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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020020816 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rab11ba
Alias: -
Full Name: ras-related protein Rab-11B
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2822 bases
Position: chr4:26204502-26207323
Accession: 101160399
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020019830	MMR_HSR1	PF01926.23	3.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020029047	-	657	-	ENSORLP00020019830	218 (aa)	XP_004068250	H2MKF6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020020816	rab11ba	78	30.460	ENSORLG00020006790	dnajc27	64	30.460
ENSORLG00020020816	rab11ba	68	41.935	ENSORLG00020013870	-	64	41.935
ENSORLG00020020816	rab11ba	96	38.278	ENSORLG00020000867	si:dkey-16l2.16	97	38.278
ENSORLG00020020816	rab11ba	75	45.122	ENSORLG00020008333	rab18a	79	45.679
ENSORLG00020020816	rab11ba	100	95.872	ENSORLG00020020844	RAB11B	100	95.872
ENSORLG00020020816	rab11ba	85	39.474	ENSORLG00020009158	rab9b	90	39.474
ENSORLG00020020816	rab11ba	89	39.175	ENSORLG00020005131	rab12	84	37.963
ENSORLG00020020816	rab11ba	66	37.063	ENSORLG00020020220	rab23	79	36.196
ENSORLG00020020816	rab11ba	94	42.157	ENSORLG00020020922	rab5aa	89	42.157
ENSORLG00020020816	rab11ba	72	39.877	ENSORLG00020005952	rab7a	78	39.877
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	61.290	ENSORLG00020020811	rab25a	69	61.290
ENSORLG00020020816	rab11ba	72	34.756	ENSORLG00020010772	rab6ba	76	34.756
ENSORLG00020020816	rab11ba	73	45.342	ENSORLG00020015717	-	66	45.342
ENSORLG00020020816	rab11ba	84	42.473	ENSORLG00020013895	rab42a	85	42.473
ENSORLG00020020816	rab11ba	76	40.000	ENSORLG00020000483	rab9a	87	40.000
ENSORLG00020020816	rab11ba	96	31.818	ENSORLG00020020277	si:dkey-34d22.5	98	31.818
ENSORLG00020020816	rab11ba	78	38.824	ENSORLG00020021663	rab3db	77	38.824
ENSORLG00020020816	rab11ba	78	36.957	ENSORLG00020018196	rab33ba	77	36.957
ENSORLG00020020816	rab11ba	72	35.220	ENSORLG00020001721	rabl2	68	35.220
ENSORLG00020020816	rab11ba	71	32.911	ENSORLG00020019465	si:dkey-13a21.4	77	32.911
ENSORLG00020020816	rab11ba	74	44.444	ENSORLG00020018259	rab15	76	44.444
ENSORLG00020020816	rab11ba	75	45.122	ENSORLG00020011590	rab18b	80	45.122
ENSORLG00020020816	rab11ba	74	47.205	ENSORLG00020008388	rab5c	74	47.205
ENSORLG00020020816	rab11ba	72	37.580	ENSORLG00020001816	rab6a	79	37.580
ENSORLG00020020816	rab11ba	84	37.234	ENSORLG00020008512	-	92	37.234
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	94.470	ENSORLG00020019393	rab11bb	99	94.470
ENSORLG00020020816	rab11ba	78	33.696	ENSORLG00020016139	rab34b	67	33.696
ENSORLG00020020816	rab11ba	77	47.024	ENSORLG00020009535	-	84	47.024
ENSORLG00020020816	rab11ba	80	52.299	ENSORLG00020018986	rab14	80	49.425
ENSORLG00020020816	rab11ba	77	34.483	ENSORLG00020005240	RAB29	84	34.104
ENSORLG00020020816	rab11ba	81	43.750	ENSORLG00020015288	rab30	87	43.750
ENSORLG00020020816	rab11ba	77	47.337	ENSORLG00020019269	RAB39B	79	47.337
ENSORLG00020020816	rab11ba	68	36.000	ENSORLG00020008129	hras	85	37.037
ENSORLG00020020816	rab11ba	74	38.922	ENSORLG00020020266	rab33a	64	37.989
ENSORLG00020020816	rab11ba	73	32.500	ENSORLG00020002801	rheb	86	32.500
ENSORLG00020020816	rab11ba	70	35.484	ENSORLG00020020961	kras	93	36.527
ENSORLG00020020816	rab11ba	96	45.024	ENSORLG00020021071	zgc:171927	99	45.024
ENSORLG00020020816	rab11ba	78	38.728	ENSORLG00020012685	zgc:101559	74	38.728
ENSORLG00020020816	rab11ba	72	32.278	ENSORLG00020012306	si:ch73-116o1.2	81	34.118
ENSORLG00020020816	rab11ba	68	37.333	ENSORLG00020013690	zgc:55558	86	38.272
ENSORLG00020020816	rab11ba	74	33.533	ENSORLG00020005258	rerg	82	33.533
ENSORLG00020020816	rab11ba	72	37.580	ENSORLG00020000604	rab41	74	37.580
ENSORLG00020020816	rab11ba	78	55.556	ENSORLG00020020035	rab2a	81	55.556
ENSORLG00020020816	rab11ba	83	70.718	ENSORLG00020013719	rab25b	86	72.024
ENSORLG00020020816	rab11ba	59	30.000	ENSORLG00020011620	rras2	75	30.000
ENSORLG00020020816	rab11ba	74	41.975	ENSORLG00020004905	RAB15	78	41.975
ENSORLG00020020816	rab11ba	72	36.306	ENSORLG00020013337	rab6bb	79	35.669
ENSORLG00020020816	rab11ba	77	52.976	ENSORLG00020021697	-	83	52.976
ENSORLG00020020816	rab11ba	78	34.239	ENSORLG00020010041	rab34a	68	34.239
ENSORLG00020020816	rab11ba	77	52.976	ENSORLG00020000892	rab1ab	83	52.976
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	83.333	ENSORLG00020013747	rab11al	99	83.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSG00000185236	RAB11B	100	97.826	Homo_sapiens
ENSORLG00020020816	rab11ba	100	94.570	ENSAMEG00000004955	RAB11B	100	94.570	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020020816	rab11ba	78	97.647	ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.647	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	96.774	ENSAOCG00000018050	rab11ba	99	96.774	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	96.313	ENSAPEG00000009177	rab11ba	99	96.313	Amphiprion_percula
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	98.618	ENSATEG00000023730	rab11ba	99	98.618	Anabas_testudineus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSANAG00000037616	RAB11B	99	95.853	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020020816	rab11ba	93	88.177	ENSACLG00000018852	-	92	88.177	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	96.313	ENSACLG00000005420	rab11ba	99	96.313	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	78.802	WBGene00004274	rab-11.1	99	78.802	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSCJAG00000010778	RAB11B	99	95.853	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSCAFG00000032060	RAB11B	99	95.853	Canis_familiaris
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSCAFG00020022184	RAB11B	99	95.853	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSTSYG00000014758	RAB11B	99	95.853	Carlito_syrichta
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.392	ENSCPOG00000030154	RAB11B	99	95.392	Cavia_porcellus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSCCAG00000031042	RAB11B	99	95.853	Cebus_capucinus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSCLAG00000003207	RAB11B	99	95.853	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSCSAG00000008024	RAB11B	99	95.853	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	81.567	ENSCHOG00000013525	RAB11B	99	81.567	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	82.488	ENSCING00000009526	-	99	82.488	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSCANG00000040517	RAB11B	99	95.853	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSCGRG00001013827	Rab11b	99	95.853	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSCGRG00000010967	Rab11b	99	95.853	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	97.222	ENSCSEG00000007121	rab11ba	84	97.222	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	93.548	ENSDARG00000041878	rab11ba	99	93.548	Danio_rerio
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	94.009	ENSDNOG00000004134	-	99	94.009	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSDNOG00000014618	RAB11B	96	95.853	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSDORG00000006304	Rab11b	99	95.853	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	91.705	ENSEBUG00000011775	rab11ba	98	91.705	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	81.106	ENSEBUG00000015447	-	99	81.106	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020020816	rab11ba	66	100.000	ENSEEUG00000009165	-	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020020816	rab11ba	89	92.268	ENSELUG00000019240	-	99	92.268	Esox_lucius
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.392	ENSFCAG00000015216	RAB11B	99	95.392	Felis_catus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.392	ENSFDAG00000019872	RAB11B	99	95.392	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	98.157	ENSFHEG00000022642	rab11ba	99	98.157	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	94.009	ENSGMOG00000007390	rab11ba	99	94.009	Gadus_morhua
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	98.618	ENSGAFG00000005679	rab11ba	99	98.618	Gambusia_affinis
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSGAGG00000012557	-	99	95.853	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSHGLG00000014984	RAB11B	99	95.853	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSHGLG00100003638	RAB11B	99	95.853	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSSTOG00000031571	RAB11B	99	95.853	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSJJAG00000018891	Rab11b	99	95.853	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	99.078	ENSKMAG00000006082	-	99	99.078	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.392	ENSLBEG00000006087	rab11ba	99	95.392	Labrus_bergylta
ENSORLG00020020816	rab11ba	78	98.824	ENSLACG00000016974	RAB11B	99	98.824	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSLAFG00000013598	RAB11B	99	95.853	Loxodonta_africana
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSMNEG00000039759	-	99	95.853	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	97.696	ENSMAMG00000018556	rab11ba	99	97.696	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	96.313	ENSMZEG00005010947	rab11ba	99	96.313	Maylandia_zebra
ENSORLG00020020816	rab11ba	93	88.177	ENSMZEG00005019251	-	92	88.177	Maylandia_zebra
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	96.313	ENSMAUG00000021579	Rab11b	99	96.313	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.392	ENSMOCG00000012667	Rab11b	99	95.392	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	94.470	ENSMALG00000021949	rab11ba	99	94.470	Monopterus_albus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	MGP_CAROLIEiJ_G0021415	Rab11b	99	97.973	Mus_caroli
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	96.774	ENSMUSG00000077450	Rab11b	99	97.973	Mus_musculus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	MGP_PahariEiJ_G0020420	Rab11b	99	95.853	Mus_pahari
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	MGP_SPRETEiJ_G0022327	Rab11b	99	97.973	Mus_spretus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.392	ENSMPUG00000007263	RAB11B	99	95.392	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	91.364	ENSMLUG00000002308	-	99	91.364	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSNGAG00000015757	Rab11b	99	95.853	Nannospalax_galili
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	96.774	ENSNBRG00000023898	rab11ba	83	96.774	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSNLEG00000001733	RAB11B	99	95.853	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	ENSODEG00000011371	RAB11B	99	95.853	Octodon_degus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	97.235	ENSONIG00000002535	rab11ba	99	97.235	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020020816	rab11ba	74	97.516	ENSOCUG00000028208	RAB11B	64	97.516	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020020816	rab11ba	100	100.000	ENSORLG00000015307	rab11ba	100	100.000	Oryzias_latipes
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	100.000	ENSORLG00015016946	rab11ba	81	100.000	Oryzias_latipes_hsok
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ENSORLG00020020816	rab11ba	61	97.744	ENSXCOG00000009194	-	98	97.744	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020020816	rab11ba	99	98.618	ENSXMAG00000013416	rab11ba	99	98.618	Xiphophorus_maculatus