EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020021196 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6402 bases
Position: chr23:10080619-10087020
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020034645	zf-C2H2	PF00096.26	5.2e-42	1	8
ENSORLP00020034645	zf-C2H2	PF00096.26	5.2e-42	2	8
ENSORLP00020034645	zf-C2H2	PF00096.26	5.2e-42	3	8
ENSORLP00020034645	zf-C2H2	PF00096.26	5.2e-42	4	8
ENSORLP00020034645	zf-C2H2	PF00096.26	5.2e-42	5	8
ENSORLP00020034645	zf-C2H2	PF00096.26	5.2e-42	6	8
ENSORLP00020034645	zf-C2H2	PF00096.26	5.2e-42	7	8
ENSORLP00020034645	zf-C2H2	PF00096.26	5.2e-42	8	8
ENSORLP00020034645	zf-met	PF12874.7	9.7e-11	1	3
ENSORLP00020034645	zf-met	PF12874.7	9.7e-11	2	3
ENSORLP00020034645	zf-met	PF12874.7	9.7e-11	3	3
ENSORLP00020034645	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	1.5e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020029597	-	3054	-	ENSORLP00020034645	496 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020021196	-	75	55.435	ENSORLG00020010880	-	90	55.435
ENSORLG00020021196	-	68	51.691	ENSORLG00020010020	-	99	51.691
ENSORLG00020021196	-	75	46.734	ENSORLG00020018069	-	99	46.734
ENSORLG00020021196	-	90	36.905	ENSORLG00020011808	-	99	35.955
ENSORLG00020021196	-	60	40.441	ENSORLG00020006820	-	78	40.441
ENSORLG00020021196	-	51	42.222	ENSORLG00020018503	-	75	35.316
ENSORLG00020021196	-	50	50.000	ENSORLG00020001707	-	75	50.000
ENSORLG00020021196	-	55	44.980	ENSORLG00020009139	-	98	44.156
ENSORLG00020021196	-	50	48.500	ENSORLG00020004353	-	95	46.829
ENSORLG00020021196	-	50	41.615	ENSORLG00020009554	-	75	38.462
ENSORLG00020021196	-	57	44.560	ENSORLG00020009965	-	69	51.389
ENSORLG00020021196	-	50	52.717	ENSORLG00020007018	-	89	52.717
ENSORLG00020021196	-	55	55.914	ENSORLG00020009180	-	90	49.010
ENSORLG00020021196	-	73	43.782	ENSORLG00020009184	-	99	43.523
ENSORLG00020021196	-	81	50.909	ENSORLG00020008891	-	99	50.909
ENSORLG00020021196	-	50	49.412	ENSORLG00020010932	-	74	49.412
ENSORLG00020021196	-	55	36.585	ENSORLG00020018051	prdm5	68	36.585
ENSORLG00020021196	-	75	41.420	ENSORLG00020020419	-	94	46.396
ENSORLG00020021196	-	74	34.844	ENSORLG00020005132	-	94	34.204
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ENSORLG00020021196	-	75	34.133	ENSORLG00020015703	-	79	49.405
ENSORLG00020021196	-	76	45.418	ENSORLG00020008018	-	90	45.418
ENSORLG00020021196	-	74	41.481	ENSORLG00020001791	-	91	41.481
ENSORLG00020021196	-	50	40.000	ENSORLG00020004889	ZNF319	86	40.000
ENSORLG00020021196	-	73	44.811	ENSORLG00020017483	-	96	44.811
ENSORLG00020021196	-	91	43.719	ENSORLG00020007599	-	99	38.832
ENSORLG00020021196	-	55	34.524	ENSORLG00020005815	-	75	36.458
ENSORLG00020021196	-	50	54.124	ENSORLG00020000161	-	78	54.124
ENSORLG00020021196	-	50	48.454	ENSORLG00020017528	-	72	48.454
ENSORLG00020021196	-	62	36.879	ENSORLG00020012967	scrt1b	51	36.111
ENSORLG00020021196	-	61	47.737	ENSORLG00020010647	-	94	47.737
ENSORLG00020021196	-	63	52.140	ENSORLG00020011075	-	86	52.549
ENSORLG00020021196	-	76	46.914	ENSORLG00020000481	-	97	47.196
ENSORLG00020021196	-	65	39.048	ENSORLG00020002128	-	96	39.048
ENSORLG00020021196	-	70	48.996	ENSORLG00020010250	-	97	48.256
ENSORLG00020021196	-	90	45.455	ENSORLG00020019227	-	96	45.455
ENSORLG00020021196	-	68	50.625	ENSORLG00020011234	-	94	50.625
ENSORLG00020021196	-	75	53.881	ENSORLG00020009089	-	89	54.128
ENSORLG00020021196	-	76	51.049	ENSORLG00020007967	-	93	58.824
ENSORLG00020021196	-	58	33.898	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	80	33.898
ENSORLG00020021196	-	73	51.200	ENSORLG00020009857	-	98	51.200
ENSORLG00020021196	-	72	48.182	ENSORLG00020001912	znf236	72	48.182
ENSORLG00020021196	-	90	30.380	ENSORLG00020010923	-	99	33.582
ENSORLG00020021196	-	50	50.459	ENSORLG00020010953	-	77	50.459
ENSORLG00020021196	-	76	44.118	ENSORLG00020016037	-	96	43.725
ENSORLG00020021196	-	75	39.257	ENSORLG00020010636	-	89	39.257
ENSORLG00020021196	-	51	41.969	ENSORLG00020010038	-	55	41.969
ENSORLG00020021196	-	50	31.522	ENSORLG00020018685	znf319b	79	31.522
ENSORLG00020021196	-	59	50.000	ENSORLG00020004162	znf341	51	50.000
ENSORLG00020021196	-	74	43.210	ENSORLG00020016666	-	91	43.210
ENSORLG00020021196	-	50	39.823	ENSORLG00020018791	-	89	34.413
ENSORLG00020021196	-	87	39.091	ENSORLG00020008240	-	93	39.615
ENSORLG00020021196	-	77	52.174	ENSORLG00020010804	-	96	52.174
ENSORLG00020021196	-	64	46.009	ENSORLG00020016754	-	95	48.734
ENSORLG00020021196	-	76	48.077	ENSORLG00020010171	-	99	49.268
ENSORLG00020021196	-	50	40.741	ENSORLG00020003719	GFI1B	58	40.741
ENSORLG00020021196	-	76	51.256	ENSORLG00020009419	-	99	49.485
ENSORLG00020021196	-	81	52.294	ENSORLG00020010916	-	91	52.294
ENSORLG00020021196	-	78	47.727	ENSORLG00020008346	-	99	51.327
ENSORLG00020021196	-	74	50.450	ENSORLG00020000246	-	99	50.450
ENSORLG00020021196	-	78	47.059	ENSORLG00020004313	-	76	44.025
ENSORLG00020021196	-	80	46.875	ENSORLG00020017850	-	98	46.875
ENSORLG00020021196	-	91	49.304	ENSORLG00020000639	-	100	48.413
ENSORLG00020021196	-	72	47.468	ENSORLG00020006148	-	80	47.468
ENSORLG00020021196	-	50	48.768	ENSORLG00020017514	-	87	48.768
ENSORLG00020021196	-	58	34.529	ENSORLG00020007790	zbtb48	63	34.529
ENSORLG00020021196	-	77	46.586	ENSORLG00020017164	-	99	47.200
ENSORLG00020021196	-	50	41.566	ENSORLG00020002817	GFI1	53	41.566
ENSORLG00020021196	-	71	40.299	ENSORLG00020008787	snai2	54	40.299
ENSORLG00020021196	-	69	47.783	ENSORLG00020021857	-	74	50.661
ENSORLG00020021196	-	74	44.643	ENSORLG00020000219	-	65	44.643
ENSORLG00020021196	-	77	51.020	ENSORLG00020010560	-	98	51.205
ENSORLG00020021196	-	74	49.721	ENSORLG00020004370	-	99	48.187
ENSORLG00020021196	-	73	48.469	ENSORLG00020008933	-	99	48.469
ENSORLG00020021196	-	52	42.000	ENSORLG00020006144	-	76	44.304
ENSORLG00020021196	-	52	37.500	ENSORLG00020018495	-	64	37.500
ENSORLG00020021196	-	62	44.800	ENSORLG00020008484	-	97	47.619
ENSORLG00020021196	-	78	53.179	ENSORLG00020009943	-	99	53.179
ENSORLG00020021196	-	74	37.956	ENSORLG00020008744	-	67	37.751
ENSORLG00020021196	-	52	40.000	ENSORLG00020000009	znf710b	51	39.500
ENSORLG00020021196	-	51	44.898	ENSORLG00020010950	-	96	49.074
ENSORLG00020021196	-	75	40.526	ENSORLG00020018921	-	94	40.526
ENSORLG00020021196	-	50	56.410	ENSORLG00020007074	-	94	56.410
ENSORLG00020021196	-	85	37.374	ENSORLG00020012229	zbtb41	62	33.779

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020021196	-	56	49.689	ENSAPOG00000000601	-	78	49.689	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020021196	-	53	44.521	ENSAPOG00000010330	-	91	44.521	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020021196	-	70	41.228	ENSAPOG00000010645	-	60	41.538	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020021196	-	54	55.000	ENSAPOG00000016615	-	87	55.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020021196	-	51	49.296	ENSAPOG00000003414	-	97	49.296	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020021196	-	50	43.750	ENSAOCG00000007347	-	68	43.750	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020021196	-	74	50.000	ENSAPEG00000004256	-	99	50.000	Amphiprion_percula
ENSORLG00020021196	-	90	44.681	ENSATEG00000007658	-	98	47.887	Anabas_testudineus
ENSORLG00020021196	-	78	48.148	ENSAMXG00000037695	-	86	48.148	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020021196	-	51	52.083	ENSAMXG00000013492	-	89	52.703	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020021196	-	50	40.876	ENSCING00000024717	-	68	40.876	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020021196	-	73	46.552	ENSCVAG00000018383	-	94	38.577	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020021196	-	91	39.695	ENSCVAG00000011712	-	94	39.695	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020021196	-	90	51.471	ENSCVAG00000016924	-	100	51.471	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020021196	-	51	42.915	ENSEBUG00000014768	-	70	43.243	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020021196	-	50	39.267	ENSEBUG00000015472	-	64	39.267	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020021196	-	50	43.636	ENSEBUG00000006666	-	79	43.636	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020021196	-	51	44.444	ENSEBUG00000000436	-	69	44.444	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020021196	-	65	43.182	ENSEBUG00000004992	-	72	43.182	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020021196	-	50	42.500	ENSEBUG00000012543	-	50	40.580	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020021196	-	50	43.089	ENSEBUG00000001569	-	75	43.089	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020021196	-	51	37.795	ENSEBUG00000003232	-	55	39.271	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020021196	-	50	39.894	ENSEBUG00000001308	-	66	39.614	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020021196	-	50	41.441	ENSEBUG00000000422	-	65	41.441	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020021196	-	82	36.779	ENSELUG00000007694	-	92	36.298	Esox_lucius
ENSORLG00020021196	-	91	32.064	ENSELUG00000022942	-	92	42.029	Esox_lucius
ENSORLG00020021196	-	89	47.727	ENSELUG00000022965	-	98	47.727	Esox_lucius
ENSORLG00020021196	-	90	47.682	ENSELUG00000000281	-	93	47.682	Esox_lucius
ENSORLG00020021196	-	50	44.144	ENSGMOG00000016007	-	71	44.144	Gadus_morhua
ENSORLG00020021196	-	54	48.598	ENSGAFG00000021143	-	65	48.598	Gambusia_affinis
ENSORLG00020021196	-	56	43.725	ENSGAFG00000021139	-	86	43.725	Gambusia_affinis
ENSORLG00020021196	-	90	44.231	ENSGAFG00000013366	-	99	45.283	Gambusia_affinis
ENSORLG00020021196	-	50	48.795	ENSGAGG00000010492	-	73	48.795	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020021196	-	51	38.967	ENSHBUG00000007316	-	69	38.500	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020021196	-	51	48.052	ENSHBUG00000003529	-	86	48.052	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020021196	-	75	43.017	ENSHCOG00000019454	-	99	43.017	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021196	-	63	47.872	ENSHCOG00000015355	-	88	51.351	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021196	-	51	44.595	ENSHCOG00000008742	-	75	44.595	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021196	-	50	44.099	ENSHCOG00000007464	-	74	43.827	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021196	-	76	43.275	ENSHCOG00000019388	-	67	43.275	Hippocampus_comes
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