EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020020682 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5358 bases
Position: chr18:2656815-2662172
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020019677	Endonuclease_NS	PF01223.23	7.4e-23	1	1
ENSORLP00020034271	Endonuclease_NS	PF01223.23	7.4e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020028856	-	5259	-	ENSORLP00020034271	326 (aa)	-	-
ENSORLT00020035272	-	5075	-	ENSORLP00020019677	326 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020020682	-	81	31.522	ENSORLG00020019335	zgc:172339	72	33.641
ENSORLG00020020682	-	82	46.494	ENSORLG00020021127	-	81	52.766
ENSORLG00020020682	-	71	30.290	ENSORLG00020017456	si:dkey-85k7.10	60	33.152
ENSORLG00020020682	-	76	48.387	ENSORLG00020021096	-	85	48.936
ENSORLG00020020682	-	75	31.008	ENSORLG00020019522	si:dkey-243k1.3	86	30.502
ENSORLG00020020682	-	69	31.873	ENSORLG00020006331	-	63	34.361
ENSORLG00020020682	-	70	36.017	ENSORLG00020018077	-	58	40.659
ENSORLG00020020682	-	70	31.330	ENSORLG00020020679	-	59	35.359
ENSORLG00020020682	-	99	74.566	ENSORLG00020020695	-	89	75.146
ENSORLG00020020682	-	80	45.283	ENSORLG00020021109	-	86	48.261
ENSORLG00020020682	-	98	81.931	ENSORLG00020020712	-	99	81.931

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020020682	-	77	48.016	ENSAPOG00000012244	-	90	46.350	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020682	-	80	56.654	ENSAPOG00000022953	-	81	57.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020682	-	69	37.931	ENSAPOG00000022205	-	66	38.073	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020682	-	55	41.176	ENSAPOG00000023293	-	61	40.957	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020682	-	71	51.948	ENSAPOG00000022923	-	78	51.948	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020682	-	80	30.216	ENSAPOG00000008666	-	84	30.189	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020682	-	59	30.808	ENSAPOG00000006928	si:dkey-243k1.3	70	30.047	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020682	-	79	44.574	ENSAPOG00000013654	-	85	45.565	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020682	-	77	48.819	ENSACIG00000023177	-	82	48.819	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020682	-	72	50.424	ENSACIG00000023171	-	82	50.644	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020682	-	74	30.612	ENSACIG00000014265	-	66	31.429	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020682	-	69	35.622	ENSACIG00000012712	-	58	40.659	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020682	-	71	38.819	ENSACIG00000006055	-	67	39.545	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020682	-	66	33.043	ENSACIG00000001431	-	80	33.043	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020682	-	71	35.600	ENSACIG00000009432	-	83	35.950	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020682	-	66	36.638	ENSACIG00000022595	-	85	36.638	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020682	-	64	33.182	ENSACIG00000016021	si:dkey-243k1.3	78	33.182	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020682	-	62	33.040	ENSACIG00000015751	-	74	33.040	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020682	-	84	44.803	ENSACIG00000008317	-	97	44.803	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020682	-	90	48.322	ENSACIG00000008299	-	92	50.000	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020682	-	76	56.800	ENSACIG00000007813	-	82	56.800	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020682	-	57	39.796	ENSAOCG00000007227	-	64	39.796	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020020682	-	70	39.316	ENSAOCG00000000850	-	66	39.545	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020020682	-	64	34.703	ENSAOCG00000002456	si:dkey-243k1.3	74	34.703	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020020682	-	59	34.804	ENSAOCG00000015199	-	75	34.247	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020020682	-	81	30.000	ENSAOCG00000013137	-	76	30.736	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020020682	-	84	51.636	ENSAOCG00000008016	si:ch211-133n4.4	85	52.823	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020020682	-	83	50.735	ENSAPEG00000023828	-	94	51.145	Amphiprion_percula
ENSORLG00020020682	-	81	30.000	ENSAPEG00000007291	-	76	30.736	Amphiprion_percula
ENSORLG00020020682	-	70	39.316	ENSAPEG00000018986	-	66	39.545	Amphiprion_percula
ENSORLG00020020682	-	59	35.294	ENSAPEG00000024402	-	70	35.294	Amphiprion_percula
ENSORLG00020020682	-	55	40.642	ENSAPEG00000013928	-	61	40.642	Amphiprion_percula
ENSORLG00020020682	-	70	38.889	ENSAPEG00000012445	-	66	39.091	Amphiprion_percula
ENSORLG00020020682	-	59	36.275	ENSAPEG00000024409	si:dkey-243k1.3	72	36.275	Amphiprion_percula
ENSORLG00020020682	-	86	50.534	ENSATEG00000014686	-	69	52.273	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	73	47.755	ENSATEG00000014672	-	78	47.737	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	92	50.489	ENSATEG00000014477	-	83	48.943	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	55	41.711	ENSATEG00000009957	-	60	41.711	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	95	47.468	ENSATEG00000014502	-	73	47.152	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	84	49.458	ENSATEG00000014621	-	96	50.746	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	65	35.681	ENSATEG00000021350	-	61	36.279	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	84	50.883	ENSATEG00000014459	-	58	50.883	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	91	52.903	ENSATEG00000014526	-	92	51.488	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	91	52.581	ENSATEG00000014520	-	93	50.599	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	92	46.205	ENSATEG00000014484	-	98	45.260	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	77	47.638	ENSATEG00000014488	-	78	47.951	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	85	51.799	ENSATEG00000014573	-	88	49.669	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	89	45.118	ENSATEG00000014579	-	92	45.238	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	85	54.839	ENSATEG00000014635	-	90	54.244	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	89	49.832	ENSATEG00000014430	-	79	48.287	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	85	41.281	ENSATEG00000014380	-	82	40.909	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	74	33.202	ENSATEG00000022068	si:dkey-243k1.3	69	36.318	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	96	56.113	ENSATEG00000014701	-	77	56.113	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	84	50.714	ENSATEG00000014542	-	91	49.667	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	88	42.759	ENSATEG00000014466	-	98	41.640	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	89	51.890	ENSATEG00000014512	-	83	50.159	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	90	52.751	ENSATEG00000014514	-	89	52.443	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	82	46.816	ENSATEG00000014652	-	90	50.628	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	70	31.092	ENSATEG00000008791	-	65	31.944	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	81	50.368	ENSATEG00000014589	-	91	47.584	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	66	38.914	ENSATEG00000011941	-	68	38.914	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020682	-	70	36.667	ENSAPLG00000004064	-	81	36.667	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020020682	-	84	32.624	ENSACAG00000005752	-	93	33.083	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020020682	-	81	36.823	ENSACAG00000005411	-	88	36.226	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020020682	-	89	48.797	ENSACLG00000017798	-	90	48.958	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020682	-	59	35.610	ENSACLG00000011404	si:dkey-243k1.3	71	35.122	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020682	-	70	30.380	ENSACLG00000008439	-	66	31.481	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020682	-	89	51.546	ENSACLG00000017733	-	75	51.736	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020682	-	65	40.183	ENSACLG00000013353	-	67	40.183	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020682	-	73	51.261	ENSACLG00000017724	-	82	51.489	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020682	-	53	41.209	ENSACLG00000021771	-	55	41.209	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020682	-	94	53.871	ENSACLG00000015425	-	82	55.172	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020682	-	77	30.935	ENSACLG00000016915	-	82	30.337	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020682	-	81	30.108	ENSACLG00000026586	-	76	31.304	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020682	-	69	33.473	ENSACLG00000001104	-	75	32.751	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020682	-	68	52.679	ENSACLG00000017744	-	79	52.679	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020682	-	66	36.100	ENSAMXG00000035215	-	80	36.100	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	80	30.909	ENSAMXG00000003411	-	82	31.128	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	76	32.319	ENSAMXG00000040657	-	83	32.794	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	73	39.516	ENSAMXG00000038214	-	82	39.357	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	71	34.454	ENSAMXG00000030013	-	92	34.454	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	66	32.900	ENSAMXG00000036403	-	76	32.900	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	68	32.669	ENSAMXG00000043661	-	78	32.661	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	56	34.171	ENSAMXG00000010981	-	66	34.171	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	71	36.546	ENSAMXG00000019466	-	75	37.179	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	67	31.111	ENSAMXG00000029128	-	77	31.111	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	84	31.142	ENSAMXG00000007611	si:dkey-243k1.3	87	31.679	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	79	31.343	ENSAMXG00000040929	-	92	30.970	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	53	41.304	ENSAMXG00000037172	-	61	41.026	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	63	30.806	ENSAMXG00000019995	zgc:172339	73	30.435	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020682	-	72	36.437	ENSCPBG00000019841	-	88	35.385	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020020682	-	83	31.359	ENSCPBG00000007740	-	58	30.797	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020020682	-	74	32.937	ENSCSEG00000006632	-	68	33.480	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020020682	-	53	40.884	ENSCSEG00000002613	-	59	40.323	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020020682	-	81	32.258	ENSCVAG00000006246	si:dkey-243k1.3	74	35.455	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020020682	-	71	38.397	ENSCVAG00000020989	-	68	37.838	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020020682	-	66	36.486	ENSCVAG00000013891	-	67	36.486	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020020682	-	92	55.263	ENSCVAG00000009853	si:ch211-133n4.4	85	56.207	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020020682	-	72	36.364	ENSCVAG00000002820	-	65	35.586	Cyprinodon_variegatus
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