EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020020726 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: polr1a
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 23425 bases
Position: chr10:22954279-22977703
Accession: ZDB-GENE-030131-5286
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020019699	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	4.3e-99	1	1
ENSORLP00020019699	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	1.9e-21	1	1
ENSORLP00020019699	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	7.4e-69	1	1
ENSORLP00020019699	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	1.4e-35	1	1
ENSORLP00020019699	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	8.7e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020028879	-	4887	-	ENSORLP00020019699	1628 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020020726's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020020726's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020020726	polr1a	71	33.333	ENSORLG00020010235	polr2a	57	33.333
ENSORLG00020020726	polr1a	69	32.971	ENSORLG00020007525	polr3a	74	33.558

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.578	ENSG00000068654	POLR1A	100	63.811	Homo_sapiens
ENSORLG00020020726	polr1a	70	81.787	ENSAPOG00000017945	polr1a	100	81.787	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.879	ENSAMEG00000005807	POLR1A	100	67.074	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020020726	polr1a	99	77.825	ENSACIG00000022147	polr1a	100	78.006	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	79.162	ENSAOCG00000017336	polr1a	100	79.280	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020020726	polr1a	99	79.103	ENSAPEG00000016105	polr1a	100	79.221	Amphiprion_percula
ENSORLG00020020726	polr1a	99	79.233	ENSATEG00000016773	polr1a	100	79.221	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020726	polr1a	86	64.874	ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	65.068	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020020726	polr1a	99	62.093	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	61.977	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020020726	polr1a	99	62.658	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	63.636	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020726	polr1a	99	75.044	ENSACLG00000020541	polr1a	100	74.867	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020726	polr1a	99	64.000	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	64.174	Bos_taurus
ENSORLG00020020726	polr1a	95	41.164	WBGene00012999	rpoa-1	77	58.696	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.268	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	63.578	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.457	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	63.399	Canis_familiaris
ENSORLG00020020726	polr1a	99	64.107	ENSCAFG00020014752	POLR1A	100	64.128	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.610	ENSCHIG00000018204	POLR1A	100	63.552	Capra_hircus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.499	ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	63.694	Carlito_syrichta
ENSORLG00020020726	polr1a	97	61.375	ENSCAPG00000010132	POLR1A	99	62.362	Cavia_aperea
ENSORLG00020020726	polr1a	99	62.890	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	63.953	Cavia_porcellus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.441	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	63.984	Cebus_capucinus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.752	ENSCATG00000029786	POLR1A	100	64.178	Cercocebus_atys
ENSORLG00020020726	polr1a	99	62.768	ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	63.521	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.405	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	64.062	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	64.950	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	64.816	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020020726	polr1a	91	55.879	ENSCSAVG00000007184	-	91	55.879	Ciona_savignyi
ENSORLG00020020726	polr1a	99	60.857	ENSCANG00000031785	POLR1A	100	61.285	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	57.688	ENSCGRG00001006651	Polr1a	100	57.797	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020020726	polr1a	60	62.112	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	62.317	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020020726	polr1a	99	73.298	ENSCSEG00000020190	polr1a	100	73.412	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020020726	polr1a	99	76.937	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	77.345	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	70.170	ENSDARG00000098375	polr1a	100	70.029	Danio_rerio
ENSORLG00020020726	polr1a	99	60.812	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	60.950	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	62.847	ENSDORG00000008298	Polr1a	100	63.399	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020020726	polr1a	91	48.792	FBgn0019938	RpI1	99	42.755	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020020726	polr1a	70	90.625	ENSETEG00000000412	-	72	90.625	Echinops_telfairi
ENSORLG00020020726	polr1a	89	46.478	ENSEBUG00000005667	-	99	46.785	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020020726	polr1a	99	64.021	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	64.273	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	64.137	ENSECAG00000036306	-	99	68.530	Equus_caballus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	64.137	ENSECAG00000010092	POLR1A	99	68.530	Equus_caballus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	64.137	ENSECAG00000030510	-	99	68.530	Equus_caballus
ENSORLG00020020726	polr1a	86	76.344	ENSEEUG00000000676	POLR1A	85	76.344	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	71.219	ENSELUG00000012769	polr1a	99	71.278	Esox_lucius
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.167	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	63.578	Felis_catus
ENSORLG00020020726	polr1a	98	63.749	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	63.995	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020020726	polr1a	99	62.912	ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	63.610	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020020726	polr1a	99	75.645	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	75.705	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	67.229	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	67.489	Gadus_morhua
ENSORLG00020020726	polr1a	89	61.638	ENSGALG00000038160	-	98	62.264	Gallus_gallus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	76.355	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	76.057	Gambusia_affinis
ENSORLG00020020726	polr1a	99	74.435	ENSGACG00000018791	polr1a	100	74.493	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020020726	polr1a	90	65.420	ENSGAGG00000004984	-	95	70.205	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.584	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	63.831	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020020726	polr1a	91	79.322	ENSHBUG00000020021	polr1a	100	79.322	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.536	ENSHGLG00000006334	POLR1A	100	64.190	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.353	ENSHGLG00100006614	POLR1A	100	64.005	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020020726	polr1a	99	75.090	ENSHCOG00000003345	polr1a	100	75.090	Hippocampus_comes
ENSORLG00020020726	polr1a	99	69.545	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	69.365	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.483	ENSSTOG00000012580	POLR1A	100	63.393	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.531	ENSJJAG00000013113	Polr1a	100	63.578	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	80.415	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	80.237	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	76.517	ENSLBEG00000015401	polr1a	100	76.637	Labrus_bergylta
ENSORLG00020020726	polr1a	53	68.872	ENSLACG00000003218	polr1a	100	68.872	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020020726	polr1a	99	68.943	ENSLOCG00000010881	polr1a	100	68.984	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.316	ENSLAFG00000014948	POLR1A	100	63.499	Loxodonta_africana
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.463	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	64.062	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.347	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	63.947	Macaca_mulatta
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.463	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	64.062	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.451	ENSMLEG00000042428	POLR1A	100	64.170	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	78.597	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	78.835	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	79.314	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	79.137	Maylandia_zebra
ENSORLG00020020726	polr1a	99	62.347	ENSMGAG00000013111	POLR1A	99	62.267	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020020726	polr1a	91	62.846	ENSMAUG00000008497	Polr1a	99	63.165	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.349	ENSMICG00000000757	POLR1A	100	63.600	Microcebus_murinus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.647	ENSMOCG00000000122	Polr1a	100	64.079	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020020726	polr1a	99	76.190	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	76.205	Mola_mola
ENSORLG00020020726	polr1a	99	60.034	ENSMODG00000009335	POLR1A	100	59.692	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020020726	polr1a	99	77.621	ENSMALG00000013363	polr1a	100	77.752	Monopterus_albus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.051	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	100	63.210	Mus_caroli
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.109	ENSMUSG00000049553	Polr1a	100	63.152	Mus_musculus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	62.910	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	100	63.384	Mus_pahari
ENSORLG00020020726	polr1a	99	62.279	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	100	62.336	Mus_spretus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.689	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	63.747	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020020726	polr1a	99	62.929	ENSMLUG00000015723	POLR1A	100	63.678	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.453	ENSNGAG00000017907	Polr1a	100	63.736	Nannospalax_galili
ENSORLG00020020726	polr1a	99	78.723	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	78.605	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020020726	polr1a	99	61.729	ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	62.154	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020020726	polr1a	75	85.039	ENSMEUG00000011665	-	74	85.039	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020020726	polr1a	98	59.224	ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	59.192	Ochotona_princeps
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.008	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	63.626	Octodon_degus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	78.156	ENSONIG00000015895	polr1a	100	78.509	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	64.107	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	64.419	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020020726	polr1a	100	92.807	ENSORLG00000008753	polr1a	100	92.807	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020726	polr1a	96	100.000	ENSORLG00015016071	polr1a	99	100.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.212	ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	63.463	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.389	ENSOARG00000020601	POLR1A	100	63.736	Ovis_aries
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.405	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	63.657	Pan_paniscus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.689	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	63.926	Panthera_pardus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.353	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	63.589	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.463	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	63.657	Pan_troglodytes
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.578	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	64.005	Papio_anubis
ENSORLG00020020726	polr1a	99	68.798	ENSPKIG00000005468	polr1a	100	68.878	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020020726	polr1a	64	63.231	ENSPSIG00000009321	-	99	63.231	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020020726	polr1a	55	80.442	ENSPMGG00000009718	polr1a	95	80.442	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.246	ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	63.426	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020020726	polr1a	94	62.775	ENSPCIG00000004222	POLR1A	99	62.531	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	76.941	ENSPFOG00000005025	polr1a	100	77.045	Poecilia_formosa
ENSORLG00020020726	polr1a	99	77.182	ENSPLAG00000021389	polr1a	100	77.182	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020020726	polr1a	99	76.331	ENSPMEG00000006463	polr1a	100	76.613	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020020726	polr1a	99	76.910	ENSPREG00000002389	polr1a	100	77.027	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.436	ENSPPYG00000012217	POLR1A	100	63.863	Pongo_abelii
ENSORLG00020020726	polr1a	87	76.484	ENSPCAG00000011582	POLR1A	87	76.484	Procavia_capensis
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.234	ENSPCOG00000026987	POLR1A	100	63.947	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020020726	polr1a	95	63.932	ENSPVAG00000012674	POLR1A	95	63.959	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	79.196	ENSPNYG00000000026	polr1a	100	79.078	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020020726	polr1a	99	69.006	ENSPNAG00000019223	polr1a	100	69.082	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.252	ENSRNOG00000009545	Polr1a	100	63.536	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.578	ENSRBIG00000028335	POLR1A	100	64.005	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.578	ENSRROG00000031473	POLR1A	100	64.005	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020020726	polr1a	92	43.791	YOR341W	RPA190	87	43.791	Saccharomyces_cerevisiae
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.557	ENSSBOG00000030262	POLR1A	100	63.752	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020020726	polr1a	99	58.813	ENSSHAG00000014739	POLR1A	100	58.902	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020020726	polr1a	99	67.943	ENSSFOG00015019716	polr1a	100	68.061	Scleropages_formosus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	77.653	ENSSMAG00000014342	polr1a	100	77.608	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	79.363	ENSSDUG00000014631	polr1a	100	79.776	Seriola_dumerili
ENSORLG00020020726	polr1a	99	79.844	ENSSLDG00000024095	polr1a	100	79.904	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020020726	polr1a	69	97.561	ENSSARG00000003136	-	71	97.561	Sorex_araneus
ENSORLG00020020726	polr1a	91	72.821	ENSSPUG00000004215	POLR1A	99	72.821	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020020726	polr1a	70	78.746	ENSSPAG00000016341	polr1a	100	78.640	Stegastes_partitus
ENSORLG00020020726	polr1a	82	64.759	ENSSSCG00000008226	POLR1A	99	64.759	Sus_scrofa
ENSORLG00020020726	polr1a	98	63.728	ENSTGUG00000010704	POLR1A	100	63.320	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020020726	polr1a	99	74.291	ENSTRUG00000002210	polr1a	99	74.364	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020020726	polr1a	99	68.473	ENSTNIG00000010116	polr1a	100	68.375	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020020726	polr1a	72	83.186	ENSTBEG00000008646	POLR1A	73	83.186	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020020726	polr1a	99	61.949	ENSTTRG00000008597	POLR1A	100	62.137	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020020726	polr1a	70	65.424	ENSUAMG00000012158	-	94	65.085	Ursus_americanus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	64.132	ENSUMAG00000006700	POLR1A	100	63.871	Ursus_maritimus
ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.457	ENSVVUG00000001245	POLR1A	100	63.631	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020020726	polr1a	99	60.218	ENSXETG00000001952	polr1a	99	61.227	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020020726	polr1a	99	76.733	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	76.792	Xiphophorus_maculatus