EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020021571 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 33446 bases
Position: chr4:25881236-25914681
Accession: 101155839
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020020561	Xpo1	PF08389.12	2.5e-23	1	1
ENSORLP00020034874	Xpo1	PF08389.12	3.6e-23	1	1
ENSORLP00020020561	IBN_N	PF03810.19	1.2e-09	1	1
ENSORLP00020034874	IBN_N	PF03810.19	1.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020029980	-	5072	XM_004068183	ENSORLP00020034874	1005 (aa)	XP_004068231	-
ENSORLT00020029986	-	2751	-	ENSORLP00020020561	916 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.243	ENSG00000117408	IPO13	99	81.081	Homo_sapiens
ENSORLG00020021571	ipo13	100	68.770	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	100	69.547	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	93.521	ENSAPOG00000003308	ipo13	100	95.842	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.351	ENSAMEG00000001123	IPO13	99	81.185	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020021571	ipo13	100	68.556	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	69.401	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020021571	ipo13	99	89.057	ENSACIG00000008146	ipo13	100	91.739	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	67.628	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	99	68.519	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020021571	ipo13	100	92.981	ENSAOCG00000004943	ipo13	100	95.322	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020021571	ipo13	100	67.735	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	99	68.621	Amphiprion_percula
ENSORLG00020021571	ipo13	100	92.981	ENSAPEG00000011282	ipo13	100	95.218	Amphiprion_percula
ENSORLG00020021571	ipo13	100	93.297	ENSATEG00000018367	ipo13	100	95.426	Anabas_testudineus
ENSORLG00020021571	ipo13	99	67.562	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	68.249	Anabas_testudineus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	80.108	ENSAPLG00000001349	IPO13	98	81.751	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020021571	ipo13	100	80.000	ENSACAG00000014300	IPO13	99	82.403	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.243	ENSANAG00000034183	IPO13	99	81.152	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020021571	ipo13	100	92.765	ENSACLG00000011458	ipo13	100	95.450	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021571	ipo13	100	68.128	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	100	69.033	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021571	ipo13	100	87.459	ENSAMXG00000005200	ipo13	100	89.616	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	61.812	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	64.076	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.811	ENSBTAG00000018887	IPO13	99	80.665	Bos_taurus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.351	ENSCJAG00000007453	IPO13	99	81.257	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.135	ENSCAFG00000004875	IPO13	99	80.977	Canis_familiaris
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.135	ENSCAFG00020017359	IPO13	99	80.977	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.919	ENSCHIG00000008341	IPO13	99	80.769	Capra_hircus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.243	ENSTSYG00000035980	IPO13	99	81.081	Carlito_syrichta
ENSORLG00020021571	ipo13	88	82.340	ENSCAPG00000001972	IPO13	97	81.781	Cavia_aperea
ENSORLG00020021571	ipo13	99	78.689	ENSCPOG00000012445	IPO13	99	80.462	Cavia_porcellus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.351	ENSCCAG00000022035	IPO13	99	81.257	Cebus_capucinus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.243	ENSCATG00000041276	IPO13	99	81.081	Cercocebus_atys
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.919	ENSCLAG00000002914	IPO13	99	80.769	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.243	ENSCSAG00000001190	IPO13	99	81.081	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020021571	ipo13	99	80.087	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	81.917	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020021571	ipo13	100	37.194	ENSCING00000001863	-	99	37.773	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020021571	ipo13	99	36.026	ENSCSAVG00000001368	-	99	36.534	Ciona_savignyi
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.243	ENSCANG00000009091	IPO13	99	81.081	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.054	ENSCGRG00001021177	Ipo13	99	79.834	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.054	ENSCGRG00000012411	Ipo13	99	79.834	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020021571	ipo13	100	62.286	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	99	62.963	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020021571	ipo13	100	90.513	ENSCSEG00000007713	ipo13	100	92.308	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020021571	ipo13	96	65.188	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	99	66.523	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	93.514	ENSCVAG00000013039	ipo13	100	95.738	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	86.811	ENSDARG00000060618	ipo13	99	89.557	Danio_rerio
ENSORLG00020021571	ipo13	100	64.147	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	65.823	Danio_rerio
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.919	ENSDNOG00000016583	IPO13	99	80.769	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.135	ENSDORG00000005471	Ipo13	99	80.873	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020021571	ipo13	100	66.595	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.961	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.135	ENSEASG00005001738	IPO13	99	80.977	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.135	ENSECAG00000015508	IPO13	99	80.977	Equus_caballus
ENSORLG00020021571	ipo13	68	83.598	ENSEEUG00000011681	IPO13	82	85.185	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	89.838	ENSELUG00000001498	ipo13	100	91.892	Esox_lucius
ENSORLG00020021571	ipo13	100	65.401	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	99	67.040	Esox_lucius
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.243	ENSFCAG00000006488	IPO13	99	81.081	Felis_catus
ENSORLG00020021571	ipo13	99	79.783	ENSFALG00000005368	IPO13	100	81.808	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.811	ENSFDAG00000015599	IPO13	99	80.665	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020021571	ipo13	100	93.514	ENSFHEG00000023271	ipo13	100	95.634	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020021571	ipo13	99	66.060	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	99	66.975	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	91.361	ENSGMOG00000015856	ipo13	99	93.568	Gadus_morhua
ENSORLG00020021571	ipo13	99	58.824	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	99	60.145	Gadus_morhua
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.676	ENSGALG00000010087	IPO13	99	82.192	Gallus_gallus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	93.413	ENSGAFG00000006361	ipo13	100	95.842	Gambusia_affinis
ENSORLG00020021571	ipo13	99	65.598	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	99	66.428	Gambusia_affinis
ENSORLG00020021571	ipo13	100	90.595	ENSGACG00000014562	ipo13	99	92.220	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020021571	ipo13	99	67.132	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	99	68.046	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	80.303	ENSGAGG00000008331	IPO13	98	82.340	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.243	ENSGGOG00000016375	IPO13	99	81.081	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020021571	ipo13	100	67.666	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	99	68.107	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020021571	ipo13	100	93.246	ENSHBUG00000018605	ipo13	100	95.114	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.486	ENSHGLG00000001822	IPO13	99	80.249	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.486	ENSHGLG00100015830	IPO13	99	80.249	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020021571	ipo13	100	88.671	ENSHCOG00000018408	ipo13	98	93.218	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021571	ipo13	99	62.783	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	64.255	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021571	ipo13	100	86.378	ENSIPUG00000011283	IPO13	99	88.669	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	58.280	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	100	59.854	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.135	ENSSTOG00000003611	IPO13	99	80.977	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.919	ENSJJAG00000018591	Ipo13	99	80.665	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020021571	ipo13	99	67.704	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	99	68.589	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020021571	ipo13	99	93.130	ENSKMAG00000007869	ipo13	99	95.388	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020021571	ipo13	98	67.211	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	99	67.809	Labrus_bergylta
ENSORLG00020021571	ipo13	100	91.037	ENSLBEG00000007442	ipo13	99	93.154	Labrus_bergylta
ENSORLG00020021571	ipo13	87	31.902	ENSLACG00000002351	TNPO3	99	32.418	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020021571	ipo13	100	74.920	ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.249	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020021571	ipo13	100	80.906	ENSLOCG00000010620	ipo13	99	83.351	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	77.287	ENSLAFG00000017144	IPO13	99	79.171	Loxodonta_africana
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.243	ENSMFAG00000032846	IPO13	99	81.081	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.243	ENSMMUG00000015142	IPO13	99	81.081	Macaca_mulatta
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.243	ENSMNEG00000041971	IPO13	99	81.081	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.243	ENSMLEG00000044330	IPO13	99	81.081	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	92.549	ENSMAMG00000017290	ipo13	100	95.010	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	68.021	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	99	69.033	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	68.021	ENSMZEG00005009283	si:ch73-182a11.2	100	68.930	Maylandia_zebra
ENSORLG00020021571	ipo13	100	92.765	ENSMZEG00005019335	ipo13	100	95.114	Maylandia_zebra
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.162	ENSMGAG00000009898	IPO13	100	80.426	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020021571	ipo13	83	81.398	ENSMAUG00000013018	Ipo13	99	81.932	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020021571	ipo13	93	83.333	ENSMICG00000011003	IPO13	99	83.240	Microcebus_murinus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.486	ENSMOCG00000008881	Ipo13	99	80.249	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020021571	ipo13	100	89.849	ENSMMOG00000001954	ipo13	99	92.652	Mola_mola
ENSORLG00020021571	ipo13	99	66.739	ENSMMOG00000018046	si:ch73-182a11.2	99	66.353	Mola_mola
ENSORLG00020021571	ipo13	99	79.022	ENSMODG00000003017	IPO13	100	80.937	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020021571	ipo13	81	69.496	ENSMALG00000006451	si:ch73-182a11.2	99	67.929	Monopterus_albus
ENSORLG00020021571	ipo13	99	90.703	ENSMALG00000010805	ipo13	100	93.275	Monopterus_albus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.919	MGP_CAROLIEiJ_G0026367	Ipo13	99	80.561	Mus_caroli
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.919	ENSMUSG00000033365	Ipo13	99	80.561	Mus_musculus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	81.081	MGP_PahariEiJ_G0028698	Ipo13	99	82.997	Mus_pahari
ENSORLG00020021571	ipo13	100	78.919	MGP_SPRETEiJ_G0027339	Ipo13	99	80.561	Mus_spretus
ENSORLG00020021571	ipo13	100	70.224	ENSMPUG00000013635	IPO13	99	75.538	Mustela_putorius_furo
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ENSORLG00020021571	ipo13	100	79.027	ENSNGAG00000013019	Ipo13	99	80.769	Nannospalax_galili
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