801-233
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020019541	Dus	PF01207.17	2.5e-74	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020035210	-	2341	-	ENSORLP00020019541	320 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020020542	dus4l	66	39.815	ENSORLG00020018056	dus1l	72	39.815

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSG00000105865	DUS4L	94	71.477	Homo_sapiens
ENSORLG00020020542	dus4l	98	90.159	ENSAPOG00000015063	dus4l	100	90.159	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSAMEG00000013535	DUS4L	93	71.477	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020020542	dus4l	98	90.159	ENSACIG00000017392	dus4l	100	90.159	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020542	dus4l	98	90.159	ENSAOCG00000007191	dus4l	100	90.159	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020020542	dus4l	98	90.159	ENSAPEG00000015296	dus4l	100	90.159	Amphiprion_percula
ENSORLG00020020542	dus4l	98	89.841	ENSATEG00000009040	dus4l	100	89.841	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	75.503	ENSAPLG00000007641	DUS4L	98	75.503	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020020542	dus4l	93	74.247	ENSACAG00000015202	DUS4L	92	74.247	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.812	ENSANAG00000037839	DUS4L	97	71.812	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020542	dus4l	98	90.794	ENSACLG00000021844	dus4l	100	90.794	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020542	dus4l	94	81.000	ENSAMXG00000032924	dus4l	100	81.000	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	70.470	ENSBTAG00000021849	DUS4L	93	70.470	Bos_taurus
ENSORLG00020020542	dus4l	88	51.429	WBGene00016674	C45G9.2	99	51.429	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.141	ENSCJAG00000016323	DUS4L	94	71.141	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	70.470	ENSCAFG00000003919	DUS4L	94	70.470	Canis_familiaris
ENSORLG00020020542	dus4l	93	70.470	ENSCAFG00020023124	DUS4L	94	70.470	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020020542	dus4l	93	70.134	ENSCHIG00000010888	DUS4L	93	70.134	Capra_hircus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.812	ENSTSYG00000010065	DUS4L	94	71.812	Carlito_syrichta
ENSORLG00020020542	dus4l	87	56.318	ENSCAPG00000007215	DUS4L	99	56.318	Cavia_aperea
ENSORLG00020020542	dus4l	95	70.395	ENSCPOG00000002384	DUS4L	96	70.395	Cavia_porcellus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.812	ENSCCAG00000027960	DUS4L	94	71.812	Cebus_capucinus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSCATG00000031611	DUS4L	94	71.477	Cercocebus_atys
ENSORLG00020020542	dus4l	96	68.987	ENSCLAG00000012135	DUS4L	99	68.987	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.141	ENSCSAG00000011370	DUS4L	94	71.141	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020020542	dus4l	64	74.020	ENSCHOG00000006848	DUS4L	88	74.020	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020020542	dus4l	93	74.832	ENSCPBG00000000863	DUS4L	95	74.832	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020020542	dus4l	93	53.512	ENSCING00000001869	-	97	53.512	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020020542	dus4l	92	55.254	ENSCSAVG00000005308	-	97	55.254	Ciona_savignyi
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.141	ENSCANG00000024456	DUS4L	94	71.141	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	72.819	ENSCGRG00001014181	Dus4l	94	72.819	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020020542	dus4l	93	72.819	ENSCGRG00000000384	Dus4l	94	72.819	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020020542	dus4l	99	86.792	ENSCSEG00000018179	dus4l	100	86.792	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020020542	dus4l	98	89.809	ENSCVAG00000010487	dus4l	99	89.809	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020020542	dus4l	94	80.464	ENSDARG00000006567	dus4l	98	80.464	Danio_rerio
ENSORLG00020020542	dus4l	93	72.819	ENSDNOG00000030725	DUS4L	94	72.819	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	72.483	ENSDORG00000010587	Dus4l	94	72.483	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020020542	dus4l	93	45.338	FBgn0032750	CG10495	78	45.338	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020020542	dus4l	64	53.922	ENSETEG00000004577	-	89	53.922	Echinops_telfairi
ENSORLG00020020542	dus4l	94	59.603	ENSEBUG00000008924	dus4l	96	59.603	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSEASG00005017480	DUS4L	94	71.477	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	72.148	ENSECAG00000014852	DUS4L	94	72.148	Equus_caballus
ENSORLG00020020542	dus4l	95	84.539	ENSELUG00000017740	dus4l	95	85.099	Esox_lucius
ENSORLG00020020542	dus4l	93	70.805	ENSFCAG00000041439	DUS4L	94	70.805	Felis_catus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	75.667	ENSFALG00000010246	DUS4L	94	75.667	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020020542	dus4l	96	68.671	ENSFDAG00000010206	DUS4L	99	68.671	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020020542	dus4l	98	88.889	ENSFHEG00000020124	dus4l	100	88.889	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020020542	dus4l	95	81.967	ENSGMOG00000001452	dus4l	99	81.967	Gadus_morhua
ENSORLG00020020542	dus4l	93	74.497	ENSGALG00000023661	DUS4L	94	74.497	Gallus_gallus
ENSORLG00020020542	dus4l	98	88.889	ENSGAFG00000010054	dus4l	100	88.889	Gambusia_affinis
ENSORLG00020020542	dus4l	98	88.141	ENSGACG00000008772	dus4l	98	88.141	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSGGOG00000003821	DUS4L	94	71.477	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020020542	dus4l	98	91.111	ENSHBUG00000015255	dus4l	100	91.111	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020020542	dus4l	93	69.463	ENSHGLG00000018976	DUS4L	94	69.463	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020020542	dus4l	93	69.463	ENSHGLG00100002604	DUS4L	94	69.463	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020020542	dus4l	98	85.256	ENSHCOG00000015919	dus4l	99	85.256	Hippocampus_comes
ENSORLG00020020542	dus4l	97	78.317	ENSIPUG00000014454	dus4l	100	79.667	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020020542	dus4l	96	70.684	ENSSTOG00000000212	DUS4L	97	70.684	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	70.805	ENSJJAG00000013626	Dus4l	97	70.805	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020020542	dus4l	98	88.013	ENSKMAG00000013719	dus4l	100	88.013	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020020542	dus4l	98	88.782	ENSLBEG00000018142	dus4l	99	88.782	Labrus_bergylta
ENSORLG00020020542	dus4l	71	74.009	ENSLACG00000000451	DUS4L	96	74.009	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020020542	dus4l	94	79.344	ENSLOCG00000015815	dus4l	94	79.344	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.812	ENSLAFG00000000968	DUS4L	94	71.812	Loxodonta_africana
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.141	ENSMFAG00000003759	DUS4L	94	71.141	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSMNEG00000040594	DUS4L	94	71.477	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSMLEG00000037658	DUS4L	94	71.477	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020020542	dus4l	96	90.909	ENSMAMG00000007717	dus4l	88	90.909	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020020542	dus4l	89	91.901	ENSMZEG00005014697	dus4l	96	91.579	Maylandia_zebra
ENSORLG00020020542	dus4l	74	74.370	ENSMGAG00000009714	DUS4L	97	74.370	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020020542	dus4l	95	71.382	ENSMAUG00000016651	Dus4l	94	72.483	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	55.034	ENSMICG00000027213	-	93	55.034	Microcebus_murinus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSMICG00000042944	-	94	71.477	Microcebus_murinus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	74.832	ENSMOCG00000019344	Dus4l	94	74.832	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020020542	dus4l	98	82.540	ENSMMOG00000011517	dus4l	100	82.540	Mola_mola
ENSORLG00020020542	dus4l	93	72.054	ENSMODG00000016361	DUS4L	94	72.054	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020020542	dus4l	98	87.302	ENSMALG00000002457	dus4l	99	87.302	Monopterus_albus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	MGP_CAROLIEiJ_G0017680	Dus4l	92	71.477	Mus_caroli
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSMUSG00000020648	Dus4l	92	71.477	Mus_musculus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.572	MGP_PahariEiJ_G0029438	Dus4l	92	71.572	Mus_pahari
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.812	MGP_SPRETEiJ_G0018522	Dus4l	92	71.812	Mus_spretus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.812	ENSMPUG00000018247	DUS4L	97	71.812	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020020542	dus4l	68	69.725	ENSMLUG00000002731	DUS4L	92	69.725	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSNGAG00000022335	Dus4l	94	71.477	Nannospalax_galili
ENSORLG00020020542	dus4l	98	91.111	ENSNBRG00000013582	dus4l	100	91.111	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSNLEG00000008716	DUS4L	94	71.477	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020020542	dus4l	61	56.633	ENSMEUG00000000187	-	100	56.633	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020020542	dus4l	68	72.350	ENSOPRG00000005394	DUS4L	92	72.350	Ochotona_princeps
ENSORLG00020020542	dus4l	96	68.987	ENSODEG00000001582	DUS4L	99	68.987	Octodon_degus
ENSORLG00020020542	dus4l	98	91.429	ENSONIG00000004993	dus4l	100	91.429	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	72.819	ENSOANG00000003179	DUS4L	97	72.819	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.717	ENSOCUG00000012784	DUS4L	94	71.717	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020020542	dus4l	100	98.438	ENSORLG00000008306	dus4l	100	98.438	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020542	dus4l	100	98.438	ENSORLG00015001648	dus4l	100	98.438	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020020542	dus4l	98	96.795	ENSOMEG00000017582	dus4l	99	96.795	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020020542	dus4l	93	72.483	ENSOGAG00000013113	DUS4L	93	72.483	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020020542	dus4l	93	70.134	ENSOARG00000005713	DUS4L	93	70.134	Ovis_aries
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSPPAG00000031482	DUS4L	94	71.477	Pan_paniscus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.141	ENSPPRG00000010523	DUS4L	94	71.141	Panthera_pardus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.141	ENSPTIG00000005318	DUS4L	94	71.141	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSPTRG00000019579	DUS4L	94	71.477	Pan_troglodytes
ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSPANG00000007111	DUS4L	94	71.477	Papio_anubis
ENSORLG00020020542	dus4l	88	83.571	ENSPKIG00000016429	dus4l	88	83.571	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020020542	dus4l	93	74.497	ENSPSIG00000013488	DUS4L	95	74.497	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020020542	dus4l	98	83.492	ENSPMGG00000012731	dus4l	100	83.492	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020020542	dus4l	93	72.819	ENSPEMG00000022807	Dus4l	94	72.819	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020020542	dus4l	93	72.148	ENSPCIG00000005163	DUS4L	99	72.093	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020020542	dus4l	98	88.679	ENSPFOG00000004246	dus4l	100	88.679	Poecilia_formosa
ENSORLG00020020542	dus4l	98	88.959	ENSPLAG00000021398	dus4l	100	88.959	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020020542	dus4l	98	88.679	ENSPMEG00000010911	dus4l	100	88.679	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020020542	dus4l	98	88.291	ENSPREG00000021419	dus4l	100	88.291	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020020542	dus4l	93	69.463	ENSPPYG00000017901	DUS4L	94	69.463	Pongo_abelii
ENSORLG00020020542	dus4l	69	73.750	ENSPCAG00000012668	-	70	73.750	Procavia_capensis
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ENSORLG00020020542	dus4l	93	71.477	ENSRROG00000000241	DUS4L	94	71.477	Rhinopithecus_roxellana
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ENSORLG00020020542	dus4l	88	71.986	ENSXETG00000005925	dus4l	99	71.986	Xenopus_tropicalis
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