EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020020708 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13044 bases
Position: chr17:6970812-6983855
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020034203	dsrm	PF00035.26	7.8e-19	1	2
ENSORLP00020034203	dsrm	PF00035.26	7.8e-19	2	2
ENSORLP00020019613	dsrm	PF00035.26	8.3e-19	1	2
ENSORLP00020019613	dsrm	PF00035.26	8.3e-19	2	2
ENSORLP00020034208	dsrm	PF00035.26	8.6e-19	1	2
ENSORLP00020034208	dsrm	PF00035.26	8.6e-19	2	2
ENSORLP00020019659	dsrm	PF00035.26	9e-19	1	2
ENSORLP00020019659	dsrm	PF00035.26	9e-19	2	2
ENSORLP00020034253	dsrm	PF00035.26	9.3e-19	1	2
ENSORLP00020034253	dsrm	PF00035.26	9.3e-19	2	2
ENSORLP00020019590	dsrm	PF00035.26	9.6e-19	1	2
ENSORLP00020019590	dsrm	PF00035.26	9.6e-19	2	2
ENSORLP00020034208	A_deamin	PF02137.18	2.1e-98	1	1
ENSORLP00020019590	A_deamin	PF02137.18	2.2e-98	1	1
ENSORLP00020034203	A_deamin	PF02137.18	5.4e-95	1	1
ENSORLP00020034253	A_deamin	PF02137.18	6.1e-90	1	1
ENSORLP00020019613	A_deamin	PF02137.18	4.3e-88	1	1
ENSORLP00020019659	A_deamin	PF02137.18	6.8e-87	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020035267	-	2019	-	ENSORLP00020019659	672 (aa)	-	-
ENSORLT00020028813	-	2070	-	ENSORLP00020034253	689 (aa)	-	-
ENSORLT00020028742	-	2079	-	ENSORLP00020019590	692 (aa)	-	-
ENSORLT00020028734	-	1938	-	ENSORLP00020034203	645 (aa)	-	-
ENSORLT00020028768	-	2088	-	ENSORLP00020019613	695 (aa)	-	-
ENSORLT00020035226	-	2001	-	ENSORLP00020034208	666 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020020708	-	99	35.684	ENSORLG00020013949	-	99	36.758
ENSORLG00020020708	-	98	41.185	ENSORLG00020012709	adarb1b	99	41.304
ENSORLG00020020708	-	97	47.531	ENSORLG00020007274	adarb2	91	45.946

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020020708	-	98	43.768	ENSG00000185736	ADARB2	91	44.526	Homo_sapiens
ENSORLG00020020708	-	76	45.966	ENSAPOG00000000330	adarb2	60	72.222	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020708	-	99	61.457	ENSAPOG00000007476	-	100	62.238	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020708	-	98	42.708	ENSAMEG00000001942	ADARB2	94	42.708	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020020708	-	90	48.499	ENSACIG00000003609	adarb2	89	48.580	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020708	-	99	67.588	ENSACIG00000018727	-	97	67.588	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020708	-	98	61.409	ENSAOCG00000005591	-	99	61.652	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020020708	-	97	48.217	ENSAOCG00000009758	adarb2	90	46.812	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020020708	-	70	69.106	ENSAPEG00000003048	-	69	66.061	Amphiprion_percula
ENSORLG00020020708	-	97	48.131	ENSAPEG00000006268	adarb2	90	47.101	Amphiprion_percula
ENSORLG00020020708	-	97	48.670	ENSATEG00000022366	adarb2	93	47.731	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020708	-	99	65.491	ENSATEG00000012728	-	99	65.084	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020708	-	99	45.636	ENSAPLG00000012729	ADARB2	96	45.839	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020020708	-	98	45.547	ENSACAG00000003231	ADARB2	86	45.547	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020020708	-	98	43.086	ENSANAG00000033136	ADARB2	97	42.700	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020708	-	90	68.167	ENSACLG00000026322	-	93	65.244	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020708	-	97	48.858	ENSACLG00000012724	adarb2	92	48.012	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020708	-	96	47.096	ENSAMXG00000040561	adarb2	94	45.852	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020020708	-	98	42.482	ENSBTAG00000014194	ADARB2	91	42.669	Bos_taurus
ENSORLG00020020708	-	97	40.596	ENSCJAG00000008412	ADARB2	97	38.974	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020020708	-	63	44.552	ENSCAFG00000005516	-	90	44.570	Canis_familiaris
ENSORLG00020020708	-	99	43.053	ENSCAFG00020004349	ADARB2	94	43.275	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020020708	-	98	42.190	ENSCHIG00000002677	ADARB2	91	43.109	Capra_hircus
ENSORLG00020020708	-	98	45.072	ENSCAPG00000009111	ADARB2	91	45.072	Cavia_aperea
ENSORLG00020020708	-	98	45.217	ENSCPOG00000013893	ADARB2	91	45.217	Cavia_porcellus
ENSORLG00020020708	-	61	46.633	ENSCCAG00000023030	ADARB2	77	47.475	Cebus_capucinus
ENSORLG00020020708	-	97	44.514	ENSCATG00000033324	ADARB2	99	43.414	Cercocebus_atys
ENSORLG00020020708	-	98	44.783	ENSCLAG00000004143	ADARB2	96	44.783	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020020708	-	97	44.741	ENSCSAG00000014037	ADARB2	96	44.672	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020020708	-	68	40.220	ENSCHOG00000003620	-	53	52.315	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020020708	-	99	45.706	ENSCPBG00000017055	ADARB2	99	46.221	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020020708	-	98	43.913	ENSCANG00000041148	ADARB2	99	43.414	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020020708	-	98	44.298	ENSCGRG00001012519	Adarb2	99	42.530	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020020708	-	98	44.298	ENSCGRG00000007814	Adarb2	99	42.530	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020020708	-	97	48.678	ENSCSEG00000012042	adarb2	93	48.602	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020020708	-	97	48.044	ENSCVAG00000000566	adarb2	91	47.254	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020020708	-	96	58.479	ENSCVAG00000009369	-	98	56.388	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020020708	-	98	45.930	ENSDARG00000071823	adarb2	93	46.098	Danio_rerio
ENSORLG00020020708	-	98	45.255	ENSDNOG00000000111	ADARB2	94	45.255	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020020708	-	97	45.227	ENSDORG00000005710	Adarb2	100	41.940	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020020708	-	88	47.079	ENSETEG00000017498	ADARB2	87	47.245	Echinops_telfairi
ENSORLG00020020708	-	99	45.205	ENSEASG00005019093	ADARB2	96	45.044	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020020708	-	99	45.205	ENSECAG00000014587	ADARB2	96	45.044	Equus_caballus
ENSORLG00020020708	-	96	48.452	ENSELUG00000003379	adarb2	95	46.023	Esox_lucius
ENSORLG00020020708	-	95	50.523	ENSELUG00000008478	ADARB2	92	47.526	Esox_lucius
ENSORLG00020020708	-	98	42.649	ENSFCAG00000003296	ADARB2	99	41.105	Felis_catus
ENSORLG00020020708	-	99	46.012	ENSFALG00000006993	ADARB2	94	46.076	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020020708	-	98	44.928	ENSFDAG00000012339	ADARB2	98	42.798	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020020708	-	98	58.642	ENSFHEG00000004579	-	97	57.267	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020020708	-	66	53.500	ENSGMOG00000017835	adarb2	63	53.500	Gadus_morhua
ENSORLG00020020708	-	81	47.670	ENSGMOG00000016035	-	81	49.064	Gadus_morhua
ENSORLG00020020708	-	99	45.872	ENSGALG00000006797	ADARB2	99	45.974	Gallus_gallus
ENSORLG00020020708	-	99	57.943	ENSGAFG00000018614	-	99	57.943	Gambusia_affinis
ENSORLG00020020708	-	97	41.745	ENSGAFG00000002060	adarb2	99	41.320	Gambusia_affinis
ENSORLG00020020708	-	98	55.349	ENSGACG00000017477	-	95	53.296	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020020708	-	97	47.523	ENSGACG00000001798	adarb2	96	46.077	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020020708	-	98	44.058	ENSGGOG00000003165	ADARB2	99	43.414	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020020708	-	99	66.514	ENSHBUG00000007365	-	93	63.675	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020020708	-	97	48.706	ENSHBUG00000001752	adarb2	96	47.763	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020020708	-	97	40.376	ENSHGLG00000014550	ADARB2	99	38.410	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020020708	-	98	44.928	ENSHGLG00100011502	ADARB2	99	42.704	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020020708	-	97	48.217	ENSHCOG00000020344	adarb2	91	46.599	Hippocampus_comes
ENSORLG00020020708	-	88	47.359	ENSIPUG00000000812	adarb2	90	45.540	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020020708	-	98	44.913	ENSSTOG00000014329	ADARB2	99	43.106	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020020708	-	97	45.171	ENSJJAG00000015849	Adarb2	99	42.303	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020020708	-	99	66.260	ENSKMAG00000000395	-	91	64.235	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020020708	-	99	47.713	ENSLBEG00000028085	adarb2	92	47.536	Labrus_bergylta
ENSORLG00020020708	-	99	65.191	ENSLBEG00000021671	-	99	63.781	Labrus_bergylta
ENSORLG00020020708	-	97	49.530	ENSLOCG00000012249	adarb2	94	47.338	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020020708	-	98	45.693	ENSLAFG00000004361	ADARB2	96	45.930	Loxodonta_africana
ENSORLG00020020708	-	98	43.768	ENSMFAG00000040865	ADARB2	99	43.280	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020020708	-	98	43.768	ENSMMUG00000017120	ADARB2	99	43.280	Macaca_mulatta
ENSORLG00020020708	-	98	43.623	ENSMNEG00000040136	ADARB2	99	43.145	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020020708	-	98	44.058	ENSMLEG00000036075	ADARB2	95	44.818	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020020708	-	98	66.924	ENSMAMG00000013888	-	99	64.986	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020020708	-	90	47.962	ENSMAMG00000015084	adarb2	94	46.995	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020020708	-	97	48.615	ENSMZEG00005017069	adarb2	90	48.012	Maylandia_zebra
ENSORLG00020020708	-	99	65.997	ENSMZEG00005006722	-	97	63.676	Maylandia_zebra
ENSORLG00020020708	-	99	45.929	ENSMGAG00000005556	ADARB2	96	46.120	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020020708	-	98	44.787	ENSMAUG00000010346	Adarb2	99	42.704	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020020708	-	99	37.596	ENSMICG00000047603	ADARB2	91	36.701	Microcebus_murinus
ENSORLG00020020708	-	98	44.444	ENSMOCG00000011797	Adarb2	96	42.621	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020020708	-	99	64.055	ENSMMOG00000011272	-	98	62.408	Mola_mola
ENSORLG00020020708	-	97	48.281	ENSMMOG00000005538	adarb2	95	46.475	Mola_mola
ENSORLG00020020708	-	92	46.557	ENSMODG00000006359	ADARB2	100	47.360	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020020708	-	89	47.966	ENSMALG00000017654	adarb2	90	46.584	Monopterus_albus
ENSORLG00020020708	-	99	64.787	ENSMALG00000012596	-	97	63.649	Monopterus_albus
ENSORLG00020020708	-	98	43.750	MGP_CAROLIEiJ_G0018212	Adarb2	99	42.035	Mus_caroli
ENSORLG00020020708	-	98	44.006	ENSMUSG00000052551	Adarb2	99	42.799	Mus_musculus
ENSORLG00020020708	-	98	44.006	MGP_PahariEiJ_G0019260	Adarb2	99	42.473	Mus_pahari
ENSORLG00020020708	-	98	44.006	MGP_SPRETEiJ_G0019068	Adarb2	99	46.019	Mus_spretus
ENSORLG00020020708	-	97	43.730	ENSMPUG00000016224	ADARB2	89	44.409	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020020708	-	98	42.550	ENSMLUG00000013832	ADARB2	99	42.550	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020020708	-	98	44.913	ENSNGAG00000015119	Adarb2	99	42.396	Nannospalax_galili
ENSORLG00020020708	-	99	60.790	ENSNBRG00000019879	-	98	60.355	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020020708	-	89	50.336	ENSNBRG00000013208	adarb2	90	49.209	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020020708	-	97	46.479	ENSMEUG00000008809	ADARB2	88	46.201	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020020708	-	70	48.796	ENSOPRG00000009309	ADARB2	69	50.331	Ochotona_princeps
ENSORLG00020020708	-	98	44.783	ENSODEG00000000345	ADARB2	99	42.704	Octodon_degus
ENSORLG00020020708	-	98	47.908	ENSONIG00000003634	adarb2	98	45.542	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020020708	-	99	66.717	ENSONIG00000017716	-	99	63.725	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020020708	-	97	45.912	ENSOANG00000006089	ADARB2	92	45.975	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020020708	-	97	45.227	ENSOCUG00000004181	ADARB2	99	45.277	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020020708	-	97	47.531	ENSORLG00000027340	adarb2	91	46.230	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020708	-	99	98.125	ENSORLG00000006209	-	97	97.988	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020708	-	97	94.845	ENSORLG00015020288	-	99	94.845	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020020708	-	97	47.531	ENSORLG00015003777	adarb2	91	46.230	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020020708	-	97	48.678	ENSOMEG00000019523	adarb2	95	46.991	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020020708	-	99	86.604	ENSOMEG00000011377	-	100	82.902	Oryzias_melastigma
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ENSORLG00020020708	-	97	50.000	ENSPMGG00000012587	adarb2	95	48.637	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020020708	-	98	44.444	ENSPEMG00000000370	Adarb2	99	42.396	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSORLG00020020708	-	84	42.814	ENSPVAG00000010042	ADARB2	72	44.720	Pteropus_vampyrus
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ENSORLG00020020708	-	97	47.344	ENSPNAG00000030072	adarb2	96	45.731	Pygocentrus_nattereri
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ENSORLG00020020708	-	88	59.130	ENSSBOG00000027116	ADARB2	81	59.130	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020020708	-	98	45.839	ENSSHAG00000015652	ADARB2	99	45.839	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020020708	-	99	46.176	ENSSFOG00015004693	ADARB2	99	46.569	Scleropages_formosus
ENSORLG00020020708	-	88	48.103	ENSSFOG00015014917	adarb2	99	45.867	Scleropages_formosus
ENSORLG00020020708	-	99	62.519	ENSSMAG00000005263	-	98	61.493	Scophthalmus_maximus
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ENSORLG00020020708	-	97	47.664	ENSSPAG00000017554	adarb2	92	46.667	Stegastes_partitus
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ENSORLG00020020708	-	99	39.571	ENSTTRG00000011179	ADARB2	91	39.394	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020020708	-	99	41.832	ENSVVUG00000008465	ADARB2	92	42.708	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020020708	-	98	41.370	ENSXETG00000018065	adarb2	99	41.370	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020020708	-	99	56.818	ENSXCOG00000019963	-	100	55.182	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020020708	-	97	49.068	ENSXMAG00000004645	adarb2	95	46.475	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020020708	-	99	57.534	ENSXMAG00000006770	-	100	56.034	Xiphophorus_maculatus